Protein–RNA interactions for Protein: Q9NWW5

CLN6, Ceroid-lipofuscinosis neuronal protein 6, humanhuman

Predictions only

Length 311 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CLN6Q9NWW5 SH3BP5-202ENST00000383791 2822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
CLN6Q9NWW5 CHGA-201ENST00000216492 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
CLN6Q9NWW5 GLOD4-202ENST00000301329 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
CLN6Q9NWW5 DUOXA1-201ENST00000267803 1996 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
CLN6Q9NWW5 ADAM11-203ENST00000535346 2529 ntTSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
CLN6Q9NWW5 PIGX-202ENST00000392391 3057 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
CLN6Q9NWW5 DKK3-203ENST00000525493 1326 ntTSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
CLN6Q9NWW5 MME-217ENST00000616757 1315 ntTSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
CLN6Q9NWW5 PDE1C-201ENST00000321453 2898 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
CLN6Q9NWW5 SCNN1A-205ENST00000396966 2336 ntTSL 3 BASIC15.93■□□□□ 0.14
CLN6Q9NWW5 CLPTM1-203ENST00000546079 2342 ntTSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
CLN6Q9NWW5 EHD2-202ENST00000538399 1766 ntTSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
CLN6Q9NWW5 SURF4-208ENST00000613129 3148 ntTSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
CLN6Q9NWW5 UBR5-207ENST00000520539 10297 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
CLN6Q9NWW5 CXXC1-201ENST00000285106 2936 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
CLN6Q9NWW5 ABO-203ENST00000611156 1577 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
CLN6Q9NWW5 TMEM50B-210ENST00000542230 2375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
CLN6Q9NWW5 TXNDC11-202ENST00000356957 3178 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
CLN6Q9NWW5 PIGP-207ENST00000464265 3437 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
CLN6Q9NWW5 SCART1-206ENST00000640237 4351 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
CLN6Q9NWW5 EXOSC5-201ENST00000221233 1118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
CLN6Q9NWW5 COX5A-201ENST00000322347 1268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
CLN6Q9NWW5 TRAPPC3-204ENST00000373166 1265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
CLN6Q9NWW5 AC115618.1-201ENST00000376775 549 ntTSL 3 BASIC15.92■□□□□ 0.14
CLN6Q9NWW5 IL15RA-208ENST00000397251 1046 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
CLN6Q9NWW5 DUSP15-205ENST00000398084 1256 ntTSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
CLN6Q9NWW5 AC005104.2-201ENST00000427818 678 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
CLN6Q9NWW5 AL390728.5-201ENST00000428687 706 ntTSL 3 BASIC15.92■□□□□ 0.14
CLN6Q9NWW5 SEC1P-202ENST00000473944 940 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
CLN6Q9NWW5 AC113404.2-201ENST00000507884 177 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
CLN6Q9NWW5 SLC39A13-212ENST00000531974 856 ntTSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
CLN6Q9NWW5 PRTN3-202ENST00000544537 1036 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
CLN6Q9NWW5 TMEM263-208ENST00000551489 621 ntTSL 4 BASIC15.92■□□□□ 0.14
CLN6Q9NWW5 C2orf69P3-201ENST00000565542 1120 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
CLN6Q9NWW5 PDCD5-207ENST00000590247 699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
CLN6Q9NWW5 RAB11B-AS1-201ENST00000593581 1013 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
CLN6Q9NWW5 FFAR4-203ENST00000604414 1142 ntTSL 3 BASIC15.92■□□□□ 0.14
CLN6Q9NWW5 Z94160.2-201ENST00000609322 910 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
CLN6Q9NWW5 TNKS-211ENST00000520408 1964 ntTSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
CLN6Q9NWW5 GDF6-201ENST00000287020 3701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
CLN6Q9NWW5 CCNL2-203ENST00000408952 1857 ntTSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
CLN6Q9NWW5 HMBS-203ENST00000442944 1548 ntTSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
CLN6Q9NWW5 GLOD4-203ENST00000536578 2497 ntTSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
CLN6Q9NWW5 LSM12-204ENST00000591247 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
CLN6Q9NWW5 PBK-201ENST00000301905 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
CLN6Q9NWW5 NBL1-213ENST00000622566 2109 ntAPPRIS P3 TSL 4 BASIC15.92■□□□□ 0.14
CLN6Q9NWW5 METTL21A-208ENST00000448007 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
CLN6Q9NWW5 COLCA2-201ENST00000398035 1414 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
CLN6Q9NWW5 FBXO28-201ENST00000366862 5451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
CLN6Q9NWW5 NDRG2-204ENST00000360463 2047 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
CLN6Q9NWW5 NSFL1C-201ENST00000216879 3568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
CLN6Q9NWW5 SLC35G6-201ENST00000412468 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
CLN6Q9NWW5 LTBR-207ENST00000539925 1665 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
CLN6Q9NWW5 ETFA-203ENST00000557943 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
CLN6Q9NWW5 THNSL2-203ENST00000377254 1560 ntTSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
CLN6Q9NWW5 MCF2L2-208ENST00000473233 4748 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
CLN6Q9NWW5 CCDC120-202ENST00000496529 2415 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
CLN6Q9NWW5 C17orf62-201ENST00000306645 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
CLN6Q9NWW5 TMC5-202ENST00000381414 4755 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
CLN6Q9NWW5 JRK-211ENST00000615982 2823 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
CLN6Q9NWW5 PBK-203ENST00000522944 1499 ntTSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
CLN6Q9NWW5 ADD1-205ENST00000398125 4079 ntTSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
CLN6Q9NWW5 AC026412.1-202ENST00000512335 2231 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
CLN6Q9NWW5 SHTN1-201ENST00000260777 5308 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
CLN6Q9NWW5 CAMTA1-201ENST00000303635 8444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
CLN6Q9NWW5 PICALM-219ENST00000532317 3474 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
CLN6Q9NWW5 ST3GAL2-201ENST00000342907 4450 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
CLN6Q9NWW5 CCDC115-201ENST00000259229 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
CLN6Q9NWW5 HMBS-221ENST00000544387 1351 ntTSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
CLN6Q9NWW5 GPAT3-208ENST00000611707 2633 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
CLN6Q9NWW5 PABPC4-203ENST00000372858 2753 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
CLN6Q9NWW5 AIF1L-203ENST00000372298 849 ntTSL 3 BASIC15.91■□□□□ 0.14
CLN6Q9NWW5 TCEAL6-202ENST00000372774 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
CLN6Q9NWW5 TMEM185A-204ENST00000507237 903 ntTSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
CLN6Q9NWW5 PAIP2-208ENST00000511706 468 ntTSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
CLN6Q9NWW5 LINGO1-AS2-201ENST00000557799 663 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
CLN6Q9NWW5 DCTPP1-205ENST00000568973 878 ntTSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
CLN6Q9NWW5 Z99916.2-201ENST00000604037 246 ntBASIC15.91■□□□□ 0.14
CLN6Q9NWW5 AP000525.1-201ENST00000608286 694 ntBASIC15.91■□□□□ 0.14
CLN6Q9NWW5 MIER1-204ENST00000371012 2420 ntTSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
CLN6Q9NWW5 C9orf64-203ENST00000376344 2443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
CLN6Q9NWW5 DZIP1-203ENST00000361396 7418 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
CLN6Q9NWW5 MGAT1-203ENST00000393340 3077 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
CLN6Q9NWW5 TMEM127-202ENST00000432959 3099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
CLN6Q9NWW5 MYRIP-202ENST00000396217 4877 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
CLN6Q9NWW5 SETD1B-201ENST00000267197 5772 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
CLN6Q9NWW5 MFGE8-201ENST00000268150 1937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
CLN6Q9NWW5 PEX6-202ENST00000304611 3478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
CLN6Q9NWW5 FRMD5-202ENST00000417257 5011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
CLN6Q9NWW5 SMC4-204ENST00000462787 5033 ntTSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
CLN6Q9NWW5 AC046185.3-201ENST00000623228 1824 ntBASIC15.91■□□□□ 0.14
CLN6Q9NWW5 ATRNL1-201ENST00000355044 8479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
CLN6Q9NWW5 AP1S2-201ENST00000329235 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
CLN6Q9NWW5 GPANK1-201ENST00000375893 1598 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
CLN6Q9NWW5 SYT6-201ENST00000369547 4369 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
CLN6Q9NWW5 USP42-201ENST00000306177 5155 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
CLN6Q9NWW5 TEAD2-204ENST00000593945 2141 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
CLN6Q9NWW5 PGAP3-203ENST00000378011 2533 ntTSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
CLN6Q9NWW5 PLXNC1-201ENST00000258526 7346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
CLN6Q9NWW5 IQCE-212ENST00000476665 2400 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 33.4 ms