Protein–RNA interactions for Protein: Q06547

GABPB1, GA-binding protein subunit beta-1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 395 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GABPB1Q06547 NOXO1-205ENST00000566005 1144 ntTSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
GABPB1Q06547 TRAPPC2L-213ENST00000567895 854 ntTSL 3 BASIC17.77■□□□□ 0.44
GABPB1Q06547 C19orf84-201ENST00000570516 788 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
GABPB1Q06547 AC011511.3-201ENST00000587088 355 ntTSL 2 BASIC17.77■□□□□ 0.44
GABPB1Q06547 PATZ1-202ENST00000266269 3781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
GABPB1Q06547 ITSN1-210ENST00000399353 3913 ntTSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
GABPB1Q06547 NORAD-201ENST00000565493 5339 ntBASIC17.77■□□□□ 0.44
GABPB1Q06547 TRIM46-210ENST00000545012 2979 ntTSL 2 BASIC17.77■□□□□ 0.44
GABPB1Q06547 SLC2A9-201ENST00000264784 1850 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
GABPB1Q06547 ATXN10-202ENST00000381061 3135 ntTSL 2 BASIC17.77■□□□□ 0.43
GABPB1Q06547 NEO1-202ENST00000339362 7342 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.43
GABPB1Q06547 C9orf43-202ENST00000374165 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
GABPB1Q06547 RCOR3-203ENST00000419091 2041 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.77■□□□□ 0.43
GABPB1Q06547 IMPDH1-202ENST00000348127 2479 ntTSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
GABPB1Q06547 CYP4F22-201ENST00000269703 2641 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.77■□□□□ 0.43
GABPB1Q06547 LLGL2-202ENST00000375227 1374 ntTSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
GABPB1Q06547 LITAF-202ENST00000381810 1527 ntTSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.43
GABPB1Q06547 C11orf80-201ENST00000360962 1807 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.43
GABPB1Q06547 AC123912.2-201ENST00000594927 2409 ntTSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
GABPB1Q06547 B4GALT3-213ENST00000622395 2414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
GABPB1Q06547 DSE-202ENST00000359564 4037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
GABPB1Q06547 CNNM2-203ENST00000433628 3857 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.76■□□□□ 0.43
GABPB1Q06547 BCAP29-202ENST00000379117 1946 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.76■□□□□ 0.43
GABPB1Q06547 HARS-204ENST00000438307 1789 ntTSL 2 BASIC17.76■□□□□ 0.43
GABPB1Q06547 ZXDA-201ENST00000358697 4113 ntAPPRIS P1 BASIC17.76■□□□□ 0.43
GABPB1Q06547 AC004706.4-201ENST00000634965 3537 ntAPPRIS P1 BASIC17.76■□□□□ 0.43
GABPB1Q06547 TPO-203ENST00000346956 2923 ntTSL 5 BASIC17.76■□□□□ 0.43
GABPB1Q06547 AC010491.1-201ENST00000563101 2797 ntBASIC17.76■□□□□ 0.43
GABPB1Q06547 TP53I11-208ENST00000525680 2647 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.76■□□□□ 0.43
GABPB1Q06547 AL662899.1-201ENST00000461287 2332 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.76■□□□□ 0.43
GABPB1Q06547 PEG3-206ENST00000598410 5304 ntTSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
GABPB1Q06547 CDC14B-208ENST00000463569 1734 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.76■□□□□ 0.43
GABPB1Q06547 HES1-201ENST00000232424 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
GABPB1Q06547 PPP1R36-201ENST00000298705 1405 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
GABPB1Q06547 BCKDHB-203ENST00000369760 743 ntTSL 3 BASIC17.76■□□□□ 0.43
GABPB1Q06547 MIR149-201ENST00000384879 89 ntBASIC17.76■□□□□ 0.43
GABPB1Q06547 AC073210.2-201ENST00000430369 194 ntBASIC17.76■□□□□ 0.43
GABPB1Q06547 CAMLG-202ENST00000514518 895 ntTSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
GABPB1Q06547 TAF1C-216ENST00000566732 2972 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.76■□□□□ 0.43
GABPB1Q06547 CYB561-214ENST00000582034 1193 ntTSL 2 BASIC17.76■□□□□ 0.43
GABPB1Q06547 LINC01901-201ENST00000585822 1115 ntTSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
GABPB1Q06547 PTCRA-204ENST00000616441 1125 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.76■□□□□ 0.43
GABPB1Q06547 AC093762.3-201ENST00000641918 318 ntAPPRIS P1 BASIC17.76■□□□□ 0.43
GABPB1Q06547 SLC44A2-201ENST00000335757 3671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
GABPB1Q06547 TLE3-202ENST00000440567 2657 ntTSL 2 BASIC17.76■□□□□ 0.43
GABPB1Q06547 RDH12-201ENST00000267502 1833 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.76■□□□□ 0.43
GABPB1Q06547 C4A-243ENST00000428956 5460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
GABPB1Q06547 C4B-202ENST00000435363 5460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
GABPB1Q06547 TAPBP-238ENST00000475304 1686 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.76■□□□□ 0.43
GABPB1Q06547 TBC1D10C-209ENST00000542590 1659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
GABPB1Q06547 FAM72B-207ENST00000619376 1659 ntTSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
GABPB1Q06547 LGALS9C-209ENST00000581545 1378 ntTSL 5 BASIC17.76■□□□□ 0.43
GABPB1Q06547 COL18A1-203ENST00000359759 6586 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.76■□□□□ 0.43
GABPB1Q06547 KCNG3-202ENST00000394973 3656 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
GABPB1Q06547 FAM49B-223ENST00000522746 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
GABPB1Q06547 WNT16-201ENST00000222462 3147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
GABPB1Q06547 C11orf58-201ENST00000228136 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
GABPB1Q06547 TYSND1-202ENST00000335494 3397 ntTSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
GABPB1Q06547 AXL-202ENST00000359092 3206 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
GABPB1Q06547 AC021683.3-202ENST00000592572 4440 ntTSL 5 BASIC17.75■□□□□ 0.43
GABPB1Q06547 PES1-202ENST00000354694 2295 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
GABPB1Q06547 GSN-203ENST00000373808 2664 ntTSL 2 BASIC17.75■□□□□ 0.43
GABPB1Q06547 PRKD2-216ENST00000601806 2906 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.75■□□□□ 0.43
GABPB1Q06547 FSTL3-206ENST00000592947 2144 ntTSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
GABPB1Q06547 ELN-208ENST00000380575 3043 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
GABPB1Q06547 ZFAND6-211ENST00000559157 1559 ntTSL 2 BASIC17.75■□□□□ 0.43
GABPB1Q06547 RBFOX1-222ENST00000585867 1580 ntTSL 2 BASIC17.75■□□□□ 0.43
GABPB1Q06547 SGK3-206ENST00000520976 2483 ntTSL 2 BASIC17.75■□□□□ 0.43
GABPB1Q06547 ERRFI1-201ENST00000377482 3104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
GABPB1Q06547 VPS9D1-201ENST00000389386 2748 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
GABPB1Q06547 LINC01311-201ENST00000565162 1445 ntBASIC17.75■□□□□ 0.43
GABPB1Q06547 AL109659.2-201ENST00000606809 1674 ntBASIC17.75■□□□□ 0.43
GABPB1Q06547 ZNF497-201ENST00000311044 3468 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.75■□□□□ 0.43
GABPB1Q06547 PDS5A-201ENST00000303538 7176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
GABPB1Q06547 FXYD7-201ENST00000270310 712 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
GABPB1Q06547 TM4SF5-201ENST00000270560 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
GABPB1Q06547 DCTPP1-201ENST00000319285 1222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
GABPB1Q06547 MIEF2-202ENST00000395703 718 ntTSL 3 BASIC17.75■□□□□ 0.43
GABPB1Q06547 ZNF32-202ENST00000395797 1201 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.75■□□□□ 0.43
GABPB1Q06547 AC124947.2-201ENST00000547118 1133 ntBASIC17.75■□□□□ 0.43
GABPB1Q06547 AL589743.5-201ENST00000616611 1050 ntBASIC17.75■□□□□ 0.43
GABPB1Q06547 TCEA1-214ENST00000640382 1234 ntTSL 5 BASIC17.75■□□□□ 0.43
GABPB1Q06547 KIAA1683-209ENST00000612316 2684 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.75■□□□□ 0.43
GABPB1Q06547 NF1-211ENST00000487476 2265 ntTSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
GABPB1Q06547 NDRG2-202ENST00000298687 2122 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
GABPB1Q06547 DTD1-201ENST00000377452 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
GABPB1Q06547 AP000439.3-201ENST00000545202 2376 ntTSL 2 BASIC17.75■□□□□ 0.43
GABPB1Q06547 RAB40B-206ENST00000571995 3859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
GABPB1Q06547 WDR13-202ENST00000376729 5469 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.75■□□□□ 0.43
GABPB1Q06547 PCDHA12-201ENST00000398631 5233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
GABPB1Q06547 C6orf106-203ENST00000374026 4232 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.75■□□□□ 0.43
GABPB1Q06547 TMED7-TICAM2-202ENST00000333314 3453 ntTSL 2 BASIC17.75■□□□□ 0.43
GABPB1Q06547 AKAP7-204ENST00000431975 2954 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.75■□□□□ 0.43
GABPB1Q06547 ZDHHC20-209ENST00000542645 5315 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.75■□□□□ 0.43
GABPB1Q06547 FP565260.3-204ENST00000623795 2238 ntTSL 2 BASIC17.75■□□□□ 0.43
GABPB1Q06547 GATA1-202ENST00000376670 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
GABPB1Q06547 EEF1AKMT3-201ENST00000300209 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
GABPB1Q06547 ARHGEF26-AS1-204ENST00000491862 2598 ntTSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
GABPB1Q06547 CNST-203ENST00000366513 5126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
GABPB1Q06547 AC092198.1-201ENST00000447651 2691 ntTSL 2 BASIC17.75■□□□□ 0.43
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 52.3 ms