Protein–RNA interactions for Protein: A8MTQ0

NOTO, Homeobox protein notochord, humanhuman

Predictions only

Length 251 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NOTOA8MTQ0 BCL2L11-201ENST00000308659 1522 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
NOTOA8MTQ0 STARD10-218ENST00000543304 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
NOTOA8MTQ0 KCNMA1-219ENST00000480683 2963 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
NOTOA8MTQ0 CA12-203ENST00000422263 2556 ntTSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
NOTOA8MTQ0 MINDY1-201ENST00000312210 2400 ntTSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
NOTOA8MTQ0 INTS14-209ENST00000567744 2419 ntTSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
NOTOA8MTQ0 ADAMTS1-201ENST00000284984 5191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
NOTOA8MTQ0 TRIM74-201ENST00000285805 1350 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
NOTOA8MTQ0 TRIM73-201ENST00000323819 1358 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
NOTOA8MTQ0 ZIC5-201ENST00000267294 4639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
NOTOA8MTQ0 SEC22C-202ENST00000273156 1608 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
NOTOA8MTQ0 NKIRAS1-207ENST00000437230 1898 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.06
NOTOA8MTQ0 PPM1E-201ENST00000308249 6542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
NOTOA8MTQ0 LYSMD4-203ENST00000378904 2122 ntBASIC15.46■□□□□ 0.06
NOTOA8MTQ0 AC021683.3-202ENST00000592572 4440 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.06
NOTOA8MTQ0 ACP2-206ENST00000529444 1719 ntTSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.06
NOTOA8MTQ0 OSGIN2-202ENST00000451899 4266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
NOTOA8MTQ0 MARVELD1-201ENST00000285605 3221 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
NOTOA8MTQ0 FCER2-201ENST00000346664 1596 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
NOTOA8MTQ0 GUCA1A-202ENST00000372958 1575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
NOTOA8MTQ0 FCER2-205ENST00000597921 1560 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
NOTOA8MTQ0 LRPPRC-203ENST00000409946 1848 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
NOTOA8MTQ0 SH2B3-202ENST00000538307 2062 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
NOTOA8MTQ0 PA2G4-201ENST00000303305 2577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
NOTOA8MTQ0 IER2-203ENST00000588173 2934 ntAPPRIS P1 BASIC15.45■□□□□ 0.06
NOTOA8MTQ0 BLOC1S5-202ENST00000397457 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
NOTOA8MTQ0 PLEKHN1-203ENST00000379410 2404 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
NOTOA8MTQ0 SLC39A6-202ENST00000440549 1657 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
NOTOA8MTQ0 TPPP3-204ENST00000562206 1410 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
NOTOA8MTQ0 IL6ST-209ENST00000502326 3007 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
NOTOA8MTQ0 TXNDC11-201ENST00000283033 3140 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
NOTOA8MTQ0 HMGA1-202ENST00000347617 1773 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
NOTOA8MTQ0 GAMT-202ENST00000447102 1769 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
NOTOA8MTQ0 LMNB1-201ENST00000261366 2878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
NOTOA8MTQ0 TSEN34-202ENST00000396383 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
NOTOA8MTQ0 OLFM1-202ENST00000277415 1014 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
NOTOA8MTQ0 C9orf129-201ENST00000375419 1154 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
NOTOA8MTQ0 AC013402.1-201ENST00000456999 561 ntTSL 4 BASIC15.45■□□□□ 0.06
NOTOA8MTQ0 AC080013.1-202ENST00000465477 674 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
NOTOA8MTQ0 USP46-AS1-201ENST00000503051 1048 ntTSL 3 BASIC15.45■□□□□ 0.06
NOTOA8MTQ0 RNA5SP413-201ENST00000516373 109 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
NOTOA8MTQ0 MMAB-206ENST00000540016 945 ntTSL 3 BASIC15.45■□□□□ 0.06
NOTOA8MTQ0 AC022167.3-201ENST00000564485 427 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
NOTOA8MTQ0 TMEM220-AS1-201ENST00000579114 575 ntTSL 4 BASIC15.45■□□□□ 0.06
NOTOA8MTQ0 ICAM2-207ENST00000579687 1154 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.45■□□□□ 0.06
NOTOA8MTQ0 AC008687.5-201ENST00000593746 558 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
NOTOA8MTQ0 HMGXB3-202ENST00000503427 5275 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
NOTOA8MTQ0 EEFSEC-202ENST00000483457 1859 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
NOTOA8MTQ0 PMPCB-201ENST00000249269 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
NOTOA8MTQ0 CSF1-204ENST00000369802 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
NOTOA8MTQ0 JMJD4-206ENST00000615711 2591 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
NOTOA8MTQ0 OGG1-206ENST00000349503 1950 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
NOTOA8MTQ0 CSNK2A2-201ENST00000262506 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
NOTOA8MTQ0 KCNC2-207ENST00000548513 3026 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
NOTOA8MTQ0 DIDO1-201ENST00000266070 8574 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
NOTOA8MTQ0 GRIN2A-201ENST00000330684 5031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
NOTOA8MTQ0 AL603756.1-201ENST00000606511 2163 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
NOTOA8MTQ0 DCLK2-201ENST00000296550 4265 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
NOTOA8MTQ0 RHBDF1-201ENST00000262316 2992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
NOTOA8MTQ0 INSIG1-203ENST00000344756 2623 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
NOTOA8MTQ0 MOCS1-206ENST00000425303 1920 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
NOTOA8MTQ0 ANKRD24-206ENST00000600132 4026 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
NOTOA8MTQ0 COMP-203ENST00000542601 2707 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
NOTOA8MTQ0 BICD2-201ENST00000356884 6427 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
NOTOA8MTQ0 AC026691.1-201ENST00000602502 2017 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
NOTOA8MTQ0 KRT13-201ENST00000246635 1699 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
NOTOA8MTQ0 RNPS1-219ENST00000566397 1685 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
NOTOA8MTQ0 GRB2-201ENST00000316615 3181 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
NOTOA8MTQ0 RGPD6-202ENST00000330331 2848 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
NOTOA8MTQ0 RGPD8-202ENST00000330575 2848 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
NOTOA8MTQ0 SLC1A7-204ENST00000611397 2499 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
NOTOA8MTQ0 OR2C3-203ENST00000617752 2481 ntAPPRIS P1 BASIC15.44■□□□□ 0.06
NOTOA8MTQ0 TRIM67-202ENST00000444294 9320 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
NOTOA8MTQ0 CCNC-207ENST00000518714 1426 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
NOTOA8MTQ0 AMOTL2-211ENST00000513145 2653 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
NOTOA8MTQ0 CBFB-201ENST00000290858 3136 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
NOTOA8MTQ0 RPAIN-203ENST00000381209 1535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
NOTOA8MTQ0 EPB41-205ENST00000373797 2402 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
NOTOA8MTQ0 PKN1-202ENST00000342216 2960 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
NOTOA8MTQ0 AKT1S1-205ENST00000391833 3640 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
NOTOA8MTQ0 CEP76-202ENST00000423709 2197 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
NOTOA8MTQ0 BNC1-201ENST00000345382 4610 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
NOTOA8MTQ0 AC024909.3-201ENST00000611513 2257 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
NOTOA8MTQ0 FUOM-201ENST00000278025 709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
NOTOA8MTQ0 PDZRN3-202ENST00000308537 1136 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
NOTOA8MTQ0 PDCD2-202ENST00000392090 936 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
NOTOA8MTQ0 GTF2A2-203ENST00000396061 758 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
NOTOA8MTQ0 GPM6B-204ENST00000398361 1033 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
NOTOA8MTQ0 IDH1-AS1-202ENST00000448588 489 ntTSL 3 BASIC15.44■□□□□ 0.06
NOTOA8MTQ0 AC234772.2-201ENST00000456532 375 ntTSL 3 BASIC15.44■□□□□ 0.06
NOTOA8MTQ0 ZNF706-206ENST00000519744 785 ntTSL 3 BASIC15.44■□□□□ 0.06
NOTOA8MTQ0 ZNF580-203ENST00000545125 1025 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.44■□□□□ 0.06
NOTOA8MTQ0 WWOX-216ENST00000569818 525 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
NOTOA8MTQ0 RPS15-203ENST00000586096 570 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
NOTOA8MTQ0 NDUFA6-AS1-207ENST00000595777 833 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
NOTOA8MTQ0 GOLGA2P10-205ENST00000618267 983 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
NOTOA8MTQ0 CICP4-201ENST00000447359 2812 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
NOTOA8MTQ0 LYPLA2-205ENST00000374514 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
NOTOA8MTQ0 CLIC5-202ENST00000339561 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
NOTOA8MTQ0 SIN3B-201ENST00000248054 5037 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 34.3 ms