Protein–RNA interactions for Protein: A0AVK6

E2F8, Transcription factor E2F8, humanhuman

Predictions only

Length 867 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
E2F8A0AVK6 NXNL2-205ENST00000618633 739 ntTSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
E2F8A0AVK6 AC073592.5-201ENST00000624854 528 ntBASIC18.26■□□□□ 0.51
E2F8A0AVK6 PROK2-202ENST00000353065 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
E2F8A0AVK6 AC012317.2-201ENST00000623305 2251 ntBASIC18.26■□□□□ 0.51
E2F8A0AVK6 LRP4-201ENST00000378623 8076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
E2F8A0AVK6 KCNQ2-207ENST00000370224 3004 ntTSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
E2F8A0AVK6 HMGN1-204ENST00000380749 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
E2F8A0AVK6 ARNT-212ENST00000515192 2892 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
E2F8A0AVK6 MYO19-225ENST00000621344 1640 ntTSL 2 BASIC18.26■□□□□ 0.51
E2F8A0AVK6 KCNB1-203ENST00000635465 4114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
E2F8A0AVK6 E2F2-201ENST00000361729 5191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
E2F8A0AVK6 PRRT2-219ENST00000637565 1733 ntTSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
E2F8A0AVK6 AL353593.2-201ENST00000602529 1483 ntBASIC18.26■□□□□ 0.51
E2F8A0AVK6 ABHD14B-203ENST00000395008 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
E2F8A0AVK6 PSRC1-205ENST00000409138 1826 ntTSL 2 BASIC18.26■□□□□ 0.51
E2F8A0AVK6 ZNF48-206ENST00000622647 2695 ntTSL 4 BASIC18.26■□□□□ 0.51
E2F8A0AVK6 UBE2O-201ENST00000319380 5436 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
E2F8A0AVK6 INPP4A-205ENST00000409851 3365 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
E2F8A0AVK6 BRI3BP-201ENST00000341446 6648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
E2F8A0AVK6 ISCU-205ENST00000535729 1330 ntTSL 2 BASIC18.25■□□□□ 0.51
E2F8A0AVK6 SUZ12-204ENST00000580398 3977 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
E2F8A0AVK6 MEF2A-204ENST00000557785 2854 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
E2F8A0AVK6 SWSAP1-201ENST00000312423 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
E2F8A0AVK6 STK4-201ENST00000372801 2038 ntTSL 2 BASIC18.25■□□□□ 0.51
E2F8A0AVK6 CDK16-223ENST00000622098 2968 ntTSL 2 BASIC18.25■□□□□ 0.51
E2F8A0AVK6 FGFR1-206ENST00000397091 5702 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
E2F8A0AVK6 MAFK-201ENST00000343242 3368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
E2F8A0AVK6 LAMTOR5-201ENST00000256644 868 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
E2F8A0AVK6 MSANTD3-201ENST00000374885 786 ntTSL 2 BASIC18.25■□□□□ 0.51
E2F8A0AVK6 RPS9-203ENST00000391752 772 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.25■□□□□ 0.51
E2F8A0AVK6 LAGE3P1-201ENST00000425356 484 ntBASIC18.25■□□□□ 0.51
E2F8A0AVK6 DDX43P3-201ENST00000441064 443 ntBASIC18.25■□□□□ 0.51
E2F8A0AVK6 BX005266.1-201ENST00000473402 457 ntBASIC18.25■□□□□ 0.51
E2F8A0AVK6 LAMTOR5-204ENST00000483260 694 ntTSL 2 BASIC18.25■□□□□ 0.51
E2F8A0AVK6 IGHV3-22-201ENST00000520721 359 ntBASIC18.25■□□□□ 0.51
E2F8A0AVK6 AC069287.3-201ENST00000527297 589 ntTSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
E2F8A0AVK6 KRT18P58-201ENST00000527480 1120 ntBASIC18.25■□□□□ 0.51
E2F8A0AVK6 ARHGEF28-214ENST00000545377 6351 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
E2F8A0AVK6 RPL18-208ENST00000549920 1004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
E2F8A0AVK6 RPL18-209ENST00000550645 463 ntTSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
E2F8A0AVK6 RPL18-214ENST00000552588 559 ntTSL 3 BASIC18.25■□□□□ 0.51
E2F8A0AVK6 AC133919.2-201ENST00000565965 589 ntTSL 4 BASIC18.25■□□□□ 0.51
E2F8A0AVK6 LAMTOR5-206ENST00000602318 634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
E2F8A0AVK6 CLEC11A-203ENST00000617718 1128 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
E2F8A0AVK6 LRRC23-215ENST00000622489 1061 ntTSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
E2F8A0AVK6 T-201ENST00000296946 2436 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
E2F8A0AVK6 ZMYND11-214ENST00000509513 2065 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
E2F8A0AVK6 PHF20L1-201ENST00000220847 3297 ntTSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
E2F8A0AVK6 AL049757.1-201ENST00000616842 1596 ntBASIC18.25■□□□□ 0.51
E2F8A0AVK6 PRRT2-216ENST00000637403 2033 ntTSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
E2F8A0AVK6 GATA2-202ENST00000430265 2525 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
E2F8A0AVK6 AC120049.1-201ENST00000592638 2065 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
E2F8A0AVK6 CHST11-205ENST00000549260 5696 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
E2F8A0AVK6 PRICKLE4-204ENST00000458694 1646 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
E2F8A0AVK6 EIF3J-201ENST00000261868 2569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
E2F8A0AVK6 KIRREL2-205ENST00000592409 2563 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
E2F8A0AVK6 PABPC1L-217ENST00000537323 1910 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
E2F8A0AVK6 DLC1-203ENST00000358919 4392 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
E2F8A0AVK6 PLEKHF2-201ENST00000315367 2881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
E2F8A0AVK6 CTSG-201ENST00000216336 886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
E2F8A0AVK6 TMEM42-201ENST00000302392 1026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
E2F8A0AVK6 KLHL7-201ENST00000322275 969 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
E2F8A0AVK6 ADIPOR1-202ENST00000367254 1116 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
E2F8A0AVK6 PSMA7-201ENST00000370858 925 ntTSL 2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
E2F8A0AVK6 HCG15-203ENST00000438190 1032 ntTSL 3 BASIC18.24■□□□□ 0.51
E2F8A0AVK6 TSPY3-202ENST00000440483 414 ntTSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
E2F8A0AVK6 EEF1D-238ENST00000531621 840 ntTSL 3 BASIC18.24■□□□□ 0.51
E2F8A0AVK6 CD63-204ENST00000546939 779 ntTSL 3 BASIC18.24■□□□□ 0.51
E2F8A0AVK6 AC105339.3-201ENST00000560043 636 ntBASIC18.24■□□□□ 0.51
E2F8A0AVK6 AC012640.2-201ENST00000561606 901 ntBASIC18.24■□□□□ 0.51
E2F8A0AVK6 SLC26A1-205ENST00000622731 1057 ntTSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
E2F8A0AVK6 AC117500.6-201ENST00000624871 588 ntBASIC18.24■□□□□ 0.51
E2F8A0AVK6 ZNF259P1-201ENST00000407656 1365 ntBASIC18.24■□□□□ 0.51
E2F8A0AVK6 ING5-201ENST00000313552 5196 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
E2F8A0AVK6 AP5B1-201ENST00000532090 4811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
E2F8A0AVK6 MON1B-202ENST00000439557 1759 ntTSL 2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
E2F8A0AVK6 SIRPAP1-201ENST00000448467 1770 ntBASIC18.24■□□□□ 0.51
E2F8A0AVK6 AL109910.2-201ENST00000607733 1953 ntTSL 2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
E2F8A0AVK6 HECTD2-203ENST00000371681 2175 ntTSL 2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
E2F8A0AVK6 P2RY6-202ENST00000393590 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
E2F8A0AVK6 AC005833.1-201ENST00000280684 4237 ntAPPRIS P1 BASIC18.24■□□□□ 0.51
E2F8A0AVK6 TES-201ENST00000358204 2782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
E2F8A0AVK6 FOXP3-201ENST00000376197 1326 ntTSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
E2F8A0AVK6 ABHD11-205ENST00000437775 1447 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
E2F8A0AVK6 CERS6-201ENST00000305747 7217 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
E2F8A0AVK6 BX276092.7-203ENST00000637198 1536 ntBASIC18.23■□□□□ 0.51
E2F8A0AVK6 IMP4-201ENST00000259239 1740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
E2F8A0AVK6 ACSM2B-208ENST00000565322 1834 ntTSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
E2F8A0AVK6 PHF1-201ENST00000374512 2224 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
E2F8A0AVK6 RAI2-201ENST00000331511 2317 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
E2F8A0AVK6 C16orf45-201ENST00000300006 2404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
E2F8A0AVK6 LRCH1-201ENST00000311191 4710 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
E2F8A0AVK6 IPMK-201ENST00000373935 6133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
E2F8A0AVK6 TEX264-204ENST00000415259 2290 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
E2F8A0AVK6 AC100803.2-201ENST00000562459 1963 ntBASIC18.23■□□□□ 0.51
E2F8A0AVK6 TMSB4Y-201ENST00000284856 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
E2F8A0AVK6 LINC00271-201ENST00000421378 1580 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
E2F8A0AVK6 TLX2-204ENST00000621092 1452 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
E2F8A0AVK6 ISCA2-201ENST00000298818 851 ntTSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
E2F8A0AVK6 CSF3-203ENST00000394148 622 ntTSL 3 BASIC18.23■□□□□ 0.51
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28.6 ms