Protein–RNA interactions for Protein: Q6P2C8

MED27, Mediator of RNA polymerase II transcription subunit 27, humanhuman

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Length 311 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MED27Q6P2C8 DNM1-202ENST00000372923 3244 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
MED27Q6P2C8 AC003669.1-201ENST00000334569 611 ntBASIC16.77■□□□□ 0.28
MED27Q6P2C8 INSL3-202ENST00000379695 899 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
MED27Q6P2C8 NKTR-203ENST00000442970 646 ntTSL 2 BASIC16.77■□□□□ 0.28
MED27Q6P2C8 KLHL21-204ENST00000467612 1056 ntTSL 3 BASIC16.77■□□□□ 0.28
MED27Q6P2C8 AL162258.2-202ENST00000469931 831 ntTSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.28
MED27Q6P2C8 NT5C2-211ENST00000470299 249 ntTSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.28
MED27Q6P2C8 BET1L-206ENST00000486280 665 ntTSL 3 BASIC16.77■□□□□ 0.28
MED27Q6P2C8 SELENOH-204ENST00000534355 818 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
MED27Q6P2C8 AL157871.1-202ENST00000556458 478 ntTSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.28
MED27Q6P2C8 AC138207.7-201ENST00000584499 668 ntTSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.28
MED27Q6P2C8 PROSER2-201ENST00000277570 3333 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
MED27Q6P2C8 ASXL1-212ENST00000620121 5374 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.27
MED27Q6P2C8 FBXO33-201ENST00000298097 3853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
MED27Q6P2C8 SYNE3-202ENST00000553340 2615 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
MED27Q6P2C8 PACS2-205ENST00000547217 2809 ntTSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.27
MED27Q6P2C8 RUNX2-201ENST00000359524 5390 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
MED27Q6P2C8 ALDH16A1-201ENST00000293350 3153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
MED27Q6P2C8 FAM53A-207ENST00000489363 2776 ntTSL 2 BASIC16.77■□□□□ 0.27
MED27Q6P2C8 ST8SIA4-202ENST00000451528 1794 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
MED27Q6P2C8 SBNO2-204ENST00000587024 4861 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.76■□□□□ 0.27
MED27Q6P2C8 VSIG10L2-202ENST00000638636 2304 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
MED27Q6P2C8 PODXL-202ENST00000378555 2105 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
MED27Q6P2C8 ANGPTL4-202ENST00000393962 1705 ntTSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
MED27Q6P2C8 CCM2-207ENST00000475551 2471 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.76■□□□□ 0.27
MED27Q6P2C8 HMGXB3-201ENST00000502717 4974 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
MED27Q6P2C8 FCGBP-203ENST00000620799 4926 ntTSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
MED27Q6P2C8 HCCS-202ENST00000380762 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
MED27Q6P2C8 KLF4P1-201ENST00000412782 1185 ntBASIC16.76■□□□□ 0.27
MED27Q6P2C8 TP53TG1-202ENST00000416560 710 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
MED27Q6P2C8 AL096828.1-201ENST00000423020 542 ntTSL 4 BASIC16.76■□□□□ 0.27
MED27Q6P2C8 UPK3BP1-201ENST00000428678 509 ntBASIC16.76■□□□□ 0.27
MED27Q6P2C8 THAP5-204ENST00000438865 868 ntTSL 2 BASIC16.76■□□□□ 0.27
MED27Q6P2C8 AP000344.1-201ENST00000454268 641 ntTSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
MED27Q6P2C8 AP000344.1-202ENST00000457193 586 ntTSL 4 BASIC16.76■□□□□ 0.27
MED27Q6P2C8 EIF5A2-203ENST00000474096 570 ntTSL 4 BASIC16.76■□□□□ 0.27
MED27Q6P2C8 SURF4-206ENST00000485435 1206 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
MED27Q6P2C8 C19orf25-210ENST00000591027 574 ntTSL 4 BASIC16.76■□□□□ 0.27
MED27Q6P2C8 NBPF14-202ENST00000593495 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
MED27Q6P2C8 NDUFA6-204ENST00000617763 1183 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
MED27Q6P2C8 AC073592.5-201ENST00000624854 528 ntBASIC16.76■□□□□ 0.27
MED27Q6P2C8 CCNC-219ENST00000627680 896 ntTSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
MED27Q6P2C8 TBX6-203ENST00000553607 2162 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
MED27Q6P2C8 ATP6V0E2-202ENST00000425642 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
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MED27Q6P2C8 UNKL-202ENST00000301712 1431 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
MED27Q6P2C8 CLDN15-202ENST00000401528 2131 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.76■□□□□ 0.27
MED27Q6P2C8 GGNBP2-212ENST00000613102 2847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
MED27Q6P2C8 MTG1-201ENST00000317502 1560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
MED27Q6P2C8 RMDN3-202ENST00000338376 2251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
MED27Q6P2C8 TSPAN7-202ENST00000378482 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
MED27Q6P2C8 TRA2A-212ENST00000621813 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.76■□□□□ 0.27
MED27Q6P2C8 TCF4-201ENST00000354452 3482 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
MED27Q6P2C8 ZNF804A-201ENST00000302277 4690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
MED27Q6P2C8 LBX1-AS1-201ENST00000430651 2553 ntTSL 2 BASIC16.76■□□□□ 0.27
MED27Q6P2C8 AC012313.1-201ENST00000593393 3059 ntBASIC16.76■□□□□ 0.27
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MED27Q6P2C8 SLX1A-SULT1A3-202ENST00000565342 2195 ntTSL 2 BASIC16.75■□□□□ 0.27
MED27Q6P2C8 PCDHGC3-205ENST00000617641 2346 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
MED27Q6P2C8 SLC39A1-211ENST00000621013 2322 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.75■□□□□ 0.27
MED27Q6P2C8 RDH12-201ENST00000267502 1833 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
MED27Q6P2C8 AC132938.5-201ENST00000624980 1813 ntBASIC16.75■□□□□ 0.27
MED27Q6P2C8 SMARCA4-215ENST00000590574 5282 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
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MED27Q6P2C8 DDX1-207ENST00000617198 2257 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
MED27Q6P2C8 PPP3CA-201ENST00000323055 4519 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
MED27Q6P2C8 BFSP1-201ENST00000377868 2063 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
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MED27Q6P2C8 MED30-201ENST00000297347 985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
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MED27Q6P2C8 IFT27-205ENST00000433985 1095 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
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MED27Q6P2C8 TBX2-201ENST00000240328 3339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
MED27Q6P2C8 APBB1-207ENST00000529519 1442 ntTSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
MED27Q6P2C8 AC009336.1-201ENST00000608941 1553 ntBASIC16.75■□□□□ 0.27
MED27Q6P2C8 CERCAM-201ENST00000372838 2685 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
MED27Q6P2C8 TRIM17-201ENST00000295033 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
MED27Q6P2C8 CLDN6-202ENST00000396925 1739 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
MED27Q6P2C8 SALL3-202ENST00000537592 6555 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
MED27Q6P2C8 UBE2Q2-201ENST00000267938 3130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
MED27Q6P2C8 ICAM3-205ENST00000589261 2024 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
MED27Q6P2C8 SH2D3C-213ENST00000629203 2478 ntTSL 2 BASIC16.75■□□□□ 0.27
MED27Q6P2C8 COL9A1-201ENST00000320755 3059 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
MED27Q6P2C8 IRF5-210ENST00000477535 1374 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
MED27Q6P2C8 FAM237A-203ENST00000543490 1376 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
MED27Q6P2C8 SORT1-201ENST00000256637 7028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
MED27Q6P2C8 TAPBP-238ENST00000475304 1686 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
MED27Q6P2C8 CLDN4-201ENST00000340958 1831 ntAPPRIS P1 BASIC16.75■□□□□ 0.27
MED27Q6P2C8 NOMO1-208ENST00000620755 3921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
MED27Q6P2C8 SLCO4A1-202ENST00000370507 2665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
MED27Q6P2C8 CREB3L1-206ENST00000621158 2687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
MED27Q6P2C8 ZSCAN10-207ENST00000575108 2247 ntTSL 2 BASIC16.74■□□□□ 0.27
MED27Q6P2C8 ZNF264-202ENST00000536056 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
MED27Q6P2C8 ZSWIM8-213ENST00000603114 5919 ntTSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
MED27Q6P2C8 TTC29-201ENST00000325106 1785 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
MED27Q6P2C8 LGALS12-205ENST00000425950 1789 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
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