Protein–RNA interactions for Protein: Q6UXM1

LRIG3, Leucine-rich repeats and immunoglobulin-like domains protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 1,119 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LRIG3Q6UXM1 SLC25A1P2-201ENST00000430693 912 ntBASIC17.75■□□□□ 0.43
LRIG3Q6UXM1 AP005717.1-202ENST00000523563 419 ntTSL 3 BASIC17.75■□□□□ 0.43
LRIG3Q6UXM1 GRAMD1B-209ENST00000533341 707 ntTSL 2 BASIC17.75■□□□□ 0.43
LRIG3Q6UXM1 CD177P1-201ENST00000606252 935 ntBASIC17.75■□□□□ 0.43
LRIG3Q6UXM1 NPR3-203ENST00000415167 1753 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
LRIG3Q6UXM1 MSC-201ENST00000325509 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
LRIG3Q6UXM1 PBK-203ENST00000522944 1499 ntTSL 2 BASIC17.75■□□□□ 0.43
LRIG3Q6UXM1 DHRS4L2-203ENST00000534993 1450 ntTSL 3 BASIC17.75■□□□□ 0.43
LRIG3Q6UXM1 MYB-203ENST00000341911 3672 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
LRIG3Q6UXM1 VASP-201ENST00000245932 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
LRIG3Q6UXM1 LAPTM4B-201ENST00000445593 3173 ntTSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
LRIG3Q6UXM1 AP3D1-201ENST00000345016 4870 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
LRIG3Q6UXM1 PHF12-205ENST00000577226 7679 ntTSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
LRIG3Q6UXM1 AMT-250ENST00000637682 1823 ntTSL 5 BASIC17.75■□□□□ 0.43
LRIG3Q6UXM1 PPP4C-202ENST00000561610 1333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
LRIG3Q6UXM1 PTEN-201ENST00000371953 9027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
LRIG3Q6UXM1 SYBU-231ENST00000533065 2645 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.74■□□□□ 0.43
LRIG3Q6UXM1 MEG3-206ENST00000423456 1771 ntTSL 2 BASIC17.74■□□□□ 0.43
LRIG3Q6UXM1 POC1A-201ENST00000296484 1898 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
LRIG3Q6UXM1 TCP11L2-201ENST00000299045 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
LRIG3Q6UXM1 SYTL2-215ENST00000527523 3049 ntTSL 2 BASIC17.74■□□□□ 0.43
LRIG3Q6UXM1 LINC00671-201ENST00000301683 1958 ntTSL 2 BASIC17.74■□□□□ 0.43
LRIG3Q6UXM1 WRB-201ENST00000333781 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
LRIG3Q6UXM1 PRORSD1P-201ENST00000295112 541 ntBASIC17.74■□□□□ 0.43
LRIG3Q6UXM1 IGHV3-73-201ENST00000390636 437 ntAPPRIS P1 BASIC17.74■□□□□ 0.43
LRIG3Q6UXM1 FAM131A-208ENST00000453072 1038 ntTSL 2 BASIC17.74■□□□□ 0.43
LRIG3Q6UXM1 AL451069.1-201ENST00000455414 634 ntTSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
LRIG3Q6UXM1 WDR86-AS1-203ENST00000480632 704 ntTSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
LRIG3Q6UXM1 AC002558.1-201ENST00000488906 803 ntBASIC17.74■□□□□ 0.43
LRIG3Q6UXM1 NUDT16P1-203ENST00000513809 620 ntBASIC17.74■□□□□ 0.43
LRIG3Q6UXM1 PRORSD1P-203ENST00000579162 626 ntTSL 5 BASIC17.74■□□□□ 0.43
LRIG3Q6UXM1 ARHGDIA-207ENST00000580685 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
LRIG3Q6UXM1 AP001412.1-201ENST00000608405 714 ntBASIC17.74■□□□□ 0.43
LRIG3Q6UXM1 BX649632.1-201ENST00000610187 819 ntTSL 3 BASIC17.74■□□□□ 0.43
LRIG3Q6UXM1 ZIC5-201ENST00000267294 4639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
LRIG3Q6UXM1 AC132872.4-202ENST00000622924 2756 ntBASIC17.74■□□□□ 0.43
LRIG3Q6UXM1 ARL6IP1-201ENST00000304414 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
LRIG3Q6UXM1 SLC25A3-211ENST00000548847 1369 ntTSL 5 BASIC17.74■□□□□ 0.43
LRIG3Q6UXM1 ANKRD23-203ENST00000418232 2156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
LRIG3Q6UXM1 TMEM138-201ENST00000278826 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
LRIG3Q6UXM1 ARHGAP27-208ENST00000528384 2296 ntTSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
LRIG3Q6UXM1 KDM5C-202ENST00000375379 5245 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.74■□□□□ 0.43
LRIG3Q6UXM1 CDK19-202ENST00000368911 6246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
LRIG3Q6UXM1 ELAC2-203ENST00000426905 2671 ntTSL 2 BASIC17.74■□□□□ 0.43
LRIG3Q6UXM1 EIF4ENIF1-206ENST00000397525 3695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
LRIG3Q6UXM1 DNAAF2-201ENST00000298292 2963 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
LRIG3Q6UXM1 NFATC4-210ENST00000554050 3057 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
LRIG3Q6UXM1 GABRB2-202ENST00000353437 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
LRIG3Q6UXM1 ONECUT1-201ENST00000305901 2092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
LRIG3Q6UXM1 CDS1-201ENST00000295887 4461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
LRIG3Q6UXM1 GPR176-205ENST00000561100 2816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
LRIG3Q6UXM1 TRAF2-201ENST00000247668 2264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
LRIG3Q6UXM1 AL360181.3-201ENST00000468317 1605 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.73■□□□□ 0.43
LRIG3Q6UXM1 ADM5-201ENST00000420022 1718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
LRIG3Q6UXM1 PHTF1-205ENST00000393357 3244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
LRIG3Q6UXM1 AL590627.1-201ENST00000626603 1910 ntTSL 2 BASIC17.73■□□□□ 0.43
LRIG3Q6UXM1 TSC2-222ENST00000568454 5434 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.73■□□□□ 0.43
LRIG3Q6UXM1 KLK14-201ENST00000156499 1060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
LRIG3Q6UXM1 EMC6-201ENST00000248378 653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
LRIG3Q6UXM1 AC073343.2-203ENST00000366167 564 ntTSL 4 BASIC17.73■□□□□ 0.43
LRIG3Q6UXM1 LINC01743-201ENST00000366308 964 ntTSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
LRIG3Q6UXM1 NDUFA1-201ENST00000371437 766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
LRIG3Q6UXM1 KLK14-202ENST00000391802 1133 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.73■□□□□ 0.43
LRIG3Q6UXM1 PVRIG2P-201ENST00000435460 978 ntBASIC17.73■□□□□ 0.43
LRIG3Q6UXM1 ADAMTS19-AS1-201ENST00000502827 786 ntTSL 4 BASIC17.73■□□□□ 0.43
LRIG3Q6UXM1 PHB2-207ENST00000542912 1138 ntTSL 5 BASIC17.73■□□□□ 0.43
LRIG3Q6UXM1 AC142381.4-202ENST00000563973 229 ntBASIC17.73■□□□□ 0.43
LRIG3Q6UXM1 AC099518.3-201ENST00000564808 809 ntAPPRIS P5 TSL 4 BASIC17.73■□□□□ 0.43
LRIG3Q6UXM1 SPAG7-207ENST00000575142 1094 ntTSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
LRIG3Q6UXM1 AP005242.2-201ENST00000580065 1175 ntBASIC17.73■□□□□ 0.43
LRIG3Q6UXM1 CD209-209ENST00000601256 994 ntTSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
LRIG3Q6UXM1 C16orf74-207ENST00000602914 761 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.73■□□□□ 0.43
LRIG3Q6UXM1 SLC17A7-204ENST00000600601 2237 ntTSL 2 BASIC17.73■□□□□ 0.43
LRIG3Q6UXM1 NDRG4-202ENST00000356752 1375 ntTSL 2 BASIC17.73■□□□□ 0.43
LRIG3Q6UXM1 TP73-208ENST00000378295 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
LRIG3Q6UXM1 MCF2L-203ENST00000375604 6445 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.73■□□□□ 0.43
LRIG3Q6UXM1 CNTNAP3-201ENST00000297668 5064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
LRIG3Q6UXM1 KLHL36-204ENST00000564996 2173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
LRIG3Q6UXM1 AC024909.3-201ENST00000611513 2257 ntBASIC17.73■□□□□ 0.43
LRIG3Q6UXM1 ARHGEF28-214ENST00000545377 6351 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.73■□□□□ 0.43
LRIG3Q6UXM1 TVP23B-202ENST00000476139 2989 ntTSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
LRIG3Q6UXM1 MBD1-204ENST00000347968 3091 ntTSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
LRIG3Q6UXM1 VPS54-201ENST00000272322 3463 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.73■□□□□ 0.43
LRIG3Q6UXM1 IL2RG-202ENST00000374188 1432 ntTSL 5 BASIC17.72■□□□□ 0.43
LRIG3Q6UXM1 LITAF-202ENST00000381810 1527 ntTSL 5 BASIC17.72■□□□□ 0.43
LRIG3Q6UXM1 KIF25-203ENST00000443060 1613 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.72■□□□□ 0.43
LRIG3Q6UXM1 QRFPR-202ENST00000394427 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
LRIG3Q6UXM1 EVA1A-205ENST00000410113 1747 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC17.72■□□□□ 0.43
LRIG3Q6UXM1 GFM1-208ENST00000478576 2147 ntTSL 2 BASIC17.72■□□□□ 0.43
LRIG3Q6UXM1 MCF2L-208ENST00000397030 6580 ntTSL 2 BASIC17.72■□□□□ 0.43
LRIG3Q6UXM1 AFTPH-202ENST00000238856 4040 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
LRIG3Q6UXM1 ADD1-205ENST00000398125 4079 ntTSL 5 BASIC17.72■□□□□ 0.43
LRIG3Q6UXM1 TM9SF1-201ENST00000261789 2452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
LRIG3Q6UXM1 CHAT-203ENST00000351556 2286 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.72■□□□□ 0.43
LRIG3Q6UXM1 LCORL-203ENST00000382226 5009 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.72■□□□□ 0.43
LRIG3Q6UXM1 HES1-201ENST00000232424 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
LRIG3Q6UXM1 SPAG4-201ENST00000374273 1453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
LRIG3Q6UXM1 MRPL15-201ENST00000260102 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
LRIG3Q6UXM1 SLC35A2-202ENST00000376512 903 ntTSL 2 BASIC17.72■□□□□ 0.43
LRIG3Q6UXM1 ANAPC11-207ENST00000572639 578 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.72■□□□□ 0.43
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 42.3 ms