Protein–RNA interactions for Protein: Q7Z7G1

CLNK, Cytokine-dependent hematopoietic cell linker, humanhuman

Predictions only

Length 428 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CLNKQ7Z7G1 HAGLR-204ENST00000425005 623 ntTSL 3 BASIC17.32■□□□□ 0.36
CLNKQ7Z7G1 HOMER2P1-201ENST00000455653 964 ntBASIC17.32■□□□□ 0.36
CLNKQ7Z7G1 AP003396.1-201ENST00000501918 507 ntTSL 5 BASIC17.32■□□□□ 0.36
CLNKQ7Z7G1 USF2-205ENST00000594064 1179 ntTSL 2 BASIC17.32■□□□□ 0.36
CLNKQ7Z7G1 ESR2-205ENST00000358599 1899 ntTSL 2 BASIC17.32■□□□□ 0.36
CLNKQ7Z7G1 CTNNAL1-201ENST00000325551 2490 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
CLNKQ7Z7G1 AC009949.1-201ENST00000623048 1830 ntBASIC17.32■□□□□ 0.36
CLNKQ7Z7G1 RAI2-206ENST00000545871 2421 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC17.32■□□□□ 0.36
CLNKQ7Z7G1 SH2B1-203ENST00000359285 3033 ntTSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
CLNKQ7Z7G1 UNC5D-203ENST00000416672 3532 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.32■□□□□ 0.36
CLNKQ7Z7G1 NPRL3-211ENST00000611875 2881 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.32■□□□□ 0.36
CLNKQ7Z7G1 GAREM2-202ENST00000407684 5138 ntTSL 2 BASIC17.32■□□□□ 0.36
CLNKQ7Z7G1 WDR18-202ENST00000585809 1608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
CLNKQ7Z7G1 LCK-202ENST00000336890 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
CLNKQ7Z7G1 HDAC8-206ENST00000373571 2133 ntTSL 5 BASIC17.32■□□□□ 0.36
CLNKQ7Z7G1 RABGGTA-201ENST00000216840 2088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
CLNKQ7Z7G1 AC006449.5-201ENST00000610658 2098 ntBASIC17.32■□□□□ 0.36
CLNKQ7Z7G1 LINC00634-201ENST00000381348 1510 ntTSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
CLNKQ7Z7G1 SULT1A2-204ENST00000533150 1991 ntTSL 2 BASIC17.31■□□□□ 0.36
CLNKQ7Z7G1 GBGT1-204ENST00000372043 1935 ntTSL 2 BASIC17.31■□□□□ 0.36
CLNKQ7Z7G1 NKIRAS1-207ENST00000437230 1898 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
CLNKQ7Z7G1 HNF1A-215ENST00000615446 2344 ntTSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
CLNKQ7Z7G1 TLE3-212ENST00000558201 2766 ntTSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
CLNKQ7Z7G1 AMMECR1-201ENST00000262844 5504 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
CLNKQ7Z7G1 THAP8-201ENST00000292894 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
CLNKQ7Z7G1 MEGF9-201ENST00000373930 6298 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.31■□□□□ 0.36
CLNKQ7Z7G1 GSTM4-201ENST00000326729 1321 ntTSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
CLNKQ7Z7G1 SLC25A45-201ENST00000294187 2196 ntTSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
CLNKQ7Z7G1 LCK-201ENST00000333070 2166 ntTSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
CLNKQ7Z7G1 KCNV2-201ENST00000382082 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
CLNKQ7Z7G1 WWOX-203ENST00000406884 1701 ntTSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
CLNKQ7Z7G1 RECQL4-210ENST00000621189 3896 ntTSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
CLNKQ7Z7G1 PEX11G-201ENST00000221480 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
CLNKQ7Z7G1 NUDT8-201ENST00000301490 809 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
CLNKQ7Z7G1 CHTOP-202ENST00000368687 1094 ntTSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
CLNKQ7Z7G1 ABCD1-202ENST00000370129 1016 ntTSL 2 BASIC17.31■□□□□ 0.36
CLNKQ7Z7G1 SUV39H2-204ENST00000378325 1292 ntTSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
CLNKQ7Z7G1 STARP1-201ENST00000397973 869 ntBASIC17.31■□□□□ 0.36
CLNKQ7Z7G1 YPEL3-201ENST00000398838 935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
CLNKQ7Z7G1 AC004080.5-201ENST00000498652 368 ntTSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
CLNKQ7Z7G1 CCNG1-211ENST00000512163 919 ntTSL 2 BASIC17.31■□□□□ 0.36
CLNKQ7Z7G1 RPL26L1-205ENST00000519974 695 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.31■□□□□ 0.36
CLNKQ7Z7G1 NTF6B-201ENST00000591913 560 ntBASIC17.31■□□□□ 0.36
CLNKQ7Z7G1 AC010331.1-201ENST00000611423 582 ntBASIC17.31■□□□□ 0.36
CLNKQ7Z7G1 MRPS30-202ENST00000507110 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
CLNKQ7Z7G1 DPEP3-201ENST00000268793 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
CLNKQ7Z7G1 SH3BP4-202ENST00000392011 5194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
CLNKQ7Z7G1 MAP4K4-202ENST00000324219 7526 ntTSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
CLNKQ7Z7G1 TMEM50B-210ENST00000542230 2375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
CLNKQ7Z7G1 AC020661.1-201ENST00000503052 1584 ntTSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
CLNKQ7Z7G1 AC117500.2-201ENST00000508145 1561 ntTSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
CLNKQ7Z7G1 BAZ1A-203ENST00000382422 5775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
CLNKQ7Z7G1 MGAT1-203ENST00000393340 3077 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.31■□□□□ 0.36
CLNKQ7Z7G1 ARSE-201ENST00000381134 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
CLNKQ7Z7G1 GOLGA2-213ENST00000610329 2212 ntTSL 2 BASIC17.31■□□□□ 0.36
CLNKQ7Z7G1 SLC3A2-203ENST00000377890 2161 ntTSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
CLNKQ7Z7G1 SUV39H1-202ENST00000376687 2871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
CLNKQ7Z7G1 TSHZ1-204ENST00000580243 3582 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.3■□□□□ 0.36
CLNKQ7Z7G1 GNG2-213ENST00000556766 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
CLNKQ7Z7G1 HSPA8-224ENST00000534624 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
CLNKQ7Z7G1 MAP2K7-202ENST00000397981 3430 ntTSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
CLNKQ7Z7G1 WDR20-211ENST00000556807 2382 ntTSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
CLNKQ7Z7G1 ENC1-207ENST00000618628 5657 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.3■□□□□ 0.36
CLNKQ7Z7G1 EDN3-205ENST00000395654 2318 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
CLNKQ7Z7G1 MVK-201ENST00000228510 1956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
CLNKQ7Z7G1 EPN1-203ENST00000411543 2621 ntTSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
CLNKQ7Z7G1 ABHD15-201ENST00000307201 3592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
CLNKQ7Z7G1 TBC1D2B-201ENST00000300584 6067 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.3■□□□□ 0.36
CLNKQ7Z7G1 GUK1-204ENST00000366721 689 ntTSL 3 BASIC17.3■□□□□ 0.36
CLNKQ7Z7G1 AC112907.2-201ENST00000448639 330 ntBASIC17.3■□□□□ 0.36
CLNKQ7Z7G1 H3F3B-206ENST00000587560 551 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.3■□□□□ 0.36
CLNKQ7Z7G1 NDUFAB1-201ENST00000007516 717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
CLNKQ7Z7G1 FGD5-201ENST00000285046 5720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
CLNKQ7Z7G1 GPAT2P1-202ENST00000471661 1569 ntTSL 2 BASIC17.3■□□□□ 0.36
CLNKQ7Z7G1 FCHO1-201ENST00000252771 3118 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.3■□□□□ 0.36
CLNKQ7Z7G1 GATAD2A-202ENST00000360315 5671 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.3■□□□□ 0.36
CLNKQ7Z7G1 DUSP8-202ENST00000397374 4480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
CLNKQ7Z7G1 LRP11-201ENST00000239367 3260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
CLNKQ7Z7G1 PTPRO-209ENST00000543886 2070 ntTSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
CLNKQ7Z7G1 RHBG-204ENST00000537040 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
CLNKQ7Z7G1 MED25-212ENST00000618715 1467 ntTSL 5 BASIC17.3■□□□□ 0.36
CLNKQ7Z7G1 FGF4-201ENST00000168712 3233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
CLNKQ7Z7G1 RRAGD-202ENST00000369415 4900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
CLNKQ7Z7G1 PICALM-219ENST00000532317 3474 ntTSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
CLNKQ7Z7G1 NLGN2-201ENST00000302926 4642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
CLNKQ7Z7G1 TRIM17-201ENST00000295033 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
CLNKQ7Z7G1 TRIM17-204ENST00000366698 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
CLNKQ7Z7G1 AC074389.1-201ENST00000382528 1423 ntTSL 2 BASIC17.3■□□□□ 0.36
CLNKQ7Z7G1 GCFC2-202ENST00000409857 2516 ntTSL 5 BASIC17.29■□□□□ 0.36
CLNKQ7Z7G1 TSPYL5-201ENST00000322128 4491 ntAPPRIS P1 BASIC17.29■□□□□ 0.36
CLNKQ7Z7G1 MAP3K11-201ENST00000309100 3566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
CLNKQ7Z7G1 FAM50A-202ENST00000393600 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
CLNKQ7Z7G1 SMARCC2-202ENST00000347471 3839 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
CLNKQ7Z7G1 CDKN2B-AS1-208ENST00000580576 2175 ntTSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
CLNKQ7Z7G1 TRAPPC11-201ENST00000334690 4552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
CLNKQ7Z7G1 FEZF1-AS1-202ENST00000428449 2653 ntTSL 2 BASIC17.29■□□□□ 0.36
CLNKQ7Z7G1 LY6E-203ENST00000517503 1335 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC17.29■□□□□ 0.36
CLNKQ7Z7G1 CYB561-205ENST00000542042 1302 ntTSL 2 BASIC17.29■□□□□ 0.36
CLNKQ7Z7G1 ACSS1-201ENST00000323482 3680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
CLNKQ7Z7G1 C16orf71-204ENST00000590191 2564 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.29■□□□□ 0.36
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 31 ms