Protein–RNA interactions for Protein: Q9UPP1

PHF8, Histone lysine demethylase PHF8, humanhuman

Predictions only

Length 1,060 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PHF8Q9UPP1 ZNF606-202ENST00000546715 636 ntTSL 4 BASIC23.48■■□□□ 1.35
PHF8Q9UPP1 IER3IP1-202ENST00000639845 832 ntTSL 2 BASIC23.48■■□□□ 1.35
PHF8Q9UPP1 ADPGK-201ENST00000311669 2557 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.48■■□□□ 1.35
PHF8Q9UPP1 ZNF623-203ENST00000526926 2612 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.48■■□□□ 1.35
PHF8Q9UPP1 ILF3-217ENST00000589998 2622 ntTSL 2 BASIC23.48■■□□□ 1.35
PHF8Q9UPP1 RNF183-203ENST00000441031 1366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
PHF8Q9UPP1 CYP4F2-201ENST00000011989 2067 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
PHF8Q9UPP1 THNSL2-202ENST00000343544 2052 ntTSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
PHF8Q9UPP1 CCDC94-201ENST00000262962 1434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
PHF8Q9UPP1 POLR2J4-203ENST00000326391 1422 ntTSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
PHF8Q9UPP1 FLJ13224-201ENST00000313737 1514 ntBASIC23.48■■□□□ 1.35
PHF8Q9UPP1 PLTP-202ENST00000372420 1530 ntTSL 2 BASIC23.48■■□□□ 1.35
PHF8Q9UPP1 CHRAC1-201ENST00000220913 2488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
PHF8Q9UPP1 AC133561.2-201ENST00000380145 1802 ntTSL 2 BASIC23.47■■□□□ 1.35
PHF8Q9UPP1 SELENOF-208ENST00000616787 1835 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.47■■□□□ 1.35
PHF8Q9UPP1 KCNH1-210ENST00000640044 1818 ntTSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
PHF8Q9UPP1 ISOC1-201ENST00000173527 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
PHF8Q9UPP1 NPNT-203ENST00000427316 2481 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.47■■□□□ 1.35
PHF8Q9UPP1 ARRDC2-201ENST00000222250 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
PHF8Q9UPP1 POP7-201ENST00000303151 927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
PHF8Q9UPP1 CCDC107-201ENST00000327351 804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
PHF8Q9UPP1 TMEM191A-202ENST00000419950 663 ntTSL 3 BASIC23.47■■□□□ 1.35
PHF8Q9UPP1 Z97056.1-201ENST00000433230 556 ntTSL 2 BASIC23.47■■□□□ 1.35
PHF8Q9UPP1 SNHG11-207ENST00000434729 1058 ntTSL 4 BASIC23.47■■□□□ 1.35
PHF8Q9UPP1 AL391335.1-201ENST00000504583 535 ntTSL 4 BASIC23.47■■□□□ 1.35
PHF8Q9UPP1 IGHV3-42-201ENST00000520410 361 ntBASIC23.47■■□□□ 1.35
PHF8Q9UPP1 ZNF667-AS1-202ENST00000586091 678 ntTSL 2 BASIC23.47■■□□□ 1.35
PHF8Q9UPP1 AL158211.3-201ENST00000607385 239 ntBASIC23.47■■□□□ 1.35
PHF8Q9UPP1 OPN5-206ENST00000638973 1090 ntTSL 5 BASIC23.47■■□□□ 1.35
PHF8Q9UPP1 PRKAR1B-204ENST00000406797 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
PHF8Q9UPP1 JMJD6-205ENST00000585429 1330 ntTSL 5 BASIC23.47■■□□□ 1.35
PHF8Q9UPP1 ODC1-201ENST00000234111 2653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
PHF8Q9UPP1 CXXC5-201ENST00000302517 2658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
PHF8Q9UPP1 UBAC2-203ENST00000403766 1375 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.47■■□□□ 1.35
PHF8Q9UPP1 BORCS8-203ENST00000477565 1489 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
PHF8Q9UPP1 GUCD1-203ENST00000404664 1606 ntTSL 2 BASIC23.47■■□□□ 1.35
PHF8Q9UPP1 CD14-201ENST00000302014 1886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
PHF8Q9UPP1 TUBB2B-201ENST00000259818 2020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
PHF8Q9UPP1 DTNB-209ENST00000407038 2294 ntTSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
PHF8Q9UPP1 PCSK6-217ENST00000618548 4269 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
PHF8Q9UPP1 SSB-201ENST00000260956 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
PHF8Q9UPP1 KRT28-201ENST00000306658 1685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
PHF8Q9UPP1 RAB39A-201ENST00000320578 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
PHF8Q9UPP1 PDGFA-201ENST00000354513 1308 ntTSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
PHF8Q9UPP1 LDOC1-201ENST00000370526 1381 ntAPPRIS P1 BASIC23.46■■□□□ 1.35
PHF8Q9UPP1 TNNC2-202ENST00000372557 780 ntTSL 3 BASIC23.46■■□□□ 1.35
PHF8Q9UPP1 PPT2-246ENST00000375137 1945 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
PHF8Q9UPP1 MAPK15-202ENST00000395107 834 ntTSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
PHF8Q9UPP1 ZNF74-203ENST00000403682 2789 ntTSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
PHF8Q9UPP1 CGREF1-206ENST00000405600 1346 ntAPPRIS P2 TSL 4 BASIC23.46■■□□□ 1.35
PHF8Q9UPP1 SPDYE7P-202ENST00000420373 878 ntBASIC23.46■■□□□ 1.35
PHF8Q9UPP1 SPDYE2-202ENST00000432940 1209 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
PHF8Q9UPP1 SPDYE2B-201ENST00000436228 1209 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
PHF8Q9UPP1 SPDYE5-201ENST00000455862 1209 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
PHF8Q9UPP1 SUSD4-208ENST00000494793 1833 ntTSL 5 BASIC23.46■■□□□ 1.35
PHF8Q9UPP1 FAM86DP-207ENST00000497543 2152 ntTSL 2 BASIC23.46■■□□□ 1.35
PHF8Q9UPP1 TSC22D3-213ENST00000506081 956 ntTSL 5 BASIC23.46■■□□□ 1.35
PHF8Q9UPP1 OSR2-209ENST00000522510 1528 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.46■■□□□ 1.35
PHF8Q9UPP1 THAP3-201ENST00000054650 1366 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
PHF8Q9UPP1 MNT-208ENST00000575394 606 ntTSL 4 BASIC23.46■■□□□ 1.35
PHF8Q9UPP1 HDDC2-203ENST00000608284 538 ntTSL 3 BASIC23.46■■□□□ 1.35
PHF8Q9UPP1 LINC00466-208ENST00000635218 1217 ntTSL 5 BASIC23.46■■□□□ 1.35
PHF8Q9UPP1 UBTD2-201ENST00000393792 3301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
PHF8Q9UPP1 GTDC1-219ENST00000542155 2677 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.46■■□□□ 1.35
PHF8Q9UPP1 RRP7BP-201ENST00000357802 2375 ntTSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.35
PHF8Q9UPP1 APOA5-201ENST00000227665 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.35
PHF8Q9UPP1 RNF167-205ENST00000571816 1728 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.45■■□□□ 1.34
PHF8Q9UPP1 BCS1L-212ENST00000439945 1483 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.45■■□□□ 1.34
PHF8Q9UPP1 PSMD6-210ENST00000492933 1495 ntTSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
PHF8Q9UPP1 MAST2-201ENST00000361297 5738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
PHF8Q9UPP1 P2RY2-201ENST00000311131 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
PHF8Q9UPP1 SRP19-201ENST00000282999 937 ntTSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
PHF8Q9UPP1 C1orf43-203ENST00000368516 872 ntTSL 2 BASIC23.45■■□□□ 1.34
PHF8Q9UPP1 ARRB2-203ENST00000381488 1236 ntTSL 2 BASIC23.45■■□□□ 1.34
PHF8Q9UPP1 NDUFAF3-203ENST00000395458 808 ntTSL 2 BASIC23.45■■□□□ 1.34
PHF8Q9UPP1 CXCL1-201ENST00000395761 1097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
PHF8Q9UPP1 TAS2R41-201ENST00000408916 924 ntAPPRIS P1 BASIC23.45■■□□□ 1.34
PHF8Q9UPP1 DANCR-201ENST00000411630 904 ntTSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
PHF8Q9UPP1 PSMA8-203ENST00000415576 1280 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
PHF8Q9UPP1 GATD1-206ENST00000526325 756 ntTSL 5 BASIC23.45■■□□□ 1.34
PHF8Q9UPP1 RPL13-214ENST00000567815 712 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.45■■□□□ 1.34
PHF8Q9UPP1 AC005412.3-201ENST00000580309 715 ntBASIC23.45■■□□□ 1.34
PHF8Q9UPP1 IRF1-211ENST00000613424 821 ntTSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
PHF8Q9UPP1 ARMC9-201ENST00000349938 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
PHF8Q9UPP1 GABRB1-201ENST00000295454 2143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
PHF8Q9UPP1 ZNF281-202ENST00000367352 2933 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.45■■□□□ 1.34
PHF8Q9UPP1 ATP6V1D-201ENST00000216442 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
PHF8Q9UPP1 TMEM259-209ENST00000592590 2509 ntTSL 5 BASIC23.44■■□□□ 1.34
PHF8Q9UPP1 RETREG2-203ENST00000430297 4618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
PHF8Q9UPP1 KSR1-205ENST00000509603 2731 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.44■■□□□ 1.34
PHF8Q9UPP1 ARF1-214ENST00000541182 2006 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.44■■□□□ 1.34
PHF8Q9UPP1 FNBP1-201ENST00000355681 1977 ntTSL 2 BASIC23.44■■□□□ 1.34
PHF8Q9UPP1 SP9-201ENST00000394967 2554 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.44■■□□□ 1.34
PHF8Q9UPP1 ARHGAP5-203ENST00000396582 5786 ntTSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
PHF8Q9UPP1 EDF1-203ENST00000371649 790 ntTSL 2 BASIC23.44■■□□□ 1.34
PHF8Q9UPP1 ITGB2-204ENST00000397846 422 ntTSL 2 BASIC23.44■■□□□ 1.34
PHF8Q9UPP1 CYB5A-203ENST00000397914 619 ntTSL 3 BASIC23.44■■□□□ 1.34
PHF8Q9UPP1 MECP2-203ENST00000407218 1174 ntTSL 5 BASIC23.44■■□□□ 1.34
PHF8Q9UPP1 AC097493.3-201ENST00000509725 367 ntBASIC23.44■■□□□ 1.34
PHF8Q9UPP1 C8orf46-213ENST00000521495 557 ntTSL 4 BASIC23.44■■□□□ 1.34
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 30 ms