Protein–RNA interactions for Protein: O43918

AIRE, Autoimmune regulator, humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
AIREO43918 MAGI3-204ENST00000369617 3911 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
AIREO43918 JRK-210ENST00000614134 8932 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
AIREO43918 PCCB-201ENST00000251654 1833 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
AIREO43918 RDH12-201ENST00000267502 1833 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
AIREO43918 CFAP77-201ENST00000343036 1818 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
AIREO43918 TMEM19-201ENST00000266673 5656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
AIREO43918 TRIM39-205ENST00000396551 3249 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
AIREO43918 TMPO-201ENST00000261210 820 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
AIREO43918 GNGT2-201ENST00000300406 889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
AIREO43918 MRGPRG-201ENST00000332314 870 ntAPPRIS P1 BASIC15.62■□□□□ 0.09
AIREO43918 C6orf48-205ENST00000375640 1053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
AIREO43918 SLC47A1P1-201ENST00000420951 500 ntTSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
AIREO43918 GCC2-AS1-202ENST00000440975 574 ntTSL 4 BASIC15.62■□□□□ 0.09
AIREO43918 NELFE-206ENST00000444811 1202 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
AIREO43918 AC234772.2-201ENST00000456532 375 ntTSL 3 BASIC15.62■□□□□ 0.09
AIREO43918 AP002982.1-201ENST00000492365 877 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
AIREO43918 FAM163B-202ENST00000496132 811 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.62■□□□□ 0.09
AIREO43918 TP53I11-215ENST00000531928 1078 ntTSL 3 BASIC15.62■□□□□ 0.09
AIREO43918 MAGIX-202ENST00000595224 1238 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
AIREO43918 AC005225.2-202ENST00000617980 408 ntTSL 4 BASIC15.62■□□□□ 0.09
AIREO43918 INO80E-214ENST00000620599 515 ntTSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
AIREO43918 MARCH4-201ENST00000273067 4447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
AIREO43918 KRT13-201ENST00000246635 1699 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
AIREO43918 RNPS1-219ENST00000566397 1685 ntTSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
AIREO43918 TMPO-203ENST00000343315 2465 ntTSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
AIREO43918 EFR3B-203ENST00000402191 3685 ntTSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
AIREO43918 EPS8L2-201ENST00000318562 3148 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
AIREO43918 RENBP-201ENST00000369997 1322 ntTSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
AIREO43918 P2RX3-204ENST00000616487 1346 ntTSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
AIREO43918 ABLIM2-201ENST00000341937 2589 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
AIREO43918 FN1-208ENST00000426059 2388 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
AIREO43918 KLHL36-204ENST00000564996 2173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
AIREO43918 WDTC1-202ENST00000361771 4275 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
AIREO43918 COL4A3BP-204ENST00000405807 2843 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
AIREO43918 PRSS50-202ENST00000315170 1372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
AIREO43918 YY1AP1-210ENST00000368339 3073 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
AIREO43918 KCNC1-202ENST00000379472 7965 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
AIREO43918 RCOR3-204ENST00000452621 1827 ntTSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
AIREO43918 PAXBP1-202ENST00000331923 3995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
AIREO43918 AL079301.1-201ENST00000424580 1633 ntTSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
AIREO43918 APBB1-210ENST00000530885 1626 ntTSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
AIREO43918 AL365203.3-201ENST00000609742 2057 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
AIREO43918 KRT8P9-201ENST00000558927 1449 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
AIREO43918 ADAMTS13-201ENST00000355699 4442 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
AIREO43918 MED29-202ENST00000594368 1471 ntTSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
AIREO43918 MCF2L-232ENST00000535094 3752 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
AIREO43918 MICALL1-201ENST00000215957 4710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
AIREO43918 KIAA1522-201ENST00000294521 878 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
AIREO43918 RPP25L-201ENST00000297613 1092 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
AIREO43918 TMEM223-201ENST00000307366 1288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
AIREO43918 CMTM8-201ENST00000307526 1174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
AIREO43918 CLTA-202ENST00000345519 1073 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
AIREO43918 ROMO1-205ENST00000397416 288 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.61■□□□□ 0.09
AIREO43918 AC226101.2-201ENST00000458252 747 ntTSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
AIREO43918 ZNF529-AS1-202ENST00000475219 1033 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
AIREO43918 PACRGL-206ENST00000502374 1034 ntTSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
AIREO43918 MYL6-209ENST00000548293 753 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
AIREO43918 AC133041.1-202ENST00000642053 222 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
AIREO43918 AL031985.4-201ENST00000642138 673 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
AIREO43918 FBLN7-205ENST00000409903 1989 ntTSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
AIREO43918 TOP1MT-218ENST00000523676 1982 ntTSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
AIREO43918 STARD10-218ENST00000543304 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
AIREO43918 MORN1-203ENST00000378531 1798 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
AIREO43918 SLC35A3-224ENST00000640732 1777 ntTSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
AIREO43918 WDR1-202ENST00000382451 2722 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
AIREO43918 CCNY-202ENST00000339497 4630 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
AIREO43918 PRAF2-202ENST00000553851 1334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
AIREO43918 HOXB3-205ENST00000470495 4208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
AIREO43918 PPP1R26-206ENST00000605660 4502 ntAPPRIS P1 BASIC15.61■□□□□ 0.09
AIREO43918 MAPK3-212ENST00000484663 2567 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
AIREO43918 ASH2L-212ENST00000545394 2808 ntTSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
AIREO43918 CKAP4-201ENST00000378026 3093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
AIREO43918 DACT3-203ENST00000410105 3085 ntTSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
AIREO43918 EPN2-201ENST00000314728 4871 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
AIREO43918 PCDHA6-203ENST00000529310 5374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
AIREO43918 PITPNA-201ENST00000313486 3912 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
AIREO43918 NTRK3-202ENST00000355254 2938 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
AIREO43918 NR2C2-201ENST00000323373 2406 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
AIREO43918 GPR161-202ENST00000367835 2400 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
AIREO43918 RBM47-212ENST00000514014 2419 ntTSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
AIREO43918 SLC35G6-201ENST00000412468 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
AIREO43918 LINC00167-201ENST00000530583 1419 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
AIREO43918 POLI-208ENST00000579534 6133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
AIREO43918 SLC43A2-204ENST00000571650 3261 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
AIREO43918 TMUB2-209ENST00000587989 1969 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC15.6■□□□□ 0.09
AIREO43918 TGFBR2-201ENST00000295754 4621 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
AIREO43918 ZBTB17-216ENST00000537142 2511 ntTSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
AIREO43918 ZNF131-214ENST00000509634 3340 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
AIREO43918 BRF1-201ENST00000327359 2292 ntTSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
AIREO43918 PNCK-203ENST00000370145 1455 ntTSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
AIREO43918 SCP2-202ENST00000371513 2003 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
AIREO43918 SLC30A4-201ENST00000261867 7157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
AIREO43918 CXorf58-201ENST00000379211 1752 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
AIREO43918 C12orf42-205ENST00000548048 1532 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
AIREO43918 TMEM39B-201ENST00000336294 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
AIREO43918 ZP3-204ENST00000416245 1846 ntTSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
AIREO43918 PPAN-P2RY11-202ENST00000428358 2661 ntTSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
AIREO43918 AC007495.1-201ENST00000501259 2678 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
AIREO43918 C9orf172-201ENST00000436881 4387 ntAPPRIS P1 BASIC15.6■□□□□ 0.09
AIREO43918 NT5C-201ENST00000245552 954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
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