Protein–RNA interactions for Protein: Q9ULD4

BRPF3, Bromodomain and PHD finger-containing protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 1,205 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BRPF3Q9ULD4 AC005091.1-201ENST00000441955 1190 ntTSL 3 BASIC21.2■□□□□ 0.98
BRPF3Q9ULD4 COLCA2-205ENST00000614153 1264 ntTSL 3 BASIC21.2■□□□□ 0.98
BRPF3Q9ULD4 MALAT1-215ENST00000619449 794 ntTSL 3 BASIC21.2■□□□□ 0.98
BRPF3Q9ULD4 CBFB-201ENST00000290858 3136 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
BRPF3Q9ULD4 MEN1-207ENST00000377326 3150 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.2■□□□□ 0.98
BRPF3Q9ULD4 NRSN2-202ENST00000382291 2088 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.2■□□□□ 0.98
BRPF3Q9ULD4 SMIM24-201ENST00000215531 1329 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
BRPF3Q9ULD4 EFNB3-201ENST00000226091 3222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
BRPF3Q9ULD4 SSB-201ENST00000260956 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
BRPF3Q9ULD4 REEP4-201ENST00000306306 1710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
BRPF3Q9ULD4 EWSAT1-206ENST00000558922 1725 ntTSL 5 BASIC21.2■□□□□ 0.98
BRPF3Q9ULD4 CES1-202ENST00000361503 1835 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
BRPF3Q9ULD4 DHFR-201ENST00000439211 3917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
BRPF3Q9ULD4 DCST1-201ENST00000295542 2279 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.2■□□□□ 0.98
BRPF3Q9ULD4 PNCK-203ENST00000370145 1455 ntTSL 2 BASIC21.2■□□□□ 0.98
BRPF3Q9ULD4 EGFR-203ENST00000344576 2864 ntTSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
BRPF3Q9ULD4 ARHGAP44-202ENST00000340825 4211 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
BRPF3Q9ULD4 ARHGAP44-203ENST00000379672 4228 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
BRPF3Q9ULD4 SENP2-201ENST00000296257 5717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
BRPF3Q9ULD4 PDE12-202ENST00000487257 3040 ntTSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
BRPF3Q9ULD4 FBXL17-201ENST00000359660 4510 ntTSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
BRPF3Q9ULD4 STK10-201ENST00000176763 6060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
BRPF3Q9ULD4 SNTB2-201ENST00000336278 9789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
BRPF3Q9ULD4 PPT2-247ENST00000375143 1754 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.19■□□□□ 0.98
BRPF3Q9ULD4 IGLL1-201ENST00000249053 716 ntTSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
BRPF3Q9ULD4 ATP6V0C-201ENST00000330398 1175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
BRPF3Q9ULD4 UBL5-201ENST00000358666 513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
BRPF3Q9ULD4 IGHGP-201ENST00000390555 1178 ntBASIC21.19■□□□□ 0.98
BRPF3Q9ULD4 UBE2J2-205ENST00000400930 1021 ntTSL 5 BASIC21.19■□□□□ 0.98
BRPF3Q9ULD4 CRELD2-204ENST00000407217 1230 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
BRPF3Q9ULD4 ACOT7-202ENST00000377842 1813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
BRPF3Q9ULD4 GSTM4-201ENST00000326729 1321 ntTSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
BRPF3Q9ULD4 NCCRP1-201ENST00000339852 1978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
BRPF3Q9ULD4 SOWAHB-201ENST00000334306 3220 ntAPPRIS P1 BASIC21.19■□□□□ 0.98
BRPF3Q9ULD4 SCARB1-202ENST00000339570 3329 ntTSL 5 BASIC21.19■□□□□ 0.98
BRPF3Q9ULD4 WNT8A-204ENST00000506684 1543 ntTSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
BRPF3Q9ULD4 EPB41L3-204ENST00000540638 3370 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
BRPF3Q9ULD4 SLA2-202ENST00000360672 2171 ntTSL 5 BASIC21.19■□□□□ 0.98
BRPF3Q9ULD4 CRYL1-202ENST00000382812 1581 ntTSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
BRPF3Q9ULD4 TCF25-201ENST00000263346 2233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
BRPF3Q9ULD4 ARHGEF28-203ENST00000426542 6118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
BRPF3Q9ULD4 SEL1L-204ENST00000555824 1631 ntTSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
BRPF3Q9ULD4 FAM72C-201ENST00000369175 1658 ntTSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
BRPF3Q9ULD4 FAM72B-207ENST00000619376 1659 ntTSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
BRPF3Q9ULD4 GTPBP3-201ENST00000324894 2579 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
BRPF3Q9ULD4 CSNK1A1-202ENST00000377843 2559 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
BRPF3Q9ULD4 MAPK3-212ENST00000484663 2567 ntTSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
BRPF3Q9ULD4 PNMA6E-202ENST00000633844 2596 ntTSL 3 BASIC21.18■□□□□ 0.98
BRPF3Q9ULD4 CAP2-208ENST00000611958 2686 ntTSL 2 BASIC21.18■□□□□ 0.98
BRPF3Q9ULD4 PCIF1-201ENST00000372409 2747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
BRPF3Q9ULD4 TNKS-211ENST00000520408 1964 ntTSL 2 BASIC21.18■□□□□ 0.98
BRPF3Q9ULD4 AC100803.2-201ENST00000562459 1963 ntBASIC21.18■□□□□ 0.98
BRPF3Q9ULD4 CHRNA7-207ENST00000635884 1975 ntTSL 5 BASIC21.18■□□□□ 0.98
BRPF3Q9ULD4 DFNA5-203ENST00000409970 2005 ntTSL 5 BASIC21.18■□□□□ 0.98
BRPF3Q9ULD4 RALGAPA1-219ENST00000637992 8512 ntTSL 5 BASIC21.18■□□□□ 0.98
BRPF3Q9ULD4 RBPMS-204ENST00000397323 2941 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
BRPF3Q9ULD4 DDRGK1-202ENST00000380201 1128 ntTSL 2 BASIC21.18■□□□□ 0.98
BRPF3Q9ULD4 BECN2-201ENST00000419583 1296 ntAPPRIS P1 BASIC21.18■□□□□ 0.98
BRPF3Q9ULD4 AP003733.1-201ENST00000491725 852 ntBASIC21.18■□□□□ 0.98
BRPF3Q9ULD4 LINC01238-205ENST00000567549 1107 ntBASIC21.18■□□□□ 0.98
BRPF3Q9ULD4 RPARP-AS1-206ENST00000596366 631 ntTSL 3 BASIC21.18■□□□□ 0.98
BRPF3Q9ULD4 GFOD2-207ENST00000602855 819 ntTSL 3 BASIC21.18■□□□□ 0.98
BRPF3Q9ULD4 ZACN-201ENST00000334586 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
BRPF3Q9ULD4 NTMT1-203ENST00000372483 1315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
BRPF3Q9ULD4 TRIM36-202ENST00000379617 1322 ntTSL 2 BASIC21.18■□□□□ 0.98
BRPF3Q9ULD4 EML3-202ENST00000394773 3256 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
BRPF3Q9ULD4 TRIM13-206ENST00000457662 1489 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
BRPF3Q9ULD4 MED25-212ENST00000618715 1467 ntTSL 5 BASIC21.18■□□□□ 0.98
BRPF3Q9ULD4 RASA4-204ENST00000462172 2634 ntTSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
BRPF3Q9ULD4 AL079301.1-201ENST00000424580 1633 ntTSL 2 BASIC21.18■□□□□ 0.98
BRPF3Q9ULD4 MELTF-201ENST00000296350 3963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
BRPF3Q9ULD4 RHOV-201ENST00000220507 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
BRPF3Q9ULD4 LINC02228-204ENST00000642115 2962 ntBASIC21.18■□□□□ 0.98
BRPF3Q9ULD4 PLAGL1-206ENST00000416623 3237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
BRPF3Q9ULD4 LUC7L3-201ENST00000240304 1972 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.17■□□□□ 0.98
BRPF3Q9ULD4 PEX14-201ENST00000356607 1985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
BRPF3Q9ULD4 TTYH2-206ENST00000529107 2015 ntTSL 2 BASIC21.17■□□□□ 0.98
BRPF3Q9ULD4 AC104809.2-201ENST00000418218 2274 ntTSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
BRPF3Q9ULD4 PSMD12-202ENST00000357146 2437 ntTSL 2 BASIC21.17■□□□□ 0.98
BRPF3Q9ULD4 LRRC57-204ENST00000563454 2407 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.17■□□□□ 0.98
BRPF3Q9ULD4 FAM222B-211ENST00000582266 2613 ntTSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
BRPF3Q9ULD4 FDFT1-224ENST00000618539 2660 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.17■□□□□ 0.98
BRPF3Q9ULD4 TLE2-201ENST00000262953 2705 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
BRPF3Q9ULD4 AGAP6-201ENST00000374056 2703 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
BRPF3Q9ULD4 HEYL-201ENST00000372852 3661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
BRPF3Q9ULD4 DARS-AS1-202ENST00000419808 772 ntTSL 5 BASIC21.17■□□□□ 0.98
BRPF3Q9ULD4 AC092159.3-201ENST00000439196 571 ntTSL 4 BASIC21.17■□□□□ 0.98
BRPF3Q9ULD4 ACY1-210ENST00000494103 1298 ntTSL 3 BASIC21.17■□□□□ 0.98
BRPF3Q9ULD4 DUTP2-201ENST00000519164 463 ntBASIC21.17■□□□□ 0.98
BRPF3Q9ULD4 MOK-234ENST00000524370 1165 ntTSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
BRPF3Q9ULD4 C17orf49-208ENST00000552402 760 ntTSL 2 BASIC21.17■□□□□ 0.98
BRPF3Q9ULD4 CLN6-204ENST00000564752 900 ntTSL 3 BASIC21.17■□□□□ 0.98
BRPF3Q9ULD4 MIR2117HG-201ENST00000588060 506 ntTSL 4 BASIC21.17■□□□□ 0.98
BRPF3Q9ULD4 CLN6-214ENST00000636314 442 ntTSL 3 BASIC21.17■□□□□ 0.98
BRPF3Q9ULD4 EMX1-202ENST00000394111 1528 ntTSL 3 BASIC21.17■□□□□ 0.98
BRPF3Q9ULD4 LINC00311-201ENST00000366314 1566 ntTSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
BRPF3Q9ULD4 HLA-DQB1-201ENST00000374943 1656 ntBASIC21.17■□□□□ 0.98
BRPF3Q9ULD4 RNPS1-205ENST00000561718 1806 ntTSL 3 BASIC21.17■□□□□ 0.98
BRPF3Q9ULD4 CFL1-203ENST00000525451 1878 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.17■□□□□ 0.98
BRPF3Q9ULD4 CLDND1-204ENST00000394185 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.17■□□□□ 0.98
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 63.2 ms