Protein–RNA interactions for Protein: Q6ZVM7

TOM1L2, TOM1-like protein 2, humanhuman

Predictions only

Length 507 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TOM1L2Q6ZVM7 FAM177A1-207ENST00000554052 540 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.78■■□□□ 1.24
TOM1L2Q6ZVM7 INO80E-210ENST00000567705 880 ntTSL 3 BASIC22.78■■□□□ 1.24
TOM1L2Q6ZVM7 GNAO1-210ENST00000569295 930 ntTSL 2 BASIC22.78■■□□□ 1.24
TOM1L2Q6ZVM7 MIR4515-201ENST00000584082 81 ntBASIC22.78■■□□□ 1.24
TOM1L2Q6ZVM7 ZNF550-208ENST00000601415 515 ntTSL 4 BASIC22.78■■□□□ 1.24
TOM1L2Q6ZVM7 RAB34-224ENST00000636513 888 ntTSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
TOM1L2Q6ZVM7 PNLDC1-207ENST00000610273 1940 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
TOM1L2Q6ZVM7 HPSE-207ENST00000513463 1458 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
TOM1L2Q6ZVM7 PSMD4-201ENST00000368881 1333 ntTSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
TOM1L2Q6ZVM7 NDUFV1-216ENST00000529927 1503 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
TOM1L2Q6ZVM7 RPN2-201ENST00000237530 2515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
TOM1L2Q6ZVM7 TGDS-201ENST00000261296 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
TOM1L2Q6ZVM7 MB21D1-202ENST00000370318 1917 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
TOM1L2Q6ZVM7 RANBP3-220ENST00000591092 1783 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
TOM1L2Q6ZVM7 PIP5KL1-201ENST00000300432 1104 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
TOM1L2Q6ZVM7 ARRB2-203ENST00000381488 1236 ntTSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.24
TOM1L2Q6ZVM7 PLAC9P1-202ENST00000433290 400 ntTSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.24
TOM1L2Q6ZVM7 SNHG11-207ENST00000434729 1058 ntTSL 4 BASIC22.77■■□□□ 1.24
TOM1L2Q6ZVM7 AC108047.1-201ENST00000457407 404 ntTSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.24
TOM1L2Q6ZVM7 REEP2-206ENST00000506158 1021 ntTSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.24
TOM1L2Q6ZVM7 IGHV3-62-201ENST00000520057 340 ntBASIC22.77■■□□□ 1.24
TOM1L2Q6ZVM7 ZNF576-206ENST00000533118 867 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.24
TOM1L2Q6ZVM7 DUSP6-204ENST00000547291 1074 ntTSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.24
TOM1L2Q6ZVM7 AC026150.2-201ENST00000564693 1156 ntBASIC22.77■■□□□ 1.24
TOM1L2Q6ZVM7 AC067852.1-201ENST00000585572 594 ntTSL 4 BASIC22.77■■□□□ 1.24
TOM1L2Q6ZVM7 AC008761.3-201ENST00000624803 892 ntBASIC22.77■■□□□ 1.24
TOM1L2Q6ZVM7 FANCA-203ENST00000389302 1641 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
TOM1L2Q6ZVM7 CADPS2-208ENST00000615869 6066 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
TOM1L2Q6ZVM7 RPS6KB1-203ENST00000406116 1982 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
TOM1L2Q6ZVM7 PKD2-201ENST00000237596 5056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
TOM1L2Q6ZVM7 RGN-204ENST00000457380 2041 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
TOM1L2Q6ZVM7 ADCY1-202ENST00000432715 1693 ntTSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.24
TOM1L2Q6ZVM7 PHLDA3-202ENST00000367311 2640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.23
TOM1L2Q6ZVM7 TTYH3-201ENST00000258796 4840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.23
TOM1L2Q6ZVM7 PRAMEF20-201ENST00000316412 1597 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
TOM1L2Q6ZVM7 CRHR2-207ENST00000471646 2530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
TOM1L2Q6ZVM7 RPS6KA1-203ENST00000374166 3131 ntTSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
TOM1L2Q6ZVM7 SMARCC2-203ENST00000394023 4271 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
TOM1L2Q6ZVM7 MARVELD3-202ENST00000299952 2214 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
TOM1L2Q6ZVM7 IGFBP3-210ENST00000613132 2412 ntTSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
TOM1L2Q6ZVM7 POP7-201ENST00000303151 927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
TOM1L2Q6ZVM7 MUC1-201ENST00000337604 859 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
TOM1L2Q6ZVM7 FAM207CP-201ENST00000443486 507 ntBASIC22.76■■□□□ 1.23
TOM1L2Q6ZVM7 MMP17-203ENST00000535004 719 ntTSL 3 BASIC22.76■■□□□ 1.23
TOM1L2Q6ZVM7 OTUB2-202ENST00000553723 708 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
TOM1L2Q6ZVM7 AL161645.1-201ENST00000622716 1255 ntBASIC22.76■■□□□ 1.23
TOM1L2Q6ZVM7 PDHX-203ENST00000448838 2653 ntTSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
TOM1L2Q6ZVM7 SET-201ENST00000322030 2915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
TOM1L2Q6ZVM7 AC087457.1-201ENST00000503496 2727 ntTSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
TOM1L2Q6ZVM7 ISYNA1-202ENST00000457269 1703 ntTSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
TOM1L2Q6ZVM7 PSMA1-209ENST00000530457 1527 ntTSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
TOM1L2Q6ZVM7 UXT-AS1-201ENST00000590504 1525 ntBASIC22.76■■□□□ 1.23
TOM1L2Q6ZVM7 CGREF1-206ENST00000405600 1346 ntAPPRIS P2 TSL 4 BASIC22.76■■□□□ 1.23
TOM1L2Q6ZVM7 CD55-206ENST00000391921 2433 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
TOM1L2Q6ZVM7 SCP2-202ENST00000371513 2003 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
TOM1L2Q6ZVM7 ERICH1-201ENST00000262109 1813 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
TOM1L2Q6ZVM7 PSTPIP1-201ENST00000379595 1840 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
TOM1L2Q6ZVM7 ZNF211-204ENST00000347302 2472 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
TOM1L2Q6ZVM7 E4F1-204ENST00000564139 2493 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
TOM1L2Q6ZVM7 LYNX1-204ENST00000614491 4708 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
TOM1L2Q6ZVM7 AL138828.1-202ENST00000576956 1881 ntTSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
TOM1L2Q6ZVM7 MAFF-202ENST00000407965 2325 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
TOM1L2Q6ZVM7 DGKI-202ENST00000424189 4163 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
TOM1L2Q6ZVM7 PAX1-205ENST00000613128 5352 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
TOM1L2Q6ZVM7 GLS-202ENST00000338435 4475 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
TOM1L2Q6ZVM7 RMND5A-201ENST00000283632 6301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
TOM1L2Q6ZVM7 RPL21-203ENST00000319826 806 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
TOM1L2Q6ZVM7 CD8B-201ENST00000331469 832 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
TOM1L2Q6ZVM7 CKLF-203ENST00000351137 508 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
TOM1L2Q6ZVM7 TMEM191A-202ENST00000419950 663 ntTSL 3 BASIC22.75■■□□□ 1.23
TOM1L2Q6ZVM7 U52111.1-201ENST00000434284 914 ntTSL 3 BASIC22.75■■□□□ 1.23
TOM1L2Q6ZVM7 AC002310.2-201ENST00000486926 950 ntTSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
TOM1L2Q6ZVM7 SBK3-202ENST00000612221 1270 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
TOM1L2Q6ZVM7 MBD3-201ENST00000156825 5518 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
TOM1L2Q6ZVM7 PRKAR1B-212ENST00000544935 2494 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
TOM1L2Q6ZVM7 ETV4-205ENST00000545954 1775 ntTSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
TOM1L2Q6ZVM7 CYR61-201ENST00000451137 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
TOM1L2Q6ZVM7 ECE2-201ENST00000324557 1823 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
TOM1L2Q6ZVM7 AC120049.1-201ENST00000592638 2065 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
TOM1L2Q6ZVM7 NKX2-1-203ENST00000518149 2583 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
TOM1L2Q6ZVM7 GGT2-201ENST00000401924 2366 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
TOM1L2Q6ZVM7 CLIP2-202ENST00000361545 5445 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
TOM1L2Q6ZVM7 TBL1Y-203ENST00000383032 2407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
TOM1L2Q6ZVM7 MSLN-207ENST00000566549 2418 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
TOM1L2Q6ZVM7 AK1-203ENST00000373176 2266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
TOM1L2Q6ZVM7 MAN1B1-207ENST00000535144 2296 ntTSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
TOM1L2Q6ZVM7 PRR5-ARHGAP8-201ENST00000352766 2043 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
TOM1L2Q6ZVM7 KRT18P55-202ENST00000578578 1546 ntBASIC22.74■■□□□ 1.23
TOM1L2Q6ZVM7 TRIM58-201ENST00000366481 3225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
TOM1L2Q6ZVM7 CCDC34-202ENST00000328697 2103 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
TOM1L2Q6ZVM7 NME1-NME2-202ENST00000393193 1021 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
TOM1L2Q6ZVM7 HMGA1P7-201ENST00000406908 502 ntBASIC22.74■■□□□ 1.23
TOM1L2Q6ZVM7 SPDYE14P-201ENST00000442619 822 ntBASIC22.74■■□□□ 1.23
TOM1L2Q6ZVM7 GAPDHP21-201ENST00000450301 1010 ntBASIC22.74■■□□□ 1.23
TOM1L2Q6ZVM7 TSC22D3-213ENST00000506081 956 ntTSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
TOM1L2Q6ZVM7 BEST1-205ENST00000526988 1263 ntTSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
TOM1L2Q6ZVM7 LINC01225-203ENST00000563550 1244 ntBASIC22.74■■□□□ 1.23
TOM1L2Q6ZVM7 AC005391.1-201ENST00000613285 341 ntTSL 3 BASIC22.74■■□□□ 1.23
TOM1L2Q6ZVM7 HFE2-206ENST00000634927 506 ntTSL 4 BASIC22.74■■□□□ 1.23
TOM1L2Q6ZVM7 KANSL1-218ENST00000638275 5352 ntTSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29.7 ms