Protein–RNA interactions for Protein: O75600

GCAT, 2-amino-3-ketobutyrate coenzyme A ligase, mitochondrial, humanhuman

Predictions only

Length 419 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GCATO75600 BATF2-202ENST00000435842 1949 ntTSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
GCATO75600 MAP3K13-212ENST00000448876 1681 ntTSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
GCATO75600 NMD3-202ENST00000460469 3061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
GCATO75600 RPP14-206ENST00000466547 805 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.85■□□□□ 0.45
GCATO75600 SMIM4-202ENST00000476842 522 ntTSL 4 BASIC17.85■□□□□ 0.45
GCATO75600 MRPS30-202ENST00000507110 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
GCATO75600 PCDHA6-202ENST00000527624 2231 ntTSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
GCATO75600 CMTM1-213ENST00000529506 581 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
GCATO75600 AC009533.2-201ENST00000543664 586 ntBASIC17.85■□□□□ 0.45
GCATO75600 TCP11L2-203ENST00000547153 1788 ntTSL 2 BASIC17.85■□□□□ 0.45
GCATO75600 AC021066.1-201ENST00000549788 647 ntTSL 3 BASIC17.85■□□□□ 0.45
GCATO75600 FICD-205ENST00000552758 603 ntTSL 2 BASIC17.85■□□□□ 0.45
GCATO75600 NFATC4-223ENST00000555802 1476 ntTSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
GCATO75600 TPM1-218ENST00000559281 851 ntTSL 5 BASIC17.85■□□□□ 0.45
GCATO75600 CARHSP1-205ENST00000562843 843 ntTSL 2 BASIC17.85■□□□□ 0.45
GCATO75600 AC087645.2-201ENST00000586321 799 ntTSL 3 BASIC17.85■□□□□ 0.45
GCATO75600 AC008687.7-201ENST00000593309 920 ntTSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
GCATO75600 BCR-201ENST00000305877 7082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
GCATO75600 CDH24-204ENST00000487137 3438 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.85■□□□□ 0.45
GCATO75600 EGR2-203ENST00000439032 2844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
GCATO75600 SAMD11-202ENST00000342066 2551 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.85■□□□□ 0.45
GCATO75600 SAMD11-217ENST00000622503 2557 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.85■□□□□ 0.45
GCATO75600 CDC73-201ENST00000367435 4969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
GCATO75600 DCLK2-204ENST00000506325 2298 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
GCATO75600 SLC7A2-205ENST00000522656 2274 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
GCATO75600 RMND5B-201ENST00000313386 1929 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
GCATO75600 OPN5-204ENST00000489301 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
GCATO75600 SEH1L-202ENST00000399892 1846 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
GCATO75600 AC046185.3-201ENST00000623228 1824 ntBASIC17.84■□□□□ 0.45
GCATO75600 ANGPTL4-202ENST00000393962 1705 ntTSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
GCATO75600 CELF6-204ENST00000543764 1676 ntTSL 2 BASIC17.84■□□□□ 0.45
GCATO75600 CACNA1B-204ENST00000371357 9642 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
GCATO75600 CD81-AS1-201ENST00000413483 1460 ntTSL 2 BASIC17.84■□□□□ 0.45
GCATO75600 PORCN-205ENST00000367574 1368 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
GCATO75600 AC011840.1-202ENST00000436477 1351 ntTSL 2 BASIC17.84■□□□□ 0.45
GCATO75600 PORCN-214ENST00000537758 1371 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
GCATO75600 CCT6P1-202ENST00000442266 1317 ntTSL 2 BASIC17.84■□□□□ 0.45
GCATO75600 TCEAL3-201ENST00000243286 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
GCATO75600 ATP5J-201ENST00000284971 614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
GCATO75600 ENSA-206ENST00000361631 725 ntTSL 2 BASIC17.84■□□□□ 0.45
GCATO75600 BEX4-201ENST00000372691 1066 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.84■□□□□ 0.45
GCATO75600 CD99-205ENST00000381192 1245 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
GCATO75600 SDR39U1-201ENST00000399395 1233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
GCATO75600 CRELD2-202ENST00000403427 1242 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
GCATO75600 EEF1E1-202ENST00000429723 562 ntTSL 3 BASIC17.84■□□□□ 0.45
GCATO75600 MRPL28-203ENST00000429738 310 ntTSL 2 BASIC17.84■□□□□ 0.45
GCATO75600 VENTXP7-201ENST00000475503 772 ntBASIC17.84■□□□□ 0.45
GCATO75600 CDV3-207ENST00000508481 661 ntTSL 3 BASIC17.84■□□□□ 0.45
GCATO75600 RNASEH2C-202ENST00000527610 835 ntTSL 2 BASIC17.84■□□□□ 0.45
GCATO75600 CTDNEP1-207ENST00000572043 857 ntTSL 3 BASIC17.84■□□□□ 0.45
GCATO75600 STK25P1-201ENST00000585406 838 ntBASIC17.84■□□□□ 0.45
GCATO75600 MAP2K3-215ENST00000627447 351 ntTSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
GCATO75600 BAZ1B-201ENST00000339594 6102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
GCATO75600 SLC47A1-209ENST00000575023 2224 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
GCATO75600 CD24-201ENST00000606017 2180 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
GCATO75600 HR-201ENST00000312841 5351 ntTSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
GCATO75600 IFNGR1-201ENST00000367739 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
GCATO75600 GSS-201ENST00000216951 1922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
GCATO75600 CLDN7-203ENST00000538261 1923 ntTSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
GCATO75600 KCTD2-201ENST00000322444 3635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
GCATO75600 ST8SIA4-202ENST00000451528 1794 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
GCATO75600 COL5A3-201ENST00000264828 6174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
GCATO75600 LINC02012-201ENST00000608206 1725 ntBASIC17.84■□□□□ 0.45
GCATO75600 AC093525.9-201ENST00000624961 1746 ntBASIC17.84■□□□□ 0.45
GCATO75600 PDE4A-201ENST00000293683 2583 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
GCATO75600 HOOK2-202ENST00000397668 2513 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
GCATO75600 RIC8B-203ENST00000392839 2440 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
GCATO75600 ARHGAP9-204ENST00000430041 2323 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
GCATO75600 NEK3-206ENST00000611833 2345 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.45
GCATO75600 GMPR-201ENST00000259727 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
GCATO75600 USB1-201ENST00000219281 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
GCATO75600 TMEM130-202ENST00000345589 2261 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
GCATO75600 AL353593.2-201ENST00000602529 1483 ntBASIC17.83■□□□□ 0.45
GCATO75600 CABP4-202ENST00000438189 1426 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
GCATO75600 LRRTM1-202ENST00000409148 2126 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC17.83■□□□□ 0.45
GCATO75600 RBCK1-202ENST00000356286 2774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
GCATO75600 RASA4-202ENST00000449970 2787 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.83■□□□□ 0.45
GCATO75600 RABGGTA-201ENST00000216840 2088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
GCATO75600 ESYT3-201ENST00000289135 1356 ntTSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.45
GCATO75600 KANSL2-212ENST00000550347 2714 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
GCATO75600 F12-201ENST00000253496 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
GCATO75600 WASF1-205ENST00000392587 2675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
GCATO75600 EWSR1-206ENST00000397938 2654 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
GCATO75600 CRKL-201ENST00000354336 5325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
GCATO75600 HIBCH-201ENST00000359678 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
GCATO75600 HBZ-201ENST00000252951 755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
GCATO75600 CD1E-203ENST00000368156 861 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
GCATO75600 BOLA1-202ENST00000369152 859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
GCATO75600 HYI-201ENST00000372425 1265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
GCATO75600 CD9-202ENST00000382515 1229 ntTSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.44
GCATO75600 KRT16P4-201ENST00000453883 522 ntBASIC17.83■□□□□ 0.44
GCATO75600 MYL6-203ENST00000536128 1221 ntTSL 2 BASIC17.83■□□□□ 0.44
GCATO75600 AL160237.2-201ENST00000556165 472 ntBASIC17.83■□□□□ 0.44
GCATO75600 BMF-207ENST00000559701 630 ntTSL 3 BASIC17.83■□□□□ 0.44
GCATO75600 ATP6V0C-202ENST00000564973 1081 ntTSL 2 BASIC17.83■□□□□ 0.44
GCATO75600 RPL19-204ENST00000579260 1051 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.83■□□□□ 0.44
GCATO75600 PPP1R1B-208ENST00000580825 1038 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.44
GCATO75600 CCNC-219ENST00000627680 896 ntTSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.44
GCATO75600 ZDHHC9-202ENST00000371064 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
GCATO75600 LYPLAL1-201ENST00000366927 1819 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 26.3 ms