Protein–RNA interactions for Protein: P38571

LIPA, Lysosomal acid lipase/cholesteryl ester hydrolase, humanhuman

Predictions only

Length 399 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LIPAP38571 SYDE1-204ENST00000600440 3058 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
LIPAP38571 NTRK2-206ENST00000376213 5560 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
LIPAP38571 NDUFV1-223ENST00000532303 1493 ntTSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
LIPAP38571 CKMT1A-202ENST00000413453 1911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
LIPAP38571 LINC00612-201ENST00000538094 2213 ntTSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
LIPAP38571 RGL3-201ENST00000380456 2542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
LIPAP38571 NR4A1-204ENST00000394825 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
LIPAP38571 MYCL-203ENST00000397332 3256 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
LIPAP38571 PLCB2-201ENST00000260402 4616 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
LIPAP38571 GTF2H1-203ENST00000453096 2707 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
LIPAP38571 THAP8-201ENST00000292894 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
LIPAP38571 BCL2L11-201ENST00000308659 1522 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
LIPAP38571 RPAIN-203ENST00000381209 1535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
LIPAP38571 AP001922.1-201ENST00000499390 1504 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
LIPAP38571 C22orf39-205ENST00000542103 1523 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
LIPAP38571 ZNF667-AS1-201ENST00000585445 1521 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
LIPAP38571 EIF4ENIF1-206ENST00000397525 3695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
LIPAP38571 ZNF423-206ENST00000563137 4911 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
LIPAP38571 SMAD4-201ENST00000342988 8769 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
LIPAP38571 ITGA8-201ENST00000378076 6755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
LIPAP38571 CCNA2-202ENST00000618014 2797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
LIPAP38571 CDC42EP4-201ENST00000335793 3272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
LIPAP38571 NTRK2-207ENST00000376214 5608 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
LIPAP38571 OPRK1-205ENST00000612786 5196 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
LIPAP38571 SYT8-202ENST00000381968 1424 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
LIPAP38571 FBXW9-203ENST00000587955 1437 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
LIPAP38571 FGF8-201ENST00000320185 799 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
LIPAP38571 Telomerase-vert.1-201ENST00000363312 438 ntBASIC15.89■□□□□ 0.13
LIPAP38571 SUV39H2-204ENST00000378325 1292 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
LIPAP38571 AL136307.1-201ENST00000454882 411 ntTSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
LIPAP38571 AC013402.1-201ENST00000456999 561 ntTSL 4 BASIC15.89■□□□□ 0.13
LIPAP38571 PTP4A3-206ENST00000524028 963 ntTSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
LIPAP38571 LTBR-211ENST00000543190 785 ntTSL 3 BASIC15.89■□□□□ 0.13
LIPAP38571 AC011773.3-202ENST00000549291 790 ntTSL 3 BASIC15.89■□□□□ 0.13
LIPAP38571 RNF187-203ENST00000639044 708 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
LIPAP38571 KDM6A-213ENST00000611820 5924 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
LIPAP38571 MAEA-219ENST00000514708 1945 ntTSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
LIPAP38571 MFSD11-219ENST00000593181 1922 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
LIPAP38571 SLITRK4-201ENST00000338017 3357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
LIPAP38571 AL512380.2-201ENST00000637901 1780 ntTSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
LIPAP38571 ABCB10-201ENST00000344517 3857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
LIPAP38571 TEF-201ENST00000266304 4394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
LIPAP38571 NDUFA6-AS1-203ENST00000439129 2950 ntTSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
LIPAP38571 HAGHL-203ENST00000389703 1347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
LIPAP38571 ARFIP2-204ENST00000445086 1300 ntTSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
LIPAP38571 TRIM7-204ENST00000393319 2320 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
LIPAP38571 KAZN-208ENST00000636203 6874 ntTSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
LIPAP38571 MAP3K3-202ENST00000361733 3529 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
LIPAP38571 ICAM3-205ENST00000589261 2024 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
LIPAP38571 PLPP4-202ENST00000398250 1521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
LIPAP38571 TMEM97-201ENST00000226230 2568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
LIPAP38571 SART1-201ENST00000312397 3293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
LIPAP38571 ACP2-206ENST00000529444 1719 ntTSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
LIPAP38571 PTPRO-209ENST00000543886 2070 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
LIPAP38571 RAPGEFL1-209ENST00000544503 2079 ntTSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
LIPAP38571 MINDY1-201ENST00000312210 2400 ntTSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
LIPAP38571 RNF216P1-203ENST00000404404 2427 ntBASIC15.88■□□□□ 0.13
LIPAP38571 POLR3E-202ENST00000359210 2469 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
LIPAP38571 PBK-201ENST00000301905 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
LIPAP38571 MCRS1-202ENST00000357123 1428 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
LIPAP38571 CRADD-202ENST00000542893 1403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
LIPAP38571 ARVCF-204ENST00000406522 2682 ntTSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
LIPAP38571 PTDSS1-202ENST00000517309 5177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
LIPAP38571 AC104809.1-201ENST00000425110 2345 ntTSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
LIPAP38571 SOWAHB-201ENST00000334306 3220 ntAPPRIS P1 BASIC15.88■□□□□ 0.13
LIPAP38571 PDE1B-201ENST00000243052 3444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
LIPAP38571 JPT1-203ENST00000409753 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
LIPAP38571 CD1E-211ENST00000368166 1271 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
LIPAP38571 GUCA2B-201ENST00000372581 597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
LIPAP38571 HSD11B1L-205ENST00000422535 730 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
LIPAP38571 TSPY5P-201ENST00000426936 936 ntBASIC15.88■□□□□ 0.13
LIPAP38571 KRT18P23-201ENST00000435622 1283 ntBASIC15.88■□□□□ 0.13
LIPAP38571 RARRES2-205ENST00000482669 563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
LIPAP38571 YBX1P2-201ENST00000489612 999 ntBASIC15.88■□□□□ 0.13
LIPAP38571 AC004080.5-201ENST00000498652 368 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
LIPAP38571 TRPM4-213ENST00000599628 1829 ntTSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
LIPAP38571 PDPK2P-201ENST00000382326 2387 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
LIPAP38571 NRG1-216ENST00000523079 2359 ntTSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
LIPAP38571 FAM83G-201ENST00000345041 2929 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
LIPAP38571 TMEM229B-201ENST00000357461 4068 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
LIPAP38571 TXNRD2-214ENST00000491939 2238 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
LIPAP38571 STARD7-201ENST00000337288 3368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
LIPAP38571 NDUFS2-202ENST00000392179 2064 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
LIPAP38571 LINC00323-202ENST00000441268 2095 ntTSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
LIPAP38571 EIF5A-204ENST00000416016 1336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
LIPAP38571 NCF1B-201ENST00000423083 1516 ntTSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
LIPAP38571 BDP1-202ENST00000380675 2861 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
LIPAP38571 FAM104A-202ENST00000405159 2865 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
LIPAP38571 DICER1-AS1-204ENST00000554631 1709 ntTSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
LIPAP38571 UGT3A2-204ENST00000513300 1924 ntTSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
LIPAP38571 MAP2K5-201ENST00000178640 2347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
LIPAP38571 OGFOD2-202ENST00000397389 2308 ntTSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
LIPAP38571 PLCG1-202ENST00000373271 7395 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
LIPAP38571 GALNT18-201ENST00000227756 2504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
LIPAP38571 CDCP1-201ENST00000296129 6006 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
LIPAP38571 FAM178B-204ENST00000490605 2710 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
LIPAP38571 SYNE4-201ENST00000324444 1354 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
LIPAP38571 ZMYM5-202ENST00000382905 1382 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
LIPAP38571 ELP5-202ENST00000356683 2197 ntTSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
LIPAP38571 TMC3-AS1-203ENST00000559781 2195 ntTSL 3 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27.3 ms