Protein–RNA interactions for Protein: Q9P298

HIGD1B, HIG1 domain family member 1B, humanhuman

Predictions only

Length 99 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HIGD1BQ9P298 EPHA5-202ENST00000354839 3427 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.5
HIGD1BQ9P298 SYT3-201ENST00000338916 2915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.5
HIGD1BQ9P298 ZFAND6-211ENST00000559157 1559 ntTSL 2 BASIC11.96□□□□□ -0.5
HIGD1BQ9P298 GMPPA-201ENST00000313597 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.5
HIGD1BQ9P298 CCDC183-AS1-201ENST00000414656 2386 ntTSL 2 BASIC11.96□□□□□ -0.5
HIGD1BQ9P298 CACNA1A-221ENST00000636012 7500 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.96□□□□□ -0.5
HIGD1BQ9P298 DHRS7B-206ENST00000579303 1479 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC11.95□□□□□ -0.5
HIGD1BQ9P298 AL121845.3-201ENST00000490623 3119 ntTSL 5 BASIC11.95□□□□□ -0.5
HIGD1BQ9P298 TOM1-206ENST00000425375 2252 ntTSL 2 BASIC11.95□□□□□ -0.5
HIGD1BQ9P298 KRT8P11-201ENST00000409686 1436 ntBASIC11.95□□□□□ -0.5
HIGD1BQ9P298 ZFP64-205ENST00000371518 1841 ntTSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
HIGD1BQ9P298 KIFC3-206ENST00000541240 3047 ntTSL 2 BASIC11.95□□□□□ -0.5
HIGD1BQ9P298 APAF1-203ENST00000359972 7029 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
HIGD1BQ9P298 TPD52L2-209ENST00000611972 2197 ntTSL 3 BASIC11.95□□□□□ -0.5
HIGD1BQ9P298 DNAJC8-201ENST00000263697 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
HIGD1BQ9P298 HYAL2-208ENST00000447092 4054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
HIGD1BQ9P298 UBE3A-207ENST00000614096 8741 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
HIGD1BQ9P298 TCP10-202ENST00000397829 2141 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
HIGD1BQ9P298 AL603832.2-201ENST00000566195 2125 ntBASIC11.95□□□□□ -0.5
HIGD1BQ9P298 AC026748.1-201ENST00000624349 3251 ntBASIC11.95□□□□□ -0.5
HIGD1BQ9P298 DAPK2-202ENST00000457488 1741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
HIGD1BQ9P298 SYT17-207ENST00000568115 1721 ntTSL 5 BASIC11.95□□□□□ -0.5
HIGD1BQ9P298 GNS-201ENST00000258145 5122 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
HIGD1BQ9P298 ETFA-202ENST00000433983 1346 ntTSL 2 BASIC11.95□□□□□ -0.5
HIGD1BQ9P298 AC135279.3-201ENST00000610945 1311 ntBASIC11.95□□□□□ -0.5
HIGD1BQ9P298 BECN1-213ENST00000590099 2087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
HIGD1BQ9P298 DDX1-202ENST00000381341 2817 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.95□□□□□ -0.5
HIGD1BQ9P298 LRRC47-201ENST00000378251 4310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
HIGD1BQ9P298 C11orf58-201ENST00000228136 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
HIGD1BQ9P298 LINC02370-201ENST00000428272 2009 ntTSL 5 BASIC11.95□□□□□ -0.5
HIGD1BQ9P298 PARP1-202ENST00000366792 553 ntTSL 3 BASIC11.95□□□□□ -0.5
HIGD1BQ9P298 LYRM9-201ENST00000379102 501 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.95□□□□□ -0.5
HIGD1BQ9P298 CDKN2AIPNL-201ENST00000395009 800 ntTSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
HIGD1BQ9P298 LYRM9-206ENST00000508862 807 ntTSL 3 BASIC11.95□□□□□ -0.5
HIGD1BQ9P298 AC011448.1-201ENST00000555938 1100 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.95□□□□□ -0.5
HIGD1BQ9P298 TYROBP-209ENST00000589517 415 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
HIGD1BQ9P298 ZNF667-AS1-206ENST00000591797 535 ntTSL 5 BASIC11.95□□□□□ -0.5
HIGD1BQ9P298 FBXO17-202ENST00000595329 1299 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.95□□□□□ -0.5
HIGD1BQ9P298 AL136162.1-201ENST00000607711 1078 ntBASIC11.95□□□□□ -0.5
HIGD1BQ9P298 HLA-A-209ENST00000638375 975 ntBASIC11.95□□□□□ -0.5
HIGD1BQ9P298 KREMEN1-201ENST00000327813 2719 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC11.95□□□□□ -0.5
HIGD1BQ9P298 GAL3ST1-206ENST00000406955 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
HIGD1BQ9P298 AL359258.3-201ENST00000622910 2331 ntBASIC11.95□□□□□ -0.5
HIGD1BQ9P298 RNF25-201ENST00000295704 1914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
HIGD1BQ9P298 GPR137-204ENST00000438980 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
HIGD1BQ9P298 CDK1-204ENST00000448257 1948 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
HIGD1BQ9P298 ARHGAP9-203ENST00000424809 2569 ntTSL 2 BASIC11.95□□□□□ -0.5
HIGD1BQ9P298 LITAF-202ENST00000381810 1527 ntTSL 5 BASIC11.95□□□□□ -0.5
HIGD1BQ9P298 CCK-202ENST00000396169 1527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
HIGD1BQ9P298 AC027601.1-201ENST00000575922 4506 ntTSL 2 BASIC11.95□□□□□ -0.5
HIGD1BQ9P298 SERPINE2-202ENST00000409304 2161 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
HIGD1BQ9P298 ARL5B-201ENST00000377275 7196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
HIGD1BQ9P298 SMARCA4-207ENST00000541122 5139 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC11.95□□□□□ -0.5
HIGD1BQ9P298 SNX18-202ENST00000343017 3140 ntBASIC11.95□□□□□ -0.5
HIGD1BQ9P298 DUOX1-201ENST00000321429 5738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
HIGD1BQ9P298 EPOP-201ENST00000621654 3719 ntAPPRIS P1 BASIC11.95□□□□□ -0.5
HIGD1BQ9P298 SNX11-202ENST00000393405 2733 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.95□□□□□ -0.5
HIGD1BQ9P298 SNAPC1-201ENST00000216294 2656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
HIGD1BQ9P298 GINS2-201ENST00000253462 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
HIGD1BQ9P298 CIAPIN1-209ENST00000567518 2016 ntTSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
HIGD1BQ9P298 DAAM2-211ENST00000633794 3871 ntTSL 5 BASIC11.94□□□□□ -0.5
HIGD1BQ9P298 RASA4CP-201ENST00000424092 1398 ntBASIC11.94□□□□□ -0.5
HIGD1BQ9P298 SPPL2B-207ENST00000610743 2583 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
HIGD1BQ9P298 NBPF9-207ENST00000615421 5835 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.94□□□□□ -0.5
HIGD1BQ9P298 ELOA-204ENST00000613537 4924 ntTSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
HIGD1BQ9P298 ACSL3-202ENST00000392066 3147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.94□□□□□ -0.5
HIGD1BQ9P298 MLKL-202ENST00000308807 2523 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.94□□□□□ -0.5
HIGD1BQ9P298 CBSL-201ENST00000398168 2514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
HIGD1BQ9P298 CTNNBL1-201ENST00000361383 1925 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
HIGD1BQ9P298 RNF11-201ENST00000242719 3084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
HIGD1BQ9P298 WDR20-202ENST00000322340 3060 ntTSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
HIGD1BQ9P298 SLAIN2-201ENST00000264313 6299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
HIGD1BQ9P298 KNSTRN-202ENST00000416151 1899 ntTSL 3 BASIC11.94□□□□□ -0.5
HIGD1BQ9P298 PODN-202ENST00000371500 3287 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
HIGD1BQ9P298 SLC25A38-201ENST00000273158 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
HIGD1BQ9P298 LAMTOR1-201ENST00000278671 1179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
HIGD1BQ9P298 COX20-201ENST00000366528 568 ntTSL 2 BASIC11.94□□□□□ -0.5
HIGD1BQ9P298 KISS1-201ENST00000367194 709 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
HIGD1BQ9P298 SPATA25-201ENST00000372519 757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
HIGD1BQ9P298 ASIP-201ENST00000374954 586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
HIGD1BQ9P298 CDC37L1-202ENST00000381858 1244 ntTSL 5 BASIC11.94□□□□□ -0.5
HIGD1BQ9P298 AC034102.6-201ENST00000550947 559 ntTSL 4 BASIC11.94□□□□□ -0.5
HIGD1BQ9P298 ANAPC11-208ENST00000572851 686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
HIGD1BQ9P298 DM1-AS-203ENST00000590076 730 ntTSL 4 BASIC11.94□□□□□ -0.5
HIGD1BQ9P298 SMAGP-206ENST00000604188 433 ntTSL 3 BASIC11.94□□□□□ -0.5
HIGD1BQ9P298 ARFRP1-202ENST00000607873 1061 ntTSL 2 BASIC11.94□□□□□ -0.5
HIGD1BQ9P298 TPGS2-221ENST00000614939 1268 ntTSL 4 BASIC11.94□□□□□ -0.5
HIGD1BQ9P298 TBC1D3D-201ENST00000616101 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
HIGD1BQ9P298 TBC1D3K-201ENST00000620247 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
HIGD1BQ9P298 MIR6084-201ENST00000622012 110 ntBASIC11.94□□□□□ -0.5
HIGD1BQ9P298 MGAT1-202ENST00000333055 8863 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.94□□□□□ -0.5
HIGD1BQ9P298 DMPK-202ENST00000343373 3227 ntTSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
HIGD1BQ9P298 IGSF1-204ENST00000370903 4594 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
HIGD1BQ9P298 IL9R-202ENST00000369423 2032 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
HIGD1BQ9P298 SIGLEC7-201ENST00000305628 1469 ntTSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
HIGD1BQ9P298 GDAP1L1-201ENST00000342560 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
HIGD1BQ9P298 AC093525.9-201ENST00000624961 1746 ntBASIC11.94□□□□□ -0.5
HIGD1BQ9P298 SORT1-201ENST00000256637 7028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
HIGD1BQ9P298 NUCKS1-201ENST00000367142 6496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
HIGD1BQ9P298 POLL-217ENST00000628479 1953 ntTSL 5 BASIC11.94□□□□□ -0.5
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27.3 ms