Protein–RNA interactions for Protein: Q9NSN8

SNTG1, Gamma-1-syntrophin, humanhuman

Predictions only

Length 517 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SNTG1Q9NSN8 TK2-207ENST00000544898 3441 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
SNTG1Q9NSN8 FAM83C-201ENST00000374408 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
SNTG1Q9NSN8 C21orf59-201ENST00000290155 1692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
SNTG1Q9NSN8 VRK3-225ENST00000601912 1668 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
SNTG1Q9NSN8 ABCF3-203ENST00000429586 2624 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
SNTG1Q9NSN8 VWA1-203ENST00000476993 4511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
SNTG1Q9NSN8 FAM53A-201ENST00000308132 2802 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
SNTG1Q9NSN8 TMEM57-202ENST00000399766 3294 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
SNTG1Q9NSN8 TBC1D9B-201ENST00000355235 5119 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
SNTG1Q9NSN8 GMDS-AS1-201ENST00000456943 2308 ntTSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
SNTG1Q9NSN8 GCLM-201ENST00000370238 4857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
SNTG1Q9NSN8 GLOD4-202ENST00000301329 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
SNTG1Q9NSN8 NPHP3-201ENST00000337331 4362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
SNTG1Q9NSN8 JPH4-202ENST00000397118 4386 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
SNTG1Q9NSN8 PLPPR5-202ENST00000370188 4139 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
SNTG1Q9NSN8 KCNK4-205ENST00000538767 1389 ntTSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
SNTG1Q9NSN8 RB1CC1-201ENST00000025008 6635 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
SNTG1Q9NSN8 ZFP28-201ENST00000301318 4096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
SNTG1Q9NSN8 RAB31-207ENST00000578921 4055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
SNTG1Q9NSN8 HCRTR1-203ENST00000403528 2003 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
SNTG1Q9NSN8 JAM2-202ENST00000400532 1757 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
SNTG1Q9NSN8 GPR158-AS1-201ENST00000449643 2433 ntTSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
SNTG1Q9NSN8 CYP4F22-202ENST00000601005 2445 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
SNTG1Q9NSN8 NFATC4-210ENST00000554050 3057 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
SNTG1Q9NSN8 FOLH1-201ENST00000256999 2635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
SNTG1Q9NSN8 AC002310.5-201ENST00000569360 1515 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
SNTG1Q9NSN8 KCNA5-201ENST00000252321 2800 ntAPPRIS P1 BASIC15.75■□□□□ 0.11
SNTG1Q9NSN8 PAPLN-202ENST00000340738 5834 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
SNTG1Q9NSN8 ECSIT-202ENST00000270517 1700 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
SNTG1Q9NSN8 OTUD7A-201ENST00000307050 10770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
SNTG1Q9NSN8 TYSND1-201ENST00000287078 3644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
SNTG1Q9NSN8 RABL2A-202ENST00000393165 1118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
SNTG1Q9NSN8 LGMN-202ENST00000393218 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
SNTG1Q9NSN8 ACP1-205ENST00000407983 703 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
SNTG1Q9NSN8 DUTP2-201ENST00000519164 463 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
SNTG1Q9NSN8 MVB12A-204ENST00000528515 686 ntTSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
SNTG1Q9NSN8 IGHMBP2-205ENST00000539224 785 ntTSL 3 BASIC15.75■□□□□ 0.11
SNTG1Q9NSN8 NUBP2-206ENST00000565134 815 ntTSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
SNTG1Q9NSN8 YPEL3-207ENST00000566134 761 ntTSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
SNTG1Q9NSN8 ITGA3-202ENST00000320031 4888 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
SNTG1Q9NSN8 SLC4A3-201ENST00000273063 4246 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
SNTG1Q9NSN8 MRGPRF-AS1-201ENST00000538407 1490 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
SNTG1Q9NSN8 GRB7-202ENST00000394204 1667 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
SNTG1Q9NSN8 AC116565.2-201ENST00000637674 1854 ntTSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
SNTG1Q9NSN8 FEM1C-201ENST00000274457 5816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
SNTG1Q9NSN8 NUP50-203ENST00000407019 2059 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
SNTG1Q9NSN8 OR2C3-203ENST00000617752 2481 ntAPPRIS P1 BASIC15.75■□□□□ 0.11
SNTG1Q9NSN8 RUNX2-204ENST00000371438 5698 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
SNTG1Q9NSN8 NRXN1-204ENST00000401669 5870 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
SNTG1Q9NSN8 AC005915.1-201ENST00000624912 2018 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
SNTG1Q9NSN8 RAI2-206ENST00000545871 2421 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC15.75■□□□□ 0.11
SNTG1Q9NSN8 KCNQ2-202ENST00000344462 2750 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
SNTG1Q9NSN8 CPEB2-204ENST00000382401 5509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
SNTG1Q9NSN8 ATP5L-201ENST00000300688 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
SNTG1Q9NSN8 SYBU-209ENST00000446070 2919 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
SNTG1Q9NSN8 WLS-205ENST00000370976 2332 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
SNTG1Q9NSN8 HAUS8-202ENST00000448593 1545 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
SNTG1Q9NSN8 CSF1-204ENST00000369802 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
SNTG1Q9NSN8 APLN-201ENST00000429967 3205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
SNTG1Q9NSN8 PTPN5-202ENST00000396166 2299 ntTSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
SNTG1Q9NSN8 GCK-209ENST00000616242 2260 ntTSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
SNTG1Q9NSN8 WDR37-206ENST00000620998 1303 ntTSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
SNTG1Q9NSN8 SYBU-231ENST00000533065 2645 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
SNTG1Q9NSN8 PITPNC1-203ENST00000580974 6182 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
SNTG1Q9NSN8 TRPC6-202ENST00000348423 2448 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
SNTG1Q9NSN8 RGPD8-201ENST00000302558 5576 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
SNTG1Q9NSN8 TMIGD2-201ENST00000301272 1262 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
SNTG1Q9NSN8 KRT17P2-202ENST00000326333 1174 ntTSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
SNTG1Q9NSN8 AIF1L-203ENST00000372298 849 ntTSL 3 BASIC15.74■□□□□ 0.11
SNTG1Q9NSN8 TMEM240-201ENST00000378733 718 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
SNTG1Q9NSN8 PLEKHB2-203ENST00000404460 1167 ntTSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
SNTG1Q9NSN8 MDK-205ENST00000405308 1166 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
SNTG1Q9NSN8 SHBG-203ENST00000416273 1042 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.74■□□□□ 0.11
SNTG1Q9NSN8 AC087499.1-201ENST00000418141 1075 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
SNTG1Q9NSN8 TSPY17P-201ENST00000450329 467 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
SNTG1Q9NSN8 RPL29-202ENST00000466397 742 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
SNTG1Q9NSN8 RARRES1-204ENST00000479756 839 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
SNTG1Q9NSN8 LINC01184-202ENST00000501173 949 ntTSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
SNTG1Q9NSN8 PSMD9-208ENST00000542602 516 ntTSL 3 BASIC15.74■□□□□ 0.11
SNTG1Q9NSN8 SIGLEC15-202ENST00000546268 1054 ntTSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
SNTG1Q9NSN8 AC009065.1-201ENST00000564055 1225 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
SNTG1Q9NSN8 AL353719.1-201ENST00000566847 864 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
SNTG1Q9NSN8 SHBG-215ENST00000575903 1196 ntTSL 3 BASIC15.74■□□□□ 0.11
SNTG1Q9NSN8 PRR29-205ENST00000579184 1052 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
SNTG1Q9NSN8 MIR4674-201ENST00000582457 87 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
SNTG1Q9NSN8 TPSB2-201ENST00000606293 1165 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
SNTG1Q9NSN8 SYDE1-204ENST00000600440 3058 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
SNTG1Q9NSN8 FRS2-206ENST00000549921 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
SNTG1Q9NSN8 CCDC8-201ENST00000307522 3213 ntAPPRIS P1 BASIC15.74■□□□□ 0.11
SNTG1Q9NSN8 DNM2-203ENST00000389253 3581 ntTSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
SNTG1Q9NSN8 TSC2-202ENST00000350773 5532 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
SNTG1Q9NSN8 HOXB1-202ENST00000577092 1414 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
SNTG1Q9NSN8 GAMT-202ENST00000447102 1769 ntTSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
SNTG1Q9NSN8 MAP3K3-202ENST00000361733 3529 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
SNTG1Q9NSN8 ZNF451-203ENST00000370706 5268 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
SNTG1Q9NSN8 PELP1-208ENST00000572293 5272 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
SNTG1Q9NSN8 YTHDF1-202ENST00000370339 3301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
SNTG1Q9NSN8 MDFIC-202ENST00000393486 4393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
SNTG1Q9NSN8 DCLK2-204ENST00000506325 2298 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
SNTG1Q9NSN8 CACFD1-202ENST00000316948 2794 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 100.3 ms