Protein–RNA interactions for Protein: P08575

PTPRC, Receptor-type tyrosine-protein phosphatase C, humanhuman

Predictions only

Length 1,304 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRCP08575 PCDHGC3-205ENST00000617641 2346 ntTSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
PTPRCP08575 FOXD4L1-201ENST00000306507 2491 ntAPPRIS P1 BASIC21.93■■□□□ 1.1
PTPRCP08575 CEP83-AS1-201ENST00000623122 2482 ntBASIC21.93■■□□□ 1.1
PTPRCP08575 SELENOF-201ENST00000331835 1781 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
PTPRCP08575 RIOX2-201ENST00000333396 5347 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
PTPRCP08575 PFKFB3-215ENST00000536985 2094 ntTSL 2 BASIC21.92■■□□□ 1.1
PTPRCP08575 HDAC10-201ENST00000216271 2687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
PTPRCP08575 CD8A-202ENST00000352580 1977 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.92■■□□□ 1.1
PTPRCP08575 XXYLT1-205ENST00000437101 2149 ntTSL 2 BASIC21.92■■□□□ 1.1
PTPRCP08575 RMDN3-202ENST00000338376 2251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
PTPRCP08575 TMEM89-201ENST00000330862 662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
PTPRCP08575 INIP-202ENST00000374236 874 ntTSL 2 BASIC21.92■■□□□ 1.1
PTPRCP08575 YDJC-202ENST00000398873 1066 ntTSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
PTPRCP08575 DTX2-202ENST00000413936 2472 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
PTPRCP08575 AC136632.2-201ENST00000512891 861 ntBASIC21.92■■□□□ 1.1
PTPRCP08575 PTHLH-205ENST00000535992 1891 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
PTPRCP08575 ZBP1-208ENST00000541799 1041 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.92■■□□□ 1.1
PTPRCP08575 RPS29-206ENST00000557111 488 ntTSL 2 BASIC21.92■■□□□ 1.1
PTPRCP08575 PRSS8-206ENST00000568261 1214 ntTSL 2 BASIC21.92■■□□□ 1.1
PTPRCP08575 DEF8-228ENST00000610455 816 ntTSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
PTPRCP08575 AL805961.1-202ENST00000641562 540 ntBASIC21.92■■□□□ 1.1
PTPRCP08575 ATOH1-201ENST00000306011 2212 ntAPPRIS P1 BASIC21.92■■□□□ 1.1
PTPRCP08575 RHBDF1P1-201ENST00000427504 1941 ntBASIC21.92■■□□□ 1.1
PTPRCP08575 PDCL3-201ENST00000264254 1337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
PTPRCP08575 CLN6-202ENST00000538696 1343 ntTSL 2 BASIC21.92■■□□□ 1.1
PTPRCP08575 TNFAIP2-201ENST00000333007 4175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
PTPRCP08575 HERPUD2-202ENST00000396081 3057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
PTPRCP08575 GABRB2-202ENST00000353437 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
PTPRCP08575 PAPD5-203ENST00000561678 2916 ntTSL 5 BASIC21.92■■□□□ 1.1
PTPRCP08575 CLEC18B-206ENST00000620745 1847 ntTSL 5 BASIC21.92■■□□□ 1.1
PTPRCP08575 ZXDB-201ENST00000374888 5894 ntAPPRIS P1 BASIC21.91■■□□□ 1.1
PTPRCP08575 KCNV2-201ENST00000382082 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
PTPRCP08575 AC108860.2-201ENST00000562760 2183 ntBASIC21.91■■□□□ 1.1
PTPRCP08575 ERBB2-205ENST00000578199 2526 ntTSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
PTPRCP08575 PRDM5-201ENST00000264808 5330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
PTPRCP08575 KCNJ2-AS1-201ENST00000590966 2442 ntBASIC21.91■■□□□ 1.1
PTPRCP08575 LMCD1-204ENST00000426878 1431 ntTSL 2 BASIC21.91■■□□□ 1.1
PTPRCP08575 LY6E-207ENST00000520466 1419 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.91■■□□□ 1.1
PTPRCP08575 CRTC3-208ENST00000560098 1421 ntTSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
PTPRCP08575 RNF7-201ENST00000273480 2763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
PTPRCP08575 RAB4A-205ENST00000618010 2799 ntTSL 3 BASIC21.91■■□□□ 1.1
PTPRCP08575 TNIP1-211ENST00000521591 2274 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
PTPRCP08575 USP3-AS1-201ENST00000558831 1784 ntTSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
PTPRCP08575 HBQ1-201ENST00000199708 536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
PTPRCP08575 DHDH-201ENST00000221403 1081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
PTPRCP08575 GSTZ1-202ENST00000349555 867 ntTSL 2 BASIC21.91■■□□□ 1.1
PTPRCP08575 NABP1-203ENST00000409510 843 ntTSL 5 BASIC21.91■■□□□ 1.1
PTPRCP08575 NDUFB2-209ENST00000472695 503 ntTSL 5 BASIC21.91■■□□□ 1.1
PTPRCP08575 EEF1D-238ENST00000531621 840 ntTSL 3 BASIC21.91■■□□□ 1.1
PTPRCP08575 GABARAP-204ENST00000571253 837 ntTSL 2 BASIC21.91■■□□□ 1.1
PTPRCP08575 AP002414.3-201ENST00000589352 1468 ntBASIC21.91■■□□□ 1.1
PTPRCP08575 BICD1-205ENST00000550207 1328 ntTSL 3 BASIC21.91■■□□□ 1.1
PTPRCP08575 BBS7-204ENST00000506636 2570 ntTSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
PTPRCP08575 MIPEP-201ENST00000382172 2400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
PTPRCP08575 PHGDH-208ENST00000641023 2096 ntAPPRIS P1 BASIC21.91■■□□□ 1.1
PTPRCP08575 LINC02012-201ENST00000608206 1725 ntBASIC21.91■■□□□ 1.1
PTPRCP08575 FBXL5-202ENST00000412094 2837 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
PTPRCP08575 TNFRSF13B-201ENST00000261652 1357 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
PTPRCP08575 CLDN15-202ENST00000401528 2131 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.91■■□□□ 1.1
PTPRCP08575 ARPIN-202ENST00000460685 2145 ntTSL 2 BASIC21.91■■□□□ 1.1
PTPRCP08575 AC254629.1-202ENST00000618276 2112 ntTSL 2 BASIC21.91■■□□□ 1.1
PTPRCP08575 RAB11FIP4-211ENST00000621161 8628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
PTPRCP08575 TRAF4-201ENST00000262395 2923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
PTPRCP08575 GDF5-202ENST00000374372 2572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
PTPRCP08575 ADCY6-206ENST00000550422 5877 ntTSL 2 BASIC21.9■■□□□ 1.1
PTPRCP08575 TM2D1-201ENST00000294613 1250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
PTPRCP08575 TM2D1-204ENST00000371180 1248 ntTSL 5 BASIC21.9■■□□□ 1.1
PTPRCP08575 TRIM36-203ENST00000379618 693 ntTSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
PTPRCP08575 AL356488.2-201ENST00000602755 427 ntBASIC21.9■■□□□ 1.1
PTPRCP08575 TM2D1-212ENST00000606498 969 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.9■■□□□ 1.1
PTPRCP08575 ATP6AP2-220ENST00000636970 1187 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.9■■□□□ 1.1
PTPRCP08575 FAM53B-AS1-202ENST00000448422 1491 ntTSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
PTPRCP08575 HLA-A-204ENST00000396634 1868 ntAPPRIS P1 BASIC21.9■■□□□ 1.1
PTPRCP08575 UBE2QL1-201ENST00000399816 4317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
PTPRCP08575 MAPKAPK3-201ENST00000357955 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
PTPRCP08575 TMPRSS2-206ENST00000458356 1701 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.9■■□□□ 1.1
PTPRCP08575 RPAIN-203ENST00000381209 1535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
PTPRCP08575 AC026954.2-202ENST00000575474 2571 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC21.9■■□□□ 1.1
PTPRCP08575 ARNT-202ENST00000358595 4887 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
PTPRCP08575 ETNK2-202ENST00000367201 2431 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.9■■□□□ 1.1
PTPRCP08575 AC243591.1-201ENST00000452967 1364 ntBASIC21.9■■□□□ 1.1
PTPRCP08575 ADCY5-202ENST00000462833 7311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
PTPRCP08575 WRAP53-203ENST00000431639 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
PTPRCP08575 WRAP53-204ENST00000457584 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
PTPRCP08575 HYAL3-205ENST00000450982 1402 ntTSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.1
PTPRCP08575 C2CD2-202ENST00000380486 6345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.1
PTPRCP08575 TFF3-201ENST00000291525 407 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.89■■□□□ 1.1
PTPRCP08575 SGF29-201ENST00000317058 1153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.1
PTPRCP08575 TMEM59-202ENST00000371337 600 ntTSL 2 BASIC21.89■■□□□ 1.1
PTPRCP08575 AL031587.1-201ENST00000410099 1055 ntTSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.1
PTPRCP08575 LINC01972-201ENST00000422271 553 ntTSL 3 BASIC21.89■■□□□ 1.1
PTPRCP08575 NDUFB2-208ENST00000471136 499 ntTSL 3 BASIC21.89■■□□□ 1.1
PTPRCP08575 AC093909.1-201ENST00000504731 1122 ntBASIC21.89■■□□□ 1.1
PTPRCP08575 LITAF-211ENST00000572255 516 ntTSL 4 BASIC21.89■■□□□ 1.1
PTPRCP08575 NAA60-217ENST00000572942 1089 ntTSL 2 BASIC21.89■■□□□ 1.1
PTPRCP08575 LITAF-215ENST00000574763 717 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.89■■□□□ 1.1
PTPRCP08575 CIRBP-235ENST00000591935 746 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC21.89■■□□□ 1.1
PTPRCP08575 PGM5P2-202ENST00000637225 1043 ntBASIC21.89■■□□□ 1.1
PTPRCP08575 FMR1-205ENST00000370475 4308 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
PTPRCP08575 KCNJ10-208ENST00000639408 1546 ntTSL 5 BASIC21.89■■□□□ 1.09
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