Protein–RNA interactions for Protein: Q0D2K3

RIPPLY1, Protein ripply1, humanhuman

Predictions only

Length 151 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RIPPLY1Q0D2K3 PRICKLE4-202ENST00000394260 1035 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
RIPPLY1Q0D2K3 PRICKLE4-203ENST00000394263 1155 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
RIPPLY1Q0D2K3 TSPY5P-201ENST00000426936 936 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
RIPPLY1Q0D2K3 TMA7-201ENST00000438607 561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
RIPPLY1Q0D2K3 UQCR11-201ENST00000585671 753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
RIPPLY1Q0D2K3 LINC01451-201ENST00000623792 534 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
RIPPLY1Q0D2K3 SMN1-211ENST00000625245 885 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
RIPPLY1Q0D2K3 SMN2-215ENST00000628696 885 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
RIPPLY1Q0D2K3 CYP4F22-202ENST00000601005 2445 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
RIPPLY1Q0D2K3 MOGS-205ENST00000452063 2568 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
RIPPLY1Q0D2K3 MADCAM1-204ENST00000587541 1723 ntTSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
RIPPLY1Q0D2K3 PPM1D-201ENST00000305921 4778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
RIPPLY1Q0D2K3 PCDHA12-201ENST00000398631 5233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
RIPPLY1Q0D2K3 C20orf166-AS1-201ENST00000412495 2302 ntTSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
RIPPLY1Q0D2K3 AC004943.2-201ENST00000563328 4842 ntTSL 3 BASIC15.39■□□□□ 0.05
RIPPLY1Q0D2K3 PTCH1-201ENST00000331920 8057 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
RIPPLY1Q0D2K3 MED29-202ENST00000594368 1471 ntTSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
RIPPLY1Q0D2K3 TMEM132D-202ENST00000422113 5776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
RIPPLY1Q0D2K3 ZSCAN10-202ENST00000538082 2350 ntTSL 4 BASIC15.39■□□□□ 0.05
RIPPLY1Q0D2K3 GUCY1A2-202ENST00000347596 2532 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
RIPPLY1Q0D2K3 SUPT20H-203ENST00000360252 2843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
RIPPLY1Q0D2K3 ABCG5-201ENST00000260645 2740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
RIPPLY1Q0D2K3 RMDN3-202ENST00000338376 2251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
RIPPLY1Q0D2K3 CACNB3-203ENST00000540990 1814 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
RIPPLY1Q0D2K3 FAM50A-202ENST00000393600 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
RIPPLY1Q0D2K3 PARD3-201ENST00000340077 3518 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
RIPPLY1Q0D2K3 ARHGAP9-204ENST00000430041 2323 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
RIPPLY1Q0D2K3 PHF20L1-201ENST00000220847 3297 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
RIPPLY1Q0D2K3 LRRC27-214ENST00000625755 1738 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
RIPPLY1Q0D2K3 ARPC1B-201ENST00000252725 1551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
RIPPLY1Q0D2K3 AL138688.1-201ENST00000624851 1594 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
RIPPLY1Q0D2K3 UPK3B-202ENST00000334348 2373 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
RIPPLY1Q0D2K3 PP12613-201ENST00000424958 2230 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
RIPPLY1Q0D2K3 LETM2-205ENST00000519476 2240 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
RIPPLY1Q0D2K3 COPE-201ENST00000262812 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
RIPPLY1Q0D2K3 TMEM190-201ENST00000291934 593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
RIPPLY1Q0D2K3 HOPX-201ENST00000317745 1129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
RIPPLY1Q0D2K3 COPE-203ENST00000351079 907 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
RIPPLY1Q0D2K3 SMYD3-204ENST00000403792 1209 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
RIPPLY1Q0D2K3 MALL-203ENST00000427178 1070 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
RIPPLY1Q0D2K3 AC092597.1-201ENST00000487352 616 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
RIPPLY1Q0D2K3 AP003733.1-201ENST00000491725 852 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
RIPPLY1Q0D2K3 TK2-213ENST00000563369 882 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
RIPPLY1Q0D2K3 AC092118.1-202ENST00000568697 718 ntTSL 3 BASIC15.38■□□□□ 0.05
RIPPLY1Q0D2K3 AC011498.3-201ENST00000590159 569 ntTSL 4 BASIC15.38■□□□□ 0.05
RIPPLY1Q0D2K3 AC239803.1-201ENST00000594189 1278 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
RIPPLY1Q0D2K3 SPEG-225ENST00000617028 815 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
RIPPLY1Q0D2K3 ASTN2-205ENST00000361209 4622 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
RIPPLY1Q0D2K3 PLEKHF2-201ENST00000315367 2881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
RIPPLY1Q0D2K3 APOA5-203ENST00000542499 1929 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
RIPPLY1Q0D2K3 KCNQ1-201ENST00000155840 3245 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
RIPPLY1Q0D2K3 AC131160.1-201ENST00000639401 3058 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
RIPPLY1Q0D2K3 HLA-J-201ENST00000462773 1622 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
RIPPLY1Q0D2K3 AC112229.1-202ENST00000490013 2918 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
RIPPLY1Q0D2K3 FLJ31104-201ENST00000500093 2289 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
RIPPLY1Q0D2K3 YY1-201ENST00000262238 6697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
RIPPLY1Q0D2K3 SPAG6-202ENST00000376603 2770 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
RIPPLY1Q0D2K3 FSCN1-201ENST00000382361 2777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
RIPPLY1Q0D2K3 TMED3-201ENST00000299705 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
RIPPLY1Q0D2K3 NRG1-202ENST00000356819 5931 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
RIPPLY1Q0D2K3 TCTN1-229ENST00000614115 1965 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
RIPPLY1Q0D2K3 UBE3A-207ENST00000614096 8741 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
RIPPLY1Q0D2K3 TYMS-201ENST00000323224 1327 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
RIPPLY1Q0D2K3 ECE2-201ENST00000324557 1823 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
RIPPLY1Q0D2K3 PUS1-208ENST00000542167 2151 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
RIPPLY1Q0D2K3 ZNF213-206ENST00000574902 3208 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
RIPPLY1Q0D2K3 ADM-201ENST00000278175 1885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
RIPPLY1Q0D2K3 LINC00847-201ENST00000501855 1871 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
RIPPLY1Q0D2K3 FUS-201ENST00000254108 5119 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
RIPPLY1Q0D2K3 TCF25-201ENST00000263346 2233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
RIPPLY1Q0D2K3 TXNRD2-214ENST00000491939 2238 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
RIPPLY1Q0D2K3 GGPS1-206ENST00000488594 1396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
RIPPLY1Q0D2K3 KCNH1-214ENST00000640566 1365 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
RIPPLY1Q0D2K3 GATA3-201ENST00000346208 2654 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
RIPPLY1Q0D2K3 MAGED4-211ENST00000599522 2669 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
RIPPLY1Q0D2K3 XKR4-203ENST00000622811 3907 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
RIPPLY1Q0D2K3 MYEOV-203ENST00000535407 2306 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
RIPPLY1Q0D2K3 COL5A1-208ENST00000618395 8437 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
RIPPLY1Q0D2K3 AMFR-201ENST00000290649 3600 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
RIPPLY1Q0D2K3 PRKCSH-205ENST00000587327 2189 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
RIPPLY1Q0D2K3 IGHGP-201ENST00000390555 1178 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
RIPPLY1Q0D2K3 HPF1-201ENST00000393381 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
RIPPLY1Q0D2K3 AC211429.1-201ENST00000415277 523 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
RIPPLY1Q0D2K3 BNIP3L-204ENST00000520409 739 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
RIPPLY1Q0D2K3 AZIN1-AS1-214ENST00000522850 473 ntTSL 3 BASIC15.37■□□□□ 0.05
RIPPLY1Q0D2K3 AC012213.1-202ENST00000523422 449 ntTSL 3 BASIC15.37■□□□□ 0.05
RIPPLY1Q0D2K3 AQP4-AS1-204ENST00000582605 525 ntTSL 4 BASIC15.37■□□□□ 0.05
RIPPLY1Q0D2K3 LIMD2-211ENST00000583211 1298 ntTSL 3 BASIC15.37■□□□□ 0.05
RIPPLY1Q0D2K3 LINC01023-201ENST00000606054 436 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
RIPPLY1Q0D2K3 FGF14-AS2-201ENST00000606448 1074 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
RIPPLY1Q0D2K3 ANKRD20A8P-203ENST00000641373 517 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
RIPPLY1Q0D2K3 CXorf38-202ENST00000378421 2380 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
RIPPLY1Q0D2K3 NKIRAS1-208ENST00000443659 2391 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
RIPPLY1Q0D2K3 TSPAN17-209ENST00000515708 2361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
RIPPLY1Q0D2K3 STUM-201ENST00000366788 7705 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
RIPPLY1Q0D2K3 ZNF84-201ENST00000327668 7162 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
RIPPLY1Q0D2K3 RASA4-202ENST00000449970 2787 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
RIPPLY1Q0D2K3 SOCS2-AS1-202ENST00000500986 1655 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
RIPPLY1Q0D2K3 SLC52A1-202ENST00000424747 2412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
RIPPLY1Q0D2K3 SLC35G1-202ENST00000427197 2402 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 49.3 ms