Protein–RNA interactions for Protein: Q9P1Z3

HCN3, Potassium/sodium hyperpolarization-activated cyclic nucleotide-gated channel 3, humanhuman

Predictions only

Length 774 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HCN3Q9P1Z3 AC134043.2-201ENST00000624206 2238 ntBASIC16.62■□□□□ 0.25
HCN3Q9P1Z3 C19orf54-203ENST00000470681 2521 ntTSL 2 BASIC16.62■□□□□ 0.25
HCN3Q9P1Z3 TCTN1-229ENST00000614115 1965 ntTSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
HCN3Q9P1Z3 KIZ-211ENST00000619574 1971 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.62■□□□□ 0.25
HCN3Q9P1Z3 WDR1-205ENST00000502702 1691 ntTSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
HCN3Q9P1Z3 TNFAIP1-202ENST00000544907 1656 ntTSL 2 BASIC16.62■□□□□ 0.25
HCN3Q9P1Z3 CALB2-202ENST00000349553 1373 ntTSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
HCN3Q9P1Z3 C16orf70-208ENST00000569600 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
HCN3Q9P1Z3 HARS-201ENST00000307633 1780 ntTSL 2 BASIC16.61■□□□□ 0.25
HCN3Q9P1Z3 DDX31-201ENST00000310532 2408 ntTSL 2 BASIC16.61■□□□□ 0.25
HCN3Q9P1Z3 PRDM8-203ENST00000504452 3706 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
HCN3Q9P1Z3 ST8SIA5-202ENST00000536490 1499 ntTSL 2 BASIC16.61■□□□□ 0.25
HCN3Q9P1Z3 AL355312.1-201ENST00000407115 2176 ntBASIC16.61■□□□□ 0.25
HCN3Q9P1Z3 GPD2-201ENST00000310454 6041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
HCN3Q9P1Z3 IL18BP-214ENST00000620017 1566 ntTSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
HCN3Q9P1Z3 LRRC32-202ENST00000404995 2656 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
HCN3Q9P1Z3 SEC22C-202ENST00000273156 1608 ntTSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
HCN3Q9P1Z3 SLBP-202ENST00000429429 1623 ntTSL 2 BASIC16.61■□□□□ 0.25
HCN3Q9P1Z3 RNASEH2A-201ENST00000221486 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
HCN3Q9P1Z3 ZNF7-201ENST00000325217 592 ntTSL 4 BASIC16.61■□□□□ 0.25
HCN3Q9P1Z3 RWDD3-202ENST00000370202 1235 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.61■□□□□ 0.25
HCN3Q9P1Z3 RBCK1-206ENST00000400247 790 ntTSL 2 BASIC16.61■□□□□ 0.25
HCN3Q9P1Z3 IGHV3-52-201ENST00000519770 353 ntBASIC16.61■□□□□ 0.25
HCN3Q9P1Z3 AC008105.3-202ENST00000585471 1077 ntTSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
HCN3Q9P1Z3 AC036176.1-201ENST00000589905 785 ntTSL 2 BASIC16.61■□□□□ 0.25
HCN3Q9P1Z3 FUT6-212ENST00000592563 1095 ntTSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
HCN3Q9P1Z3 MED16-213ENST00000616387 1078 ntTSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
HCN3Q9P1Z3 COL4A3BP-203ENST00000380494 5651 ntTSL 2 BASIC16.61■□□□□ 0.25
HCN3Q9P1Z3 FHL1-205ENST00000370690 2441 ntTSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
HCN3Q9P1Z3 C3orf58-201ENST00000315691 4346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
HCN3Q9P1Z3 IQSEC2-202ENST00000396435 6015 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
HCN3Q9P1Z3 PAN3-AS1-201ENST00000563843 1351 ntBASIC16.61■□□□□ 0.25
HCN3Q9P1Z3 CSAD-209ENST00000453446 1774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
HCN3Q9P1Z3 ZNF394-201ENST00000337673 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
HCN3Q9P1Z3 ZNF416-201ENST00000196489 2561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
HCN3Q9P1Z3 GATB-213ENST00000515812 1893 ntTSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
HCN3Q9P1Z3 CHTOP-205ENST00000403433 1923 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
HCN3Q9P1Z3 NPAS3-202ENST00000356141 2802 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
HCN3Q9P1Z3 FUT8-AS1-201ENST00000621019 1521 ntBASIC16.6■□□□□ 0.25
HCN3Q9P1Z3 FRMD4A-203ENST00000357447 6821 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
HCN3Q9P1Z3 LINC00271-201ENST00000421378 1580 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
HCN3Q9P1Z3 PMPCAP1-201ENST00000508114 1576 ntBASIC16.6■□□□□ 0.25
HCN3Q9P1Z3 PTGES2-201ENST00000277462 1614 ntTSL 2 BASIC16.6■□□□□ 0.25
HCN3Q9P1Z3 SLAIN2-201ENST00000264313 6299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
HCN3Q9P1Z3 FAM208B-201ENST00000328090 8626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
HCN3Q9P1Z3 SIN3A-203ENST00000394949 4930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
HCN3Q9P1Z3 ARHGAP11A-201ENST00000361627 5898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
HCN3Q9P1Z3 DUS3L-201ENST00000309061 2113 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
HCN3Q9P1Z3 PLD3-206ENST00000409587 2180 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
HCN3Q9P1Z3 ZSCAN18-201ENST00000240727 2779 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
HCN3Q9P1Z3 PHPT1-202ENST00000371661 985 ntTSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
HCN3Q9P1Z3 SLC9A3R1-202ENST00000413388 1285 ntTSL 2 BASIC16.6■□□□□ 0.25
HCN3Q9P1Z3 AC026396.1-201ENST00000419388 421 ntBASIC16.6■□□□□ 0.25
HCN3Q9P1Z3 AC009078.2-202ENST00000463353 338 ntBASIC16.6■□□□□ 0.25
HCN3Q9P1Z3 CARHSP1-205ENST00000562843 843 ntTSL 2 BASIC16.6■□□□□ 0.25
HCN3Q9P1Z3 AC026336.2-201ENST00000563922 763 ntTSL 2 BASIC16.6■□□□□ 0.25
HCN3Q9P1Z3 AC104692.2-201ENST00000603054 253 ntBASIC16.6■□□□□ 0.25
HCN3Q9P1Z3 OLA1-201ENST00000284719 4417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
HCN3Q9P1Z3 CCNI2-201ENST00000378731 2355 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
HCN3Q9P1Z3 PPAN-P2RY11-201ENST00000393796 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
HCN3Q9P1Z3 APOA5-203ENST00000542499 1929 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
HCN3Q9P1Z3 CXorf40B-205ENST00000462691 1440 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC16.6■□□□□ 0.25
HCN3Q9P1Z3 NKIRAS2-207ENST00000449471 1461 ntTSL 2 BASIC16.6■□□□□ 0.25
HCN3Q9P1Z3 AL353593.2-201ENST00000602529 1483 ntBASIC16.6■□□□□ 0.25
HCN3Q9P1Z3 IGSF9-206ENST00000611023 2663 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
HCN3Q9P1Z3 MYO1B-204ENST00000392318 5082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
HCN3Q9P1Z3 PSMA1-209ENST00000530457 1527 ntTSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
HCN3Q9P1Z3 ROBO3-221ENST00000543966 1520 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
HCN3Q9P1Z3 TRIM8-201ENST00000302424 2831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
HCN3Q9P1Z3 MAGI1-213ENST00000483466 4791 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
HCN3Q9P1Z3 TRAF4-201ENST00000262395 2923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
HCN3Q9P1Z3 HS3ST2-201ENST00000261374 2314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
HCN3Q9P1Z3 SWSAP1-201ENST00000312423 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
HCN3Q9P1Z3 BRPF1-203ENST00000424362 4712 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
HCN3Q9P1Z3 AC132938.5-201ENST00000624980 1813 ntBASIC16.59■□□□□ 0.25
HCN3Q9P1Z3 GNE-201ENST00000377902 2565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
HCN3Q9P1Z3 ARFGAP2-229ENST00000627920 2613 ntTSL 2 BASIC16.59■□□□□ 0.25
HCN3Q9P1Z3 TGDS-201ENST00000261296 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
HCN3Q9P1Z3 AL356309.3-201ENST00000624132 1934 ntBASIC16.59■□□□□ 0.25
HCN3Q9P1Z3 HCK-210ENST00000629881 1969 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.59■□□□□ 0.25
HCN3Q9P1Z3 RTL8B-201ENST00000391440 2026 ntAPPRIS P1 BASIC16.59■□□□□ 0.25
HCN3Q9P1Z3 C18orf8-208ENST00000590868 2002 ntTSL 2 BASIC16.59■□□□□ 0.25
HCN3Q9P1Z3 SETD3-202ENST00000331768 2878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
HCN3Q9P1Z3 VAMP5-201ENST00000306384 689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
HCN3Q9P1Z3 UPK3A-202ENST00000396082 627 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
HCN3Q9P1Z3 HIST2H3DP1-201ENST00000401004 416 ntBASIC16.59■□□□□ 0.25
HCN3Q9P1Z3 KLF4P1-201ENST00000412782 1185 ntBASIC16.59■□□□□ 0.25
HCN3Q9P1Z3 LAT-205ENST00000454369 1262 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
HCN3Q9P1Z3 BX005266.1-201ENST00000473402 457 ntBASIC16.59■□□□□ 0.25
HCN3Q9P1Z3 AC002558.1-201ENST00000488906 803 ntBASIC16.59■□□□□ 0.25
HCN3Q9P1Z3 TTLL12-204ENST00000494035 888 ntTSL 2 BASIC16.59■□□□□ 0.25
HCN3Q9P1Z3 ANKRD13D-218ENST00000515828 1111 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
HCN3Q9P1Z3 AP002469.2-201ENST00000531724 424 ntBASIC16.59■□□□□ 0.25
HCN3Q9P1Z3 MTUS2-205ENST00000542829 1165 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
HCN3Q9P1Z3 SART3-203ENST00000546611 1184 ntBASIC16.59■□□□□ 0.25
HCN3Q9P1Z3 BLOC1S1-204ENST00000549147 1229 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
HCN3Q9P1Z3 AL160237.2-201ENST00000556165 472 ntBASIC16.59■□□□□ 0.25
HCN3Q9P1Z3 ZNF554-204ENST00000591265 1148 ntTSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
HCN3Q9P1Z3 CALM3-211ENST00000598871 561 ntTSL 4 BASIC16.59■□□□□ 0.25
HCN3Q9P1Z3 SREK1-216ENST00000612404 2128 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 46.3 ms