Protein–RNA interactions for Protein: Q9BSH5

HDHD3, Haloacid dehalogenase-like hydrolase domain-containing protein 3, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 251 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HDHD3Q9BSH5 AC010460.3-201ENST00000511359 1579 ntBASIC14.73□□□□□ -0.05
HDHD3Q9BSH5 SURF4-208ENST00000613129 3148 ntTSL 2 BASIC14.72□□□□□ -0.05
HDHD3Q9BSH5 C9orf62-201ENST00000623103 1924 ntTSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
HDHD3Q9BSH5 PPOX-202ENST00000367999 1740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
HDHD3Q9BSH5 ETV4-211ENST00000591713 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
HDHD3Q9BSH5 NAA50-201ENST00000240922 6135 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
HDHD3Q9BSH5 MINK1-202ENST00000355280 4961 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
HDHD3Q9BSH5 CTNNAL1-201ENST00000325551 2490 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
HDHD3Q9BSH5 LSM12-204ENST00000591247 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
HDHD3Q9BSH5 ELMO3-203ENST00000477898 2281 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.72□□□□□ -0.05
HDHD3Q9BSH5 MELTF-201ENST00000296350 3963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
HDHD3Q9BSH5 NDUFA10-202ENST00000307300 1313 ntTSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
HDHD3Q9BSH5 NDRG2-204ENST00000360463 2047 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
HDHD3Q9BSH5 TOM1-204ENST00000411850 2390 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
HDHD3Q9BSH5 TSPAN17-209ENST00000515708 2361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
HDHD3Q9BSH5 AMT-250ENST00000637682 1823 ntTSL 5 BASIC14.72□□□□□ -0.05
HDHD3Q9BSH5 COPE-201ENST00000262812 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
HDHD3Q9BSH5 PIEZO1-202ENST00000327397 1246 ntTSL 2 BASIC14.72□□□□□ -0.05
HDHD3Q9BSH5 SPDYE2-201ENST00000341656 1219 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
HDHD3Q9BSH5 COPE-203ENST00000351079 907 ntTSL 2 BASIC14.72□□□□□ -0.05
HDHD3Q9BSH5 RHOC-204ENST00000369633 1295 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.72□□□□□ -0.05
HDHD3Q9BSH5 COMTD1-201ENST00000372538 976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
HDHD3Q9BSH5 MCF2L-207ENST00000397024 490 ntTSL 5 BASIC14.72□□□□□ -0.05
HDHD3Q9BSH5 STARP1-201ENST00000397973 869 ntBASIC14.72□□□□□ -0.05
HDHD3Q9BSH5 FAM8A6P-201ENST00000407496 1135 ntBASIC14.72□□□□□ -0.05
HDHD3Q9BSH5 MRPS24-203ENST00000418740 743 ntTSL 2 BASIC14.72□□□□□ -0.05
HDHD3Q9BSH5 LINC01315-202ENST00000424852 1142 ntTSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
HDHD3Q9BSH5 SPDYE2B-202ENST00000455020 1219 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
HDHD3Q9BSH5 SNX5-210ENST00000481323 562 ntTSL 3 BASIC14.72□□□□□ -0.05
HDHD3Q9BSH5 AC098829.1-201ENST00000502344 630 ntTSL 3 BASIC14.72□□□□□ -0.05
HDHD3Q9BSH5 CLDN7-204ENST00000571881 735 ntTSL 3 BASIC14.72□□□□□ -0.05
HDHD3Q9BSH5 ECSIT-207ENST00000588998 818 ntTSL 3 BASIC14.72□□□□□ -0.05
HDHD3Q9BSH5 ZNF524-203ENST00000591046 1260 ntAPPRIS P1 BASIC14.72□□□□□ -0.05
HDHD3Q9BSH5 AC239803.1-201ENST00000594189 1278 ntTSL 5 BASIC14.72□□□□□ -0.05
HDHD3Q9BSH5 AC139887.4-201ENST00000607877 719 ntBASIC14.72□□□□□ -0.05
HDHD3Q9BSH5 SMIM29-209ENST00000636500 1186 ntTSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
HDHD3Q9BSH5 BRD2-201ENST00000374825 4894 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
HDHD3Q9BSH5 ATP6V0E2-202ENST00000425642 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
HDHD3Q9BSH5 DMKN-213ENST00000447113 1611 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
HDHD3Q9BSH5 CDCP2-202ENST00000530059 1623 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.72□□□□□ -0.05
HDHD3Q9BSH5 SCOC-211ENST00000614192 1959 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
HDHD3Q9BSH5 DNMT3A-205ENST00000402667 2300 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.72□□□□□ -0.05
HDHD3Q9BSH5 PANK4-201ENST00000378466 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
HDHD3Q9BSH5 VGLL4-210ENST00000426568 1428 ntTSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
HDHD3Q9BSH5 COBL-201ENST00000265136 5291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
HDHD3Q9BSH5 KLK5-201ENST00000336334 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
HDHD3Q9BSH5 TMEM222-201ENST00000374076 1599 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
HDHD3Q9BSH5 ETFA-203ENST00000557943 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
HDHD3Q9BSH5 FCHO1-201ENST00000252771 3118 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.72□□□□□ -0.05
HDHD3Q9BSH5 RNF216P1-203ENST00000404404 2427 ntBASIC14.72□□□□□ -0.05
HDHD3Q9BSH5 PTPRO-209ENST00000543886 2070 ntTSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
HDHD3Q9BSH5 GBA2-203ENST00000378103 3611 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
HDHD3Q9BSH5 RUSC1-214ENST00000490373 1700 ntTSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
HDHD3Q9BSH5 LINC02012-201ENST00000608206 1725 ntBASIC14.72□□□□□ -0.05
HDHD3Q9BSH5 LETM2-202ENST00000379957 1873 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.72□□□□□ -0.05
HDHD3Q9BSH5 WDR6-202ENST00000415265 1883 ntTSL 2 BASIC14.72□□□□□ -0.05
HDHD3Q9BSH5 LIN54-204ENST00000505397 2742 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.72□□□□□ -0.05
HDHD3Q9BSH5 GHR-201ENST00000230882 4560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
HDHD3Q9BSH5 FAM9A-202ENST00000543214 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
HDHD3Q9BSH5 ADRA1A-206ENST00000380586 2304 ntTSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
HDHD3Q9BSH5 SUSD4-208ENST00000494793 1833 ntTSL 5 BASIC14.71□□□□□ -0.05
HDHD3Q9BSH5 TRPV4-207ENST00000541794 2475 ntTSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
HDHD3Q9BSH5 HS6ST2-204ENST00000521489 2607 ntTSL 5 BASIC14.71□□□□□ -0.05
HDHD3Q9BSH5 SATB2-202ENST00000417098 5730 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.71□□□□□ -0.05
HDHD3Q9BSH5 PIAS3-201ENST00000369298 2761 ntTSL 5 BASIC14.71□□□□□ -0.05
HDHD3Q9BSH5 DOC2A-209ENST00000564979 1630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
HDHD3Q9BSH5 GLS2-216ENST00000610413 2296 ntTSL 5 BASIC14.71□□□□□ -0.05
HDHD3Q9BSH5 DGKZ-201ENST00000318201 3213 ntTSL 2 BASIC14.71□□□□□ -0.05
HDHD3Q9BSH5 FBXL16-202ENST00000397621 3547 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.71□□□□□ -0.05
HDHD3Q9BSH5 ILVBL-209ENST00000534378 2067 ntTSL 5 BASIC14.71□□□□□ -0.05
HDHD3Q9BSH5 LIMD2-211ENST00000583211 1298 ntTSL 3 BASIC14.71□□□□□ -0.05
HDHD3Q9BSH5 UQCR11-201ENST00000585671 753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
HDHD3Q9BSH5 MIR2117HG-201ENST00000588060 506 ntTSL 4 BASIC14.71□□□□□ -0.05
HDHD3Q9BSH5 AC009779.2-201ENST00000552576 1443 ntTSL 4 BASIC14.71□□□□□ -0.05
HDHD3Q9BSH5 AD000671.3-202ENST00000591091 1712 ntTSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
HDHD3Q9BSH5 AC093525.9-201ENST00000624961 1746 ntBASIC14.71□□□□□ -0.05
HDHD3Q9BSH5 HAGH-202ENST00000397356 2984 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
HDHD3Q9BSH5 SLC10A3-204ENST00000393587 1862 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC14.71□□□□□ -0.05
HDHD3Q9BSH5 SART1-201ENST00000312397 3293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
HDHD3Q9BSH5 NEIL2-204ENST00000455213 2323 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.71□□□□□ -0.05
HDHD3Q9BSH5 B4GALT4-216ENST00000483209 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
HDHD3Q9BSH5 PALM-201ENST00000264560 2755 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC14.71□□□□□ -0.06
HDHD3Q9BSH5 EIF4ENIF1-206ENST00000397525 3695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.06
HDHD3Q9BSH5 SLC9A7-201ENST00000328306 3838 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.06
HDHD3Q9BSH5 CDK2AP2-201ENST00000301488 1378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.06
HDHD3Q9BSH5 HMBS-203ENST00000442944 1548 ntTSL 5 BASIC14.71□□□□□ -0.06
HDHD3Q9BSH5 TRMT44-205ENST00000513449 1666 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.06
HDHD3Q9BSH5 LYPLAL1-201ENST00000366927 1819 ntTSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.06
HDHD3Q9BSH5 SREK1-216ENST00000612404 2128 ntTSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.06
HDHD3Q9BSH5 ABCB10-201ENST00000344517 3857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
HDHD3Q9BSH5 SLC27A1-201ENST00000252595 3594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
HDHD3Q9BSH5 DRC3-201ENST00000313838 2064 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.7□□□□□ -0.06
HDHD3Q9BSH5 TRNT1-205ENST00000402675 1935 ntTSL 2 BASIC14.7□□□□□ -0.06
HDHD3Q9BSH5 SELENBP1-201ENST00000368868 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
HDHD3Q9BSH5 TYMS-201ENST00000323224 1327 ntTSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
HDHD3Q9BSH5 HNRNPF-204ENST00000443950 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
HDHD3Q9BSH5 LITAF-209ENST00000571688 2632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
HDHD3Q9BSH5 MYEOV-203ENST00000535407 2306 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.7□□□□□ -0.06
HDHD3Q9BSH5 CEP76-202ENST00000423709 2197 ntTSL 2 BASIC14.7□□□□□ -0.06
HDHD3Q9BSH5 DPEP3-201ENST00000268793 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
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