Protein–RNA interactions for Protein: Q9C0H6

KLHL4, Kelch-like protein 4, humanhuman

Predictions only

Length 718 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KLHL4Q9C0H6 ASTN2-205ENST00000361209 4622 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
KLHL4Q9C0H6 GMDS-AS1-201ENST00000456943 2308 ntTSL 2 BASIC16.85■□□□□ 0.29
KLHL4Q9C0H6 FSCN2-201ENST00000334850 1551 ntTSL 5 BASIC16.85■□□□□ 0.29
KLHL4Q9C0H6 FCGRT-202ENST00000426395 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
KLHL4Q9C0H6 BANP-201ENST00000286122 2368 ntTSL 5 BASIC16.85■□□□□ 0.29
KLHL4Q9C0H6 SLBP-201ENST00000318386 1635 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC16.85■□□□□ 0.29
KLHL4Q9C0H6 AC034236.2-201ENST00000606662 1610 ntBASIC16.85■□□□□ 0.29
KLHL4Q9C0H6 CDC42EP4-201ENST00000335793 3272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
KLHL4Q9C0H6 DDHD2-201ENST00000397166 4921 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.85■□□□□ 0.29
KLHL4Q9C0H6 CDK4-202ENST00000312990 1650 ntTSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
KLHL4Q9C0H6 RIMS1-210ENST00000491071 5047 ntTSL 5 BASIC16.85■□□□□ 0.29
KLHL4Q9C0H6 AC022188.1-201ENST00000620960 1664 ntBASIC16.85■□□□□ 0.29
KLHL4Q9C0H6 PRPF31-202ENST00000391755 1767 ntTSL 5 BASIC16.84■□□□□ 0.29
KLHL4Q9C0H6 ADAM15-228ENST00000531455 2678 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.84■□□□□ 0.29
KLHL4Q9C0H6 ADAM15-205ENST00000360674 2732 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
KLHL4Q9C0H6 TLL1-204ENST00000507499 4818 ntTSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
KLHL4Q9C0H6 FAM83C-201ENST00000374408 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
KLHL4Q9C0H6 MAPKAP1-202ENST00000350766 3256 ntTSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
KLHL4Q9C0H6 HDHD2-201ENST00000300605 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
KLHL4Q9C0H6 ZDHHC24-201ENST00000310442 4721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
KLHL4Q9C0H6 SLC18B1-201ENST00000275227 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
KLHL4Q9C0H6 PLEKHB1-202ENST00000354190 2380 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
KLHL4Q9C0H6 PAX3-201ENST00000258387 958 ntTSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
KLHL4Q9C0H6 POMZP3-201ENST00000275569 1259 ntTSL 2 BASIC16.84■□□□□ 0.29
KLHL4Q9C0H6 CHCHD6-201ENST00000290913 1006 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
KLHL4Q9C0H6 BOLA3-202ENST00000327428 639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
KLHL4Q9C0H6 CKS1B-203ENST00000368439 912 ntTSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
KLHL4Q9C0H6 HMGA1P5-201ENST00000412453 271 ntBASIC16.84■□□□□ 0.29
KLHL4Q9C0H6 AC103564.1-201ENST00000437330 562 ntTSL 5 BASIC16.84■□□□□ 0.29
KLHL4Q9C0H6 DCTN3-209ENST00000477738 713 ntTSL 3 BASIC16.84■□□□□ 0.29
KLHL4Q9C0H6 PTP4A3-206ENST00000524028 963 ntTSL 5 BASIC16.84■□□□□ 0.29
KLHL4Q9C0H6 GPX4-207ENST00000589115 812 ntTSL 2 BASIC16.84■□□□□ 0.29
KLHL4Q9C0H6 FAM87A-204ENST00000613235 858 ntBASIC16.84■□□□□ 0.29
KLHL4Q9C0H6 AC092850.2-201ENST00000623821 2697 ntBASIC16.84■□□□□ 0.29
KLHL4Q9C0H6 KRT8P50-201ENST00000562022 1438 ntBASIC16.84■□□□□ 0.29
KLHL4Q9C0H6 AC073508.3-201ENST00000619697 1419 ntBASIC16.84■□□□□ 0.29
KLHL4Q9C0H6 CADPS2-204ENST00000412584 4308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
KLHL4Q9C0H6 ZNF764-202ENST00000395091 2970 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.84■□□□□ 0.29
KLHL4Q9C0H6 PPP1R21-206ENST00000449090 3049 ntTSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
KLHL4Q9C0H6 RUBCN-206ENST00000449205 1603 ntTSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
KLHL4Q9C0H6 KLC1-206ENST00000389744 3250 ntTSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
KLHL4Q9C0H6 SLITRK4-201ENST00000338017 3357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
KLHL4Q9C0H6 ETV7-202ENST00000340181 1719 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
KLHL4Q9C0H6 ADGRG3-202ENST00000450388 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.84■□□□□ 0.29
KLHL4Q9C0H6 PICALM-204ENST00000526033 3613 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
KLHL4Q9C0H6 ELMOD1-202ENST00000443271 1990 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.84■□□□□ 0.29
KLHL4Q9C0H6 AC005915.1-201ENST00000624912 2018 ntBASIC16.84■□□□□ 0.29
KLHL4Q9C0H6 NBL1-213ENST00000622566 2109 ntAPPRIS P3 TSL 4 BASIC16.84■□□□□ 0.29
KLHL4Q9C0H6 DOLPP1-202ENST00000372546 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
KLHL4Q9C0H6 RABL2A-204ENST00000393167 2179 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
KLHL4Q9C0H6 WASHC2C-209ENST00000540872 4519 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
KLHL4Q9C0H6 PCDHGC3-205ENST00000617641 2346 ntTSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
KLHL4Q9C0H6 C21orf58-201ENST00000291691 2975 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.83■□□□□ 0.29
KLHL4Q9C0H6 TSC2-201ENST00000219476 6156 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.83■□□□□ 0.29
KLHL4Q9C0H6 TK2-207ENST00000544898 3441 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.29
KLHL4Q9C0H6 UGCG-201ENST00000374279 4007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.29
KLHL4Q9C0H6 DCST1-201ENST00000295542 2279 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.83■□□□□ 0.28
KLHL4Q9C0H6 TMEM234-201ENST00000309777 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
KLHL4Q9C0H6 SGPP2-201ENST00000321276 3336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
KLHL4Q9C0H6 MRPL54-201ENST00000330133 626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
KLHL4Q9C0H6 INSIG1-202ENST00000342407 1127 ntTSL 2 BASIC16.83■□□□□ 0.28
KLHL4Q9C0H6 YY1AP1-210ENST00000368339 3073 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.83■□□□□ 0.28
KLHL4Q9C0H6 TIMM17B-201ENST00000376582 950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
KLHL4Q9C0H6 TNIP1-202ENST00000389378 2935 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.83■□□□□ 0.28
KLHL4Q9C0H6 TFR2-202ENST00000431692 2631 ntTSL 5 BASIC16.83■□□□□ 0.28
KLHL4Q9C0H6 CT47A1-201ENST00000433030 1288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
KLHL4Q9C0H6 GPAT2P1-201ENST00000444924 1672 ntBASIC16.83■□□□□ 0.28
KLHL4Q9C0H6 KRT18P35-201ENST00000510488 1269 ntBASIC16.83■□□□□ 0.28
KLHL4Q9C0H6 DBX1-201ENST00000524983 1380 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.83■□□□□ 0.28
KLHL4Q9C0H6 ABHD14B-208ENST00000525795 980 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.83■□□□□ 0.28
KLHL4Q9C0H6 FAM109A-203ENST00000547838 2846 ntAPPRIS P3 TSL 4 BASIC16.83■□□□□ 0.28
KLHL4Q9C0H6 ETFA-203ENST00000557943 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
KLHL4Q9C0H6 AC020911.2-202ENST00000588945 593 ntTSL 3 BASIC16.83■□□□□ 0.28
KLHL4Q9C0H6 AC132872.4-202ENST00000622924 2756 ntBASIC16.83■□□□□ 0.28
KLHL4Q9C0H6 LRRC27-214ENST00000625755 1738 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
KLHL4Q9C0H6 TRAPPC6A-201ENST00000006275 805 ntTSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
KLHL4Q9C0H6 PRICKLE1-211ENST00000639566 3341 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.83■□□□□ 0.28
KLHL4Q9C0H6 DIMT1-201ENST00000199320 2859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
KLHL4Q9C0H6 TLE3-212ENST00000558201 2766 ntTSL 5 BASIC16.83■□□□□ 0.28
KLHL4Q9C0H6 TUBGCP2-202ENST00000368562 2685 ntTSL 2 BASIC16.83■□□□□ 0.28
KLHL4Q9C0H6 EDN3-202ENST00000337938 2636 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
KLHL4Q9C0H6 PDAP1-201ENST00000350498 2546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
KLHL4Q9C0H6 DPY19L3-206ENST00000587077 2456 ntTSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
KLHL4Q9C0H6 COL8A2-202ENST00000397799 4670 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.82■□□□□ 0.28
KLHL4Q9C0H6 RGMB-AS1-201ENST00000498871 1903 ntTSL 2 BASIC16.82■□□□□ 0.28
KLHL4Q9C0H6 SHMT2-232ENST00000557487 1918 ntTSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
KLHL4Q9C0H6 FAM110A-202ENST00000304189 1856 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.82■□□□□ 0.28
KLHL4Q9C0H6 PPHLN1-213ENST00000549190 1777 ntTSL 5 BASIC16.82■□□□□ 0.28
KLHL4Q9C0H6 PROSER1-211ENST00000625998 5102 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.82■□□□□ 0.28
KLHL4Q9C0H6 DIDO1-207ENST00000395343 8477 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
KLHL4Q9C0H6 KRAS-203ENST00000556131 1696 ntTSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
KLHL4Q9C0H6 ZNF84-208ENST00000539354 3237 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
KLHL4Q9C0H6 CCK-202ENST00000396169 1527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
KLHL4Q9C0H6 AP001922.1-201ENST00000499390 1504 ntTSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
KLHL4Q9C0H6 C12orf42-205ENST00000548048 1532 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.82■□□□□ 0.28
KLHL4Q9C0H6 LGALS8-AS1-201ENST00000487567 1457 ntBASIC16.82■□□□□ 0.28
KLHL4Q9C0H6 SMN2-202ENST00000380742 1388 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.82■□□□□ 0.28
KLHL4Q9C0H6 INSIG1-203ENST00000344756 2623 ntTSL 5 BASIC16.82■□□□□ 0.28
KLHL4Q9C0H6 EWSR1-203ENST00000332050 2552 ntTSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
KLHL4Q9C0H6 AC007663.1-201ENST00000438948 1240 ntBASIC16.82■□□□□ 0.28
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 33.6 ms