Protein–RNA interactions for Protein: P02654

APOC1, Apolipoprotein C-I, humanhuman

Predictions only

Length 83 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
APOC1P02654 CLN6-204ENST00000564752 900 ntTSL 3 BASIC15.42■□□□□ 0.06
APOC1P02654 CENPX-206ENST00000580435 710 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
APOC1P02654 RABAC1-208ENST00000601078 728 ntTSL 3 BASIC15.42■□□□□ 0.06
APOC1P02654 HNF4A-208ENST00000609795 1192 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
APOC1P02654 CLN6-214ENST00000636314 442 ntTSL 3 BASIC15.42■□□□□ 0.06
APOC1P02654 DYRK1B-203ENST00000430012 2007 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
APOC1P02654 CYHR1-204ENST00000438911 2020 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
APOC1P02654 HASPIN-201ENST00000325418 2797 ntAPPRIS P1 BASIC15.42■□□□□ 0.06
APOC1P02654 SERF2-203ENST00000381359 1931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
APOC1P02654 YY1AP1-206ENST00000359205 2690 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
APOC1P02654 ASCC2-223ENST00000542393 2594 ntTSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
APOC1P02654 RPH3AL-222ENST00000618002 2578 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
APOC1P02654 UBXN6-202ENST00000394765 1809 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
APOC1P02654 ELFN2-207ENST00000613079 8360 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC15.42■□□□□ 0.06
APOC1P02654 ECE2-205ENST00000404464 3229 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
APOC1P02654 DZIP1-203ENST00000361396 7418 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
APOC1P02654 PLAUR-201ENST00000221264 1610 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
APOC1P02654 EML3-212ENST00000494176 2901 ntTSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
APOC1P02654 CD5L-201ENST00000368174 2191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
APOC1P02654 LRRD1-201ENST00000343318 2073 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
APOC1P02654 NKX2-2-201ENST00000377142 2092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
APOC1P02654 VGLL4-210ENST00000426568 1428 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
APOC1P02654 SLC29A2-206ENST00000546034 2509 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
APOC1P02654 RCAN3-209ENST00000616511 2527 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
APOC1P02654 CYB561-205ENST00000542042 1302 ntTSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
APOC1P02654 LEXM-201ENST00000358193 1777 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
APOC1P02654 PGRMC1-202ENST00000535419 1762 ntTSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
APOC1P02654 MAP3K11-201ENST00000309100 3566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
APOC1P02654 PGBD5-201ENST00000391860 10961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
APOC1P02654 KCNA2-201ENST00000316361 2827 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
APOC1P02654 LMNA-205ENST00000368299 2253 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
APOC1P02654 DDIT4L-201ENST00000273990 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
APOC1P02654 RTN3-205ENST00000356000 2645 ntTSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
APOC1P02654 PLIN1-201ENST00000300055 2953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
APOC1P02654 AC009041.2-206ENST00000563863 1728 ntTSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
APOC1P02654 KRT79-201ENST00000330553 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
APOC1P02654 RTKN2-203ENST00000395260 2076 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
APOC1P02654 ZNF575-201ENST00000314228 1298 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
APOC1P02654 LCE1D-201ENST00000326233 430 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
APOC1P02654 MYCLP1-201ENST00000372451 1075 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
APOC1P02654 MIEN1-201ENST00000394231 1006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
APOC1P02654 MOBP-204ENST00000420739 940 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
APOC1P02654 AC073111.4-202ENST00000486297 585 ntTSL 4 BASIC15.41■□□□□ 0.06
APOC1P02654 AF250324.1-201ENST00000506276 703 ntTSL 3 BASIC15.41■□□□□ 0.06
APOC1P02654 FOXP3-205ENST00000518685 1213 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
APOC1P02654 VENTXP5-201ENST00000523979 775 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
APOC1P02654 AL449423.1-201ENST00000578935 435 ntTSL 3 BASIC15.41■□□□□ 0.06
APOC1P02654 ELAVL1-202ENST00000593807 856 ntTSL 3 BASIC15.41■□□□□ 0.06
APOC1P02654 AC243829.1-201ENST00000615128 1059 ntTSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
APOC1P02654 LRRC23-215ENST00000622489 1061 ntTSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
APOC1P02654 WDR6-223ENST00000627177 207 ntTSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
APOC1P02654 CCDC115-201ENST00000259229 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
APOC1P02654 ITGA3-202ENST00000320031 4888 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
APOC1P02654 MEG3-205ENST00000412736 1615 ntTSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
APOC1P02654 THNSL2-205ENST00000449349 1616 ntTSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
APOC1P02654 TMEM237-202ENST00000409444 5592 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
APOC1P02654 RBBP7-203ENST00000380087 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
APOC1P02654 SH3BP5-203ENST00000408919 1880 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
APOC1P02654 RCAN3-202ENST00000374395 6802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
APOC1P02654 FAM13C-204ENST00000468840 2110 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
APOC1P02654 C14orf93-204ENST00000397377 1776 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
APOC1P02654 NSUN5P2-205ENST00000602348 1776 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
APOC1P02654 IGSF8-202ENST00000368086 2366 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
APOC1P02654 CPEB2-201ENST00000259997 5612 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
APOC1P02654 A4GALT-202ENST00000381278 1935 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
APOC1P02654 NUDC-201ENST00000321265 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
APOC1P02654 CDC25A-202ENST00000351231 3663 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
APOC1P02654 SLC30A2-202ENST00000374278 3097 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
APOC1P02654 STRN4-201ENST00000263280 3210 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
APOC1P02654 CACNB3-202ENST00000536187 1872 ntTSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
APOC1P02654 HADHB-208ENST00000537713 2142 ntTSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
APOC1P02654 SARS2-212ENST00000600042 1630 ntTSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
APOC1P02654 OBSL1-201ENST00000289656 2274 ntTSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
APOC1P02654 POLR3H-202ENST00000355209 4416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
APOC1P02654 AC004943.2-201ENST00000563328 4842 ntTSL 3 BASIC15.4■□□□□ 0.06
APOC1P02654 NUDT6-201ENST00000304430 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
APOC1P02654 ABCD1-202ENST00000370129 1016 ntTSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
APOC1P02654 ROMO1-204ENST00000374078 498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
APOC1P02654 TFPT-203ENST00000391759 1205 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
APOC1P02654 AL645929.1-201ENST00000420084 975 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
APOC1P02654 PLPP5-202ENST00000422581 853 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
APOC1P02654 HAGLR-204ENST00000425005 623 ntTSL 3 BASIC15.4■□□□□ 0.06
APOC1P02654 SAPCD2P2-201ENST00000431719 1174 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
APOC1P02654 DMKN-212ENST00000443640 842 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
APOC1P02654 AC104076.2-201ENST00000448912 469 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
APOC1P02654 MHENCR-202ENST00000449500 801 ntTSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
APOC1P02654 AP000777.3-201ENST00000538705 491 ntTSL 3 BASIC15.4■□□□□ 0.06
APOC1P02654 AC090616.6-201ENST00000582640 721 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
APOC1P02654 AL772307.1-201ENST00000639363 1066 ntTSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
APOC1P02654 CXorf67-201ENST00000342995 1929 ntAPPRIS P1 BASIC15.4■□□□□ 0.06
APOC1P02654 MFSD11-219ENST00000593181 1922 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
APOC1P02654 CTDSP2-201ENST00000398073 4795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
APOC1P02654 EPB41L3-203ENST00000400111 4259 ntTSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
APOC1P02654 AL645608.8-201ENST00000606034 2086 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
APOC1P02654 RNF168-201ENST00000318037 5347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
APOC1P02654 HOXA2-201ENST00000222718 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
APOC1P02654 AGPS-201ENST00000264167 7764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
APOC1P02654 KDM5C-205ENST00000404049 5677 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
APOC1P02654 PROK1-201ENST00000271331 1338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
APOC1P02654 ACP2-206ENST00000529444 1719 ntTSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28.1 ms