Protein–RNA interactions for Protein: Q9P0J0

NDUFA13, NADH dehydrogenase [ubiquinone] 1 alpha subcomplex subunit 13, humanhuman

Predictions only

Length 144 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NDUFA13Q9P0J0 TREX2-205ENST00000370231 1255 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
NDUFA13Q9P0J0 TREX2-207ENST00000393862 907 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
NDUFA13Q9P0J0 RALB-203ENST00000420510 1252 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
NDUFA13Q9P0J0 SIGLEC10-205ENST00000439889 2126 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
NDUFA13Q9P0J0 AC069236.1-201ENST00000604339 616 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
NDUFA13Q9P0J0 AC000035.1-201ENST00000634116 343 ntTSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
NDUFA13Q9P0J0 C11orf58-201ENST00000228136 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
NDUFA13Q9P0J0 NR2E3-204ENST00000621736 2032 ntTSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
NDUFA13Q9P0J0 C3orf67-201ENST00000295966 2650 ntTSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
NDUFA13Q9P0J0 PCCB-201ENST00000251654 1833 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
NDUFA13Q9P0J0 CLIC6-202ENST00000360731 3860 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
NDUFA13Q9P0J0 FNIP1-204ENST00000511848 1720 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
NDUFA13Q9P0J0 HNF4A-205ENST00000443598 1603 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
NDUFA13Q9P0J0 WIPF3-202ENST00000409123 3491 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
NDUFA13Q9P0J0 IGSF8-205ENST00000614243 2191 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
NDUFA13Q9P0J0 SMARCA4-207ENST00000541122 5139 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
NDUFA13Q9P0J0 EDC3-202ENST00000426797 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
NDUFA13Q9P0J0 AC004233.2-201ENST00000573315 2062 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
NDUFA13Q9P0J0 ATP2A3-206ENST00000397043 3197 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
NDUFA13Q9P0J0 EPOP-201ENST00000621654 3719 ntAPPRIS P1 BASIC15.93■□□□□ 0.14
NDUFA13Q9P0J0 ELFN2-201ENST00000402918 8361 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC15.93■□□□□ 0.14
NDUFA13Q9P0J0 NAAA-206ENST00000507956 1300 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
NDUFA13Q9P0J0 FOXI2-201ENST00000388920 3217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
NDUFA13Q9P0J0 EXT2-210ENST00000533608 3136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
NDUFA13Q9P0J0 MIOX-202ENST00000395732 1658 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
NDUFA13Q9P0J0 ARHGAP5-205ENST00000433497 3047 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
NDUFA13Q9P0J0 PM20D2-201ENST00000275072 4708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
NDUFA13Q9P0J0 NTMT1-209ENST00000611055 1562 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.92■□□□□ 0.14
NDUFA13Q9P0J0 SLC29A1-203ENST00000371724 2275 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
NDUFA13Q9P0J0 ZMIZ2-202ENST00000309315 5144 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
NDUFA13Q9P0J0 WRAP53-203ENST00000431639 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
NDUFA13Q9P0J0 WRAP53-204ENST00000457584 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
NDUFA13Q9P0J0 GPS1-226ENST00000623691 1839 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
NDUFA13Q9P0J0 DISC1-209ENST00000439617 7059 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
NDUFA13Q9P0J0 PLAGL1-208ENST00000437412 2640 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
NDUFA13Q9P0J0 MYEF2-201ENST00000267836 2958 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
NDUFA13Q9P0J0 PCED1A-201ENST00000356872 1706 ntTSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
NDUFA13Q9P0J0 MIER1-205ENST00000371014 1728 ntTSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
NDUFA13Q9P0J0 MARVELD1-201ENST00000285605 3221 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
NDUFA13Q9P0J0 TVP23B-201ENST00000307767 2064 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
NDUFA13Q9P0J0 RRM1-214ENST00000534285 2075 ntTSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
NDUFA13Q9P0J0 SBF1-201ENST00000348911 6045 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
NDUFA13Q9P0J0 VMO1-201ENST00000328739 766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
NDUFA13Q9P0J0 KDELR3-202ENST00000409006 931 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
NDUFA13Q9P0J0 MIR663AHG-233ENST00000609248 830 ntTSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
NDUFA13Q9P0J0 AC010999.2-201ENST00000621974 596 ntTSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
NDUFA13Q9P0J0 HAUS7-211ENST00000626181 414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
NDUFA13Q9P0J0 AC004805.1-201ENST00000577662 1616 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
NDUFA13Q9P0J0 REEP3-201ENST00000373758 5205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
NDUFA13Q9P0J0 ARL8B-201ENST00000256496 3005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
NDUFA13Q9P0J0 KCNC2-207ENST00000548513 3026 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
NDUFA13Q9P0J0 HYAL2-208ENST00000447092 4054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
NDUFA13Q9P0J0 KRT17P1-201ENST00000399211 1546 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
NDUFA13Q9P0J0 NPY5R-203ENST00000515560 3183 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
NDUFA13Q9P0J0 ASCL1-201ENST00000266744 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
NDUFA13Q9P0J0 SLC44A2-203ENST00000586078 3784 ntTSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
NDUFA13Q9P0J0 TEAD2-204ENST00000593945 2141 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
NDUFA13Q9P0J0 ZIC4-212ENST00000484399 1774 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
NDUFA13Q9P0J0 CHD4-210ENST00000544040 6514 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
NDUFA13Q9P0J0 AC068338.2-201ENST00000563278 1430 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
NDUFA13Q9P0J0 ARL8B-208ENST00000611208 2981 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
NDUFA13Q9P0J0 NID2-208ENST00000617139 3827 ntTSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
NDUFA13Q9P0J0 FAM131A-204ENST00000418281 1664 ntTSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
NDUFA13Q9P0J0 AC012615.6-201ENST00000593201 1697 ntTSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
NDUFA13Q9P0J0 PCK2-203ENST00000545054 2505 ntTSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
NDUFA13Q9P0J0 HTR3E-201ENST00000335304 1912 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
NDUFA13Q9P0J0 SLC5A7-201ENST00000264047 5152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
NDUFA13Q9P0J0 ARRB2-216ENST00000574954 1348 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
NDUFA13Q9P0J0 HES1-201ENST00000232424 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
NDUFA13Q9P0J0 ZNF408-201ENST00000311764 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
NDUFA13Q9P0J0 HOXA3-202ENST00000396352 3263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
NDUFA13Q9P0J0 RDH12-201ENST00000267502 1833 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
NDUFA13Q9P0J0 MAGEA2-201ENST00000595583 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
NDUFA13Q9P0J0 ZNF219-202ENST00000421093 2908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
NDUFA13Q9P0J0 MAP1S-201ENST00000324096 3419 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
NDUFA13Q9P0J0 SOD2-215ENST00000546087 2558 ntTSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
NDUFA13Q9P0J0 POU5F1-204ENST00000471529 1723 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
NDUFA13Q9P0J0 FBXL20-205ENST00000583610 1739 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
NDUFA13Q9P0J0 CTSD-213ENST00000637915 1982 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
NDUFA13Q9P0J0 SHISA9-203ENST00000558583 6724 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
NDUFA13Q9P0J0 FTSJ1-202ENST00000348411 1892 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
NDUFA13Q9P0J0 NKIRAS1-207ENST00000437230 1898 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
NDUFA13Q9P0J0 CREB3L3-201ENST00000078445 2618 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
NDUFA13Q9P0J0 GIPR-201ENST00000263281 1791 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
NDUFA13Q9P0J0 HAUS8-202ENST00000448593 1545 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
NDUFA13Q9P0J0 SATB2-206ENST00000457245 2656 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
NDUFA13Q9P0J0 KRT15-201ENST00000254043 5237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
NDUFA13Q9P0J0 SPATA2L-202ENST00000335360 1001 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
NDUFA13Q9P0J0 EDA-201ENST00000338901 1233 ntBASIC15.91■□□□□ 0.14
NDUFA13Q9P0J0 AC093752.1-201ENST00000511950 605 ntTSL 4 BASIC15.91■□□□□ 0.14
NDUFA13Q9P0J0 TMEM191C-212ENST00000536718 480 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
NDUFA13Q9P0J0 SLC6A6-208ENST00000621751 1252 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
NDUFA13Q9P0J0 RPS6KB1-204ENST00000443572 1913 ntTSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
NDUFA13Q9P0J0 SLC25A34-201ENST00000294454 2986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
NDUFA13Q9P0J0 KHDC1-202ENST00000370384 1430 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
NDUFA13Q9P0J0 HAUS4-204ENST00000490506 1447 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
NDUFA13Q9P0J0 NDRG2-206ENST00000397844 2096 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
NDUFA13Q9P0J0 GPR42-201ENST00000454971 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
NDUFA13Q9P0J0 CHL1-202ENST00000397491 5235 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
NDUFA13Q9P0J0 RNFT2-203ENST00000392549 2896 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 25.5 ms