Protein–RNA interactions for Protein: P48426

PIP4K2A, Phosphatidylinositol 5-phosphate 4-kinase type-2 alpha, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 406 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PIP4K2AP48426 AC244153.1-202ENST00000617855 482 ntTSL 3 BASIC22.07■■□□□ 1.12
PIP4K2AP48426 AC091812.2-201ENST00000619081 385 ntBASIC22.07■■□□□ 1.12
PIP4K2AP48426 CBY1-211ENST00000619293 1118 ntTSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
PIP4K2AP48426 RAB39A-201ENST00000320578 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
PIP4K2AP48426 RNF146-203ENST00000368314 2369 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
PIP4K2AP48426 PGM5-202ENST00000396396 3338 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
PIP4K2AP48426 AFG3L1P-203ENST00000418696 2965 ntTSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
PIP4K2AP48426 TFEB-203ENST00000358871 2188 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
PIP4K2AP48426 SKP2-201ENST00000274254 1537 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
PIP4K2AP48426 HPCAL1-206ENST00000613496 1547 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.06■■□□□ 1.12
PIP4K2AP48426 IFFO1-202ENST00000356896 2680 ntTSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
PIP4K2AP48426 PLCL2-204ENST00000615277 4147 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
PIP4K2AP48426 LRPPRC-203ENST00000409946 1848 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
PIP4K2AP48426 NUTM2D-201ENST00000381697 3290 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
PIP4K2AP48426 NADK-201ENST00000341426 3235 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
PIP4K2AP48426 TMEM205-201ENST00000354882 1034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
PIP4K2AP48426 BLOC1S2-202ENST00000370372 1249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
PIP4K2AP48426 AL031587.1-201ENST00000410099 1055 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
PIP4K2AP48426 C17orf49-203ENST00000546760 764 ntTSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
PIP4K2AP48426 TMEM205-205ENST00000586590 677 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
PIP4K2AP48426 TMEM205-207ENST00000586956 1003 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
PIP4K2AP48426 STXBP2-222ENST00000612033 1188 ntTSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
PIP4K2AP48426 MAGIX-204ENST00000614074 778 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
PIP4K2AP48426 PRR22-202ENST00000419421 1392 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
PIP4K2AP48426 AC010198.1-201ENST00000500076 1552 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
PIP4K2AP48426 OBSL1-203ENST00000373876 5503 ntTSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
PIP4K2AP48426 FOLH1-203ENST00000343844 2258 ntTSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
PIP4K2AP48426 ANKS3-201ENST00000304283 2662 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
PIP4K2AP48426 PCSK7-201ENST00000320934 4649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
PIP4K2AP48426 PARD3-205ENST00000374773 3420 ntTSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
PIP4K2AP48426 FOXD4L6-201ENST00000622588 2034 ntAPPRIS P1 BASIC22.06■■□□□ 1.12
PIP4K2AP48426 PSMD4-201ENST00000368881 1333 ntTSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
PIP4K2AP48426 CADPS2-202ENST00000334010 6045 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
PIP4K2AP48426 RIOX2-201ENST00000333396 5347 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
PIP4K2AP48426 USP25-204ENST00000400183 5341 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
PIP4K2AP48426 LRCH4-201ENST00000310300 2552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
PIP4K2AP48426 EGFL6-202ENST00000380602 2385 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
PIP4K2AP48426 NKD2-202ENST00000296849 2155 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
PIP4K2AP48426 MCOLN1-201ENST00000264079 2082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
PIP4K2AP48426 FBXO24-202ENST00000427939 2087 ntTSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
PIP4K2AP48426 EMC8-201ENST00000253457 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
PIP4K2AP48426 MYBPH-202ENST00000621380 1772 ntTSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
PIP4K2AP48426 TMC5-203ENST00000396229 4917 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
PIP4K2AP48426 PRAMEF20-201ENST00000316412 1597 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
PIP4K2AP48426 CNTNAP3B-203ENST00000377561 5379 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
PIP4K2AP48426 APEH-202ENST00000438011 2249 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
PIP4K2AP48426 PDCD2L-201ENST00000246535 1171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
PIP4K2AP48426 UPK2-201ENST00000264031 916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
PIP4K2AP48426 HUS1B-201ENST00000380907 1025 ntAPPRIS P1 BASIC22.05■■□□□ 1.12
PIP4K2AP48426 IZUMO4-201ENST00000395296 869 ntTSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
PIP4K2AP48426 MKNK2P1-201ENST00000437526 628 ntBASIC22.05■■□□□ 1.12
PIP4K2AP48426 IQCF3-204ENST00000446775 1241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
PIP4K2AP48426 AC074386.1-202ENST00000463561 864 ntBASIC22.05■■□□□ 1.12
PIP4K2AP48426 KIAA0930-215ENST00000496226 589 ntTSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
PIP4K2AP48426 SLC25A6P2-201ENST00000497974 877 ntBASIC22.05■■□□□ 1.12
PIP4K2AP48426 CXCL1P1-201ENST00000502804 216 ntBASIC22.05■■□□□ 1.12
PIP4K2AP48426 BRF1-219ENST00000551787 824 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
PIP4K2AP48426 AC020558.1-201ENST00000583662 425 ntTSL 3 BASIC22.05■■□□□ 1.12
PIP4K2AP48426 HIST1H2AK-201ENST00000618958 393 ntAPPRIS P1 BASIC22.05■■□□□ 1.12
PIP4K2AP48426 TCF25-225ENST00000614813 2047 ntTSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
PIP4K2AP48426 SPSB1-202ENST00000357898 1439 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
PIP4K2AP48426 AC087289.2-201ENST00000587267 1419 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
PIP4K2AP48426 FOXP1-210ENST00000484350 1996 ntTSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
PIP4K2AP48426 MYH7B-201ENST00000262873 6293 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
PIP4K2AP48426 TMEM235-201ENST00000374946 2409 ntTSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
PIP4K2AP48426 KIF25-201ENST00000351261 1326 ntTSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
PIP4K2AP48426 FAM131A-207ENST00000450976 1335 ntTSL 3 BASIC22.05■■□□□ 1.12
PIP4K2AP48426 RAI2-201ENST00000331511 2317 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
PIP4K2AP48426 UVSSA-209ENST00000512728 1668 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
PIP4K2AP48426 RNH1-205ENST00000397615 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
PIP4K2AP48426 EMX2-201ENST00000442245 2710 ntTSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
PIP4K2AP48426 C8orf58-207ENST00000615223 1848 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
PIP4K2AP48426 NDRG4-202ENST00000356752 1375 ntTSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
PIP4K2AP48426 ZNF395-211ENST00000523202 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
PIP4K2AP48426 PANX1-201ENST00000227638 2769 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
PIP4K2AP48426 AL049612.1-201ENST00000427017 694 ntTSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
PIP4K2AP48426 MLF1-210ENST00000484955 1247 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
PIP4K2AP48426 CYB561D1-208ENST00000528785 1271 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
PIP4K2AP48426 CYB561D1-209ENST00000533024 913 ntTSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
PIP4K2AP48426 OVCA2-201ENST00000572195 1122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
PIP4K2AP48426 ZNF773-202ENST00000593916 548 ntTSL 3 BASIC22.04■■□□□ 1.12
PIP4K2AP48426 ACTL9-202ENST00000612068 1252 ntBASIC22.04■■□□□ 1.12
PIP4K2AP48426 CHPF-201ENST00000243776 3013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
PIP4K2AP48426 CXXC1-212ENST00000589940 2242 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
PIP4K2AP48426 HSD17B6-203ENST00000554150 1547 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
PIP4K2AP48426 KCNQ5-203ENST00000355635 6623 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
PIP4K2AP48426 FGFR1-203ENST00000341462 6054 ntTSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
PIP4K2AP48426 DNAJA3-203ENST00000431375 2294 ntTSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
PIP4K2AP48426 OPCML-202ENST00000374778 1302 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
PIP4K2AP48426 PANX1-202ENST00000436171 2750 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
PIP4K2AP48426 SLC35A3-217ENST00000639807 2767 ntTSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
PIP4K2AP48426 GTDC1-219ENST00000542155 2677 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
PIP4K2AP48426 ARSA-201ENST00000216124 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
PIP4K2AP48426 TFAP2D-201ENST00000008391 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
PIP4K2AP48426 LDHD-202ENST00000450168 1966 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
PIP4K2AP48426 AL590648.2-201ENST00000427949 2225 ntTSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
PIP4K2AP48426 CHRND-201ENST00000258385 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
PIP4K2AP48426 TNFRSF13B-201ENST00000261652 1357 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
PIP4K2AP48426 PDE6B-202ENST00000429163 2120 ntTSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
PIP4K2AP48426 ZBTB46-203ENST00000395104 5198 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22.1 ms