Protein–RNA interactions for Protein: P57059

SIK1, Serine/threonine-protein kinase SIK1, humanhuman

Predictions only

Length 783 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SIK1P57059 HIST1H3D-202ENST00000635200 948 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.97■■□□□ 1.11
SIK1P57059 ADGRL1-202ENST00000361434 5610 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
SIK1P57059 RNF167-205ENST00000571816 1728 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.97■■□□□ 1.11
SIK1P57059 HYOU1-212ENST00000532519 2162 ntTSL 5 BASIC21.97■■□□□ 1.11
SIK1P57059 ATP6V1D-201ENST00000216442 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
SIK1P57059 ANXA6-201ENST00000354546 2593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
SIK1P57059 DTNB-209ENST00000407038 2294 ntTSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
SIK1P57059 RSRP1-201ENST00000243189 1502 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
SIK1P57059 COQ6-220ENST00000629426 1538 ntTSL 5 BASIC21.96■■□□□ 1.11
SIK1P57059 TUBB2B-201ENST00000259818 2020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
SIK1P57059 PTH2R-204ENST00000617735 2472 ntTSL 2 BASIC21.96■■□□□ 1.11
SIK1P57059 GCSH-208ENST00000639169 2537 ntTSL 2 BASIC21.96■■□□□ 1.11
SIK1P57059 GABRB1-201ENST00000295454 2143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
SIK1P57059 CD8B-201ENST00000331469 832 ntTSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
SIK1P57059 MUC1-201ENST00000337604 859 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
SIK1P57059 RAC2-204ENST00000406508 893 ntTSL 5 BASIC21.96■■□□□ 1.11
SIK1P57059 OTUB2-202ENST00000553723 708 ntTSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
SIK1P57059 PMF1-BGLAP-204ENST00000567140 655 ntTSL 3 BASIC21.96■■□□□ 1.11
SIK1P57059 AC084121.4-201ENST00000641598 221 ntBASIC21.96■■□□□ 1.11
SIK1P57059 AF228730.8-201ENST00000642140 221 ntBASIC21.96■■□□□ 1.11
SIK1P57059 CORO1A-208ENST00000565497 1348 ntTSL 5 BASIC21.96■■□□□ 1.11
SIK1P57059 MTERF2-201ENST00000240050 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
SIK1P57059 EEF1D-205ENST00000442189 2207 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
SIK1P57059 PLA2G2F-201ENST00000375102 2723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
SIK1P57059 SOX21-201ENST00000376945 2778 ntAPPRIS P1 BASIC21.96■■□□□ 1.11
SIK1P57059 SIL1-201ENST00000265195 1895 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.96■■□□□ 1.11
SIK1P57059 PPP1R7-201ENST00000234038 2386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
SIK1P57059 ISOC1-201ENST00000173527 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
SIK1P57059 PPT2-246ENST00000375137 1945 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
SIK1P57059 HGNC:18790-211ENST00000621129 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
SIK1P57059 FNBP1-201ENST00000355681 1977 ntTSL 2 BASIC21.96■■□□□ 1.11
SIK1P57059 MPZL1-201ENST00000359523 5010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
SIK1P57059 PLTP-202ENST00000372420 1530 ntTSL 2 BASIC21.96■■□□□ 1.11
SIK1P57059 THNSL2-202ENST00000343544 2052 ntTSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.11
SIK1P57059 FAM206A-201ENST00000322940 2134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.11
SIK1P57059 BID-205ENST00000399774 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
SIK1P57059 FAM86DP-207ENST00000497543 2152 ntTSL 2 BASIC21.95■■□□□ 1.1
SIK1P57059 PRR15-201ENST00000319694 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
SIK1P57059 HNRNPRP1-201ENST00000453465 1695 ntBASIC21.95■■□□□ 1.1
SIK1P57059 PLEKHM2-202ENST00000375799 4122 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
SIK1P57059 CECR2-202ENST00000342247 6178 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.95■■□□□ 1.1
SIK1P57059 APOA5-201ENST00000227665 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
SIK1P57059 AMER2-202ENST00000515384 3197 ntAPPRIS P1 BASIC21.95■■□□□ 1.1
SIK1P57059 HLA-DMA-201ENST00000374843 1123 ntAPPRIS P1 BASIC21.95■■□□□ 1.1
SIK1P57059 AL645941.2-201ENST00000429234 612 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.95■■□□□ 1.1
SIK1P57059 FAM207CP-201ENST00000443486 507 ntBASIC21.95■■□□□ 1.1
SIK1P57059 TSPAN32-207ENST00000451520 1236 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.95■■□□□ 1.1
SIK1P57059 ZNF789-211ENST00000493485 556 ntTSL 4 BASIC21.95■■□□□ 1.1
SIK1P57059 SLC25A39P2-201ENST00000537614 270 ntBASIC21.95■■□□□ 1.1
SIK1P57059 ZNF710-AS1-201ENST00000558334 1168 ntTSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
SIK1P57059 TIMM13-202ENST00000591871 631 ntTSL 5 BASIC21.95■■□□□ 1.1
SIK1P57059 RBP1-207ENST00000619087 516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
SIK1P57059 SFN-201ENST00000339276 1320 ntAPPRIS P1 BASIC21.95■■□□□ 1.1
SIK1P57059 FAM13C-204ENST00000468840 2110 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.95■■□□□ 1.1
SIK1P57059 UBE2I-203ENST00000397514 2976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
SIK1P57059 IL4I1-201ENST00000341114 2349 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
SIK1P57059 SLC25A24-204ENST00000569674 2357 ntBASIC21.95■■□□□ 1.1
SIK1P57059 AP000974.1-201ENST00000623909 2387 ntBASIC21.95■■□□□ 1.1
SIK1P57059 ATRIP-203ENST00000357105 2403 ntTSL 2 BASIC21.95■■□□□ 1.1
SIK1P57059 KRT28-201ENST00000306658 1685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
SIK1P57059 WDR53-201ENST00000332629 1679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
SIK1P57059 NAB2-201ENST00000300131 2711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
SIK1P57059 RAB39A-201ENST00000320578 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
SIK1P57059 POLR2C-201ENST00000219252 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
SIK1P57059 CLDND1-204ENST00000394185 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.94■■□□□ 1.1
SIK1P57059 TRAF3-203ENST00000392745 2459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
SIK1P57059 PIP5KL1-201ENST00000300432 1104 ntTSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
SIK1P57059 Z97056.1-201ENST00000433230 556 ntTSL 2 BASIC21.94■■□□□ 1.1
SIK1P57059 AC002310.2-201ENST00000486926 950 ntTSL 2 BASIC21.94■■□□□ 1.1
SIK1P57059 IGHV3-62-201ENST00000520057 340 ntBASIC21.94■■□□□ 1.1
SIK1P57059 ZNF576-206ENST00000533118 867 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.94■■□□□ 1.1
SIK1P57059 NDUFA4L2-202ENST00000554503 1177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
SIK1P57059 KRT8P23-201ENST00000560090 1207 ntBASIC21.94■■□□□ 1.1
SIK1P57059 LINC02560-201ENST00000596379 459 ntBASIC21.94■■□□□ 1.1
SIK1P57059 AL009183.1-201ENST00000603760 355 ntBASIC21.94■■□□□ 1.1
SIK1P57059 AL390754.1-201ENST00000619088 582 ntBASIC21.94■■□□□ 1.1
SIK1P57059 AC008761.3-201ENST00000624803 892 ntBASIC21.94■■□□□ 1.1
SIK1P57059 HFE2-206ENST00000634927 506 ntTSL 4 BASIC21.94■■□□□ 1.1
SIK1P57059 OPN5-206ENST00000638973 1090 ntTSL 5 BASIC21.94■■□□□ 1.1
SIK1P57059 PRKAR1B-204ENST00000406797 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
SIK1P57059 JMJD6-205ENST00000585429 1330 ntTSL 5 BASIC21.94■■□□□ 1.1
SIK1P57059 GTDC1-219ENST00000542155 2677 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.94■■□□□ 1.1
SIK1P57059 THAP3-201ENST00000054650 1366 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
SIK1P57059 ATP6V1E1-201ENST00000253413 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
SIK1P57059 CCDC94-201ENST00000262962 1434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
SIK1P57059 LYSMD4-202ENST00000344791 2885 ntTSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
SIK1P57059 HCG18-235ENST00000426882 4862 ntTSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
SIK1P57059 HIC1-207ENST00000619757 6711 ntTSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
SIK1P57059 MFGE8-202ENST00000268151 1752 ntTSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
SIK1P57059 SUSD4-208ENST00000494793 1833 ntTSL 5 BASIC21.94■■□□□ 1.1
SIK1P57059 SELENOF-208ENST00000616787 1835 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.94■■□□□ 1.1
SIK1P57059 ARF1-214ENST00000541182 2006 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.94■■□□□ 1.1
SIK1P57059 ACTN4-202ENST00000390009 2102 ntTSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
SIK1P57059 CDHR5-201ENST00000349570 2318 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
SIK1P57059 LIPG-203ENST00000577628 2323 ntTSL 2 BASIC21.94■■□□□ 1.1
SIK1P57059 CSPG5-202ENST00000383738 4161 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
SIK1P57059 POLR2J4-203ENST00000326391 1422 ntTSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
SIK1P57059 UBAC2-203ENST00000403766 1375 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.93■■□□□ 1.1
SIK1P57059 PAXIP1-202ENST00000404141 3827 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.93■■□□□ 1.1
SIK1P57059 CAPG-205ENST00000409921 1195 ntTSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 49.9 ms