Protein–RNA interactions for Protein: P61574

HERVK_113, Endogenous retrovirus group K member 113 Rec protein, humanhuman

Predictions only

Length 105 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HERVK_113P61574 NDUFB1-201ENST00000329559 528 ntTSL 1 (best) BASIC12.27□□□□□ -0.45
HERVK_113P61574 PYY-201ENST00000360085 1053 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.27□□□□□ -0.45
HERVK_113P61574 CASK-202ENST00000378158 3848 ntTSL 5 BASIC12.27□□□□□ -0.45
HERVK_113P61574 YBEY-205ENST00000397694 534 ntTSL 1 (best) BASIC12.27□□□□□ -0.45
HERVK_113P61574 LINC01315-202ENST00000424852 1142 ntTSL 1 (best) BASIC12.27□□□□□ -0.45
HERVK_113P61574 CCDC124-201ENST00000445755 938 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.27□□□□□ -0.45
HERVK_113P61574 MCRIP1-201ENST00000455127 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.27□□□□□ -0.45
HERVK_113P61574 Z85996.1-201ENST00000494644 937 ntBASIC12.27□□□□□ -0.45
HERVK_113P61574 AC008443.1-203ENST00000505151 886 ntTSL 2 BASIC12.27□□□□□ -0.45
HERVK_113P61574 FXYD1-204ENST00000588081 645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.27□□□□□ -0.45
HERVK_113P61574 IMPA2-208ENST00000589238 923 ntTSL 3 BASIC12.27□□□□□ -0.45
HERVK_113P61574 CCDC124-203ENST00000597436 1055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.27□□□□□ -0.45
HERVK_113P61574 ZNF628-203ENST00000598519 3847 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.27□□□□□ -0.45
HERVK_113P61574 MDK-213ENST00000617138 635 ntTSL 2 BASIC12.27□□□□□ -0.45
HERVK_113P61574 ADGRB2-205ENST00000398547 4857 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.27□□□□□ -0.45
HERVK_113P61574 EXOC6B-202ENST00000410104 5795 ntTSL 1 (best) BASIC12.27□□□□□ -0.45
HERVK_113P61574 RAB28-201ENST00000288723 1810 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.27□□□□□ -0.45
HERVK_113P61574 RNF32-201ENST00000311822 1842 ntTSL 1 (best) BASIC12.27□□□□□ -0.45
HERVK_113P61574 GOPC-201ENST00000052569 4590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.27□□□□□ -0.45
HERVK_113P61574 SPATA22-214ENST00000575375 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.27□□□□□ -0.45
HERVK_113P61574 EFR3B-203ENST00000402191 3685 ntTSL 5 BASIC12.27□□□□□ -0.45
HERVK_113P61574 APLN-201ENST00000429967 3205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.27□□□□□ -0.45
HERVK_113P61574 SIN3B-206ENST00000595541 2767 ntTSL 2 BASIC12.27□□□□□ -0.45
HERVK_113P61574 TMEM57-202ENST00000399766 3294 ntTSL 1 (best) BASIC12.27□□□□□ -0.45
HERVK_113P61574 ENTPD5-206ENST00000556242 1437 ntTSL 5 BASIC12.27□□□□□ -0.45
HERVK_113P61574 CYHR1-202ENST00000403000 1477 ntTSL 1 (best) BASIC12.27□□□□□ -0.45
HERVK_113P61574 CCDC59-201ENST00000256151 1983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.27□□□□□ -0.45
HERVK_113P61574 PEX14-201ENST00000356607 1985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.27□□□□□ -0.45
HERVK_113P61574 SLC1A6-208ENST00000598504 2987 ntTSL 1 (best) BASIC12.27□□□□□ -0.45
HERVK_113P61574 SALL3-205ENST00000575389 3996 ntTSL 5 BASIC12.27□□□□□ -0.45
HERVK_113P61574 DPEP3-201ENST00000268793 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.27□□□□□ -0.45
HERVK_113P61574 RPAIN-203ENST00000381209 1535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.27□□□□□ -0.45
HERVK_113P61574 FBXO42-201ENST00000375592 6202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.26□□□□□ -0.45
HERVK_113P61574 FGFR4-201ENST00000292408 3122 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.26□□□□□ -0.45
HERVK_113P61574 AC092368.3-202ENST00000574180 1591 ntBASIC12.26□□□□□ -0.45
HERVK_113P61574 MTMR9-201ENST00000221086 7481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.26□□□□□ -0.45
HERVK_113P61574 ADAM15-228ENST00000531455 2678 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.26□□□□□ -0.45
HERVK_113P61574 PBX1-219ENST00000560641 3225 ntTSL 5 BASIC12.26□□□□□ -0.45
HERVK_113P61574 ACP5-201ENST00000218758 1630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.26□□□□□ -0.45
HERVK_113P61574 TMC3-AS1-203ENST00000559781 2195 ntTSL 3 BASIC12.26□□□□□ -0.45
HERVK_113P61574 CNOT3-204ENST00000447684 2765 ntTSL 2 BASIC12.26□□□□□ -0.45
HERVK_113P61574 GPRIN2-201ENST00000374314 1696 ntAPPRIS P1 BASIC12.26□□□□□ -0.45
HERVK_113P61574 FEM1A-201ENST00000269856 9593 ntAPPRIS P1 BASIC12.26□□□□□ -0.45
HERVK_113P61574 AUTS2-218ENST00000615871 4511 ntTSL 5 BASIC12.26□□□□□ -0.45
HERVK_113P61574 HDAC11-214ENST00000446613 2875 ntTSL 5 BASIC12.26□□□□□ -0.45
HERVK_113P61574 AC007950.2-201ENST00000615045 2347 ntBASIC12.26□□□□□ -0.45
HERVK_113P61574 ANHX-201ENST00000419717 1765 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.26□□□□□ -0.45
HERVK_113P61574 C21orf58-201ENST00000291691 2975 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC12.26□□□□□ -0.45
HERVK_113P61574 ABTB2-201ENST00000435224 4902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.26□□□□□ -0.45
HERVK_113P61574 MID1IP1-202ENST00000378474 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.26□□□□□ -0.45
HERVK_113P61574 MRPS24-201ENST00000317534 707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.26□□□□□ -0.45
HERVK_113P61574 MPRIP-203ENST00000395806 527 ntTSL 3 BASIC12.26□□□□□ -0.45
HERVK_113P61574 BX276092.2-201ENST00000417668 665 ntBASIC12.26□□□□□ -0.45
HERVK_113P61574 PPM1N-207ENST00000451287 1293 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.26□□□□□ -0.45
HERVK_113P61574 TTTY14-205ENST00000454875 544 ntTSL 2 BASIC12.26□□□□□ -0.45
HERVK_113P61574 ATOX1-207ENST00000524142 749 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.26□□□□□ -0.45
HERVK_113P61574 AP001005.4-202ENST00000575325 560 ntTSL 4 BASIC12.26□□□□□ -0.45
HERVK_113P61574 SEPT4-215ENST00000580809 952 ntTSL 1 (best) BASIC12.26□□□□□ -0.45
HERVK_113P61574 AC120498.8-201ENST00000614275 531 ntBASIC12.26□□□□□ -0.45
HERVK_113P61574 BCAN-202ENST00000361588 2563 ntTSL 1 (best) BASIC12.26□□□□□ -0.45
HERVK_113P61574 CCDC8-201ENST00000307522 3213 ntAPPRIS P1 BASIC12.26□□□□□ -0.45
HERVK_113P61574 ASAH1-201ENST00000262097 2618 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.26□□□□□ -0.45
HERVK_113P61574 KIF1A-213ENST00000498729 9221 ntTSL 5 BASIC12.26□□□□□ -0.45
HERVK_113P61574 STAB1-201ENST00000321725 7928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.26□□□□□ -0.45
HERVK_113P61574 SLC30A5-209ENST00000621204 3999 ntTSL 5 BASIC12.26□□□□□ -0.45
HERVK_113P61574 BLOC1S5-202ENST00000397457 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.26□□□□□ -0.45
HERVK_113P61574 AC092068.3-201ENST00000587894 2016 ntBASIC12.26□□□□□ -0.45
HERVK_113P61574 GTF2H1-203ENST00000453096 2707 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.26□□□□□ -0.45
HERVK_113P61574 ASAP1-202ENST00000518721 5507 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC12.26□□□□□ -0.45
HERVK_113P61574 ATXN2L-202ENST00000336783 4367 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.26□□□□□ -0.45
HERVK_113P61574 BPIFB3-201ENST00000375494 1454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.26□□□□□ -0.45
HERVK_113P61574 HDHD2-201ENST00000300605 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.26□□□□□ -0.45
HERVK_113P61574 ETFA-203ENST00000557943 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.26□□□□□ -0.45
HERVK_113P61574 AC117500.2-201ENST00000508145 1561 ntTSL 1 (best) BASIC12.26□□□□□ -0.45
HERVK_113P61574 PLXNB2-201ENST00000359337 6335 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.26□□□□□ -0.45
HERVK_113P61574 WDR20-211ENST00000556807 2382 ntTSL 1 (best) BASIC12.26□□□□□ -0.45
HERVK_113P61574 AD000671.3-202ENST00000591091 1712 ntTSL 1 (best) BASIC12.25□□□□□ -0.45
HERVK_113P61574 PRRT2-219ENST00000637565 1733 ntTSL 5 BASIC12.25□□□□□ -0.45
HERVK_113P61574 SPATA20-202ENST00000356488 2634 ntTSL 1 (best) BASIC12.25□□□□□ -0.45
HERVK_113P61574 RUVBL1-201ENST00000322623 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.25□□□□□ -0.45
HERVK_113P61574 MTFR2-203ENST00000420702 1793 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC12.25□□□□□ -0.45
HERVK_113P61574 EHD2-202ENST00000538399 1766 ntTSL 2 BASIC12.25□□□□□ -0.45
HERVK_113P61574 PANK4-201ENST00000378466 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.25□□□□□ -0.45
HERVK_113P61574 DNM2-202ENST00000359692 3588 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC12.25□□□□□ -0.45
HERVK_113P61574 TNFRSF14-AS1-202ENST00000432521 3608 ntTSL 2 BASIC12.25□□□□□ -0.45
HERVK_113P61574 NAT9-210ENST00000580301 1860 ntTSL 1 (best) BASIC12.25□□□□□ -0.45
HERVK_113P61574 MCF2L-232ENST00000535094 3752 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.25□□□□□ -0.45
HERVK_113P61574 HSPB9-201ENST00000565659 1922 ntAPPRIS P1 BASIC12.25□□□□□ -0.45
HERVK_113P61574 SCLT1-208ENST00000506368 2096 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.25□□□□□ -0.45
HERVK_113P61574 PPP1R21-202ENST00000294952 3142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.25□□□□□ -0.45
HERVK_113P61574 DOLPP1-202ENST00000372546 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.25□□□□□ -0.45
HERVK_113P61574 DLGAP1-220ENST00000581699 2258 ntTSL 2 BASIC12.25□□□□□ -0.45
HERVK_113P61574 GCFC2-202ENST00000409857 2516 ntTSL 5 BASIC12.25□□□□□ -0.45
HERVK_113P61574 KRTCAP3-201ENST00000288873 872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.25□□□□□ -0.45
HERVK_113P61574 HIST2H2AC-201ENST00000331380 390 ntAPPRIS P1 BASIC12.25□□□□□ -0.45
HERVK_113P61574 DERL1-203ENST00000419562 918 ntTSL 2 BASIC12.25□□□□□ -0.45
HERVK_113P61574 PTPA-216ENST00000432651 857 ntTSL 2 BASIC12.25□□□□□ -0.45
HERVK_113P61574 MCCD1P1-208ENST00000445732 328 ntBASIC12.25□□□□□ -0.45
HERVK_113P61574 TESMIN-209ENST00000544963 1235 ntTSL 1 (best) BASIC12.25□□□□□ -0.45
HERVK_113P61574 AL356020.1-201ENST00000554235 1076 ntTSL 5 BASIC12.25□□□□□ -0.45
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 53.5 ms