Protein–RNA interactions for Protein: O75648

TRMU, Mitochondrial tRNA-specific 2-thiouridylase 1, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 421 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRMUO75648 AL512380.2-201ENST00000637901 1780 ntTSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
TRMUO75648 LINC00884-202ENST00000448892 2680 ntTSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
TRMUO75648 AL513523.2-202ENST00000427283 2040 ntBASIC16.38■□□□□ 0.21
TRMUO75648 CHTF8-203ENST00000448552 2903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
TRMUO75648 DLGAP1-220ENST00000581699 2258 ntTSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
TRMUO75648 PLEKHJ1-211ENST00000589097 2251 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
TRMUO75648 LINC02228-204ENST00000642115 2962 ntBASIC16.38■□□□□ 0.21
TRMUO75648 LINC01568-207ENST00000641790 1380 ntBASIC16.38■□□□□ 0.21
TRMUO75648 SLBP-201ENST00000318386 1635 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC16.37■□□□□ 0.21
TRMUO75648 TSSC2-204ENST00000529482 2337 ntTSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
TRMUO75648 MAP3K9-206ENST00000555993 4449 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
TRMUO75648 CD68-201ENST00000250092 1878 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
TRMUO75648 ZDHHC24-201ENST00000310442 4721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
TRMUO75648 SLC44A1-203ENST00000374724 3088 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
TRMUO75648 AQP1-201ENST00000311813 2913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
TRMUO75648 AC009102.3-201ENST00000623118 1491 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
TRMUO75648 RAD23A-201ENST00000316856 1736 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
TRMUO75648 PSRC1-204ENST00000369909 1742 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
TRMUO75648 PAUPAR-201ENST00000630360 2965 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
TRMUO75648 AC024909.3-201ENST00000611513 2257 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
TRMUO75648 ACTG1-208ENST00000575087 2001 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
TRMUO75648 ERCC2-205ENST00000485403 1538 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
TRMUO75648 CFL1-201ENST00000308162 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
TRMUO75648 PLPP7-201ENST00000372261 972 ntTSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
TRMUO75648 MIR149-201ENST00000384879 89 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
TRMUO75648 HMGA1P5-201ENST00000412453 271 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
TRMUO75648 AC008825.1-201ENST00000504398 452 ntTSL 3 BASIC16.37■□□□□ 0.21
TRMUO75648 AC104390.1-201ENST00000555663 520 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
TRMUO75648 AC015712.4-203ENST00000559673 630 ntTSL 3 BASIC16.37■□□□□ 0.21
TRMUO75648 CD177-202ENST00000607855 536 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
TRMUO75648 GPR176-205ENST00000561100 2816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
TRMUO75648 CDK19-202ENST00000368911 6246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
TRMUO75648 MYB-203ENST00000341911 3672 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
TRMUO75648 UROS-202ENST00000368778 1556 ntTSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
TRMUO75648 MRM2-203ENST00000440306 1570 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
TRMUO75648 SEPT11-203ENST00000502584 2615 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
TRMUO75648 VLDLR-AS1-205ENST00000599229 1346 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
TRMUO75648 KCNC2-209ENST00000550433 2931 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
TRMUO75648 DAPK1-202ENST00000408954 5892 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
TRMUO75648 PIEZO1-201ENST00000301015 8072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
TRMUO75648 QRICH1-202ENST00000395443 3549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
TRMUO75648 NUCB1-202ENST00000407032 2158 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
TRMUO75648 SLC5A6-203ENST00000408041 2230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
TRMUO75648 CYP2T1P-202ENST00000641596 2535 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
TRMUO75648 CLCNKA-203ENST00000439316 1997 ntTSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
TRMUO75648 TCTN1-229ENST00000614115 1965 ntTSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
TRMUO75648 CDH15-201ENST00000289746 2847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
TRMUO75648 IQCF5-AS1-201ENST00000440723 2000 ntTSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
TRMUO75648 SDHAP2-201ENST00000455183 2001 ntBASIC16.36■□□□□ 0.21
TRMUO75648 RTEL1-TNFRSF6B-202ENST00000482936 4931 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
TRMUO75648 COL23A1-202ENST00000407622 2329 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
TRMUO75648 MRGPRF-AS1-201ENST00000538407 1490 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
TRMUO75648 FDFT1-224ENST00000618539 2660 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
TRMUO75648 LRPPRC-203ENST00000409946 1848 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
TRMUO75648 BDKRB1-202ENST00000553356 1526 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
TRMUO75648 SLC3A2-203ENST00000377890 2161 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
TRMUO75648 EPS8L2-201ENST00000318562 3148 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
TRMUO75648 STKLD1-201ENST00000371957 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
TRMUO75648 FRMD5-202ENST00000417257 5011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
TRMUO75648 PICALM-219ENST00000532317 3474 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
TRMUO75648 DHRS4L2-202ENST00000397071 1117 ntTSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
TRMUO75648 GRAMD4P1-201ENST00000435181 1110 ntBASIC16.36■□□□□ 0.21
TRMUO75648 FAHD2CP-202ENST00000443258 893 ntTSL 3 BASIC16.36■□□□□ 0.21
TRMUO75648 AC002467.1-201ENST00000457510 657 ntTSL 3 BASIC16.36■□□□□ 0.21
TRMUO75648 RNF165-206ENST00000590330 1049 ntTSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
TRMUO75648 CSNK1A1-202ENST00000377843 2559 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
TRMUO75648 FAM110A-201ENST00000246100 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
TRMUO75648 SLC25A45-202ENST00000398802 2286 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
TRMUO75648 ART1-201ENST00000250693 1312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
TRMUO75648 CIRBP-201ENST00000320936 1328 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
TRMUO75648 CIRBP-207ENST00000586472 1303 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC16.36■□□□□ 0.21
TRMUO75648 MAP1LC3B-201ENST00000268607 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
TRMUO75648 PDZD4-202ENST00000393758 3763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
TRMUO75648 ZBTB46-201ENST00000245663 5185 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
TRMUO75648 CD40-202ENST00000372285 1729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
TRMUO75648 ZDHHC13-202ENST00000446113 2445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
TRMUO75648 TAP2-202ENST00000374899 2497 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
TRMUO75648 PRDM5-202ENST00000394435 2492 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
TRMUO75648 TSNARE1-204ENST00000519651 2110 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
TRMUO75648 SQOR-208ENST00000568606 1792 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
TRMUO75648 ACTN4-201ENST00000252699 4963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
TRMUO75648 RAB39A-201ENST00000320578 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
TRMUO75648 NSFL1C-202ENST00000353088 2611 ntTSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
TRMUO75648 PCDHA13-202ENST00000409494 4884 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
TRMUO75648 ZNF799-201ENST00000419318 3036 ntTSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
TRMUO75648 CD19-201ENST00000324662 1932 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
TRMUO75648 AC010198.1-201ENST00000500076 1552 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
TRMUO75648 EFNB3-201ENST00000226091 3222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
TRMUO75648 ASCC3-207ENST00000522650 2828 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
TRMUO75648 RBPMS-204ENST00000397323 2941 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
TRMUO75648 NAA60-201ENST00000360862 2522 ntTSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
TRMUO75648 LRRC23-202ENST00000323702 1208 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
TRMUO75648 CCK-201ENST00000334681 830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
TRMUO75648 AC087499.1-201ENST00000418141 1075 ntBASIC16.35■□□□□ 0.21
TRMUO75648 AC009947.2-201ENST00000444014 672 ntBASIC16.35■□□□□ 0.21
TRMUO75648 AL445472.1-201ENST00000452532 1007 ntTSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
TRMUO75648 DCTN3-209ENST00000477738 713 ntTSL 3 BASIC16.35■□□□□ 0.21
TRMUO75648 RARRES1-204ENST00000479756 839 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
TRMUO75648 CCNJL-205ENST00000519673 940 ntTSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
TRMUO75648 YPEL3-207ENST00000566134 761 ntTSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 111.6 ms