Protein–RNA interactions for Protein: Q15223

NECTIN1, Nectin-1, humanhuman

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Length 517 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NECTIN1Q15223 HIBCH-201ENST00000359678 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
NECTIN1Q15223 ARFRP1-212ENST00000618838 1623 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.61■□□□□ 0.89
NECTIN1Q15223 MRPL52-202ENST00000355151 1118 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
NECTIN1Q15223 DBNDD2-202ENST00000360981 1078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
NECTIN1Q15223 MRPL43-208ENST00000370242 884 ntTSL 2 BASIC20.61■□□□□ 0.89
NECTIN1Q15223 CREM-211ENST00000374726 1207 ntTSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
NECTIN1Q15223 MRPL52-203ENST00000397496 1111 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.61■□□□□ 0.89
NECTIN1Q15223 HDAC11-202ENST00000402259 1000 ntTSL 3 BASIC20.61■□□□□ 0.89
NECTIN1Q15223 C7orf34-201ENST00000409607 766 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
NECTIN1Q15223 UBXN10-AS1-201ENST00000442226 510 ntTSL 2 BASIC20.61■□□□□ 0.89
NECTIN1Q15223 LINC01293-201ENST00000453951 1266 ntTSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
NECTIN1Q15223 CT47A11-201ENST00000457020 1294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
NECTIN1Q15223 AC124947.2-201ENST00000547118 1133 ntBASIC20.61■□□□□ 0.89
NECTIN1Q15223 HDDC3-205ENST00000559898 1024 ntTSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
NECTIN1Q15223 AC020934.1-201ENST00000588469 739 ntTSL 3 BASIC20.61■□□□□ 0.89
NECTIN1Q15223 EWSR1-206ENST00000397938 2654 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
NECTIN1Q15223 JKAMP-215ENST00000616435 2338 ntTSL 5 BASIC20.61■□□□□ 0.89
NECTIN1Q15223 USP3-AS1-201ENST00000558831 1784 ntTSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
NECTIN1Q15223 VIPR2-202ENST00000377633 1491 ntTSL 2 BASIC20.61■□□□□ 0.89
NECTIN1Q15223 EML6-201ENST00000356458 8320 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.61■□□□□ 0.89
NECTIN1Q15223 SCOC-211ENST00000614192 1959 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
NECTIN1Q15223 CCZ1-207ENST00000628813 2218 ntTSL 2 BASIC20.61■□□□□ 0.89
NECTIN1Q15223 LTBR-207ENST00000539925 1665 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.61■□□□□ 0.89
NECTIN1Q15223 WBP2-201ENST00000254806 1944 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
NECTIN1Q15223 CD24-201ENST00000606017 2180 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
NECTIN1Q15223 SLC27A2-201ENST00000267842 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
NECTIN1Q15223 CDKN1A-204ENST00000448526 2104 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.6■□□□□ 0.89
NECTIN1Q15223 CFL1-203ENST00000525451 1878 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.6■□□□□ 0.89
NECTIN1Q15223 AC132872.2-201ENST00000581303 2368 ntTSL 5 BASIC20.6■□□□□ 0.89
NECTIN1Q15223 NUP62-211ENST00000597029 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
NECTIN1Q15223 SPAST-203ENST00000615843 5212 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
NECTIN1Q15223 ATG3-201ENST00000283290 1570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
NECTIN1Q15223 TNFSF13-205ENST00000396545 1593 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
NECTIN1Q15223 STX3-203ENST00000529177 1571 ntTSL 2 BASIC20.6■□□□□ 0.89
NECTIN1Q15223 KCNQ2-207ENST00000370224 3004 ntTSL 5 BASIC20.6■□□□□ 0.89
NECTIN1Q15223 KANK4-204ENST00000371153 4665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
NECTIN1Q15223 KLHDC7B-201ENST00000395676 2991 ntAPPRIS P1 BASIC20.6■□□□□ 0.89
NECTIN1Q15223 TSR2-201ENST00000375151 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
NECTIN1Q15223 TMEM14A-201ENST00000211314 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
NECTIN1Q15223 RSPH14-201ENST00000216036 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
NECTIN1Q15223 TYMS-202ENST00000323250 693 ntTSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
NECTIN1Q15223 RAP1B-229ENST00000543393 874 ntTSL 3 BASIC20.6■□□□□ 0.89
NECTIN1Q15223 EFCAB11-211ENST00000556609 568 ntTSL 3 BASIC20.6■□□□□ 0.89
NECTIN1Q15223 AC009061.1-201ENST00000567261 475 ntTSL 3 BASIC20.6■□□□□ 0.89
NECTIN1Q15223 AC135776.2-201ENST00000567803 714 ntTSL 4 BASIC20.6■□□□□ 0.89
NECTIN1Q15223 RNPS1-224ENST00000569598 918 ntTSL 5 BASIC20.6■□□□□ 0.89
NECTIN1Q15223 MCRIP1-206ENST00000573478 1123 ntTSL 2 BASIC20.6■□□□□ 0.89
NECTIN1Q15223 COPE-211ENST00000600932 1144 ntTSL 5 BASIC20.6■□□□□ 0.89
NECTIN1Q15223 LDHAL6A-203ENST00000615355 1042 ntTSL 5 BASIC20.6■□□□□ 0.89
NECTIN1Q15223 WDR18-204ENST00000587001 1465 ntTSL 5 BASIC20.6■□□□□ 0.89
NECTIN1Q15223 ALOX12-201ENST00000251535 2358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
NECTIN1Q15223 SLC18B1-201ENST00000275227 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
NECTIN1Q15223 CBSL-202ENST00000617706 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
NECTIN1Q15223 SKOR1-203ENST00000554054 3620 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.6■□□□□ 0.89
NECTIN1Q15223 TOM1L1-221ENST00000575882 2507 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
NECTIN1Q15223 AC106886.4-201ENST00000623557 2502 ntBASIC20.6■□□□□ 0.89
NECTIN1Q15223 TEX264-209ENST00000457573 1448 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.6■□□□□ 0.89
NECTIN1Q15223 GDA-201ENST00000238018 2074 ntTSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
NECTIN1Q15223 NECAB2-203ENST00000565691 2064 ntTSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
NECTIN1Q15223 AATK-203ENST00000417379 5081 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
NECTIN1Q15223 PGRMC2-208ENST00000613358 3783 ntTSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
NECTIN1Q15223 AC011676.5-201ENST00000624864 2660 ntBASIC20.6■□□□□ 0.89
NECTIN1Q15223 NDRG2-204ENST00000360463 2047 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
NECTIN1Q15223 DYDC2-202ENST00000372197 2022 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
NECTIN1Q15223 AC092068.3-201ENST00000587894 2016 ntBASIC20.6■□□□□ 0.89
NECTIN1Q15223 COBLL1-201ENST00000342193 4898 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
NECTIN1Q15223 CHTOP-203ENST00000368690 2165 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
NECTIN1Q15223 GJA8-201ENST00000369235 1302 ntAPPRIS P1 BASIC20.59■□□□□ 0.89
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NECTIN1Q15223 AC023830.1-201ENST00000569678 1543 ntTSL 2 BASIC20.59■□□□□ 0.89
NECTIN1Q15223 AUNIP-201ENST00000374298 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
NECTIN1Q15223 ITGA7-201ENST00000257879 4120 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
NECTIN1Q15223 PTHLH-201ENST00000201015 1872 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC20.59■□□□□ 0.89
NECTIN1Q15223 AGXT-201ENST00000307503 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
NECTIN1Q15223 HDDC3-201ENST00000330334 1047 ntTSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
NECTIN1Q15223 ZNF81-201ENST00000334937 610 ntTSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
NECTIN1Q15223 ATPIF1-201ENST00000335514 494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
NECTIN1Q15223 AC093459.1-201ENST00000444567 481 ntTSL 3 BASIC20.59■□□□□ 0.89
NECTIN1Q15223 HOXB-AS4-202ENST00000480386 566 ntTSL 4 BASIC20.59■□□□□ 0.89
NECTIN1Q15223 AP003555.3-201ENST00000534086 432 ntTSL 4 BASIC20.59■□□□□ 0.89
NECTIN1Q15223 AL121772.3-201ENST00000610840 674 ntBASIC20.59■□□□□ 0.89
NECTIN1Q15223 SLC39A7-202ENST00000374677 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
NECTIN1Q15223 ADGRB1-201ENST00000323289 5527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
NECTIN1Q15223 AC105020.1-201ENST00000435356 2205 ntBASIC20.59■□□□□ 0.89
NECTIN1Q15223 PDPK2P-201ENST00000382326 2387 ntTSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
NECTIN1Q15223 CPT2-210ENST00000637252 2739 ntTSL 5 BASIC20.59■□□□□ 0.89
NECTIN1Q15223 TCF4-201ENST00000354452 3482 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.59■□□□□ 0.89
NECTIN1Q15223 LINC00336-201ENST00000477984 2107 ntTSL 2 BASIC20.59■□□□□ 0.89
NECTIN1Q15223 ABLIM2-203ENST00000361737 3396 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.59■□□□□ 0.89
NECTIN1Q15223 BLCAP-201ENST00000373537 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
NECTIN1Q15223 RHNO1-209ENST00000618250 2070 ntAPPRIS P3 TSL 4 BASIC20.58■□□□□ 0.89
NECTIN1Q15223 AL109955.1-201ENST00000417346 1540 ntTSL 2 BASIC20.58■□□□□ 0.89
NECTIN1Q15223 LYPLAL1-202ENST00000366928 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
NECTIN1Q15223 SEPHS2-201ENST00000478753 2551 ntAPPRIS P1 BASIC20.58■□□□□ 0.89
NECTIN1Q15223 SH2B1-216ENST00000618521 2935 ntTSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
NECTIN1Q15223 ESM1-201ENST00000381403 1326 ntTSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
NECTIN1Q15223 BLOC1S5-202ENST00000397457 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
NECTIN1Q15223 BCAM-206ENST00000589651 2686 ntTSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
NECTIN1Q15223 ZBTB32-201ENST00000262630 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
NECTIN1Q15223 AC097637.2-201ENST00000624096 1997 ntBASIC20.58■□□□□ 0.89
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