Protein–RNA interactions for Protein: P0DJD1

RGPD2, RANBP2-like and GRIP domain-containing protein 2, humanhuman

Predictions only

Length 1,756 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RGPD2P0DJD1 POLR3D-201ENST00000306433 1931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
RGPD2P0DJD1 REEP2-206ENST00000506158 1021 ntTSL 2 BASIC22.55■■□□□ 1.2
RGPD2P0DJD1 TSFM-210ENST00000550559 897 ntTSL 5 BASIC22.55■■□□□ 1.2
RGPD2P0DJD1 NAA60-208ENST00000570819 833 ntTSL 2 BASIC22.55■■□□□ 1.2
RGPD2P0DJD1 RNF34-201ENST00000361234 2066 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
RGPD2P0DJD1 FBXO24-202ENST00000427939 2087 ntTSL 2 BASIC22.55■■□□□ 1.2
RGPD2P0DJD1 SARDH-202ENST00000371867 1326 ntTSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
RGPD2P0DJD1 TSSK3-201ENST00000373534 1368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
RGPD2P0DJD1 CAPN1-201ENST00000279247 3007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
RGPD2P0DJD1 SCAI-202ENST00000373549 1968 ntTSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
RGPD2P0DJD1 HCK-210ENST00000629881 1969 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.55■■□□□ 1.2
RGPD2P0DJD1 HTRA3-201ENST00000307358 2541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
RGPD2P0DJD1 LINC00029-201ENST00000370341 1631 ntTSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
RGPD2P0DJD1 ADAMTS16-203ENST00000511368 2682 ntTSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
RGPD2P0DJD1 EIF4E3-201ENST00000295612 2764 ntTSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
RGPD2P0DJD1 CTDSP1-204ENST00000443891 1109 ntTSL 3 BASIC22.55■■□□□ 1.2
RGPD2P0DJD1 AC027088.1-201ENST00000557966 1117 ntTSL 2 BASIC22.55■■□□□ 1.2
RGPD2P0DJD1 AC025678.2-201ENST00000562061 970 ntBASIC22.55■■□□□ 1.2
RGPD2P0DJD1 CBR3-AS1-216ENST00000624883 564 ntTSL 3 BASIC22.55■■□□□ 1.2
RGPD2P0DJD1 FN1-208ENST00000426059 2388 ntTSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
RGPD2P0DJD1 HNRNPH3-202ENST00000354695 1332 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
RGPD2P0DJD1 COMMD5-202ENST00000402718 1305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
RGPD2P0DJD1 CHD1L-204ENST00000431239 2907 ntTSL 5 BASIC22.55■■□□□ 1.2
RGPD2P0DJD1 NTRK1-201ENST00000358660 2492 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.55■■□□□ 1.2
RGPD2P0DJD1 ZNF274-203ENST00000424679 2539 ntTSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
RGPD2P0DJD1 SLC25A35-205ENST00000580340 1541 ntTSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
RGPD2P0DJD1 ARFRP1-212ENST00000618838 1623 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.54■■□□□ 1.2
RGPD2P0DJD1 C19orf48-202ENST00000391812 1666 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.54■■□□□ 1.2
RGPD2P0DJD1 CITED2-201ENST00000367651 2354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
RGPD2P0DJD1 SSB-201ENST00000260956 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
RGPD2P0DJD1 GPT-202ENST00000394955 1885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
RGPD2P0DJD1 CHRFAM7A-202ENST00000397827 2794 ntTSL 5 BASIC22.54■■□□□ 1.2
RGPD2P0DJD1 EIF5A-201ENST00000336452 1256 ntTSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
RGPD2P0DJD1 RNU1-129P-201ENST00000384064 167 ntBASIC22.54■■□□□ 1.2
RGPD2P0DJD1 ANKRD6-204ENST00000447838 2968 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
RGPD2P0DJD1 AC004846.2-201ENST00000556578 777 ntTSL 3 BASIC22.54■■□□□ 1.2
RGPD2P0DJD1 AC005412.3-201ENST00000580309 715 ntBASIC22.54■■□□□ 1.2
RGPD2P0DJD1 U1.21-201ENST00000580816 167 ntBASIC22.54■■□□□ 1.2
RGPD2P0DJD1 CLDN7-201ENST00000360325 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
RGPD2P0DJD1 TEAD4-202ENST00000359864 1690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
RGPD2P0DJD1 SLC7A9-204ENST00000590341 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
RGPD2P0DJD1 LGMN-201ENST00000334869 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
RGPD2P0DJD1 CTSH-201ENST00000220166 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
RGPD2P0DJD1 ZNF398-202ENST00000475153 2860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
RGPD2P0DJD1 TRPC1-203ENST00000476941 3061 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
RGPD2P0DJD1 CRYGN-201ENST00000337323 754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
RGPD2P0DJD1 AC236430.1-201ENST00000402231 743 ntBASIC22.53■■□□□ 1.2
RGPD2P0DJD1 MECP2-203ENST00000407218 1174 ntTSL 5 BASIC22.53■■□□□ 1.2
RGPD2P0DJD1 PMS2P4-201ENST00000412466 1052 ntBASIC22.53■■□□□ 1.2
RGPD2P0DJD1 WASH6P-202ENST00000359512 1437 ntBASIC22.53■■□□□ 1.2
RGPD2P0DJD1 OTUD5-204ENST00000428668 1493 ntTSL 2 BASIC22.53■■□□□ 1.2
RGPD2P0DJD1 EED-202ENST00000327320 2033 ntTSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
RGPD2P0DJD1 UNC5D-204ENST00000420357 2966 ntTSL 5 BASIC22.53■■□□□ 1.2
RGPD2P0DJD1 ZBTB10-204ENST00000455036 5458 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.53■■□□□ 1.2
RGPD2P0DJD1 ARHGAP4-204ENST00000393721 2721 ntTSL 5 BASIC22.53■■□□□ 1.2
RGPD2P0DJD1 ZBTB16-201ENST00000335953 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
RGPD2P0DJD1 CHRND-201ENST00000258385 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
RGPD2P0DJD1 C18orf8-208ENST00000590868 2002 ntTSL 2 BASIC22.53■■□□□ 1.2
RGPD2P0DJD1 OSR2-209ENST00000522510 1528 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.53■■□□□ 1.2
RGPD2P0DJD1 TSPAN4-205ENST00000397406 1426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
RGPD2P0DJD1 MRPL16-201ENST00000300151 1182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
RGPD2P0DJD1 TREML5P-201ENST00000421694 576 ntBASIC22.53■■□□□ 1.2
RGPD2P0DJD1 FBXO45-201ENST00000311630 5899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
RGPD2P0DJD1 CD82-201ENST00000227155 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
RGPD2P0DJD1 MXRA8-202ENST00000342753 2231 ntTSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
RGPD2P0DJD1 TIMM13-201ENST00000215570 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
RGPD2P0DJD1 PYCR2-201ENST00000343818 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
RGPD2P0DJD1 CD276-201ENST00000318424 2738 ntTSL 5 BASIC22.52■■□□□ 1.2
RGPD2P0DJD1 EGFEM1P-202ENST00000431685 1563 ntBASIC22.52■■□□□ 1.2
RGPD2P0DJD1 AC008677.1-201ENST00000519230 1561 ntBASIC22.52■■□□□ 1.2
RGPD2P0DJD1 RELL2-201ENST00000297164 2520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
RGPD2P0DJD1 POLR2J4-203ENST00000326391 1422 ntTSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
RGPD2P0DJD1 ACOXL-205ENST00000439055 2373 ntTSL 2 BASIC22.52■■□□□ 1.2
RGPD2P0DJD1 WDR45-240ENST00000635003 1376 ntTSL 3 BASIC22.52■■□□□ 1.2
RGPD2P0DJD1 TRIP6-209ENST00000619988 1303 ntTSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
RGPD2P0DJD1 KLF2P3-201ENST00000451977 1087 ntBASIC22.52■■□□□ 1.2
RGPD2P0DJD1 PTPRVP-202ENST00000490575 953 ntTSL 5 BASIC22.52■■□□□ 1.2
RGPD2P0DJD1 LMO7-AS1-202ENST00000568735 467 ntTSL 3 BASIC22.52■■□□□ 1.2
RGPD2P0DJD1 SSH2-211ENST00000590153 570 ntTSL 4 BASIC22.52■■□□□ 1.2
RGPD2P0DJD1 BSG-214ENST00000614867 960 ntTSL 3 BASIC22.52■■□□□ 1.2
RGPD2P0DJD1 LSP1-217ENST00000612798 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.52■■□□□ 1.2
RGPD2P0DJD1 HARS-204ENST00000438307 1789 ntTSL 2 BASIC22.52■■□□□ 1.2
RGPD2P0DJD1 RDH8-203ENST00000591589 1715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
RGPD2P0DJD1 PSMA8-202ENST00000343848 1675 ntTSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
RGPD2P0DJD1 PLD3-206ENST00000409587 2180 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.52■■□□□ 1.19
RGPD2P0DJD1 UGP2-202ENST00000394417 2136 ntTSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
RGPD2P0DJD1 SLC44A3-207ENST00000529450 2045 ntTSL 2 BASIC22.51■■□□□ 1.19
RGPD2P0DJD1 CCDC28B-202ENST00000421922 1415 ntTSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
RGPD2P0DJD1 AL445433.2-201ENST00000425113 2544 ntTSL 2 BASIC22.51■■□□□ 1.19
RGPD2P0DJD1 ATP6AP2-224ENST00000637327 1929 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.51■■□□□ 1.19
RGPD2P0DJD1 CORO1A-208ENST00000565497 1348 ntTSL 5 BASIC22.51■■□□□ 1.19
RGPD2P0DJD1 AC138696.1-201ENST00000522452 2897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
RGPD2P0DJD1 RESP18-201ENST00000333527 795 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
RGPD2P0DJD1 XAGE1A-203ENST00000375602 614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
RGPD2P0DJD1 XAGE1B-203ENST00000375616 614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
RGPD2P0DJD1 CENPM-205ENST00000404067 905 ntTSL 3 BASIC22.51■■□□□ 1.19
RGPD2P0DJD1 AC005237.2-201ENST00000434368 219 ntBASIC22.51■■□□□ 1.19
RGPD2P0DJD1 TMEM176B-206ENST00000492607 1265 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.51■■□□□ 1.19
RGPD2P0DJD1 HILS1-201ENST00000504307 1219 ntTSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
RGPD2P0DJD1 MTFR1L-218ENST00000526894 733 ntTSL 4 BASIC22.51■■□□□ 1.19
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 30.2 ms