Protein–RNA interactions for Protein: A6NEM1

GOLGA6L9, Golgin subfamily A member 6-like protein 9, humanhuman

Predictions only

Length 432 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GOLGA6L9A6NEM1 SLC35E2B-204ENST00000614300 2156 ntTSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
GOLGA6L9A6NEM1 CRY2-211ENST00000616080 1936 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
GOLGA6L9A6NEM1 AC093525.9-201ENST00000624961 1746 ntBASIC18.87■□□□□ 0.61
GOLGA6L9A6NEM1 MYB-209ENST00000442647 3304 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
GOLGA6L9A6NEM1 AGK-211ENST00000629555 2765 ntTSL 5 BASIC18.87■□□□□ 0.61
GOLGA6L9A6NEM1 AMOTL2-211ENST00000513145 2653 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
GOLGA6L9A6NEM1 CDKN2B-AS1-208ENST00000580576 2175 ntTSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
GOLGA6L9A6NEM1 LFNG-207ENST00000614382 1969 ntTSL 5 BASIC18.86■□□□□ 0.61
GOLGA6L9A6NEM1 KCNG3-201ENST00000306078 3824 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
GOLGA6L9A6NEM1 DGKE-204ENST00000572810 1843 ntTSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
GOLGA6L9A6NEM1 METTL21A-208ENST00000448007 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
GOLGA6L9A6NEM1 AL109955.1-201ENST00000417346 1540 ntTSL 2 BASIC18.86■□□□□ 0.61
GOLGA6L9A6NEM1 SYBU-209ENST00000446070 2919 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
GOLGA6L9A6NEM1 AC027031.2-201ENST00000521369 1318 ntTSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
GOLGA6L9A6NEM1 WDR45B-201ENST00000392325 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
GOLGA6L9A6NEM1 TSPY14P-201ENST00000303979 915 ntBASIC18.86■□□□□ 0.61
GOLGA6L9A6NEM1 LINC01063-201ENST00000441644 348 ntTSL 3 BASIC18.86■□□□□ 0.61
GOLGA6L9A6NEM1 BX322234.1-201ENST00000444188 980 ntTSL 3 BASIC18.86■□□□□ 0.61
GOLGA6L9A6NEM1 KCNIP3-205ENST00000468529 985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
GOLGA6L9A6NEM1 C7orf49-209ENST00000483029 596 ntTSL 2 BASIC18.86■□□□□ 0.61
GOLGA6L9A6NEM1 AP005717.1-202ENST00000523563 419 ntTSL 3 BASIC18.86■□□□□ 0.61
GOLGA6L9A6NEM1 EGLN1P1-201ENST00000531623 762 ntBASIC18.86■□□□□ 0.61
GOLGA6L9A6NEM1 TGIF1-219ENST00000551541 990 ntTSL 2 BASIC18.86■□□□□ 0.61
GOLGA6L9A6NEM1 VASH1-204ENST00000554743 1096 ntTSL 3 BASIC18.86■□□□□ 0.61
GOLGA6L9A6NEM1 GLDC-219ENST00000640208 420 ntTSL 2 BASIC18.86■□□□□ 0.61
GOLGA6L9A6NEM1 PPP1CB-202ENST00000358506 4771 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.86■□□□□ 0.61
GOLGA6L9A6NEM1 WDR20-211ENST00000556807 2382 ntTSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
GOLGA6L9A6NEM1 SCP2-204ENST00000407246 2239 ntTSL 2 BASIC18.86■□□□□ 0.61
GOLGA6L9A6NEM1 SLA2-202ENST00000360672 2171 ntTSL 5 BASIC18.86■□□□□ 0.61
GOLGA6L9A6NEM1 SHTN1-202ENST00000355371 5361 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.86■□□□□ 0.61
GOLGA6L9A6NEM1 PAX4-202ENST00000341640 2010 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
GOLGA6L9A6NEM1 GPER1-206ENST00000617001 1900 ntTSL 5 BASIC18.86■□□□□ 0.61
GOLGA6L9A6NEM1 NAT9-210ENST00000580301 1860 ntTSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
GOLGA6L9A6NEM1 OSR2-201ENST00000297565 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
GOLGA6L9A6NEM1 ATP6V0E2-201ENST00000421974 2605 ntTSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
GOLGA6L9A6NEM1 RGS3-202ENST00000342620 1714 ntTSL 5 BASIC18.86■□□□□ 0.61
GOLGA6L9A6NEM1 LPAR3-201ENST00000370611 1720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
GOLGA6L9A6NEM1 CA7-202ENST00000394069 1713 ntTSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
GOLGA6L9A6NEM1 NFKBID-210ENST00000606253 1736 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
GOLGA6L9A6NEM1 ZSCAN10-201ENST00000252463 2463 ntTSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
GOLGA6L9A6NEM1 PAX4-204ENST00000463946 1613 ntTSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
GOLGA6L9A6NEM1 AFG3L2-201ENST00000269143 3247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
GOLGA6L9A6NEM1 PDE12-202ENST00000487257 3040 ntTSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
GOLGA6L9A6NEM1 TXNRD2-214ENST00000491939 2238 ntTSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
GOLGA6L9A6NEM1 TPSD1-201ENST00000211076 1499 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
GOLGA6L9A6NEM1 SCAF8-201ENST00000367178 5057 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.85■□□□□ 0.61
GOLGA6L9A6NEM1 KRT8P9-201ENST00000558927 1449 ntBASIC18.85■□□□□ 0.61
GOLGA6L9A6NEM1 OR13J1-201ENST00000377981 1339 ntAPPRIS P1 BASIC18.85■□□□□ 0.61
GOLGA6L9A6NEM1 TMIGD2-201ENST00000301272 1262 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
GOLGA6L9A6NEM1 FAM182B-202ENST00000376404 456 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.85■□□□□ 0.61
GOLGA6L9A6NEM1 SDCBP2-203ENST00000381808 1261 ntTSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
GOLGA6L9A6NEM1 PEX26-203ENST00000428061 815 ntTSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
GOLGA6L9A6NEM1 NDUFB2-203ENST00000461457 559 ntTSL 3 BASIC18.85■□□□□ 0.61
GOLGA6L9A6NEM1 TMEM185A-204ENST00000507237 903 ntTSL 2 BASIC18.85■□□□□ 0.61
GOLGA6L9A6NEM1 IKBKB-210ENST00000518983 447 ntTSL 2 BASIC18.85■□□□□ 0.61
GOLGA6L9A6NEM1 HRASLS5-205ENST00000539221 1167 ntTSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
GOLGA6L9A6NEM1 AC124947.2-201ENST00000547118 1133 ntBASIC18.85■□□□□ 0.61
GOLGA6L9A6NEM1 AL512604.3-201ENST00000569583 964 ntBASIC18.85■□□□□ 0.61
GOLGA6L9A6NEM1 ZNF561-AS1-202ENST00000586614 568 ntTSL 5 BASIC18.85■□□□□ 0.61
GOLGA6L9A6NEM1 UBALD1-209ENST00000591897 1275 ntTSL 2 BASIC18.85■□□□□ 0.61
GOLGA6L9A6NEM1 C16orf74-207ENST00000602914 761 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.85■□□□□ 0.61
GOLGA6L9A6NEM1 NFATC4-202ENST00000413692 5700 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
GOLGA6L9A6NEM1 PRDM5-202ENST00000394435 2492 ntTSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
GOLGA6L9A6NEM1 RNF216P1-203ENST00000404404 2427 ntBASIC18.85■□□□□ 0.61
GOLGA6L9A6NEM1 RHOV-201ENST00000220507 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
GOLGA6L9A6NEM1 RAI1-207ENST00000640861 5172 ntTSL 5 BASIC18.85■□□□□ 0.61
GOLGA6L9A6NEM1 SLC25A45-202ENST00000398802 2286 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.85■□□□□ 0.61
GOLGA6L9A6NEM1 LINC00612-201ENST00000538094 2213 ntTSL 2 BASIC18.85■□□□□ 0.61
GOLGA6L9A6NEM1 ATP6V0E2-202ENST00000425642 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
GOLGA6L9A6NEM1 GNG2-213ENST00000556766 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
GOLGA6L9A6NEM1 SRSF12-201ENST00000452027 3599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
GOLGA6L9A6NEM1 SRSF1-201ENST00000258962 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
GOLGA6L9A6NEM1 CASK-203ENST00000378163 4411 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.84■□□□□ 0.61
GOLGA6L9A6NEM1 AC092143.3-201ENST00000565150 1900 ntTSL 5 BASIC18.84■□□□□ 0.61
GOLGA6L9A6NEM1 TTC8-216ENST00000614125 2377 ntTSL 5 BASIC18.84■□□□□ 0.61
GOLGA6L9A6NEM1 GATA6-201ENST00000269216 3770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
GOLGA6L9A6NEM1 KCNQ2-202ENST00000344462 2750 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
GOLGA6L9A6NEM1 ZBTB16-202ENST00000392996 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
GOLGA6L9A6NEM1 PLPPR2-201ENST00000251473 2727 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
GOLGA6L9A6NEM1 NSFL1C-201ENST00000216879 3568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
GOLGA6L9A6NEM1 ITGA3-202ENST00000320031 4888 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
GOLGA6L9A6NEM1 PTPRC-206ENST00000413409 1338 ntTSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
GOLGA6L9A6NEM1 GTPBP3-201ENST00000324894 2579 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
GOLGA6L9A6NEM1 VKORC1-204ENST00000394971 664 ntTSL 5 BASIC18.84■□□□□ 0.61
GOLGA6L9A6NEM1 BIRC7-203ENST00000395306 593 ntTSL 2 BASIC18.84■□□□□ 0.61
GOLGA6L9A6NEM1 SLC25A1P3-201ENST00000395415 828 ntBASIC18.84■□□□□ 0.61
GOLGA6L9A6NEM1 SNORA78-201ENST00000459373 127 ntBASIC18.84■□□□□ 0.61
GOLGA6L9A6NEM1 SNX21-213ENST00000614929 587 ntTSL 5 BASIC18.84■□□□□ 0.61
GOLGA6L9A6NEM1 DNAJC28-201ENST00000314399 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
GOLGA6L9A6NEM1 RGS6-210ENST00000553530 5685 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
GOLGA6L9A6NEM1 AC020661.1-201ENST00000503052 1584 ntTSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
GOLGA6L9A6NEM1 SORT1-201ENST00000256637 7028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
GOLGA6L9A6NEM1 CYP11A1-201ENST00000268053 1934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
GOLGA6L9A6NEM1 RDH13-223ENST00000610356 1931 ntTSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
GOLGA6L9A6NEM1 ADAM15-228ENST00000531455 2678 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.84■□□□□ 0.61
GOLGA6L9A6NEM1 SCN3B-202ENST00000392770 6061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
GOLGA6L9A6NEM1 ITM2C-201ENST00000326407 1888 ntTSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
GOLGA6L9A6NEM1 UBXN6-202ENST00000394765 1809 ntTSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
GOLGA6L9A6NEM1 WRAP53-203ENST00000431639 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
GOLGA6L9A6NEM1 WRAP53-204ENST00000457584 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 92.9 ms