Protein–RNA interactions for Protein: Q6GV28

TMEM225, Transmembrane protein 225, humanhuman

Predictions only

Length 225 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TMEM225Q6GV28 PGRMC1-202ENST00000535419 1762 ntTSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.11
TMEM225Q6GV28 FAM135A-205ENST00000418814 6415 ntTSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.11
TMEM225Q6GV28 SLC39A1-211ENST00000621013 2322 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.11
TMEM225Q6GV28 MGEA5-202ENST00000361464 5155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
TMEM225Q6GV28 MDFIC-201ENST00000257724 4598 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
TMEM225Q6GV28 SUFU-202ENST00000369902 5001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
TMEM225Q6GV28 TRIM9-201ENST00000298355 5284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
TMEM225Q6GV28 CRTAC1-201ENST00000309155 1946 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
TMEM225Q6GV28 P2RY6-209ENST00000540342 1611 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
TMEM225Q6GV28 IL27RA-201ENST00000263379 2962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
TMEM225Q6GV28 JPH2-202ENST00000372980 4787 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
TMEM225Q6GV28 ARHGAP22-205ENST00000417912 2352 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
TMEM225Q6GV28 ADGRB2-206ENST00000398556 4879 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
TMEM225Q6GV28 MIB2-219ENST00000505820 3305 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
TMEM225Q6GV28 CCS-201ENST00000310190 942 ntTSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
TMEM225Q6GV28 CXCL12-204ENST00000395793 665 ntTSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
TMEM225Q6GV28 GGT1-204ENST00000401885 968 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
TMEM225Q6GV28 AC005104.2-201ENST00000427818 678 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
TMEM225Q6GV28 LINC02237-202ENST00000521904 477 ntTSL 3 BASIC15.76■□□□□ 0.11
TMEM225Q6GV28 METRN-205ENST00000568415 612 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.76■□□□□ 0.11
TMEM225Q6GV28 AC111152.3-201ENST00000569699 673 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
TMEM225Q6GV28 SRSF1-209ENST00000585096 568 ntTSL 4 BASIC15.76■□□□□ 0.11
TMEM225Q6GV28 AC010632.1-201ENST00000590376 572 ntTSL 4 BASIC15.76■□□□□ 0.11
TMEM225Q6GV28 AC005944.1-201ENST00000592758 564 ntTSL 3 BASIC15.76■□□□□ 0.11
TMEM225Q6GV28 AC011467.2-201ENST00000598425 242 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
TMEM225Q6GV28 C14orf93-204ENST00000397377 1776 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
TMEM225Q6GV28 LOXL3-205ENST00000409986 2005 ntTSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
TMEM225Q6GV28 PIP5K1A-207ENST00000441902 2297 ntTSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
TMEM225Q6GV28 PML-220ENST00000569477 2251 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
TMEM225Q6GV28 PARD3-201ENST00000340077 3518 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
TMEM225Q6GV28 BCAR1-201ENST00000162330 3221 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
TMEM225Q6GV28 NR2E1-202ENST00000368986 3212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
TMEM225Q6GV28 STXBP3-201ENST00000370008 2478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
TMEM225Q6GV28 KDM6B-202ENST00000448097 5422 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
TMEM225Q6GV28 LPAR3-201ENST00000370611 1720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
TMEM225Q6GV28 ACP2-206ENST00000529444 1719 ntTSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
TMEM225Q6GV28 PPP1R3G-201ENST00000405617 4907 ntAPPRIS P1 BASIC15.76■□□□□ 0.11
TMEM225Q6GV28 PEX16-201ENST00000241041 1479 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
TMEM225Q6GV28 WDFY4-202ENST00000360890 2193 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
TMEM225Q6GV28 PLEKHF2-201ENST00000315367 2881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
TMEM225Q6GV28 APBB1-207ENST00000529519 1442 ntTSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
TMEM225Q6GV28 KDM6A-212ENST00000543216 5655 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
TMEM225Q6GV28 GRAMD1B-214ENST00000635736 2814 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
TMEM225Q6GV28 ABCC3-202ENST00000427699 1881 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
TMEM225Q6GV28 PLPPR4-202ENST00000370185 5369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
TMEM225Q6GV28 NADSYN1-201ENST00000319023 2773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
TMEM225Q6GV28 BNIP2-213ENST00000612191 2515 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
TMEM225Q6GV28 LYPLA2-205ENST00000374514 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
TMEM225Q6GV28 SLC7A9-204ENST00000590341 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
TMEM225Q6GV28 CASK-203ENST00000378163 4411 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
TMEM225Q6GV28 RGS14-201ENST00000408923 2415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
TMEM225Q6GV28 SFT2D3-201ENST00000310981 3735 ntAPPRIS P1 BASIC15.75■□□□□ 0.11
TMEM225Q6GV28 NFS1-202ENST00000374085 2645 ntTSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
TMEM225Q6GV28 SCRIB-202ENST00000356994 5218 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
TMEM225Q6GV28 MAP6-202ENST00000434603 4329 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
TMEM225Q6GV28 TGDS-201ENST00000261296 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
TMEM225Q6GV28 HIST2H2AB-201ENST00000331128 393 ntAPPRIS P1 BASIC15.75■□□□□ 0.11
TMEM225Q6GV28 GUCA2A-201ENST00000357001 569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
TMEM225Q6GV28 RPS9-203ENST00000391752 772 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
TMEM225Q6GV28 TNFSF13-204ENST00000396542 726 ntTSL 3 BASIC15.75■□□□□ 0.11
TMEM225Q6GV28 ITM2C-204ENST00000409704 1106 ntTSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
TMEM225Q6GV28 IFT27-205ENST00000433985 1095 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
TMEM225Q6GV28 LINC01293-201ENST00000453951 1266 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
TMEM225Q6GV28 AC002558.1-201ENST00000488906 803 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
TMEM225Q6GV28 NMU-205ENST00000511469 756 ntTSL 3 BASIC15.75■□□□□ 0.11
TMEM225Q6GV28 SNX2-213ENST00000514949 2119 ntTSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
TMEM225Q6GV28 AC004080.2-201ENST00000523331 556 ntTSL 4 BASIC15.75■□□□□ 0.11
TMEM225Q6GV28 AC015712.1-203ENST00000559331 593 ntTSL 3 BASIC15.75■□□□□ 0.11
TMEM225Q6GV28 YPEL3-204ENST00000563788 730 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.75■□□□□ 0.11
TMEM225Q6GV28 AC092338.2-202ENST00000567158 611 ntTSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
TMEM225Q6GV28 AC109462.3-201ENST00000573934 613 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
TMEM225Q6GV28 BAGE2-202ENST00000474011 1482 ntTSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
TMEM225Q6GV28 SENP6-205ENST00000447266 6501 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
TMEM225Q6GV28 CADM3-201ENST00000368124 2546 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
TMEM225Q6GV28 GBA2-201ENST00000378088 1672 ntTSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
TMEM225Q6GV28 NR2F1-201ENST00000327111 3732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
TMEM225Q6GV28 RRM2B-201ENST00000251810 4931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
TMEM225Q6GV28 PHRF1-201ENST00000264555 5523 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
TMEM225Q6GV28 SVOPL-204ENST00000436657 1420 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
TMEM225Q6GV28 SMN1-204ENST00000506163 1445 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
TMEM225Q6GV28 CFC1B-203ENST00000620207 1444 ntTSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
TMEM225Q6GV28 CFC1-203ENST00000621673 1444 ntTSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
TMEM225Q6GV28 CAMK2G-205ENST00000372765 1822 ntTSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
TMEM225Q6GV28 SCP2-202ENST00000371513 2003 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
TMEM225Q6GV28 AC080080.1-201ENST00000625121 2420 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
TMEM225Q6GV28 HDAC10-222ENST00000626012 2607 ntTSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
TMEM225Q6GV28 SYVN1-201ENST00000294256 3048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
TMEM225Q6GV28 SQSTM1-202ENST00000389805 2986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
TMEM225Q6GV28 USH1C-205ENST00000527020 2159 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
TMEM225Q6GV28 AC105001.2-201ENST00000554914 1753 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
TMEM225Q6GV28 FFAR2-202ENST00000599180 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
TMEM225Q6GV28 SCARF1-205ENST00000571272 2871 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
TMEM225Q6GV28 CLN5-208ENST00000636183 6664 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
TMEM225Q6GV28 ALG3-201ENST00000397676 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
TMEM225Q6GV28 AC126755.2-202ENST00000427999 1547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
TMEM225Q6GV28 PSMA1-209ENST00000530457 1527 ntTSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
TMEM225Q6GV28 KCNQ2-207ENST00000370224 3004 ntTSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
TMEM225Q6GV28 ZNF264-202ENST00000536056 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
TMEM225Q6GV28 ADIRF-AS1-201ENST00000418273 2627 ntTSL 3 BASIC15.74■□□□□ 0.11
TMEM225Q6GV28 PCGF6-202ENST00000369847 2230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 43.4 ms