Protein–RNA interactions for Protein: Q9C0C7

AMBRA1, Activating molecule in BECN1-regulated autophagy protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 1,298 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
AMBRA1Q9C0C7 LY6E-203ENST00000517503 1335 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.32■□□□□ 0.2
AMBRA1Q9C0C7 AZIN1-AS1-214ENST00000522850 473 ntTSL 3 BASIC16.32■□□□□ 0.2
AMBRA1Q9C0C7 TMEM41B-203ENST00000527813 803 ntTSL 5 BASIC16.32■□□□□ 0.2
AMBRA1Q9C0C7 IFI27L2-206ENST00000556727 556 ntTSL 3 BASIC16.32■□□□□ 0.2
AMBRA1Q9C0C7 ETFA-203ENST00000557943 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
AMBRA1Q9C0C7 CENPT-215ENST00000564817 1638 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.32■□□□□ 0.2
AMBRA1Q9C0C7 ANXA8-202ENST00000583448 1971 ntTSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
AMBRA1Q9C0C7 RNF165-204ENST00000587853 2011 ntTSL 5 BASIC16.32■□□□□ 0.2
AMBRA1Q9C0C7 YIPF2-209ENST00000590329 958 ntTSL 5 BASIC16.32■□□□□ 0.2
AMBRA1Q9C0C7 SARS2-212ENST00000600042 1630 ntTSL 2 BASIC16.32■□□□□ 0.2
AMBRA1Q9C0C7 AC009154.2-201ENST00000621177 724 ntBASIC16.32■□□□□ 0.2
AMBRA1Q9C0C7 NBL1-213ENST00000622566 2109 ntAPPRIS P3 TSL 4 BASIC16.32■□□□□ 0.2
AMBRA1Q9C0C7 ADORA1-204ENST00000367236 3407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
AMBRA1Q9C0C7 DNAAF2-202ENST00000406043 2819 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
AMBRA1Q9C0C7 LETM2-205ENST00000519476 2240 ntTSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
AMBRA1Q9C0C7 ABR-203ENST00000536794 2213 ntTSL 2 BASIC16.31■□□□□ 0.2
AMBRA1Q9C0C7 C17orf62-201ENST00000306645 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
AMBRA1Q9C0C7 MOCS1-206ENST00000425303 1920 ntTSL 2 BASIC16.31■□□□□ 0.2
AMBRA1Q9C0C7 SH3BP5-203ENST00000408919 1880 ntTSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
AMBRA1Q9C0C7 KLF10-202ENST00000395884 3659 ntTSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
AMBRA1Q9C0C7 KIF25-203ENST00000443060 1613 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.31■□□□□ 0.2
AMBRA1Q9C0C7 AC068831.1-204ENST00000501381 1621 ntTSL 2 BASIC16.31■□□□□ 0.2
AMBRA1Q9C0C7 ARPC1B-201ENST00000252725 1551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
AMBRA1Q9C0C7 PDE12-202ENST00000487257 3040 ntTSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
AMBRA1Q9C0C7 SPAG4-201ENST00000374273 1453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
AMBRA1Q9C0C7 CRADD-202ENST00000542893 1403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
AMBRA1Q9C0C7 MIR4300HG-201ENST00000500502 1397 ntTSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
AMBRA1Q9C0C7 LCE4A-202ENST00000368777 672 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.31■□□□□ 0.2
AMBRA1Q9C0C7 ABCD1-202ENST00000370129 1016 ntTSL 2 BASIC16.31■□□□□ 0.2
AMBRA1Q9C0C7 TSPY8-203ENST00000383005 435 ntTSL 5 BASIC16.31■□□□□ 0.2
AMBRA1Q9C0C7 ST6GALNAC4P1-201ENST00000435385 499 ntBASIC16.31■□□□□ 0.2
AMBRA1Q9C0C7 AC092647.4-201ENST00000457211 535 ntBASIC16.31■□□□□ 0.2
AMBRA1Q9C0C7 AC004080.5-201ENST00000498652 368 ntTSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
AMBRA1Q9C0C7 GEMIN7-203ENST00000591607 848 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.31■□□□□ 0.2
AMBRA1Q9C0C7 NTF6B-201ENST00000591913 560 ntBASIC16.31■□□□□ 0.2
AMBRA1Q9C0C7 AC004076.1-201ENST00000596831 664 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.31■□□□□ 0.2
AMBRA1Q9C0C7 AL136038.4-201ENST00000603606 1261 ntBASIC16.31■□□□□ 0.2
AMBRA1Q9C0C7 C10orf142-201ENST00000619243 1110 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.31■□□□□ 0.2
AMBRA1Q9C0C7 CD24-206ENST00000620405 586 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.31■□□□□ 0.2
AMBRA1Q9C0C7 ZFP90-203ENST00000563169 2512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
AMBRA1Q9C0C7 HSPA8-224ENST00000534624 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
AMBRA1Q9C0C7 C9orf64-203ENST00000376344 2443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
AMBRA1Q9C0C7 NKIRAS1-208ENST00000443659 2391 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.31■□□□□ 0.2
AMBRA1Q9C0C7 CACNA1A-225ENST00000636389 8137 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.31■□□□□ 0.2
AMBRA1Q9C0C7 FOXRED2-203ENST00000397223 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
AMBRA1Q9C0C7 RABGGTA-201ENST00000216840 2088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
AMBRA1Q9C0C7 FUK-207ENST00000571514 3054 ntTSL 2 BASIC16.31■□□□□ 0.2
AMBRA1Q9C0C7 SCP2-202ENST00000371513 2003 ntTSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
AMBRA1Q9C0C7 SCOC-211ENST00000614192 1959 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
AMBRA1Q9C0C7 LYPLAL1-202ENST00000366928 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
AMBRA1Q9C0C7 PLEKHG4-205ENST00000450733 4480 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
AMBRA1Q9C0C7 VEGFA-205ENST00000372067 3535 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
AMBRA1Q9C0C7 VKORC1L1-201ENST00000360768 5899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
AMBRA1Q9C0C7 RPAIN-203ENST00000381209 1535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
AMBRA1Q9C0C7 RRM2-202ENST00000360566 3673 ntTSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
AMBRA1Q9C0C7 CTPS2-201ENST00000359276 3629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
AMBRA1Q9C0C7 RPL3-201ENST00000216146 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
AMBRA1Q9C0C7 LAT-204ENST00000395461 1448 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
AMBRA1Q9C0C7 P2RY6-207ENST00000538328 1425 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.3■□□□□ 0.2
AMBRA1Q9C0C7 BATF2-201ENST00000301887 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
AMBRA1Q9C0C7 PEX6-202ENST00000304611 3478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
AMBRA1Q9C0C7 ICAM3-205ENST00000589261 2024 ntTSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
AMBRA1Q9C0C7 VIPR1-217ENST00000543411 2681 ntTSL 2 BASIC16.3■□□□□ 0.2
AMBRA1Q9C0C7 RUNX1-207ENST00000437180 5967 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.3■□□□□ 0.2
AMBRA1Q9C0C7 SRRM2-AS1-203ENST00000571305 1344 ntTSL 2 BASIC16.3■□□□□ 0.2
AMBRA1Q9C0C7 SNTB1-201ENST00000395601 5164 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.3■□□□□ 0.2
AMBRA1Q9C0C7 DGUOK-201ENST00000264093 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
AMBRA1Q9C0C7 DGUOK-202ENST00000348222 880 ntTSL 2 BASIC16.3■□□□□ 0.2
AMBRA1Q9C0C7 CDC26-201ENST00000374206 872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
AMBRA1Q9C0C7 CCNG1-211ENST00000512163 919 ntTSL 2 BASIC16.3■□□□□ 0.2
AMBRA1Q9C0C7 PHB2-207ENST00000542912 1138 ntTSL 5 BASIC16.3■□□□□ 0.2
AMBRA1Q9C0C7 IFNL4-202ENST00000616270 1132 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
AMBRA1Q9C0C7 DGUOK-208ENST00000629438 1029 ntTSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
AMBRA1Q9C0C7 CTNNAL1-201ENST00000325551 2490 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
AMBRA1Q9C0C7 ARL14EP-201ENST00000282032 2430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
AMBRA1Q9C0C7 CTSO-201ENST00000433477 2954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
AMBRA1Q9C0C7 ADGRG3-202ENST00000450388 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.3■□□□□ 0.2
AMBRA1Q9C0C7 TRIM17-201ENST00000295033 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
AMBRA1Q9C0C7 TRIM17-204ENST00000366698 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
AMBRA1Q9C0C7 LPAR3-201ENST00000370611 1720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
AMBRA1Q9C0C7 NFKBID-210ENST00000606253 1736 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
AMBRA1Q9C0C7 ACBD6-201ENST00000367595 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
AMBRA1Q9C0C7 C3orf58-201ENST00000315691 4346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
AMBRA1Q9C0C7 THNSL2-203ENST00000377254 1560 ntTSL 2 BASIC16.3■□□□□ 0.2
AMBRA1Q9C0C7 RNF31-201ENST00000324103 3627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
AMBRA1Q9C0C7 WNT8A-204ENST00000506684 1543 ntTSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
AMBRA1Q9C0C7 AC007381.1-201ENST00000457668 2005 ntTSL 5 BASIC16.29■□□□□ 0.2
AMBRA1Q9C0C7 ELOVL7-205ENST00000508821 3994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
AMBRA1Q9C0C7 SLC6A2-209ENST00000568943 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
AMBRA1Q9C0C7 AQP5-201ENST00000293599 1450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
AMBRA1Q9C0C7 KHNYN-202ENST00000553935 3359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
AMBRA1Q9C0C7 SPTBN4-204ENST00000392025 8671 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.29■□□□□ 0.2
AMBRA1Q9C0C7 POM121C-208ENST00000615331 5835 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
AMBRA1Q9C0C7 SCP2-204ENST00000407246 2239 ntTSL 2 BASIC16.29■□□□□ 0.2
AMBRA1Q9C0C7 EDA-203ENST00000374552 5278 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
AMBRA1Q9C0C7 AC009041.2-206ENST00000563863 1728 ntTSL 2 BASIC16.29■□□□□ 0.2
AMBRA1Q9C0C7 PBK-201ENST00000301905 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
AMBRA1Q9C0C7 C21orf2-201ENST00000325223 1283 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
AMBRA1Q9C0C7 TSPY12P-201ENST00000421279 868 ntBASIC16.29■□□□□ 0.2
AMBRA1Q9C0C7 ANKRD34C-AS1-201ENST00000557790 594 ntTSL 3 BASIC16.29■□□□□ 0.2
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23.9 ms