Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y5L0

TNPO3, Transportin-3, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 923 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TNPO3Q9Y5L0 SHBG-211ENST00000574539 938 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
TNPO3Q9Y5L0 AC010463.1-201ENST00000596542 1207 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
TNPO3Q9Y5L0 COQ9-201ENST00000262507 1677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
TNPO3Q9Y5L0 LTBR-207ENST00000539925 1665 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
TNPO3Q9Y5L0 BEND4-201ENST00000502486 8765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
TNPO3Q9Y5L0 HIBCH-201ENST00000359678 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
TNPO3Q9Y5L0 ADO-201ENST00000373783 3627 ntAPPRIS P1 BASIC16.99■□□□□ 0.31
TNPO3Q9Y5L0 SELENBP1-201ENST00000368868 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
TNPO3Q9Y5L0 VPS13B-201ENST00000355155 2822 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
TNPO3Q9Y5L0 NDRG4-202ENST00000356752 1375 ntTSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
TNPO3Q9Y5L0 LINC01979-201ENST00000576738 5271 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
TNPO3Q9Y5L0 PIP5K1C-205ENST00000589578 2933 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
TNPO3Q9Y5L0 HOOK2-202ENST00000397668 2513 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
TNPO3Q9Y5L0 DAPK1-202ENST00000408954 5892 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
TNPO3Q9Y5L0 RNF7-201ENST00000273480 2763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
TNPO3Q9Y5L0 NOMO2-211ENST00000621364 3921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
TNPO3Q9Y5L0 PRAG1-201ENST00000615670 4903 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
TNPO3Q9Y5L0 ZBTB32-201ENST00000262630 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
TNPO3Q9Y5L0 RFXANK-205ENST00000456252 1325 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
TNPO3Q9Y5L0 AC005332.1-201ENST00000577698 1310 ntBASIC16.98■□□□□ 0.31
TNPO3Q9Y5L0 FICD-204ENST00000552695 3347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
TNPO3Q9Y5L0 NLRP6-203ENST00000534750 2936 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
TNPO3Q9Y5L0 KRT8P10-201ENST00000450021 1447 ntBASIC16.98■□□□□ 0.31
TNPO3Q9Y5L0 PTP4A3-201ENST00000329397 2785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
TNPO3Q9Y5L0 SLC7A2-205ENST00000522656 2274 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
TNPO3Q9Y5L0 F12-201ENST00000253496 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
TNPO3Q9Y5L0 PPARD-202ENST00000337400 2041 ntTSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
TNPO3Q9Y5L0 RPS12-201ENST00000230050 631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
TNPO3Q9Y5L0 HBZ-201ENST00000252951 755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
TNPO3Q9Y5L0 CCS-201ENST00000310190 942 ntTSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
TNPO3Q9Y5L0 C18orf32-201ENST00000318240 1128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
TNPO3Q9Y5L0 BOLA1-202ENST00000369152 859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
TNPO3Q9Y5L0 MRPL23-201ENST00000381514 919 ntTSL 3 BASIC16.98■□□□□ 0.31
TNPO3Q9Y5L0 RPL36-202ENST00000394580 556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
TNPO3Q9Y5L0 RPS14-203ENST00000407193 784 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
TNPO3Q9Y5L0 MOGAT1-201ENST00000446656 1048 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
TNPO3Q9Y5L0 PDZD7-203ENST00000470414 1057 ntTSL 2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
TNPO3Q9Y5L0 SMIM4-202ENST00000476842 522 ntTSL 4 BASIC16.98■□□□□ 0.31
TNPO3Q9Y5L0 EEF1D-243ENST00000532400 419 ntTSL 3 BASIC16.98■□□□□ 0.31
TNPO3Q9Y5L0 MYL6-203ENST00000536128 1221 ntTSL 2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
TNPO3Q9Y5L0 ABR-204ENST00000543210 1049 ntTSL 2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
TNPO3Q9Y5L0 ABR-217ENST00000572441 563 ntTSL 4 BASIC16.98■□□□□ 0.31
TNPO3Q9Y5L0 STK25P1-201ENST00000585406 838 ntBASIC16.98■□□□□ 0.31
TNPO3Q9Y5L0 NTF6B-201ENST00000591913 560 ntBASIC16.98■□□□□ 0.31
TNPO3Q9Y5L0 NSMF-204ENST00000371473 3556 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
TNPO3Q9Y5L0 RPH3AL-222ENST00000618002 2578 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
TNPO3Q9Y5L0 SUZ12-201ENST00000322652 4491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
TNPO3Q9Y5L0 TRIM33-201ENST00000358465 8339 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
TNPO3Q9Y5L0 NKIRAS2-207ENST00000449471 1461 ntTSL 2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
TNPO3Q9Y5L0 AL353593.2-201ENST00000602529 1483 ntBASIC16.98■□□□□ 0.31
TNPO3Q9Y5L0 LYPLAL1-201ENST00000366927 1819 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
TNPO3Q9Y5L0 BRD2-201ENST00000374825 4894 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
TNPO3Q9Y5L0 CTNNAL1-204ENST00000374595 2522 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
TNPO3Q9Y5L0 MFGE8-201ENST00000268150 1937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
TNPO3Q9Y5L0 ATXN7-210ENST00000487717 3683 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
TNPO3Q9Y5L0 LARP4B-211ENST00000612396 8546 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
TNPO3Q9Y5L0 FN1-208ENST00000426059 2388 ntTSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
TNPO3Q9Y5L0 HRAT92-201ENST00000452622 3506 ntTSL 2 BASIC16.97■□□□□ 0.31
TNPO3Q9Y5L0 EGR2-203ENST00000439032 2844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
TNPO3Q9Y5L0 CCT6P1-202ENST00000442266 1317 ntTSL 2 BASIC16.97■□□□□ 0.31
TNPO3Q9Y5L0 ELOVL7-205ENST00000508821 3994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
TNPO3Q9Y5L0 KCNQ2-207ENST00000370224 3004 ntTSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
TNPO3Q9Y5L0 AP1S2-201ENST00000329235 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
TNPO3Q9Y5L0 IL2RG-202ENST00000374188 1432 ntTSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
TNPO3Q9Y5L0 MCTP2-205ENST00000543482 1422 ntTSL 2 BASIC16.97■□□□□ 0.31
TNPO3Q9Y5L0 EWSR1-206ENST00000397938 2654 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
TNPO3Q9Y5L0 ADRA1A-206ENST00000380586 2304 ntTSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
TNPO3Q9Y5L0 RABGGTA-201ENST00000216840 2088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
TNPO3Q9Y5L0 DCP1B-201ENST00000280665 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
TNPO3Q9Y5L0 WTAP-205ENST00000614346 1623 ntTSL 2 BASIC16.97■□□□□ 0.31
TNPO3Q9Y5L0 INSIG1-203ENST00000344756 2623 ntTSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
TNPO3Q9Y5L0 KCNV2-201ENST00000382082 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
TNPO3Q9Y5L0 USB1-201ENST00000219281 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
TNPO3Q9Y5L0 TMEM130-202ENST00000345589 2261 ntTSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
TNPO3Q9Y5L0 RGL3-202ENST00000393423 2278 ntTSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
TNPO3Q9Y5L0 HSD17B10-201ENST00000168216 960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
TNPO3Q9Y5L0 PGLS-201ENST00000252603 1028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
TNPO3Q9Y5L0 SNRPA1-201ENST00000254193 1055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
TNPO3Q9Y5L0 KCNK7-202ENST00000342202 1283 ntTSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
TNPO3Q9Y5L0 RPA2-202ENST00000373909 1162 ntTSL 3 BASIC16.97■□□□□ 0.31
TNPO3Q9Y5L0 MPIG6B-202ENST00000375805 668 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
TNPO3Q9Y5L0 FXN-203ENST00000396366 922 ntTSL 2 BASIC16.97■□□□□ 0.31
TNPO3Q9Y5L0 PTK2-216ENST00000519881 863 ntTSL 3 BASIC16.97■□□□□ 0.31
TNPO3Q9Y5L0 AC013356.2-201ENST00000559730 729 ntTSL 3 BASIC16.97■□□□□ 0.31
TNPO3Q9Y5L0 ARL16-209ENST00000573715 763 ntTSL 3 BASIC16.97■□□□□ 0.31
TNPO3Q9Y5L0 ARL16-211ENST00000576135 694 ntTSL 3 BASIC16.97■□□□□ 0.31
TNPO3Q9Y5L0 EEF2KMT-206ENST00000587133 873 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.97■□□□□ 0.31
TNPO3Q9Y5L0 KCNE1B-204ENST00000623803 811 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
TNPO3Q9Y5L0 TPD52L1-213ENST00000534000 2356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
TNPO3Q9Y5L0 PORCN-205ENST00000367574 1368 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
TNPO3Q9Y5L0 AC011840.1-202ENST00000436477 1351 ntTSL 2 BASIC16.97■□□□□ 0.31
TNPO3Q9Y5L0 PORCN-214ENST00000537758 1371 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
TNPO3Q9Y5L0 CLDN7-203ENST00000538261 1923 ntTSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
TNPO3Q9Y5L0 C9orf43-202ENST00000374165 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
TNPO3Q9Y5L0 PDLIM2-206ENST00000409141 1463 ntTSL 2 BASIC16.97■□□□□ 0.31
TNPO3Q9Y5L0 RBCK1-202ENST00000356286 2774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
TNPO3Q9Y5L0 SLC47A1-209ENST00000575023 2224 ntTSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
TNPO3Q9Y5L0 ZNF423-206ENST00000563137 4911 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
TNPO3Q9Y5L0 SLC8A2-201ENST00000236877 5234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
TNPO3Q9Y5L0 TSC2-204ENST00000401874 5421 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 46.9 ms