Protein–RNA interactions for Protein: Q9UEE9

CFDP1, Craniofacial development protein 1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 299 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CFDP1Q9UEE9 PAPD5-203ENST00000561678 2916 ntTSL 5 BASIC26.16■■□□□ 1.78
CFDP1Q9UEE9 AC090286.1-201ENST00000354432 1489 ntTSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
CFDP1Q9UEE9 NPM2-209ENST00000521157 1484 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC26.16■■□□□ 1.78
CFDP1Q9UEE9 ADGRL1-202ENST00000361434 5610 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
CFDP1Q9UEE9 LYSMD4-203ENST00000378904 2122 ntBASIC26.15■■□□□ 1.78
CFDP1Q9UEE9 OTUD1-201ENST00000376495 2933 ntAPPRIS P1 BASIC26.15■■□□□ 1.78
CFDP1Q9UEE9 LINC01143-201ENST00000449073 625 ntTSL 2 BASIC26.15■■□□□ 1.78
CFDP1Q9UEE9 ITPA-203ENST00000455664 729 ntTSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
CFDP1Q9UEE9 OST4-203ENST00000456793 561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
CFDP1Q9UEE9 IGLL5-201ENST00000526893 1050 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
CFDP1Q9UEE9 IGLL5-202ENST00000531372 882 ntTSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
CFDP1Q9UEE9 MIR4515-201ENST00000584082 81 ntBASIC26.15■■□□□ 1.78
CFDP1Q9UEE9 GPS1-201ENST00000306823 1842 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
CFDP1Q9UEE9 MAP4K1-203ENST00000586296 1363 ntTSL 5 BASIC26.15■■□□□ 1.78
CFDP1Q9UEE9 PLXNB2-214ENST00000614805 1387 ntTSL 5 BASIC26.15■■□□□ 1.78
CFDP1Q9UEE9 FAM189B-204ENST00000368368 2609 ntTSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
CFDP1Q9UEE9 ZNF510-203ENST00000375231 5616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
CFDP1Q9UEE9 THNSL2-202ENST00000343544 2052 ntTSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
CFDP1Q9UEE9 RNFT2-202ENST00000319176 2180 ntTSL 5 BASIC26.14■■□□□ 1.78
CFDP1Q9UEE9 COMMD5-202ENST00000402718 1305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.78
CFDP1Q9UEE9 TNFRSF8-202ENST00000413146 2363 ntTSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.78
CFDP1Q9UEE9 WTAP-205ENST00000614346 1623 ntTSL 2 BASIC26.14■■□□□ 1.78
CFDP1Q9UEE9 DLGAP4-204ENST00000373913 5056 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.78
CFDP1Q9UEE9 TFAMP1-201ENST00000412727 736 ntBASIC26.14■■□□□ 1.78
CFDP1Q9UEE9 AC005237.2-201ENST00000434368 219 ntBASIC26.14■■□□□ 1.78
CFDP1Q9UEE9 DUT-210ENST00000559935 569 ntTSL 3 BASIC26.14■■□□□ 1.78
CFDP1Q9UEE9 AC005759.1-201ENST00000594805 855 ntTSL 3 BASIC26.14■■□□□ 1.78
CFDP1Q9UEE9 MTX1-207ENST00000609421 1085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.78
CFDP1Q9UEE9 PSMD6-210ENST00000492933 1495 ntTSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.78
CFDP1Q9UEE9 TEX264-202ENST00000395057 1555 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.78
CFDP1Q9UEE9 LSP1-201ENST00000311604 1699 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.78
CFDP1Q9UEE9 RBM26-207ENST00000622611 5230 ntTSL 2 BASIC26.14■■□□□ 1.78
CFDP1Q9UEE9 EWSR1-202ENST00000332035 1989 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.14■■□□□ 1.77
CFDP1Q9UEE9 NKD2-202ENST00000296849 2155 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.77
CFDP1Q9UEE9 ARSA-204ENST00000395621 1918 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.14■■□□□ 1.77
CFDP1Q9UEE9 AHRR-209ENST00000512529 1912 ntTSL 5 BASIC26.14■■□□□ 1.77
CFDP1Q9UEE9 POLR1D-220ENST00000637071 1943 ntTSL 5 BASIC26.14■■□□□ 1.77
CFDP1Q9UEE9 REEP1-208ENST00000538924 1702 ntTSL 5 BASIC26.14■■□□□ 1.77
CFDP1Q9UEE9 KRT6C-201ENST00000252250 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
CFDP1Q9UEE9 KRT6B-201ENST00000252252 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
CFDP1Q9UEE9 PGP-201ENST00000333503 2727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
CFDP1Q9UEE9 YAP1-202ENST00000345877 5284 ntTSL 5 BASIC26.13■■□□□ 1.77
CFDP1Q9UEE9 IFNL1-201ENST00000333625 857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
CFDP1Q9UEE9 CLIC1-208ENST00000375784 1254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
CFDP1Q9UEE9 HNRNPFP1-201ENST00000391730 1133 ntBASIC26.13■■□□□ 1.77
CFDP1Q9UEE9 AL592309.1-201ENST00000443127 649 ntBASIC26.13■■□□□ 1.77
CFDP1Q9UEE9 RN7SL589P-201ENST00000481268 310 ntBASIC26.13■■□□□ 1.77
CFDP1Q9UEE9 AP000275.2-202ENST00000553001 929 ntTSL 5 BASIC26.13■■□□□ 1.77
CFDP1Q9UEE9 AC090515.4-201ENST00000558042 450 ntTSL 3 BASIC26.13■■□□□ 1.77
CFDP1Q9UEE9 INO80E-210ENST00000567705 880 ntTSL 3 BASIC26.13■■□□□ 1.77
CFDP1Q9UEE9 LMO7-AS1-202ENST00000568735 467 ntTSL 3 BASIC26.13■■□□□ 1.77
CFDP1Q9UEE9 AC004771.3-201ENST00000574260 551 ntTSL 4 BASIC26.13■■□□□ 1.77
CFDP1Q9UEE9 FOSB-211ENST00000592436 1057 ntTSL 5 BASIC26.13■■□□□ 1.77
CFDP1Q9UEE9 PGPEP1-209ENST00000604499 769 ntTSL 5 BASIC26.13■■□□□ 1.77
CFDP1Q9UEE9 OPN5-206ENST00000638973 1090 ntTSL 5 BASIC26.13■■□□□ 1.77
CFDP1Q9UEE9 ABALON-201ENST00000629058 1903 ntBASIC26.13■■□□□ 1.77
CFDP1Q9UEE9 SIGIRR-201ENST00000332725 1639 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.13■■□□□ 1.77
CFDP1Q9UEE9 FANCA-203ENST00000389302 1641 ntTSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
CFDP1Q9UEE9 FXYD6-204ENST00000526014 2171 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
CFDP1Q9UEE9 WDR45-234ENST00000634838 1545 ntTSL 5 BASIC26.13■■□□□ 1.77
CFDP1Q9UEE9 RARA-201ENST00000254066 2414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
CFDP1Q9UEE9 SIL1-201ENST00000265195 1895 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.13■■□□□ 1.77
CFDP1Q9UEE9 ELP5-201ENST00000354429 1304 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC26.13■■□□□ 1.77
CFDP1Q9UEE9 GRAP2-202ENST00000407075 1304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
CFDP1Q9UEE9 RAI2-201ENST00000331511 2317 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.13■■□□□ 1.77
CFDP1Q9UEE9 ZNF346-208ENST00000511834 2306 ntTSL 5 BASIC26.13■■□□□ 1.77
CFDP1Q9UEE9 CTTN-203ENST00000376561 2247 ntTSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
CFDP1Q9UEE9 AL590648.2-201ENST00000427949 2225 ntTSL 2 BASIC26.12■■□□□ 1.77
CFDP1Q9UEE9 AFDN-202ENST00000351017 5823 ntTSL 5 BASIC26.12■■□□□ 1.77
CFDP1Q9UEE9 PCGF2-206ENST00000618941 1499 ntTSL 5 BASIC26.12■■□□□ 1.77
CFDP1Q9UEE9 SLC47A2-201ENST00000325411 2258 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
CFDP1Q9UEE9 LINC01657-201ENST00000457217 1809 ntTSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
CFDP1Q9UEE9 SLC1A6-210ENST00000600144 1735 ntTSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
CFDP1Q9UEE9 METTL26-202ENST00000338401 544 ntTSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
CFDP1Q9UEE9 HMGA1P7-201ENST00000406908 502 ntBASIC26.12■■□□□ 1.77
CFDP1Q9UEE9 FAM58DP-201ENST00000428076 619 ntBASIC26.12■■□□□ 1.77
CFDP1Q9UEE9 REEP2-206ENST00000506158 1021 ntTSL 2 BASIC26.12■■□□□ 1.77
CFDP1Q9UEE9 NDUFAF2-203ENST00000511107 586 ntTSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
CFDP1Q9UEE9 SFTPC-204ENST00000520605 519 ntTSL 3 BASIC26.12■■□□□ 1.77
CFDP1Q9UEE9 SFTPC-210ENST00000524255 681 ntTSL 2 BASIC26.12■■□□□ 1.77
CFDP1Q9UEE9 DUX4L27-201ENST00000554796 1261 ntBASIC26.12■■□□□ 1.77
CFDP1Q9UEE9 AL135744.1-201ENST00000565098 629 ntBASIC26.12■■□□□ 1.77
CFDP1Q9UEE9 CD7-202ENST00000578509 925 ntTSL 3 BASIC26.12■■□□□ 1.77
CFDP1Q9UEE9 ZNF517-201ENST00000359971 2335 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC26.12■■□□□ 1.77
CFDP1Q9UEE9 PDE6B-202ENST00000429163 2120 ntTSL 2 BASIC26.12■■□□□ 1.77
CFDP1Q9UEE9 HBEGF-201ENST00000230990 2386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
CFDP1Q9UEE9 TPGS2-220ENST00000610723 1426 ntTSL 3 BASIC26.12■■□□□ 1.77
CFDP1Q9UEE9 WDR53-201ENST00000332629 1679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
CFDP1Q9UEE9 APLP2-210ENST00000528499 2530 ntTSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
CFDP1Q9UEE9 PTPRC-206ENST00000413409 1338 ntTSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
CFDP1Q9UEE9 TDRKH-207ENST00000458431 2768 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
CFDP1Q9UEE9 DLK1-202ENST00000341267 4722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
CFDP1Q9UEE9 LINC00574-201ENST00000420557 2318 ntTSL 2 BASIC26.11■■□□□ 1.77
CFDP1Q9UEE9 SYBU-224ENST00000529690 1983 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.11■■□□□ 1.77
CFDP1Q9UEE9 SEMA6C-209ENST00000613223 1950 ntTSL 5 BASIC26.11■■□□□ 1.77
CFDP1Q9UEE9 MZF1-203ENST00000594234 2385 ntTSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
CFDP1Q9UEE9 NPM1-201ENST00000296930 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
CFDP1Q9UEE9 RSRP1-201ENST00000243189 1502 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
CFDP1Q9UEE9 COQ6-220ENST00000629426 1538 ntTSL 5 BASIC26.11■■□□□ 1.77
CFDP1Q9UEE9 PDE8A-202ENST00000339708 2663 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 40.9 ms