Protein–RNA interactions for Protein: P56597

NME5, Nucleoside diphosphate kinase homolog 5, humanhuman

Predictions only

Length 212 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NME5P56597 SFRP1-201ENST00000220772 4492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
NME5P56597 TCP10L2-202ENST00000366832 2185 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
NME5P56597 ASTN2-202ENST00000313400 4747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.91■□□□□ 0.3
NME5P56597 BX276092.7-203ENST00000637198 1536 ntBASIC16.91■□□□□ 0.3
NME5P56597 EWSAT1-206ENST00000558922 1725 ntTSL 5 BASIC16.9■□□□□ 0.3
NME5P56597 AC008741.2-201ENST00000612792 3115 ntBASIC16.9■□□□□ 0.3
NME5P56597 VPS54-201ENST00000272322 3463 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.9■□□□□ 0.3
NME5P56597 HS6ST2-204ENST00000521489 2607 ntTSL 5 BASIC16.9■□□□□ 0.3
NME5P56597 ZNF628-201ENST00000391718 3177 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.9■□□□□ 0.3
NME5P56597 CSF1-204ENST00000369802 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
NME5P56597 PDCD2-208ENST00000541970 3378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
NME5P56597 EIF4H-201ENST00000265753 2679 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC16.9■□□□□ 0.3
NME5P56597 FOXA1-201ENST00000250448 2862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
NME5P56597 PAK4-203ENST00000360442 2855 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.9■□□□□ 0.3
NME5P56597 AP2A2-201ENST00000332231 4656 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
NME5P56597 SNAPIN-201ENST00000368685 1030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
NME5P56597 CALML5-201ENST00000380332 859 ntAPPRIS P1 BASIC16.9■□□□□ 0.3
NME5P56597 RPL39L-203ENST00000455270 653 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.9■□□□□ 0.3
NME5P56597 AP005717.1-202ENST00000523563 419 ntTSL 3 BASIC16.9■□□□□ 0.3
NME5P56597 PAQR4-204ENST00000574988 869 ntTSL 2 BASIC16.9■□□□□ 0.3
NME5P56597 AC140113.3-201ENST00000605663 199 ntBASIC16.9■□□□□ 0.3
NME5P56597 CD24-206ENST00000620405 586 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.9■□□□□ 0.3
NME5P56597 ILKAP-212ENST00000622223 1088 ntTSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
NME5P56597 SLC18B1-201ENST00000275227 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
NME5P56597 GRIN2C-202ENST00000347612 2929 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
NME5P56597 NCAPH2-205ENST00000420993 2037 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
NME5P56597 AQP5-201ENST00000293599 1450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
NME5P56597 ZNF503-201ENST00000372524 3347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
NME5P56597 OGFOD2-211ENST00000538628 1696 ntTSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
NME5P56597 TINF2-201ENST00000267415 1852 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
NME5P56597 CD300A-202ENST00000360141 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
NME5P56597 RABGGTA-201ENST00000216840 2088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
NME5P56597 AC004951.4-201ENST00000454572 2076 ntTSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
NME5P56597 AQP10-203ENST00000484864 2262 ntTSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
NME5P56597 WNT8A-204ENST00000506684 1543 ntTSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
NME5P56597 MFGE8-201ENST00000268150 1937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
NME5P56597 CLDN7-203ENST00000538261 1923 ntTSL 5 BASIC16.9■□□□□ 0.3
NME5P56597 SLC2A6-201ENST00000371897 2301 ntTSL 2 BASIC16.9■□□□□ 0.3
NME5P56597 ZNF133-204ENST00000396026 2717 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC16.9■□□□□ 0.3
NME5P56597 PLCB1-201ENST00000338037 7092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.3
NME5P56597 TRABD2A-202ENST00000409133 1554 ntTSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.3
NME5P56597 ZNF79-204ENST00000617266 1969 ntTSL 3 BASIC16.89■□□□□ 0.3
NME5P56597 C16orf71-204ENST00000590191 2564 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.89■□□□□ 0.3
NME5P56597 AC011270.2-201ENST00000624293 2550 ntBASIC16.89■□□□□ 0.3
NME5P56597 DENR-201ENST00000280557 2769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.3
NME5P56597 PIAS3-201ENST00000369298 2761 ntTSL 5 BASIC16.89■□□□□ 0.3
NME5P56597 TRPV4-205ENST00000537083 2436 ntTSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
NME5P56597 SCAF8-201ENST00000367178 5057 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.89■□□□□ 0.29
NME5P56597 HLA-A-203ENST00000376809 1611 ntAPPRIS P1 BASIC16.89■□□□□ 0.29
NME5P56597 JPT1-203ENST00000409753 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
NME5P56597 CENPT-215ENST00000564817 1638 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.89■□□□□ 0.29
NME5P56597 LYNX1-206ENST00000621401 4537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
NME5P56597 TCF3-212ENST00000588136 2658 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.89■□□□□ 0.29
NME5P56597 KLC1-202ENST00000334553 2524 ntTSL 5 BASIC16.89■□□□□ 0.29
NME5P56597 SLC29A2-202ENST00000357440 2514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
NME5P56597 PGAP3-203ENST00000378011 2533 ntTSL 2 BASIC16.89■□□□□ 0.29
NME5P56597 NEIL2-204ENST00000455213 2323 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.89■□□□□ 0.29
NME5P56597 SCT-201ENST00000176195 366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
NME5P56597 PEX11G-201ENST00000221480 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
NME5P56597 SCGB3A1-201ENST00000292641 521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
NME5P56597 IFI6-201ENST00000339145 822 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC16.89■□□□□ 0.29
NME5P56597 NDUFA1-201ENST00000371437 766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
NME5P56597 CCDC74B-203ENST00000409128 789 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.89■□□□□ 0.29
NME5P56597 KRT18P48-201ENST00000434763 852 ntBASIC16.89■□□□□ 0.29
NME5P56597 CNTD2-203ENST00000513948 787 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.89■□□□□ 0.29
NME5P56597 AC009154.2-201ENST00000621177 724 ntBASIC16.89■□□□□ 0.29
NME5P56597 NDUFAB1-201ENST00000007516 717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
NME5P56597 DMPK-204ENST00000447742 2754 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
NME5P56597 EFNB3-201ENST00000226091 3222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
NME5P56597 CSNK1A1L-201ENST00000379800 2406 ntAPPRIS P1 BASIC16.89■□□□□ 0.29
NME5P56597 PDE8B-201ENST00000264917 5956 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
NME5P56597 LINC01148-201ENST00000557527 1763 ntTSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
NME5P56597 SQOR-208ENST00000568606 1792 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.89■□□□□ 0.29
NME5P56597 ARPC1B-201ENST00000252725 1551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
NME5P56597 LAT2-204ENST00000398475 2453 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
NME5P56597 TXNDC11-202ENST00000356957 3178 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
NME5P56597 RBM6-210ENST00000442092 2260 ntTSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
NME5P56597 TMED3-203ENST00000536821 2265 ntTSL 2 BASIC16.89■□□□□ 0.29
NME5P56597 KCNK7-204ENST00000394217 1372 ntTSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
NME5P56597 CRTC3-201ENST00000268184 2537 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
NME5P56597 AL162727.3-201ENST00000635661 2787 ntBASIC16.89■□□□□ 0.29
NME5P56597 AC011473.4-202ENST00000250366 1602 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC16.88■□□□□ 0.29
NME5P56597 RAD51-203ENST00000423169 1611 ntTSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
NME5P56597 DOC2A-209ENST00000564979 1630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
NME5P56597 PDCD1-201ENST00000334409 2114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
NME5P56597 C6orf203-202ENST00000405204 1420 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.88■□□□□ 0.29
NME5P56597 AC016396.2-201ENST00000562575 1417 ntBASIC16.88■□□□□ 0.29
NME5P56597 SLC35F3-202ENST00000366618 2891 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.88■□□□□ 0.29
NME5P56597 TXNDC11-201ENST00000283033 3140 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.88■□□□□ 0.29
NME5P56597 HYAL3-201ENST00000336307 1942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
NME5P56597 PDZD8-201ENST00000334464 9699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
NME5P56597 BAGE2-202ENST00000474011 1482 ntTSL 2 BASIC16.88■□□□□ 0.29
NME5P56597 KRT89P-201ENST00000620027 1478 ntBASIC16.88■□□□□ 0.29
NME5P56597 FAM208B-201ENST00000328090 8626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
NME5P56597 TRAF2-201ENST00000247668 2264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
NME5P56597 SLC5A2-201ENST00000330498 2271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
NME5P56597 GRK6-202ENST00000355958 1789 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
NME5P56597 COMMD1-201ENST00000311832 911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
NME5P56597 DNPH1-202ENST00000393987 796 ntTSL 2 BASIC16.88■□□□□ 0.29
NME5P56597 SLC25A48-202ENST00000412661 1148 ntTSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 38.6 ms