Protein–RNA interactions for Protein: Q9UGN4

CD300A, CMRF35-like molecule 8, humanhuman

Predictions only

Length 299 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CD300AQ9UGN4 LY6K-205ENST00000522591 2724 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.46■□□□□ 0.22
CD300AQ9UGN4 BTC-201ENST00000395743 2816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.22
CD300AQ9UGN4 CROCC2-201ENST00000443866 5382 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.22
CD300AQ9UGN4 PROK1-201ENST00000271331 1338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
CD300AQ9UGN4 GNA13-201ENST00000439174 4922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
CD300AQ9UGN4 TRIM39-205ENST00000396551 3249 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
CD300AQ9UGN4 WDR45-205ENST00000376358 1432 ntTSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
CD300AQ9UGN4 SGK3-206ENST00000520976 2483 ntTSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
CD300AQ9UGN4 ELN-221ENST00000445912 2583 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
CD300AQ9UGN4 SMO-201ENST00000249373 3738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
CD300AQ9UGN4 IFIH1-202ENST00000421365 1617 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
CD300AQ9UGN4 DMKN-213ENST00000447113 1611 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
CD300AQ9UGN4 PLA2R1-202ENST00000392771 5160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
CD300AQ9UGN4 TAF4B-201ENST00000269142 5260 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
CD300AQ9UGN4 SHMT2-232ENST00000557487 1918 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
CD300AQ9UGN4 TMTC4-203ENST00000376234 3483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
CD300AQ9UGN4 SREK1-216ENST00000612404 2128 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
CD300AQ9UGN4 FAM109A-203ENST00000547838 2846 ntAPPRIS P3 TSL 4 BASIC16.45■□□□□ 0.22
CD300AQ9UGN4 FGFR4-201ENST00000292408 3122 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
CD300AQ9UGN4 Telomerase-vert.1-201ENST00000363312 438 ntBASIC16.45■□□□□ 0.22
CD300AQ9UGN4 KRTAP5-3-201ENST00000399685 899 ntAPPRIS P1 BASIC16.45■□□□□ 0.22
CD300AQ9UGN4 AL731557.1-201ENST00000425264 744 ntTSL 3 BASIC16.45■□□□□ 0.22
CD300AQ9UGN4 EGLN1P1-201ENST00000531623 762 ntBASIC16.45■□□□□ 0.22
CD300AQ9UGN4 CDC42EP2-202ENST00000533419 1279 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.45■□□□□ 0.22
CD300AQ9UGN4 NODAL-201ENST00000287139 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
CD300AQ9UGN4 PPHLN1-213ENST00000549190 1777 ntTSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
CD300AQ9UGN4 PRODH-202ENST00000334029 1985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
CD300AQ9UGN4 SARAF-201ENST00000256255 2154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
CD300AQ9UGN4 UBQLN1-201ENST00000257468 2299 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
CD300AQ9UGN4 NRG1-216ENST00000523079 2359 ntTSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
CD300AQ9UGN4 AC006019.1-201ENST00000425591 2470 ntTSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
CD300AQ9UGN4 CARS-203ENST00000397111 2685 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
CD300AQ9UGN4 CACFD1-202ENST00000316948 2794 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
CD300AQ9UGN4 NPRL3-211ENST00000611875 2881 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
CD300AQ9UGN4 TBC1D10B-201ENST00000409939 3350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
CD300AQ9UGN4 VPS54-201ENST00000272322 3463 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
CD300AQ9UGN4 MAPK14-201ENST00000229794 3779 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
CD300AQ9UGN4 TXNDC11-201ENST00000283033 3140 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
CD300AQ9UGN4 FAM83G-201ENST00000345041 2929 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
CD300AQ9UGN4 CARD14-202ENST00000570421 2607 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
CD300AQ9UGN4 PRRC2A-201ENST00000376007 6861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
CD300AQ9UGN4 TMEM138-201ENST00000278826 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
CD300AQ9UGN4 TMEM39B-201ENST00000336294 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
CD300AQ9UGN4 CLDN4-201ENST00000340958 1831 ntAPPRIS P1 BASIC16.45■□□□□ 0.22
CD300AQ9UGN4 PIGT-221ENST00000638594 1835 ntTSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
CD300AQ9UGN4 KCTD11-201ENST00000333751 2783 ntAPPRIS P1 BASIC16.44■□□□□ 0.22
CD300AQ9UGN4 ZC3H12A-201ENST00000373087 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
CD300AQ9UGN4 NDUFS2-202ENST00000392179 2064 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
CD300AQ9UGN4 FAM83C-201ENST00000374408 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
CD300AQ9UGN4 KRT35-202ENST00000393989 1670 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
CD300AQ9UGN4 PEX16-201ENST00000241041 1479 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
CD300AQ9UGN4 OTUD5-204ENST00000428668 1493 ntTSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
CD300AQ9UGN4 HOXD3-201ENST00000249440 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
CD300AQ9UGN4 CD151-213ENST00000528011 1369 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
CD300AQ9UGN4 SLC5A6-203ENST00000408041 2230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
CD300AQ9UGN4 CCK-201ENST00000334681 830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
CD300AQ9UGN4 CKS1B-203ENST00000368439 912 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
CD300AQ9UGN4 TSPY12P-201ENST00000421279 868 ntBASIC16.44■□□□□ 0.22
CD300AQ9UGN4 BX322234.1-201ENST00000444188 980 ntTSL 3 BASIC16.44■□□□□ 0.22
CD300AQ9UGN4 LINC01024-205ENST00000521563 939 ntTSL 3 BASIC16.44■□□□□ 0.22
CD300AQ9UGN4 RAB2A-211ENST00000531289 1058 ntTSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
CD300AQ9UGN4 FP565260.3-205ENST00000620481 816 ntTSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
CD300AQ9UGN4 AL590094.1-202ENST00000634619 1131 ntTSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
CD300AQ9UGN4 RPS27A-211ENST00000639844 606 ntTSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
CD300AQ9UGN4 CCDC90B-203ENST00000525503 1919 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
CD300AQ9UGN4 SEMA3C-201ENST00000265361 5174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
CD300AQ9UGN4 SAMM50-201ENST00000350028 1717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
CD300AQ9UGN4 PLAUR-201ENST00000221264 1610 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
CD300AQ9UGN4 WTAP-205ENST00000614346 1623 ntTSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
CD300AQ9UGN4 KCNA5-201ENST00000252321 2800 ntAPPRIS P1 BASIC16.44■□□□□ 0.22
CD300AQ9UGN4 LITAF-202ENST00000381810 1527 ntTSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
CD300AQ9UGN4 EPHX2-201ENST00000380476 2064 ntTSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
CD300AQ9UGN4 THOC3-212ENST00000628318 1442 ntTSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
CD300AQ9UGN4 DKK3-203ENST00000525493 1326 ntTSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
CD300AQ9UGN4 LEXM-201ENST00000358193 1777 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
CD300AQ9UGN4 SURF4-209ENST00000618229 3200 ntTSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
CD300AQ9UGN4 ELAC2-203ENST00000426905 2671 ntTSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
CD300AQ9UGN4 PRPF31-201ENST00000321030 2126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
CD300AQ9UGN4 HOXA10-202ENST00000396344 1570 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
CD300AQ9UGN4 STX3-203ENST00000529177 1571 ntTSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
CD300AQ9UGN4 CHD1L-203ENST00000369259 2358 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
CD300AQ9UGN4 ASXL1-202ENST00000375687 7031 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
CD300AQ9UGN4 YAP1-208ENST00000531439 1490 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
CD300AQ9UGN4 DNAH17-AS1-202ENST00000591373 1453 ntTSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
CD300AQ9UGN4 AKT1-214ENST00000555528 3066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
CD300AQ9UGN4 NOTCH3-201ENST00000263388 8666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
CD300AQ9UGN4 GMIP-204ENST00000587238 2987 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
CD300AQ9UGN4 PWP1-202ENST00000541166 1722 ntTSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
CD300AQ9UGN4 SCT-201ENST00000176195 366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
CD300AQ9UGN4 S100A16-203ENST00000368705 956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
CD300AQ9UGN4 TMSB4X-201ENST00000380633 495 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.43■□□□□ 0.22
CD300AQ9UGN4 UBE2SP1-201ENST00000450587 669 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
CD300AQ9UGN4 BCL7B-206ENST00000455335 985 ntTSL 3 BASIC16.43■□□□□ 0.22
CD300AQ9UGN4 GLYCTK-205ENST00000473032 935 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
CD300AQ9UGN4 MYD88-211ENST00000495303 976 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
CD300AQ9UGN4 DLEU7-203ENST00000504404 1122 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
CD300AQ9UGN4 RTBDN-213ENST00000592204 1024 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
CD300AQ9UGN4 ARFRP1-212ENST00000618838 1623 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
CD300AQ9UGN4 TGIF1-201ENST00000330513 1980 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
CD300AQ9UGN4 HR-201ENST00000312841 5351 ntTSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 26.3 ms