Protein–RNA interactions for Protein: Q13033

STRN3, Striatin-3, humanhuman

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Length 797 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
STRN3Q13033 MTDHP4-201ENST00000600287 670 ntBASIC19.17■□□□□ 0.66
STRN3Q13033 APMAP-201ENST00000217456 2430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
STRN3Q13033 ELOA3-201ENST00000330682 1877 ntAPPRIS P1 BASIC19.17■□□□□ 0.66
STRN3Q13033 GAREM2-202ENST00000407684 5138 ntTSL 2 BASIC19.17■□□□□ 0.66
STRN3Q13033 KDSR-202ENST00000406396 5447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
STRN3Q13033 PVR-204ENST00000406449 1344 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
STRN3Q13033 JMJD6-205ENST00000585429 1330 ntTSL 5 BASIC19.17■□□□□ 0.66
STRN3Q13033 CDC25A-201ENST00000302506 3783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
STRN3Q13033 GBA2-201ENST00000378088 1672 ntTSL 2 BASIC19.17■□□□□ 0.66
STRN3Q13033 TRIM60-203ENST00000508504 1674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
STRN3Q13033 SLC7A9-204ENST00000590341 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
STRN3Q13033 TEF-201ENST00000266304 4394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
STRN3Q13033 WDR13-201ENST00000218056 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
STRN3Q13033 ERMARD-210ENST00000588451 2146 ntTSL 5 BASIC19.16■□□□□ 0.66
STRN3Q13033 WDR90-202ENST00000315764 1454 ntTSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
STRN3Q13033 AC046185.3-201ENST00000623228 1824 ntBASIC19.16■□□□□ 0.66
STRN3Q13033 PABPC1L-217ENST00000537323 1910 ntTSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
STRN3Q13033 AC148477.5-201ENST00000625164 1645 ntBASIC19.16■□□□□ 0.66
STRN3Q13033 MUC1-204ENST00000343256 648 ntTSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
STRN3Q13033 MED22-202ENST00000371999 987 ntTSL 3 BASIC19.16■□□□□ 0.66
STRN3Q13033 LINC01615-202ENST00000449466 603 ntTSL 3 BASIC19.16■□□□□ 0.66
STRN3Q13033 PRYP5-201ENST00000451909 266 ntBASIC19.16■□□□□ 0.66
STRN3Q13033 AL356056.2-201ENST00000506914 669 ntTSL 4 BASIC19.16■□□□□ 0.66
STRN3Q13033 MOK-208ENST00000519058 917 ntTSL 2 BASIC19.16■□□□□ 0.66
STRN3Q13033 ARAP1-AS1-201ENST00000542022 388 ntTSL 5 BASIC19.16■□□□□ 0.66
STRN3Q13033 AL662844.1-201ENST00000546340 181 ntBASIC19.16■□□□□ 0.66
STRN3Q13033 AC021087.4-201ENST00000563761 564 ntBASIC19.16■□□□□ 0.66
STRN3Q13033 MIR22HG-204ENST00000571595 767 ntTSL 5 BASIC19.16■□□□□ 0.66
STRN3Q13033 AC012615.3-201ENST00000592884 500 ntTSL 3 BASIC19.16■□□□□ 0.66
STRN3Q13033 NODAL-201ENST00000287139 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
STRN3Q13033 LEMD2-214ENST00000614475 2883 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.16■□□□□ 0.66
STRN3Q13033 AC004817.3-201ENST00000602957 2129 ntBASIC19.16■□□□□ 0.66
STRN3Q13033 LINC01097-201ENST00000627163 2122 ntTSL 2 BASIC19.16■□□□□ 0.66
STRN3Q13033 CLDN5-202ENST00000406028 2548 ntTSL 2 BASIC19.16■□□□□ 0.66
STRN3Q13033 SYT15-201ENST00000374321 1369 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC19.16■□□□□ 0.66
STRN3Q13033 MUS81-215ENST00000533035 2180 ntTSL 5 BASIC19.16■□□□□ 0.66
STRN3Q13033 FARP2-202ENST00000373287 2580 ntTSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
STRN3Q13033 REPS1-202ENST00000367663 2607 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.16■□□□□ 0.66
STRN3Q13033 TMEM237-213ENST00000621467 1824 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
STRN3Q13033 TMEM106C-203ENST00000449758 1414 ntTSL 2 BASIC19.16■□□□□ 0.66
STRN3Q13033 MTG1-201ENST00000317502 1560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
STRN3Q13033 AC138969.1-205ENST00000381497 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
STRN3Q13033 LYSMD4-203ENST00000378904 2122 ntBASIC19.15■□□□□ 0.66
STRN3Q13033 CYP2D6-203ENST00000360608 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
STRN3Q13033 SGCE-206ENST00000445866 1666 ntTSL 5 BASIC19.15■□□□□ 0.66
STRN3Q13033 PWP1-202ENST00000541166 1722 ntTSL 2 BASIC19.15■□□□□ 0.66
STRN3Q13033 TUBGCP3-202ENST00000375669 2723 ntTSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
STRN3Q13033 RAB1A-204ENST00000409892 2254 ntTSL 2 BASIC19.15■□□□□ 0.66
STRN3Q13033 POLR1D-221ENST00000637180 2262 ntTSL 5 BASIC19.15■□□□□ 0.66
STRN3Q13033 NDUFB9-201ENST00000276689 711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
STRN3Q13033 COLEC11-202ENST00000349077 1259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
STRN3Q13033 PHPT1-202ENST00000371661 985 ntTSL 5 BASIC19.15■□□□□ 0.66
STRN3Q13033 RAB17-203ENST00000409576 466 ntTSL 3 BASIC19.15■□□□□ 0.66
STRN3Q13033 PRSS42-201ENST00000429665 882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
STRN3Q13033 FIGNL1-207ENST00000435566 593 ntTSL 4 BASIC19.15■□□□□ 0.66
STRN3Q13033 AC016999.1-201ENST00000447880 452 ntTSL 3 BASIC19.15■□□□□ 0.66
STRN3Q13033 KNCN-203ENST00000481882 1037 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.15■□□□□ 0.66
STRN3Q13033 S100A2-206ENST00000497140 697 ntTSL 2 BASIC19.15■□□□□ 0.66
STRN3Q13033 AL162171.1-201ENST00000556328 718 ntTSL 3 BASIC19.15■□□□□ 0.66
STRN3Q13033 TK1-204ENST00000590430 683 ntTSL 3 BASIC19.15■□□□□ 0.66
STRN3Q13033 TMEM263-204ENST00000548125 3349 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.15■□□□□ 0.66
STRN3Q13033 CORO6-210ENST00000580212 2345 ntTSL 5 BASIC19.15■□□□□ 0.66
STRN3Q13033 MARK2-209ENST00000509502 2862 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.15■□□□□ 0.66
STRN3Q13033 C9orf64-203ENST00000376344 2443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
STRN3Q13033 FO681492.1-201ENST00000623662 5321 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC19.15■□□□□ 0.66
STRN3Q13033 AC009779.2-201ENST00000552576 1443 ntTSL 4 BASIC19.15■□□□□ 0.66
STRN3Q13033 ZNF211-203ENST00000299871 2577 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC19.15■□□□□ 0.66
STRN3Q13033 HTD2-201ENST00000461393 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
STRN3Q13033 SLC7A9-202ENST00000587772 1568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
STRN3Q13033 CA9-201ENST00000378357 1618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.66
STRN3Q13033 OLA1-201ENST00000284719 4417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.66
STRN3Q13033 LRPPRC-203ENST00000409946 1848 ntTSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
STRN3Q13033 PRKCB-202ENST00000321728 2689 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
STRN3Q13033 SCARB1-203ENST00000415380 2731 ntTSL 2 BASIC19.14■□□□□ 0.65
STRN3Q13033 GOSR1-201ENST00000225724 6039 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
STRN3Q13033 SYNGR2-206ENST00000589711 2041 ntTSL 5 BASIC19.14■□□□□ 0.65
STRN3Q13033 MTA1-201ENST00000331320 2876 ntTSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
STRN3Q13033 MRPL28-201ENST00000199706 1098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
STRN3Q13033 TCEAL3-201ENST00000243286 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
STRN3Q13033 ENSA-206ENST00000361631 725 ntTSL 2 BASIC19.14■□□□□ 0.65
STRN3Q13033 HDAC11-202ENST00000402259 1000 ntTSL 3 BASIC19.14■□□□□ 0.65
STRN3Q13033 AC009078.2-202ENST00000463353 338 ntBASIC19.14■□□□□ 0.65
STRN3Q13033 TRPC2-202ENST00000526541 1189 ntTSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
STRN3Q13033 MRPL49-206ENST00000531705 489 ntTSL 5 BASIC19.14■□□□□ 0.65
STRN3Q13033 SLC39A1-210ENST00000617697 2214 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.14■□□□□ 0.65
STRN3Q13033 GGA1-203ENST00000343632 3159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
STRN3Q13033 RBBP7-203ENST00000380087 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
STRN3Q13033 APH1A-202ENST00000360244 2353 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
STRN3Q13033 PGM5-202ENST00000396396 3338 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.14■□□□□ 0.65
STRN3Q13033 ZBTB16-201ENST00000335953 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
STRN3Q13033 PLTP-202ENST00000372420 1530 ntTSL 2 BASIC19.14■□□□□ 0.65
STRN3Q13033 GNE-201ENST00000377902 2565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
STRN3Q13033 ABCB8-211ENST00000477092 1596 ntTSL 5 BASIC19.14■□□□□ 0.65
STRN3Q13033 PTP4A3-202ENST00000349124 2710 ntTSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
STRN3Q13033 PCDHA13-201ENST00000289272 5260 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
STRN3Q13033 TMEM145-201ENST00000301204 1768 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC19.14■□□□□ 0.65
STRN3Q13033 GCDH-201ENST00000222214 1956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
STRN3Q13033 SYBU-224ENST00000529690 1983 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.13■□□□□ 0.65
STRN3Q13033 TDRP-201ENST00000324079 3395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
STRN3Q13033 LINC01554-202ENST00000436592 2052 ntTSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
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