Protein–RNA interactions for Protein: O00233

PSMD9, 26S proteasome non-ATPase regulatory subunit 9, humanhuman

Predictions only

Length 223 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PSMD9O00233 AC019068.1-202ENST00000483218 768 ntTSL 3 BASIC15.6■□□□□ 0.09
PSMD9O00233 PML-221ENST00000569965 2148 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
PSMD9O00233 PAQR4-204ENST00000574988 869 ntTSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
PSMD9O00233 SLF2-205ENST00000609386 891 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
PSMD9O00233 C9orf64-203ENST00000376344 2443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
PSMD9O00233 KLHL33-201ENST00000344581 1863 ntTSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
PSMD9O00233 LYRM9-203ENST00000460380 2196 ntTSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
PSMD9O00233 CDX1-202ENST00000616154 1343 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
PSMD9O00233 PTGES2-201ENST00000277462 1614 ntTSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
PSMD9O00233 MFSD11-219ENST00000593181 1922 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
PSMD9O00233 B3GNT3-201ENST00000318683 2226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
PSMD9O00233 UGCG-201ENST00000374279 4007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
PSMD9O00233 PFN2-201ENST00000239940 2261 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
PSMD9O00233 FKBP3-201ENST00000216330 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
PSMD9O00233 LSP1-201ENST00000311604 1699 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
PSMD9O00233 KL-201ENST00000380099 5006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
PSMD9O00233 GBA2-203ENST00000378103 3611 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
PSMD9O00233 EIF4ENIF1-206ENST00000397525 3695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
PSMD9O00233 CHEK2-202ENST00000348295 1771 ntTSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
PSMD9O00233 SLC45A1-202ENST00000471889 2784 ntTSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
PSMD9O00233 PGRMC2-207ENST00000520121 3785 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
PSMD9O00233 PPP1R16B-202ENST00000373331 6106 ntTSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
PSMD9O00233 NAP1L4-201ENST00000380542 2511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
PSMD9O00233 BCL2L11-201ENST00000308659 1522 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
PSMD9O00233 WASHC2C-204ENST00000374362 4623 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
PSMD9O00233 NKAIN1-201ENST00000373736 2589 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
PSMD9O00233 NSFL1C-202ENST00000353088 2611 ntTSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
PSMD9O00233 CCDC187-205ENST00000638797 10126 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
PSMD9O00233 CRELD1-201ENST00000326434 1994 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
PSMD9O00233 IFIH1-202ENST00000421365 1617 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
PSMD9O00233 PEX11G-201ENST00000221480 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
PSMD9O00233 BAD-201ENST00000309032 929 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
PSMD9O00233 SPDYE2-201ENST00000341656 1219 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
PSMD9O00233 TSPY8-203ENST00000383005 435 ntTSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
PSMD9O00233 KRTAP5-10-201ENST00000398531 1176 ntAPPRIS P1 BASIC15.59■□□□□ 0.09
PSMD9O00233 YPEL3-201ENST00000398838 935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
PSMD9O00233 PLEKHB2-203ENST00000404460 1167 ntTSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
PSMD9O00233 AC087499.1-201ENST00000418141 1075 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
PSMD9O00233 LIN28AP1-201ENST00000429574 405 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
PSMD9O00233 ATP5G1P1-201ENST00000448724 379 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
PSMD9O00233 SPDYE2B-202ENST00000455020 1219 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
PSMD9O00233 AC112698.1-201ENST00000510299 916 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
PSMD9O00233 AP005717.1-202ENST00000523563 419 ntTSL 3 BASIC15.59■□□□□ 0.09
PSMD9O00233 LINGO1-AS2-201ENST00000557799 663 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
PSMD9O00233 ILKAP-212ENST00000622223 1088 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
PSMD9O00233 AL590627.2-201ENST00000637510 144 ntTSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
PSMD9O00233 SCP2-202ENST00000371513 2003 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
PSMD9O00233 OGFOD2-211ENST00000538628 1696 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
PSMD9O00233 RREB1-204ENST00000379938 8778 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
PSMD9O00233 GSK3B-201ENST00000264235 7711 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
PSMD9O00233 SLC8B1-210ENST00000550047 2493 ntTSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
PSMD9O00233 ELF2-204ENST00000394235 4012 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
PSMD9O00233 C1QTNF1-209ENST00000581774 1368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
PSMD9O00233 RUVBL1-201ENST00000322623 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
PSMD9O00233 LINC00472-203ENST00000426635 2958 ntTSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
PSMD9O00233 FAM210B-201ENST00000371384 3046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
PSMD9O00233 LYPLA2-205ENST00000374514 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
PSMD9O00233 HNF1B-202ENST00000614313 1819 ntTSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
PSMD9O00233 HNF1B-203ENST00000617272 1820 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
PSMD9O00233 DYNLL2-201ENST00000579991 6805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
PSMD9O00233 CFL1-203ENST00000525451 1878 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
PSMD9O00233 KRT89P-201ENST00000620027 1478 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
PSMD9O00233 ATAD3A-207ENST00000536055 2332 ntTSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
PSMD9O00233 BET1L-203ENST00000382762 2819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
PSMD9O00233 GABRB3-215ENST00000622697 5876 ntTSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.09
PSMD9O00233 KIZ-211ENST00000619574 1971 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.09
PSMD9O00233 PDE4C-202ENST00000355502 5979 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.09
PSMD9O00233 TUBB2B-201ENST00000259818 2020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
PSMD9O00233 PPP1CB-202ENST00000358506 4771 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.09
PSMD9O00233 DTX3-204ENST00000548804 2067 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.09
PSMD9O00233 OPRK1-202ENST00000520287 1602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
PSMD9O00233 LRP10-201ENST00000359591 6886 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
PSMD9O00233 BEST2-202ENST00000549706 2183 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
PSMD9O00233 NFKBID-210ENST00000606253 1736 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
PSMD9O00233 HOXB3-205ENST00000470495 4208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
PSMD9O00233 KCNQ2-202ENST00000344462 2750 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
PSMD9O00233 PJA1-201ENST00000361478 2755 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
PSMD9O00233 DCLK2-204ENST00000506325 2298 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
PSMD9O00233 COA5-201ENST00000328709 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
PSMD9O00233 ANKRD20A18P-201ENST00000359341 492 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
PSMD9O00233 AC092597.1-201ENST00000487352 616 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
PSMD9O00233 AC026471.3-201ENST00000565137 578 ntTSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
PSMD9O00233 AC145285.6-201ENST00000604632 637 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
PSMD9O00233 LZTS1-201ENST00000265801 5459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
PSMD9O00233 MSI2-201ENST00000284073 6364 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
PSMD9O00233 POLR3E-203ENST00000418581 2529 ntTSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
PSMD9O00233 PITPNM2-208ENST00000542749 6660 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
PSMD9O00233 OTUD7A-201ENST00000307050 10770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
PSMD9O00233 SCART1-206ENST00000640237 4351 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
PSMD9O00233 AQP5-201ENST00000293599 1450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
PSMD9O00233 RHNO1-209ENST00000618250 2070 ntAPPRIS P3 TSL 4 BASIC15.58■□□□□ 0.08
PSMD9O00233 TBC1D2-205ENST00000465784 3349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
PSMD9O00233 RNF121-203ENST00000393713 2132 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
PSMD9O00233 DTX2-201ENST00000324432 2769 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
PSMD9O00233 TRMT44-201ENST00000389737 2799 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
PSMD9O00233 ARPC1B-201ENST00000252725 1551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
PSMD9O00233 ETV7-204ENST00000373738 1570 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
PSMD9O00233 ETV7-207ENST00000620358 1599 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
PSMD9O00233 KCNQ2-215ENST00000629241 2853 ntTSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
PSMD9O00233 RAD51-203ENST00000423169 1611 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 30.2 ms