Protein–RNA interactions for Protein: Q15811

ITSN1, Intersectin-1, humanhuman

Predictions only

Length 1,721 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ITSN1Q15811 RNF151-203ENST00000569714 796 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
ITSN1Q15811 EWSR1-202ENST00000332035 1989 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.45■■□□□ 1.34
ITSN1Q15811 WASH6P-202ENST00000359512 1437 ntBASIC23.45■■□□□ 1.34
ITSN1Q15811 ALDH3A1-206ENST00000457500 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
ITSN1Q15811 PDGFA-201ENST00000354513 1308 ntTSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
ITSN1Q15811 EMC8-201ENST00000253457 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
ITSN1Q15811 ELF2-207ENST00000510408 1965 ntTSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
ITSN1Q15811 PPP2R5A-201ENST00000261461 3128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
ITSN1Q15811 ULK3-220ENST00000569437 2611 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
ITSN1Q15811 TMEM41A-201ENST00000296254 1060 ntTSL 2 BASIC23.45■■□□□ 1.34
ITSN1Q15811 MRPL9-202ENST00000368830 1296 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
ITSN1Q15811 GRTP1-AS1-201ENST00000419199 867 ntTSL 5 BASIC23.45■■□□□ 1.34
ITSN1Q15811 PRRT3-AS1-201ENST00000431558 614 ntTSL 2 BASIC23.45■■□□□ 1.34
ITSN1Q15811 AC125807.1-201ENST00000483097 614 ntBASIC23.45■■□□□ 1.34
ITSN1Q15811 RPS3A-212ENST00000514682 985 ntTSL 5 BASIC23.45■■□□□ 1.34
ITSN1Q15811 NTRK1-206ENST00000524377 2432 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
ITSN1Q15811 IQCE-210ENST00000438376 2170 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.45■■□□□ 1.34
ITSN1Q15811 PRR15-201ENST00000319694 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
ITSN1Q15811 CBS-203ENST00000398158 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
ITSN1Q15811 CBSL-206ENST00000624406 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
ITSN1Q15811 HMOX2-217ENST00000619528 1829 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.44■■□□□ 1.34
ITSN1Q15811 DDIT4L-201ENST00000273990 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
ITSN1Q15811 CORO1A-208ENST00000565497 1348 ntTSL 5 BASIC23.44■■□□□ 1.34
ITSN1Q15811 CASP16P-202ENST00000575497 2161 ntTSL 2 BASIC23.44■■□□□ 1.34
ITSN1Q15811 RSRP1-201ENST00000243189 1502 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
ITSN1Q15811 HS3ST3A1-201ENST00000284110 2527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
ITSN1Q15811 RPS27A-201ENST00000272317 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
ITSN1Q15811 LRRC37A5P-201ENST00000374304 1103 ntTSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
ITSN1Q15811 RNU1-129P-201ENST00000384064 167 ntBASIC23.44■■□□□ 1.34
ITSN1Q15811 IL32-212ENST00000526464 1198 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC23.44■■□□□ 1.34
ITSN1Q15811 IL32-217ENST00000530538 674 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC23.44■■□□□ 1.34
ITSN1Q15811 U1.21-201ENST00000580816 167 ntBASIC23.44■■□□□ 1.34
ITSN1Q15811 AMHR2-202ENST00000379791 1437 ntTSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
ITSN1Q15811 OCIAD1-213ENST00000508293 1423 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.44■■□□□ 1.34
ITSN1Q15811 LRRC42-201ENST00000319223 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
ITSN1Q15811 SMOC2-206ENST00000535039 1875 ntTSL 5 BASIC23.44■■□□□ 1.34
ITSN1Q15811 TIMM13-201ENST00000215570 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
ITSN1Q15811 KLF9-201ENST00000377126 5175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
ITSN1Q15811 GBA2-201ENST00000378088 1672 ntTSL 2 BASIC23.43■■□□□ 1.34
ITSN1Q15811 CHEK1-202ENST00000427383 1670 ntTSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
ITSN1Q15811 WDR45-234ENST00000634838 1545 ntTSL 5 BASIC23.43■■□□□ 1.34
ITSN1Q15811 TCERG1L-201ENST00000368642 2618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
ITSN1Q15811 RAB37-208ENST00000402449 1560 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.43■■□□□ 1.34
ITSN1Q15811 GNA11-201ENST00000078429 4147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
ITSN1Q15811 TNNC2-202ENST00000372557 780 ntTSL 3 BASIC23.43■■□□□ 1.34
ITSN1Q15811 HMGA1P7-201ENST00000406908 502 ntBASIC23.43■■□□□ 1.34
ITSN1Q15811 HCG4-201ENST00000418983 998 ntBASIC23.43■■□□□ 1.34
ITSN1Q15811 TTC28-AS1-213ENST00000434221 972 ntTSL 3 BASIC23.43■■□□□ 1.34
ITSN1Q15811 REEP2-206ENST00000506158 1021 ntTSL 2 BASIC23.43■■□□□ 1.34
ITSN1Q15811 AC027088.1-201ENST00000557966 1117 ntTSL 2 BASIC23.43■■□□□ 1.34
ITSN1Q15811 TMEM88-202ENST00000574668 510 ntTSL 2 BASIC23.43■■□□□ 1.34
ITSN1Q15811 AC084121.4-201ENST00000641598 221 ntBASIC23.43■■□□□ 1.34
ITSN1Q15811 AF228730.8-201ENST00000642140 221 ntBASIC23.43■■□□□ 1.34
ITSN1Q15811 UBE3D-203ENST00000369747 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
ITSN1Q15811 FANCA-203ENST00000389302 1641 ntTSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
ITSN1Q15811 PPM1B-201ENST00000282412 2606 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
ITSN1Q15811 LRRC71-201ENST00000337428 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
ITSN1Q15811 BIN1-208ENST00000376113 1832 ntTSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
ITSN1Q15811 FOXD4L6-201ENST00000622588 2034 ntAPPRIS P1 BASIC23.43■■□□□ 1.34
ITSN1Q15811 SCYL1-203ENST00000420247 2583 ntTSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
ITSN1Q15811 GAL3ST1-201ENST00000338911 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
ITSN1Q15811 MIR661-201ENST00000384842 89 ntBASIC23.42■■□□□ 1.34
ITSN1Q15811 MAPK15-202ENST00000395107 834 ntTSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
ITSN1Q15811 AC021744.1-201ENST00000518354 453 ntTSL 3 BASIC23.42■■□□□ 1.34
ITSN1Q15811 C8orf46-213ENST00000521495 557 ntTSL 4 BASIC23.42■■□□□ 1.34
ITSN1Q15811 PRR29-209ENST00000582540 967 ntTSL 2 BASIC23.42■■□□□ 1.34
ITSN1Q15811 INO80C-206ENST00000586489 594 ntTSL 3 BASIC23.42■■□□□ 1.34
ITSN1Q15811 LGMN-211ENST00000555699 1728 ntTSL 5 BASIC23.42■■□□□ 1.34
ITSN1Q15811 MADCAM1-204ENST00000587541 1723 ntTSL 2 BASIC23.42■■□□□ 1.34
ITSN1Q15811 RCAN3-209ENST00000616511 2527 ntTSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
ITSN1Q15811 HCK-210ENST00000629881 1969 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.42■■□□□ 1.34
ITSN1Q15811 ATP6V1E1-201ENST00000253413 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
ITSN1Q15811 ECE1-203ENST00000374893 2484 ntTSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
ITSN1Q15811 NUDT4P1-201ENST00000322209 1206 ntAPPRIS P1 BASIC23.42■■□□□ 1.34
ITSN1Q15811 RESP18-201ENST00000333527 795 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
ITSN1Q15811 VMA21-202ENST00000370361 693 ntTSL 5 BASIC23.42■■□□□ 1.34
ITSN1Q15811 CLIC1-208ENST00000375784 1254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
ITSN1Q15811 CXCL12-206ENST00000395795 404 ntTSL 5 BASIC23.42■■□□□ 1.34
ITSN1Q15811 AC107890.1-201ENST00000422478 521 ntBASIC23.42■■□□□ 1.34
ITSN1Q15811 AC005237.2-201ENST00000434368 219 ntBASIC23.42■■□□□ 1.34
ITSN1Q15811 MTRF1LP2-201ENST00000506027 1122 ntBASIC23.42■■□□□ 1.34
ITSN1Q15811 AC138761.1-201ENST00000584393 385 ntBASIC23.42■■□□□ 1.34
ITSN1Q15811 AC239800.4-201ENST00000603712 296 ntBASIC23.42■■□□□ 1.34
ITSN1Q15811 AL355312.1-201ENST00000407115 2176 ntBASIC23.41■■□□□ 1.34
ITSN1Q15811 SLC6A7-203ENST00000524041 2431 ntTSL 5 BASIC23.41■■□□□ 1.34
ITSN1Q15811 AL353732.1-201ENST00000569618 1459 ntBASIC23.41■■□□□ 1.34
ITSN1Q15811 SLC16A13-201ENST00000308027 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
ITSN1Q15811 AC055854.1-201ENST00000523627 570 ntTSL 4 BASIC23.41■■□□□ 1.34
ITSN1Q15811 AC109635.5-201ENST00000533593 962 ntBASIC23.41■■□□□ 1.34
ITSN1Q15811 AL512356.2-201ENST00000546955 174 ntBASIC23.41■■□□□ 1.34
ITSN1Q15811 AC090241.2-202ENST00000602333 633 ntTSL 3 BASIC23.41■■□□□ 1.34
ITSN1Q15811 AL158211.3-201ENST00000607385 239 ntBASIC23.41■■□□□ 1.34
ITSN1Q15811 MIR6080-201ENST00000617359 66 ntBASIC23.41■■□□□ 1.34
ITSN1Q15811 HOTAIR-201ENST00000424518 2421 ntTSL 5 BASIC23.41■■□□□ 1.34
ITSN1Q15811 UMOD-201ENST00000302509 2477 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.41■■□□□ 1.34
ITSN1Q15811 CLDN7-203ENST00000538261 1923 ntTSL 5 BASIC23.41■■□□□ 1.34
ITSN1Q15811 CORO1C-204ENST00000541050 2487 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.41■■□□□ 1.34
ITSN1Q15811 CCDC28B-202ENST00000421922 1415 ntTSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
ITSN1Q15811 RNH1-205ENST00000397615 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
ITSN1Q15811 FAM90A1-201ENST00000307435 2342 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.4■■□□□ 1.34
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