Protein–RNA interactions for Protein: Q92750

TAF4B, Transcription initiation factor TFIID subunit 4B, humanhuman

Predictions only

Length 862 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TAF4BQ92750 ARMC12-202ENST00000373866 1254 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.1■□□□□ 0.65
TAF4BQ92750 C1QC-201ENST00000374637 1089 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.1■□□□□ 0.65
TAF4BQ92750 PSMB8-202ENST00000374882 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
TAF4BQ92750 ITM2C-204ENST00000409704 1106 ntTSL 5 BASIC19.1■□□□□ 0.65
TAF4BQ92750 LENG8-AS1-201ENST00000416022 582 ntTSL 3 BASIC19.1■□□□□ 0.65
TAF4BQ92750 IFT27-205ENST00000433985 1095 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
TAF4BQ92750 MINOS1P3-201ENST00000457048 203 ntBASIC19.1■□□□□ 0.65
TAF4BQ92750 AC004080.2-201ENST00000523331 556 ntTSL 4 BASIC19.1■□□□□ 0.65
TAF4BQ92750 CHTOP-203ENST00000368690 2165 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
TAF4BQ92750 GLRB-201ENST00000264428 3126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
TAF4BQ92750 GPAT3-202ENST00000395226 2631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
TAF4BQ92750 JAK3-201ENST00000458235 5432 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.1■□□□□ 0.65
TAF4BQ92750 CCDC78-201ENST00000293889 1611 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
TAF4BQ92750 EMB-204ENST00000508934 1617 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.1■□□□□ 0.65
TAF4BQ92750 AC008969.1-201ENST00000550135 6438 ntTSL 2 BASIC19.1■□□□□ 0.65
TAF4BQ92750 GABARAPL1-201ENST00000266458 1957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
TAF4BQ92750 ARNTL2-208ENST00000544915 6785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.1■□□□□ 0.65
TAF4BQ92750 CYP2W1-202ENST00000340150 2361 ntTSL 2 BASIC19.1■□□□□ 0.65
TAF4BQ92750 UQCC3-201ENST00000377953 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
TAF4BQ92750 CD151-203ENST00000397421 1486 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
TAF4BQ92750 NUDC-201ENST00000321265 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
TAF4BQ92750 WDR88-202ENST00000361680 1835 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
TAF4BQ92750 NRP1-204ENST00000374822 2213 ntTSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
TAF4BQ92750 PRPF31-202ENST00000391755 1767 ntTSL 5 BASIC19.09■□□□□ 0.65
TAF4BQ92750 AMFR-201ENST00000290649 3600 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
TAF4BQ92750 PFN1-201ENST00000225655 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
TAF4BQ92750 OR10H5-201ENST00000308940 1132 ntAPPRIS P1 BASIC19.09■□□□□ 0.65
TAF4BQ92750 NEURL2-201ENST00000372518 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
TAF4BQ92750 NFIB-201ENST00000380921 1274 ntTSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
TAF4BQ92750 COX5BP2-201ENST00000392354 334 ntBASIC19.09■□□□□ 0.65
TAF4BQ92750 POM121L3P-201ENST00000419331 1163 ntBASIC19.09■□□□□ 0.65
TAF4BQ92750 AC007967.3-201ENST00000434308 558 ntBASIC19.09■□□□□ 0.65
TAF4BQ92750 ADA-207ENST00000537820 1128 ntTSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
TAF4BQ92750 SPAG7-207ENST00000575142 1094 ntTSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
TAF4BQ92750 CYP1B1-AS1-214ENST00000620177 554 ntTSL 4 BASIC19.09■□□□□ 0.65
TAF4BQ92750 RAB34-226ENST00000636772 1180 ntTSL 5 BASIC19.09■□□□□ 0.65
TAF4BQ92750 RBBP7-203ENST00000380087 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
TAF4BQ92750 CAMK1D-201ENST00000378845 1578 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
TAF4BQ92750 ODF2-204ENST00000372814 2249 ntTSL 2 BASIC19.09■□□□□ 0.65
TAF4BQ92750 GMPR-201ENST00000259727 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
TAF4BQ92750 PYCR2-208ENST00000612039 1549 ntTSL 3 BASIC19.09■□□□□ 0.65
TAF4BQ92750 PYCR2-209ENST00000612651 1538 ntTSL 5 BASIC19.09■□□□□ 0.65
TAF4BQ92750 RCAN3-209ENST00000616511 2527 ntTSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
TAF4BQ92750 TADA1-201ENST00000367874 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
TAF4BQ92750 RNF32-201ENST00000311822 1842 ntTSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
TAF4BQ92750 PTGER3-208ENST00000370932 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.09■□□□□ 0.65
TAF4BQ92750 WDR13-201ENST00000218056 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
TAF4BQ92750 AC099398.1-201ENST00000567919 2776 ntBASIC19.09■□□□□ 0.65
TAF4BQ92750 CHEK2-202ENST00000348295 1771 ntTSL 5 BASIC19.09■□□□□ 0.65
TAF4BQ92750 VPS51-201ENST00000279281 2714 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
TAF4BQ92750 LINC01554-202ENST00000436592 2052 ntTSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
TAF4BQ92750 MEPCE-201ENST00000310512 3030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
TAF4BQ92750 RAPGEFL1-212ENST00000620260 3855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
TAF4BQ92750 AQP8-201ENST00000219660 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
TAF4BQ92750 NR1H3-202ENST00000405576 1352 ntTSL 5 BASIC19.08■□□□□ 0.65
TAF4BQ92750 RGL3-202ENST00000393423 2278 ntTSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
TAF4BQ92750 ALDH3B1-204ENST00000614849 2280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
TAF4BQ92750 PDE2A-226ENST00000544570 3119 ntTSL 5 BASIC19.08■□□□□ 0.65
TAF4BQ92750 GGN-201ENST00000334928 2239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
TAF4BQ92750 PCGF6-202ENST00000369847 2230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
TAF4BQ92750 MUM1-216ENST00000627377 2235 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.08■□□□□ 0.65
TAF4BQ92750 PROK1-201ENST00000271331 1338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
TAF4BQ92750 IFFO1-211ENST00000615885 2775 ntTSL 5 BASIC19.08■□□□□ 0.65
TAF4BQ92750 GHDC-202ENST00000414034 2496 ntTSL 2 BASIC19.08■□□□□ 0.65
TAF4BQ92750 LARP4-210ENST00000522085 1577 ntTSL 2 BASIC19.08■□□□□ 0.65
TAF4BQ92750 CFC1-202ENST00000615342 1554 ntTSL 5 BASIC19.08■□□□□ 0.65
TAF4BQ92750 CFC1B-202ENST00000619050 1554 ntTSL 5 BASIC19.08■□□□□ 0.65
TAF4BQ92750 NPFFR2-202ENST00000344413 1234 ntTSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
TAF4BQ92750 BOLA1-201ENST00000369150 811 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.08■□□□□ 0.64
TAF4BQ92750 FAM57A-205ENST00000572018 373 ntTSL 3 BASIC19.08■□□□□ 0.64
TAF4BQ92750 MCRIP1-206ENST00000573478 1123 ntTSL 2 BASIC19.08■□□□□ 0.64
TAF4BQ92750 C1QTNF1-205ENST00000578229 1294 ntTSL 4 BASIC19.08■□□□□ 0.64
TAF4BQ92750 Z94160.2-201ENST00000609322 910 ntTSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
TAF4BQ92750 CERCAM-201ENST00000372838 2685 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
TAF4BQ92750 HNRNPUL2-BSCL2-201ENST00000403734 4001 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.08■□□□□ 0.64
TAF4BQ92750 HIC2-201ENST00000407464 6798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
TAF4BQ92750 TMEFF2-201ENST00000272771 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
TAF4BQ92750 STRN4-204ENST00000539396 2608 ntTSL 2 BASIC19.08■□□□□ 0.64
TAF4BQ92750 VSIG10L2-202ENST00000638636 2304 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.08■□□□□ 0.64
TAF4BQ92750 AL138752.2-201ENST00000540557 2591 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.08■□□□□ 0.64
TAF4BQ92750 AD000864.1-201ENST00000624076 2295 ntBASIC19.08■□□□□ 0.64
TAF4BQ92750 COL9A1-201ENST00000320755 3059 ntTSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
TAF4BQ92750 SPECC1-203ENST00000395525 2536 ntTSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
TAF4BQ92750 ZNF618-203ENST00000374126 3018 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
TAF4BQ92750 PMS1-206ENST00000418224 3018 ntTSL 5 BASIC19.08■□□□□ 0.64
TAF4BQ92750 MEX3A-202ENST00000532414 6124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
TAF4BQ92750 CXorf67-201ENST00000342995 1929 ntAPPRIS P1 BASIC19.08■□□□□ 0.64
TAF4BQ92750 AL355312.1-201ENST00000407115 2176 ntBASIC19.08■□□□□ 0.64
TAF4BQ92750 CCDC115-201ENST00000259229 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
TAF4BQ92750 MMEL1-201ENST00000378412 2849 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.07■□□□□ 0.64
TAF4BQ92750 WASHC2C-209ENST00000540872 4519 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
TAF4BQ92750 HOXA-AS3-205ENST00000524304 2063 ntTSL 2 BASIC19.07■□□□□ 0.64
TAF4BQ92750 SDCBP2-204ENST00000381812 1550 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.07■□□□□ 0.64
TAF4BQ92750 RNF187-201ENST00000305943 3017 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
TAF4BQ92750 TSPAN32-201ENST00000182290 1318 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
TAF4BQ92750 TSPAN32-217ENST00000612299 1301 ntTSL 5 BASIC19.07■□□□□ 0.64
TAF4BQ92750 INPP4A-202ENST00000409016 9996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
TAF4BQ92750 HYAL1-203ENST00000395143 1522 ntTSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
TAF4BQ92750 ZSCAN10-207ENST00000575108 2247 ntTSL 2 BASIC19.07■□□□□ 0.64
TAF4BQ92750 MAP4K2-202ENST00000377350 2931 ntTSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28.1 ms