Protein–RNA interactions for Protein: P60509

ERVPABLB-1, Endogenous retrovirus group PABLB member 1 Env polyprotein, humanhuman

Predictions only

Length 514 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ERVPABLB-1P60509 SOCS2-AS1-202ENST00000500986 1655 ntTSL 2 BASIC17.26■□□□□ 0.35
ERVPABLB-1P60509 ALDH3B1-204ENST00000614849 2280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
ERVPABLB-1P60509 AGO4-201ENST00000373210 7116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
ERVPABLB-1P60509 RGS14-201ENST00000408923 2415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
ERVPABLB-1P60509 EVI5L-202ENST00000538904 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
ERVPABLB-1P60509 SCARF1-205ENST00000571272 2871 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
ERVPABLB-1P60509 PRKRIP1-208ENST00000496391 3430 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.25■□□□□ 0.35
ERVPABLB-1P60509 AC002310.2-202ENST00000492040 1488 ntTSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
ERVPABLB-1P60509 DHRS4L2-203ENST00000534993 1450 ntTSL 3 BASIC17.25■□□□□ 0.35
ERVPABLB-1P60509 CCDC177-201ENST00000599174 4131 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.25■□□□□ 0.35
ERVPABLB-1P60509 IL12RB2-202ENST00000371000 2454 ntTSL 2 BASIC17.25■□□□□ 0.35
ERVPABLB-1P60509 VSIG10L2-202ENST00000638636 2304 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.25■□□□□ 0.35
ERVPABLB-1P60509 ZDHHC2-201ENST00000262096 6377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
ERVPABLB-1P60509 RBFOX1-222ENST00000585867 1580 ntTSL 2 BASIC17.25■□□□□ 0.35
ERVPABLB-1P60509 ERLEC1-201ENST00000185150 2433 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
ERVPABLB-1P60509 BOLA1-202ENST00000369152 859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
ERVPABLB-1P60509 UPK3A-202ENST00000396082 627 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
ERVPABLB-1P60509 TNFSF13-204ENST00000396542 726 ntTSL 3 BASIC17.25■□□□□ 0.35
ERVPABLB-1P60509 AP001058.1-201ENST00000423967 463 ntTSL 2 BASIC17.25■□□□□ 0.35
ERVPABLB-1P60509 TSPY3-202ENST00000440483 414 ntTSL 5 BASIC17.25■□□□□ 0.35
ERVPABLB-1P60509 AL591424.1-201ENST00000442569 1213 ntBASIC17.25■□□□□ 0.35
ERVPABLB-1P60509 SMIM4-202ENST00000476842 522 ntTSL 4 BASIC17.25■□□□□ 0.35
ERVPABLB-1P60509 PACRGL-218ENST00000507634 1142 ntTSL 5 BASIC17.25■□□□□ 0.35
ERVPABLB-1P60509 PGAM5P1-201ENST00000518923 814 ntBASIC17.25■□□□□ 0.35
ERVPABLB-1P60509 SPCS2-207ENST00000530257 612 ntTSL 3 BASIC17.25■□□□□ 0.35
ERVPABLB-1P60509 CD63-204ENST00000546939 779 ntTSL 3 BASIC17.25■□□□□ 0.35
ERVPABLB-1P60509 LINC01451-201ENST00000623792 534 ntBASIC17.25■□□□□ 0.35
ERVPABLB-1P60509 WDR88-202ENST00000361680 1835 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
ERVPABLB-1P60509 LTV1-201ENST00000367576 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
ERVPABLB-1P60509 PTGER3-208ENST00000370932 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.25■□□□□ 0.35
ERVPABLB-1P60509 MTMR14-203ENST00000353332 2368 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
ERVPABLB-1P60509 GBA2-201ENST00000378088 1672 ntTSL 2 BASIC17.25■□□□□ 0.35
ERVPABLB-1P60509 IFFO1-211ENST00000615885 2775 ntTSL 5 BASIC17.25■□□□□ 0.35
ERVPABLB-1P60509 FBXL7-202ENST00000504595 4562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
ERVPABLB-1P60509 POFUT2-201ENST00000331343 4825 ntTSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
ERVPABLB-1P60509 SPRED3-201ENST00000338502 4778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
ERVPABLB-1P60509 TFAP2E-201ENST00000373235 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
ERVPABLB-1P60509 AC026954.2-202ENST00000575474 2571 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC17.25■□□□□ 0.35
ERVPABLB-1P60509 CCDC115-201ENST00000259229 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
ERVPABLB-1P60509 TMED3-201ENST00000299705 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
ERVPABLB-1P60509 DNAJC28-203ENST00000402202 1480 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.24■□□□□ 0.35
ERVPABLB-1P60509 TEX264-215ENST00000611400 1488 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.24■□□□□ 0.35
ERVPABLB-1P60509 CYP2W1-202ENST00000340150 2361 ntTSL 2 BASIC17.24■□□□□ 0.35
ERVPABLB-1P60509 FAM69C-201ENST00000343998 3671 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.24■□□□□ 0.35
ERVPABLB-1P60509 FAM66C-209ENST00000544214 2623 ntTSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
ERVPABLB-1P60509 P2RX6-201ENST00000401443 1834 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
ERVPABLB-1P60509 ZNF264-202ENST00000536056 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
ERVPABLB-1P60509 CTSG-201ENST00000216336 886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
ERVPABLB-1P60509 PTTG1-202ENST00000393964 1070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
ERVPABLB-1P60509 POMC-203ENST00000395826 959 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.24■□□□□ 0.35
ERVPABLB-1P60509 HNRNPDP1-201ENST00000439535 754 ntBASIC17.24■□□□□ 0.35
ERVPABLB-1P60509 AC112698.1-201ENST00000510299 916 ntBASIC17.24■□□□□ 0.35
ERVPABLB-1P60509 RTBDN-213ENST00000592204 1024 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
ERVPABLB-1P60509 CERCAM-201ENST00000372838 2685 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
ERVPABLB-1P60509 ALG3-201ENST00000397676 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
ERVPABLB-1P60509 WDR13-201ENST00000218056 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
ERVPABLB-1P60509 GPAT3-202ENST00000395226 2631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
ERVPABLB-1P60509 IFIH1-202ENST00000421365 1617 ntTSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
ERVPABLB-1P60509 HTD2-206ENST00000481972 1378 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.24■□□□□ 0.35
ERVPABLB-1P60509 PARP6-220ENST00000569795 2855 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.24■□□□□ 0.35
ERVPABLB-1P60509 RUBCNL-203ENST00000378787 2731 ntTSL 2 BASIC17.24■□□□□ 0.35
ERVPABLB-1P60509 TMCO1-207ENST00000580248 1735 ntTSL 2 BASIC17.24■□□□□ 0.35
ERVPABLB-1P60509 RTKN2-203ENST00000395260 2076 ntTSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
ERVPABLB-1P60509 CAMK2G-205ENST00000372765 1822 ntTSL 5 BASIC17.24■□□□□ 0.35
ERVPABLB-1P60509 TRAM1-201ENST00000262213 2785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
ERVPABLB-1P60509 PLBD2-201ENST00000280800 4800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
ERVPABLB-1P60509 SPECC1-203ENST00000395525 2536 ntTSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
ERVPABLB-1P60509 ENC1-201ENST00000302351 5520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
ERVPABLB-1P60509 PPP1R9B-202ENST00000612501 4167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
ERVPABLB-1P60509 FAM9B-202ENST00000362066 2047 ntTSL 2 BASIC17.23■□□□□ 0.35
ERVPABLB-1P60509 FBXW11-202ENST00000296933 4539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
ERVPABLB-1P60509 GMPR-201ENST00000259727 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
ERVPABLB-1P60509 PCDHA12-202ENST00000613593 2588 ntBASIC17.23■□□□□ 0.35
ERVPABLB-1P60509 RAD51-203ENST00000423169 1611 ntTSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
ERVPABLB-1P60509 MED16-201ENST00000269814 1199 ntTSL 5 BASIC17.23■□□□□ 0.35
ERVPABLB-1P60509 ISCA2-201ENST00000298818 851 ntTSL 5 BASIC17.23■□□□□ 0.35
ERVPABLB-1P60509 ZAR1L-201ENST00000345108 1103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
ERVPABLB-1P60509 HNRNPA1P28-201ENST00000424481 961 ntBASIC17.23■□□□□ 0.35
ERVPABLB-1P60509 AP000355.1-201ENST00000432032 480 ntTSL 5 BASIC17.23■□□□□ 0.35
ERVPABLB-1P60509 IGHV3-22-201ENST00000520721 359 ntBASIC17.23■□□□□ 0.35
ERVPABLB-1P60509 AL049869.3-201ENST00000554918 558 ntTSL 3 BASIC17.23■□□□□ 0.35
ERVPABLB-1P60509 ANKRD34C-AS1-205ENST00000560452 576 ntTSL 4 BASIC17.23■□□□□ 0.35
ERVPABLB-1P60509 NADSYN1-201ENST00000319023 2773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
ERVPABLB-1P60509 ABHD14B-206ENST00000483233 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
ERVPABLB-1P60509 FAM237A-203ENST00000543490 1376 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.23■□□□□ 0.35
ERVPABLB-1P60509 PRPF19-201ENST00000227524 2157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
ERVPABLB-1P60509 PRORSD1P-202ENST00000563365 2154 ntBASIC17.23■□□□□ 0.35
ERVPABLB-1P60509 AP001094.4-201ENST00000579008 2176 ntBASIC17.23■□□□□ 0.35
ERVPABLB-1P60509 PCBP4-203ENST00000428823 1835 ntTSL 5 BASIC17.23■□□□□ 0.35
ERVPABLB-1P60509 COL9A1-201ENST00000320755 3059 ntTSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
ERVPABLB-1P60509 CAMK2B-204ENST00000350811 2292 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC17.23■□□□□ 0.35
ERVPABLB-1P60509 PRDM5-212ENST00000515109 2259 ntTSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
ERVPABLB-1P60509 SREBF2-201ENST00000361204 5240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
ERVPABLB-1P60509 ZNFX1-203ENST00000371754 5235 ntTSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
ERVPABLB-1P60509 VPS51-201ENST00000279281 2714 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
ERVPABLB-1P60509 GPANK1-201ENST00000375893 1598 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.23■□□□□ 0.35
ERVPABLB-1P60509 PODXL-202ENST00000378555 2105 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
ERVPABLB-1P60509 TSNARE1-204ENST00000519651 2110 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
ERVPABLB-1P60509 GLRB-201ENST00000264428 3126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
ERVPABLB-1P60509 NR2E1-202ENST00000368986 3212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 25.2 ms