Protein–RNA interactions for Protein: O14522

PTPRT, Receptor-type tyrosine-protein phosphatase T, humanhuman

Predictions only

Length 1,441 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRTO14522 ZDHHC4-203ENST00000396707 1461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
PTPRTO14522 NOP9-202ENST00000396802 1942 ntTSL 5 BASIC25.1■■□□□ 1.61
PTPRTO14522 IFITM3-201ENST00000399808 808 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
PTPRTO14522 BPGM-203ENST00000418040 1870 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.1■■□□□ 1.61
PTPRTO14522 AC007405.3-202ENST00000426475 660 ntTSL 3 BASIC25.1■■□□□ 1.61
PTPRTO14522 AL592309.1-201ENST00000443127 649 ntBASIC25.1■■□□□ 1.61
PTPRTO14522 SLC22A18-206ENST00000449793 1225 ntTSL 5 BASIC25.1■■□□□ 1.61
PTPRTO14522 MECP2-205ENST00000453960 1729 ntTSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
PTPRTO14522 SNX19-207ENST00000528555 1506 ntTSL 2 BASIC25.1■■□□□ 1.61
PTPRTO14522 RPRD1A-209ENST00000590898 1945 ntTSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
PTPRTO14522 MZF1-203ENST00000594234 2385 ntTSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
PTPRTO14522 AC009118.2-201ENST00000613275 655 ntBASIC25.1■■□□□ 1.61
PTPRTO14522 SCARF2-203ENST00000623402 3248 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
PTPRTO14522 LINC01451-201ENST00000623792 534 ntBASIC25.1■■□□□ 1.61
PTPRTO14522 TFAP2D-201ENST00000008391 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
PTPRTO14522 TMEM179-201ENST00000341595 2513 ntTSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
PTPRTO14522 VAV3-202ENST00000370056 4990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
PTPRTO14522 CDK11A-205ENST00000378633 2458 ntTSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
PTPRTO14522 SDCBP-204ENST00000447182 2103 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
PTPRTO14522 CDK1-204ENST00000448257 1948 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
PTPRTO14522 CTD-2194D22.4-201ENST00000514569 1635 ntTSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
PTPRTO14522 TRIM58-201ENST00000366481 3225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
PTPRTO14522 PLTP-202ENST00000372420 1530 ntTSL 2 BASIC25.09■■□□□ 1.61
PTPRTO14522 MAP4K1-203ENST00000586296 1363 ntTSL 5 BASIC25.09■■□□□ 1.61
PTPRTO14522 CRYBA2-201ENST00000295728 893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
PTPRTO14522 AL512638.1-201ENST00000457493 794 ntBASIC25.09■■□□□ 1.61
PTPRTO14522 CD99L2-206ENST00000466436 988 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
PTPRTO14522 AC008378.1-201ENST00000521251 496 ntTSL 5 BASIC25.09■■□□□ 1.61
PTPRTO14522 ERGIC1-212ENST00000523291 586 ntTSL 2 BASIC25.09■■□□□ 1.61
PTPRTO14522 LINC01089-211ENST00000543334 1282 ntTSL 4 BASIC25.09■■□□□ 1.61
PTPRTO14522 ADORA2A-214ENST00000611543 2412 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.09■■□□□ 1.61
PTPRTO14522 GGT3P-201ENST00000412448 2340 ntTSL 2 BASIC25.09■■□□□ 1.61
PTPRTO14522 BPGM-202ENST00000393132 2051 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.09■■□□□ 1.61
PTPRTO14522 PRRT2-212ENST00000636619 2065 ntTSL 5 BASIC25.09■■□□□ 1.61
PTPRTO14522 GPC2-201ENST00000292377 2532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
PTPRTO14522 ANKS3-230ENST00000614075 2387 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.08■■□□□ 1.61
PTPRTO14522 CD40-207ENST00000620709 1522 ntTSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
PTPRTO14522 AKT2-206ENST00000392038 5300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
PTPRTO14522 AL590648.2-201ENST00000427949 2225 ntTSL 2 BASIC25.08■■□□□ 1.61
PTPRTO14522 RNFT2-202ENST00000319176 2180 ntTSL 5 BASIC25.08■■□□□ 1.61
PTPRTO14522 BIRC7-201ENST00000217169 1368 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
PTPRTO14522 SMOC1-201ENST00000361956 2040 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
PTPRTO14522 MECP2-203ENST00000407218 1174 ntTSL 5 BASIC25.08■■□□□ 1.61
PTPRTO14522 AL645941.1-201ENST00000415875 338 ntTSL 3 BASIC25.08■■□□□ 1.61
PTPRTO14522 FALEC-201ENST00000416894 566 ntTSL 3 BASIC25.08■■□□□ 1.61
PTPRTO14522 RN7SL589P-201ENST00000481268 310 ntBASIC25.08■■□□□ 1.61
PTPRTO14522 AC004890.2-204ENST00000481968 304 ntBASIC25.08■■□□□ 1.61
PTPRTO14522 IQSEC2-204ENST00000485377 835 ntTSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
PTPRTO14522 AC079140.1-201ENST00000508039 487 ntBASIC25.08■■□□□ 1.61
PTPRTO14522 MTFR1L-218ENST00000526894 733 ntTSL 4 BASIC25.08■■□□□ 1.61
PTPRTO14522 AC079336.1-201ENST00000583156 420 ntTSL 3 BASIC25.08■■□□□ 1.61
PTPRTO14522 AC243571.2-201ENST00000615265 628 ntTSL 3 BASIC25.08■■□□□ 1.61
PTPRTO14522 MOCS2-202ENST00000396954 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
PTPRTO14522 KCNQ2-205ENST00000360480 2775 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.08■■□□□ 1.6
PTPRTO14522 PPP2R2C-209ENST00000515571 1832 ntTSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
PTPRTO14522 PDLIM3-201ENST00000284767 2589 ntTSL 5 BASIC25.07■■□□□ 1.6
PTPRTO14522 TAS2R41-201ENST00000408916 924 ntAPPRIS P1 BASIC25.07■■□□□ 1.6
PTPRTO14522 LINC00475-203ENST00000417983 703 ntTSL 2 BASIC25.07■■□□□ 1.6
PTPRTO14522 ZNF606-202ENST00000546715 636 ntTSL 4 BASIC25.07■■□□□ 1.6
PTPRTO14522 LINC01128-210ENST00000609139 455 ntTSL 3 BASIC25.07■■□□□ 1.6
PTPRTO14522 SIGIRR-201ENST00000332725 1639 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.07■■□□□ 1.6
PTPRTO14522 ZDHHC4-205ENST00000396713 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
PTPRTO14522 TSPAN4-205ENST00000397406 1426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
PTPRTO14522 RANBP3-220ENST00000591092 1783 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
PTPRTO14522 RUVBL1-202ENST00000464873 2126 ntTSL 2 BASIC25.07■■□□□ 1.6
PTPRTO14522 TDRKH-207ENST00000458431 2768 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
PTPRTO14522 SEPT8-208ENST00000378721 1723 ntTSL 5 BASIC25.06■■□□□ 1.6
PTPRTO14522 EDN3-204ENST00000371028 2397 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC25.06■■□□□ 1.6
PTPRTO14522 KRT28-201ENST00000306658 1685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
PTPRTO14522 UVSSA-209ENST00000512728 1668 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
PTPRTO14522 KRT6C-201ENST00000252250 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
PTPRTO14522 KRT6B-201ENST00000252252 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
PTPRTO14522 CD248-201ENST00000311330 2558 ntAPPRIS P1 BASIC25.06■■□□□ 1.6
PTPRTO14522 ACTB-201ENST00000331789 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
PTPRTO14522 PPT2-246ENST00000375137 1945 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
PTPRTO14522 PLAC9P1-202ENST00000433290 400 ntTSL 2 BASIC25.06■■□□□ 1.6
PTPRTO14522 AL627443.1-201ENST00000456477 1035 ntTSL 3 BASIC25.06■■□□□ 1.6
PTPRTO14522 AF131215.3-201ENST00000532453 639 ntTSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
PTPRTO14522 SIGLEC7-205ENST00000600577 616 ntTSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
PTPRTO14522 ZNF655-225ENST00000626122 705 ntTSL 5 BASIC25.06■■□□□ 1.6
PTPRTO14522 TXNRD3-203ENST00000524230 2950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
PTPRTO14522 CEP55-201ENST00000371485 2638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
PTPRTO14522 LSM12-201ENST00000293406 2308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
PTPRTO14522 TRIM17-204ENST00000366698 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
PTPRTO14522 PSRC1-204ENST00000369909 1742 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
PTPRTO14522 C12orf40-202ENST00000405531 1656 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
PTPRTO14522 ADAM15-207ENST00000368413 1901 ntTSL 5 BASIC25.06■■□□□ 1.6
PTPRTO14522 RGN-202ENST00000352078 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
PTPRTO14522 STMN1-204ENST00000426559 948 ntTSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
PTPRTO14522 PSEN2-206ENST00000472139 1163 ntTSL 5 BASIC25.05■■□□□ 1.6
PTPRTO14522 AC097493.3-201ENST00000509725 367 ntBASIC25.05■■□□□ 1.6
PTPRTO14522 POC1B-GALNT4-201ENST00000547474 2207 ntTSL 2 BASIC25.05■■□□□ 1.6
PTPRTO14522 ZCCHC2-201ENST00000269499 5959 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.05■■□□□ 1.6
PTPRTO14522 AC009779.2-201ENST00000552576 1443 ntTSL 4 BASIC25.05■■□□□ 1.6
PTPRTO14522 GPS1-201ENST00000306823 1842 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
PTPRTO14522 ADRA1A-202ENST00000354550 1765 ntTSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
PTPRTO14522 ESR2-201ENST00000267525 1518 ntTSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
PTPRTO14522 PIGV-201ENST00000078527 2367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
PTPRTO14522 TNNT3-204ENST00000381558 1258 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.04■■□□□ 1.6
PTPRTO14522 KRTAP6-3-201ENST00000391624 636 ntAPPRIS P1 BASIC25.04■■□□□ 1.6
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 31.3 ms