Protein–RNA interactions for Protein: Q08345

DDR1, Epithelial discoidin domain-containing receptor 1, humanhuman

Predictions only

Length 913 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DDR1Q08345 MRNIP-201ENST00000292586 1238 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
DDR1Q08345 THOC7-201ENST00000295899 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
DDR1Q08345 MAPK15-202ENST00000395107 834 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
DDR1Q08345 CXCL1-201ENST00000395761 1097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
DDR1Q08345 DANCR-201ENST00000411630 904 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
DDR1Q08345 TMEM191A-202ENST00000419950 663 ntTSL 3 BASIC21.43■■□□□ 1.02
DDR1Q08345 GABARAPL1-202ENST00000421801 855 ntTSL 2 BASIC21.43■■□□□ 1.02
DDR1Q08345 SNHG11-207ENST00000434729 1058 ntTSL 4 BASIC21.43■■□□□ 1.02
DDR1Q08345 FYCO1-203ENST00000438446 1072 ntTSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
DDR1Q08345 TSPAN32-207ENST00000451520 1236 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.43■■□□□ 1.02
DDR1Q08345 SERBP1P5-201ENST00000510079 1181 ntBASIC21.43■■□□□ 1.02
DDR1Q08345 IGHV3-62-201ENST00000520057 340 ntBASIC21.43■■□□□ 1.02
DDR1Q08345 KRT8P23-201ENST00000560090 1207 ntBASIC21.43■■□□□ 1.02
DDR1Q08345 AL009183.1-201ENST00000603760 355 ntBASIC21.43■■□□□ 1.02
DDR1Q08345 LETM1-201ENST00000302787 5462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
DDR1Q08345 COL13A1-205ENST00000398978 3093 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
DDR1Q08345 LINC01819-201ENST00000422351 2156 ntTSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
DDR1Q08345 WIZP1-201ENST00000531444 2299 ntBASIC21.43■■□□□ 1.02
DDR1Q08345 ARRDC2-201ENST00000222250 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
DDR1Q08345 CRHR2-207ENST00000471646 2530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
DDR1Q08345 NCKAP1-201ENST00000360982 4989 ntTSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
DDR1Q08345 RSRP1-201ENST00000243189 1502 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
DDR1Q08345 ERICH1-201ENST00000262109 1813 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
DDR1Q08345 RFTN1-201ENST00000334133 2982 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
DDR1Q08345 SCP2-202ENST00000371513 2003 ntTSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
DDR1Q08345 TCEAL3-202ENST00000372627 1113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
DDR1Q08345 STK4-201ENST00000372801 2038 ntTSL 2 BASIC21.42■■□□□ 1.02
DDR1Q08345 KDELC1-201ENST00000376004 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
DDR1Q08345 CACNB2-206ENST00000377328 1233 ntTSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
DDR1Q08345 MDM2-209ENST00000393412 1404 ntTSL 5 BASIC21.42■■□□□ 1.02
DDR1Q08345 NDUFAF3-203ENST00000395458 808 ntTSL 2 BASIC21.42■■□□□ 1.02
DDR1Q08345 UMOD-203ENST00000396138 2399 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.42■■□□□ 1.02
DDR1Q08345 MECP2-203ENST00000407218 1174 ntTSL 5 BASIC21.42■■□□□ 1.02
DDR1Q08345 MRPS18AP1-201ENST00000414458 589 ntBASIC21.42■■□□□ 1.02
DDR1Q08345 C2orf88-205ENST00000443551 692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
DDR1Q08345 RAB3A-202ENST00000464076 1253 ntTSL 2 BASIC21.42■■□□□ 1.02
DDR1Q08345 AC087457.1-201ENST00000503496 2727 ntTSL 2 BASIC21.42■■□□□ 1.02
DDR1Q08345 AL391335.1-201ENST00000504583 535 ntTSL 4 BASIC21.42■■□□□ 1.02
DDR1Q08345 SFTPC-204ENST00000520605 519 ntTSL 3 BASIC21.42■■□□□ 1.02
DDR1Q08345 AL138828.1-202ENST00000576956 1881 ntTSL 5 BASIC21.42■■□□□ 1.02
DDR1Q08345 CXXC1-212ENST00000589940 2242 ntTSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
DDR1Q08345 SSH2-211ENST00000590153 570 ntTSL 4 BASIC21.42■■□□□ 1.02
DDR1Q08345 PGPEP1-209ENST00000604499 769 ntTSL 5 BASIC21.42■■□□□ 1.02
DDR1Q08345 AL161645.1-201ENST00000622716 1255 ntBASIC21.42■■□□□ 1.02
DDR1Q08345 CKMT1B-215ENST00000627381 1074 ntTSL 5 BASIC21.42■■□□□ 1.02
DDR1Q08345 COQ6-220ENST00000629426 1538 ntTSL 5 BASIC21.42■■□□□ 1.02
DDR1Q08345 ST8SIA2-201ENST00000268164 5708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
DDR1Q08345 MAPKAPK2-202ENST00000367103 2961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
DDR1Q08345 FOXK2-201ENST00000335255 5265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
DDR1Q08345 AK1-203ENST00000373176 2266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
DDR1Q08345 MAN1B1-207ENST00000535144 2296 ntTSL 2 BASIC21.41■■□□□ 1.02
DDR1Q08345 SERPINA4-201ENST00000298841 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
DDR1Q08345 CAMKV-217ENST00000620470 1485 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
DDR1Q08345 MATN3-202ENST00000421259 1443 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
DDR1Q08345 TDG-209ENST00000544861 1387 ntTSL 2 BASIC21.41■■□□□ 1.02
DDR1Q08345 CCDC107-201ENST00000327351 804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
DDR1Q08345 TCEAL3-203ENST00000372628 1221 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
DDR1Q08345 CYB5A-203ENST00000397914 619 ntTSL 3 BASIC21.41■■□□□ 1.02
DDR1Q08345 SPDYE7P-202ENST00000420373 878 ntBASIC21.41■■□□□ 1.02
DDR1Q08345 Z98749.2-201ENST00000428294 700 ntTSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
DDR1Q08345 SPDYE2-202ENST00000432940 1209 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
DDR1Q08345 SPDYE2B-201ENST00000436228 1209 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
DDR1Q08345 SPDYE5-201ENST00000455862 1209 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
DDR1Q08345 GSTO1-207ENST00000539281 1052 ntTSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
DDR1Q08345 AL008721.1-201ENST00000609964 604 ntBASIC21.41■■□□□ 1.02
DDR1Q08345 IRF1-211ENST00000613424 821 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
DDR1Q08345 MIR6080-201ENST00000617359 66 ntBASIC21.41■■□□□ 1.02
DDR1Q08345 RPN2-201ENST00000237530 2515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
DDR1Q08345 PARD3-210ENST00000374794 5669 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
DDR1Q08345 AC120049.1-201ENST00000592638 2065 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
DDR1Q08345 PPT2-246ENST00000375137 1945 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
DDR1Q08345 ZNF398-202ENST00000475153 2860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
DDR1Q08345 SOCS2-201ENST00000340600 2761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
DDR1Q08345 GGT2-202ENST00000405188 1845 ntTSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
DDR1Q08345 FDXR-217ENST00000582944 1766 ntTSL 2 BASIC21.41■■□□□ 1.02
DDR1Q08345 LARGE2-202ENST00000401752 2516 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
DDR1Q08345 PSMA8-202ENST00000343848 1675 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
DDR1Q08345 HNRNPRP1-201ENST00000453465 1695 ntBASIC21.4■■□□□ 1.02
DDR1Q08345 LTBP3-217ENST00000530785 2461 ntTSL 2 BASIC21.4■■□□□ 1.02
DDR1Q08345 BRSK2-201ENST00000308219 4089 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
DDR1Q08345 PDE9A-209ENST00000398227 1606 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
DDR1Q08345 NFKBIA-201ENST00000216797 1558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
DDR1Q08345 KCNMB4-201ENST00000258111 4731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
DDR1Q08345 EXD3-203ENST00000465160 1585 ntTSL 2 BASIC21.4■■□□□ 1.02
DDR1Q08345 CDHR5-201ENST00000349570 2318 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
DDR1Q08345 KRT18P55-202ENST00000578578 1546 ntBASIC21.4■■□□□ 1.02
DDR1Q08345 CD40-207ENST00000620709 1522 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
DDR1Q08345 TREX2-201ENST00000330912 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
DDR1Q08345 BAGE2-202ENST00000474011 1482 ntTSL 2 BASIC21.4■■□□□ 1.02
DDR1Q08345 DZANK1-202ENST00000329494 1389 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
DDR1Q08345 MAP3K15-201ENST00000338883 4012 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
DDR1Q08345 PSMD4-201ENST00000368881 1333 ntTSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
DDR1Q08345 ENDOV-201ENST00000323854 1226 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
DDR1Q08345 ADIRF-201ENST00000372013 917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
DDR1Q08345 TNNC2-201ENST00000372555 710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
DDR1Q08345 TNNC2-202ENST00000372557 780 ntTSL 3 BASIC21.4■■□□□ 1.02
DDR1Q08345 CD81-202ENST00000381036 880 ntTSL 3 BASIC21.4■■□□□ 1.02
DDR1Q08345 TNNT3-204ENST00000381558 1258 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
DDR1Q08345 AL365255.1-202ENST00000413887 363 ntTSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
DDR1Q08345 AC004890.2-204ENST00000481968 304 ntBASIC21.4■■□□□ 1.02
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 64 ms