Protein–RNA interactions for Protein: Q9UL33

TRAPPC2L, Trafficking protein particle complex subunit 2-like protein, humanhuman

Predictions only

Length 140 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRAPPC2LQ9UL33 NSFL1C-206ENST00000476071 2800 ntTSL 5 BASIC14.71□□□□□ -0.05
TRAPPC2LQ9UL33 GSK3B-201ENST00000264235 7711 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.06
TRAPPC2LQ9UL33 PTP4A3-201ENST00000329397 2785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.06
TRAPPC2LQ9UL33 AKR1A1-214ENST00000621846 1360 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.71□□□□□ -0.06
TRAPPC2LQ9UL33 ACSF3-202ENST00000378345 1541 ntTSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.06
TRAPPC2LQ9UL33 SYBU-224ENST00000529690 1983 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.71□□□□□ -0.06
TRAPPC2LQ9UL33 LYSMD4-203ENST00000378904 2122 ntBASIC14.71□□□□□ -0.06
TRAPPC2LQ9UL33 PML-221ENST00000569965 2148 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.06
TRAPPC2LQ9UL33 OSGIN1-202ENST00000361711 2230 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.7□□□□□ -0.06
TRAPPC2LQ9UL33 KRT79-201ENST00000330553 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
TRAPPC2LQ9UL33 DMKN-201ENST00000339686 1927 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
TRAPPC2LQ9UL33 DMKN-213ENST00000447113 1611 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
TRAPPC2LQ9UL33 ADM-208ENST00000534464 1640 ntTSL 2 BASIC14.7□□□□□ -0.06
TRAPPC2LQ9UL33 SARS2-212ENST00000600042 1630 ntTSL 2 BASIC14.7□□□□□ -0.06
TRAPPC2LQ9UL33 CYB561-205ENST00000542042 1302 ntTSL 2 BASIC14.7□□□□□ -0.06
TRAPPC2LQ9UL33 DNM2-201ENST00000355667 3541 ntTSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
TRAPPC2LQ9UL33 HRAT92-201ENST00000452622 3506 ntTSL 2 BASIC14.7□□□□□ -0.06
TRAPPC2LQ9UL33 TSC2-202ENST00000350773 5532 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
TRAPPC2LQ9UL33 GMDS-AS1-201ENST00000456943 2308 ntTSL 2 BASIC14.7□□□□□ -0.06
TRAPPC2LQ9UL33 SETD3-202ENST00000331768 2878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
TRAPPC2LQ9UL33 COQ8A-201ENST00000366777 2872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
TRAPPC2LQ9UL33 MARK2-209ENST00000509502 2862 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.7□□□□□ -0.06
TRAPPC2LQ9UL33 RUBCNL-203ENST00000378787 2731 ntTSL 2 BASIC14.7□□□□□ -0.06
TRAPPC2LQ9UL33 TNXB-204ENST00000479795 2742 ntTSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
TRAPPC2LQ9UL33 SSBP3-203ENST00000371319 1578 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC14.7□□□□□ -0.06
TRAPPC2LQ9UL33 OGFR-201ENST00000290291 2410 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
TRAPPC2LQ9UL33 GCSH-209ENST00000639689 2412 ntTSL 5 BASIC14.7□□□□□ -0.06
TRAPPC2LQ9UL33 SPSB3-201ENST00000301717 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
TRAPPC2LQ9UL33 VGLL4-210ENST00000426568 1428 ntTSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
TRAPPC2LQ9UL33 AC016396.2-201ENST00000562575 1417 ntBASIC14.7□□□□□ -0.06
TRAPPC2LQ9UL33 C20orf196-201ENST00000303142 1154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
TRAPPC2LQ9UL33 LCE3D-201ENST00000368787 613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
TRAPPC2LQ9UL33 BEX1-201ENST00000372728 864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
TRAPPC2LQ9UL33 ISG15-201ENST00000379389 711 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
TRAPPC2LQ9UL33 MIEN1-201ENST00000394231 1006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
TRAPPC2LQ9UL33 DLEU2-203ENST00000425586 1267 ntTSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
TRAPPC2LQ9UL33 AC005104.2-201ENST00000427818 678 ntBASIC14.7□□□□□ -0.06
TRAPPC2LQ9UL33 LBX1-AS1-203ENST00000454527 740 ntTSL 5 BASIC14.7□□□□□ -0.06
TRAPPC2LQ9UL33 LY6E-213ENST00000522528 606 ntTSL 3 BASIC14.7□□□□□ -0.06
TRAPPC2LQ9UL33 HNF4A-208ENST00000609795 1192 ntTSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
TRAPPC2LQ9UL33 LPAR5-202ENST00000431922 2695 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.7□□□□□ -0.06
TRAPPC2LQ9UL33 KRT28-201ENST00000306658 1685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
TRAPPC2LQ9UL33 HFE2-201ENST00000336751 2234 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.7□□□□□ -0.06
TRAPPC2LQ9UL33 VAV2-201ENST00000371850 4837 ntTSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
TRAPPC2LQ9UL33 RNF187-201ENST00000305943 3017 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
TRAPPC2LQ9UL33 LRP10-201ENST00000359591 6886 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
TRAPPC2LQ9UL33 PTGES2-201ENST00000277462 1614 ntTSL 2 BASIC14.7□□□□□ -0.06
TRAPPC2LQ9UL33 CCDC78-201ENST00000293889 1611 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
TRAPPC2LQ9UL33 PC-208ENST00000529047 1607 ntTSL 3 BASIC14.7□□□□□ -0.06
TRAPPC2LQ9UL33 NEIL2-202ENST00000403422 2016 ntTSL 2 BASIC14.7□□□□□ -0.06
TRAPPC2LQ9UL33 FENDRR-206ENST00000599749 2843 ntTSL 3 BASIC14.7□□□□□ -0.06
TRAPPC2LQ9UL33 FFAR2-202ENST00000599180 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
TRAPPC2LQ9UL33 LPAR3-201ENST00000370611 1720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
TRAPPC2LQ9UL33 UBC-206ENST00000538617 1303 ntTSL 5 BASIC14.69□□□□□ -0.06
TRAPPC2LQ9UL33 MYH14-210ENST00000601313 6896 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
TRAPPC2LQ9UL33 ZNF668-201ENST00000300849 2762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
TRAPPC2LQ9UL33 AC009053.2-201ENST00000563701 2365 ntBASIC14.69□□□□□ -0.06
TRAPPC2LQ9UL33 MXD4-201ENST00000337190 4056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
TRAPPC2LQ9UL33 FRMPD4-201ENST00000380682 8465 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
TRAPPC2LQ9UL33 LYRM9-203ENST00000460380 2196 ntTSL 2 BASIC14.69□□□□□ -0.06
TRAPPC2LQ9UL33 CD320-201ENST00000301458 1250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
TRAPPC2LQ9UL33 HRAS-201ENST00000311189 894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
TRAPPC2LQ9UL33 INPP5F-203ENST00000369081 874 ntTSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
TRAPPC2LQ9UL33 FNDC5-205ENST00000496770 837 ntTSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
TRAPPC2LQ9UL33 MOK-234ENST00000524370 1165 ntTSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
TRAPPC2LQ9UL33 CLN6-204ENST00000564752 900 ntTSL 3 BASIC14.69□□□□□ -0.06
TRAPPC2LQ9UL33 AC009084.1-201ENST00000566869 317 ntTSL 5 BASIC14.69□□□□□ -0.06
TRAPPC2LQ9UL33 RNF126P1-202ENST00000569893 925 ntBASIC14.69□□□□□ -0.06
TRAPPC2LQ9UL33 LINC00092-202ENST00000580908 580 ntTSL 2 BASIC14.69□□□□□ -0.06
TRAPPC2LQ9UL33 TMED1-207ENST00000591695 809 ntTSL 5 BASIC14.69□□□□□ -0.06
TRAPPC2LQ9UL33 ELAVL1-202ENST00000593807 856 ntTSL 3 BASIC14.69□□□□□ -0.06
TRAPPC2LQ9UL33 HYMAI.1-201ENST00000620949 238 ntBASIC14.69□□□□□ -0.06
TRAPPC2LQ9UL33 LRRC23-215ENST00000622489 1061 ntTSL 5 BASIC14.69□□□□□ -0.06
TRAPPC2LQ9UL33 CLN6-214ENST00000636314 442 ntTSL 3 BASIC14.69□□□□□ -0.06
TRAPPC2LQ9UL33 EVPL-201ENST00000301607 6614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
TRAPPC2LQ9UL33 BCL2L11-201ENST00000308659 1522 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.69□□□□□ -0.06
TRAPPC2LQ9UL33 EMX1-202ENST00000394111 1528 ntTSL 3 BASIC14.69□□□□□ -0.06
TRAPPC2LQ9UL33 CHEK2-202ENST00000348295 1771 ntTSL 5 BASIC14.69□□□□□ -0.06
TRAPPC2LQ9UL33 NT5DC3-201ENST00000392876 7207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
TRAPPC2LQ9UL33 CCDC74B-202ENST00000392984 1353 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.69□□□□□ -0.06
TRAPPC2LQ9UL33 LAT-203ENST00000395456 1616 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
TRAPPC2LQ9UL33 THNSL2-205ENST00000449349 1616 ntTSL 5 BASIC14.69□□□□□ -0.06
TRAPPC2LQ9UL33 SRPX-202ENST00000432886 1725 ntTSL 2 BASIC14.69□□□□□ -0.06
TRAPPC2LQ9UL33 ZGLP1-202ENST00000403903 2303 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
TRAPPC2LQ9UL33 LGMN-201ENST00000334869 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
TRAPPC2LQ9UL33 DHCR7-201ENST00000355527 2666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
TRAPPC2LQ9UL33 TLK2-201ENST00000326270 3512 ntTSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
TRAPPC2LQ9UL33 ADAMTS18-201ENST00000282849 5913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
TRAPPC2LQ9UL33 RBCK1-202ENST00000356286 2774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
TRAPPC2LQ9UL33 EPB41L3-204ENST00000540638 3370 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
TRAPPC2LQ9UL33 CAB39-203ENST00000410084 1324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
TRAPPC2LQ9UL33 QSOX1-201ENST00000367600 2519 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
TRAPPC2LQ9UL33 UQCC3-202ENST00000531323 2288 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.68□□□□□ -0.06
TRAPPC2LQ9UL33 SLC35G6-201ENST00000412468 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
TRAPPC2LQ9UL33 H2AFV-201ENST00000222690 3804 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC14.68□□□□□ -0.06
TRAPPC2LQ9UL33 ADARB1-204ENST00000389863 3563 ntTSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
TRAPPC2LQ9UL33 C14orf93-204ENST00000397377 1776 ntTSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
TRAPPC2LQ9UL33 PURB-201ENST00000395699 9069 ntAPPRIS P1 BASIC14.68□□□□□ -0.06
TRAPPC2LQ9UL33 TVP23C-204ENST00000438826 1852 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
TRAPPC2LQ9UL33 SMOX-205ENST00000379460 2230 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.68□□□□□ -0.06
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 59.4 ms