Protein–RNA interactions for Protein: Q9NQ76

MEPE, Matrix extracellular phosphoglycoprotein, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 525 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MEPEQ9NQ76 SATB1-201ENST00000338745 7810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
MEPEQ9NQ76 GGT7-201ENST00000336431 2642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
MEPEQ9NQ76 CDC25A-202ENST00000351231 3663 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
MEPEQ9NQ76 PHKA1-205ENST00000541944 5944 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
MEPEQ9NQ76 TMEM50B-210ENST00000542230 2375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
MEPEQ9NQ76 C2orf27B-201ENST00000623129 1325 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
MEPEQ9NQ76 NTRK2-206ENST00000376213 5560 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
MEPEQ9NQ76 AUNIP-201ENST00000374298 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
MEPEQ9NQ76 DAGLB-202ENST00000425398 2044 ntTSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
MEPEQ9NQ76 FGFR4-203ENST00000393648 2733 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
MEPEQ9NQ76 MBOAT1-201ENST00000324607 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
MEPEQ9NQ76 UCHL5-206ENST00000367455 5327 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
MEPEQ9NQ76 QPCTL-201ENST00000012049 2310 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
MEPEQ9NQ76 PTPRN2-204ENST00000404321 1374 ntTSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
MEPEQ9NQ76 RHBDF1P1-201ENST00000427504 1941 ntBASIC15.9■□□□□ 0.14
MEPEQ9NQ76 ANAPC11-211ENST00000575195 1361 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
MEPEQ9NQ76 ZFAND2A-201ENST00000316495 860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
MEPEQ9NQ76 GUCA2A-201ENST00000357001 569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
MEPEQ9NQ76 CD1E-210ENST00000368165 1003 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
MEPEQ9NQ76 ROMO1-204ENST00000374078 498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
MEPEQ9NQ76 RNF121-203ENST00000393713 2132 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
MEPEQ9NQ76 ZFAND2A-203ENST00000401903 968 ntTSL 3 BASIC15.9■□□□□ 0.14
MEPEQ9NQ76 GGT1-208ENST00000404920 657 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
MEPEQ9NQ76 MHENCR-202ENST00000449500 801 ntTSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
MEPEQ9NQ76 CD1E-214ENST00000452291 745 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
MEPEQ9NQ76 GGTLC2-203ENST00000480559 657 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
MEPEQ9NQ76 BOC-211ENST00000484034 1286 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
MEPEQ9NQ76 AC020558.2-201ENST00000582325 795 ntTSL 3 BASIC15.9■□□□□ 0.14
MEPEQ9NQ76 AL138831.2-201ENST00000606564 490 ntBASIC15.9■□□□□ 0.14
MEPEQ9NQ76 LRRC23-215ENST00000622489 1061 ntTSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
MEPEQ9NQ76 DCLK2-204ENST00000506325 2298 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
MEPEQ9NQ76 NADK2-206ENST00000506945 1437 ntTSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
MEPEQ9NQ76 PAK4-202ENST00000358301 2739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
MEPEQ9NQ76 ASIC3-201ENST00000297512 1718 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
MEPEQ9NQ76 NOTCH2NL-201ENST00000362074 1874 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
MEPEQ9NQ76 SLC22A3-201ENST00000275300 3348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
MEPEQ9NQ76 AC060834.1-201ENST00000443027 2032 ntBASIC15.9■□□□□ 0.14
MEPEQ9NQ76 LUC7L2-202ENST00000354926 2645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
MEPEQ9NQ76 STARD4-203ENST00000502322 1467 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
MEPEQ9NQ76 SLC1A4-201ENST00000234256 4561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
MEPEQ9NQ76 MFGE8-201ENST00000268150 1937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
MEPEQ9NQ76 BLCAP-201ENST00000373537 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
MEPEQ9NQ76 OSBP2-211ENST00000446658 2836 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
MEPEQ9NQ76 SEPHS1-201ENST00000327347 3273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
MEPEQ9NQ76 PSMD12-202ENST00000357146 2437 ntTSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
MEPEQ9NQ76 WDR88-202ENST00000361680 1835 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
MEPEQ9NQ76 LRRC61-201ENST00000323078 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
MEPEQ9NQ76 HMBS-203ENST00000442944 1548 ntTSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
MEPEQ9NQ76 AC084018.2-201ENST00000613093 2607 ntBASIC15.89■□□□□ 0.13
MEPEQ9NQ76 GHDC-202ENST00000414034 2496 ntTSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
MEPEQ9NQ76 SFTPB-202ENST00000409383 1867 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
MEPEQ9NQ76 ASB10-202ENST00000377867 1738 ntTSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
MEPEQ9NQ76 ARID1A-205ENST00000457599 6268 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
MEPEQ9NQ76 ARL6IP6-201ENST00000326446 2805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
MEPEQ9NQ76 YIPF2-204ENST00000586748 1550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
MEPEQ9NQ76 ITSN2-201ENST00000355123 6300 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
MEPEQ9NQ76 ELANE-201ENST00000263621 920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
MEPEQ9NQ76 NUDT8-201ENST00000301490 809 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
MEPEQ9NQ76 SLC25A1P3-201ENST00000395415 828 ntBASIC15.89■□□□□ 0.13
MEPEQ9NQ76 LINC01770-202ENST00000430109 510 ntTSL 3 BASIC15.89■□□□□ 0.13
MEPEQ9NQ76 AC004540.1-201ENST00000439120 891 ntTSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
MEPEQ9NQ76 RDH5-202ENST00000547072 1054 ntTSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
MEPEQ9NQ76 GSKIP-207ENST00000556095 3834 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
MEPEQ9NQ76 AC090616.6-201ENST00000582640 721 ntBASIC15.89■□□□□ 0.13
MEPEQ9NQ76 EFCAB14-201ENST00000371933 5767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
MEPEQ9NQ76 RABL6-203ENST00000371663 3078 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
MEPEQ9NQ76 SBNO2-204ENST00000587024 4861 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
MEPEQ9NQ76 IFT74-203ENST00000433700 2119 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
MEPEQ9NQ76 AC105411.1-202ENST00000565050 1476 ntTSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
MEPEQ9NQ76 HSPA8-224ENST00000534624 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
MEPEQ9NQ76 MAPKAP1-208ENST00000394063 2977 ntTSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
MEPEQ9NQ76 RGS12-203ENST00000344733 5469 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
MEPEQ9NQ76 C9orf43-202ENST00000374165 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
MEPEQ9NQ76 RPAIN-203ENST00000381209 1535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
MEPEQ9NQ76 CSF3-206ENST00000577675 1360 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
MEPEQ9NQ76 SALL3-202ENST00000537592 6555 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
MEPEQ9NQ76 RHOT1-201ENST00000333942 3133 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
MEPEQ9NQ76 H2AFV-201ENST00000222690 3804 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
MEPEQ9NQ76 TSPAN7-202ENST00000378482 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
MEPEQ9NQ76 SDCBP2-204ENST00000381812 1550 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
MEPEQ9NQ76 BACE1-201ENST00000313005 6326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
MEPEQ9NQ76 PBK-201ENST00000301905 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
MEPEQ9NQ76 ZDHHC20-209ENST00000542645 5315 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
MEPEQ9NQ76 NLGN2-201ENST00000302926 4642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
MEPEQ9NQ76 NCOA5-201ENST00000290231 3220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
MEPEQ9NQ76 CRELD1-201ENST00000326434 1994 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
MEPEQ9NQ76 RTCA-203ENST00000370128 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
MEPEQ9NQ76 HPDL-201ENST00000334815 1629 ntAPPRIS P1 BASIC15.88■□□□□ 0.13
MEPEQ9NQ76 ERO1A-201ENST00000395686 5285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
MEPEQ9NQ76 HEBP2-201ENST00000367697 844 ntTSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
MEPEQ9NQ76 SUV39H2-204ENST00000378325 1292 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
MEPEQ9NQ76 AL031133.1-201ENST00000406807 723 ntBASIC15.88■□□□□ 0.13
MEPEQ9NQ76 AC004540.1-203ENST00000421862 907 ntTSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
MEPEQ9NQ76 AL603832.1-201ENST00000421943 449 ntTSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
MEPEQ9NQ76 LCN10-205ENST00000497771 723 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
MEPEQ9NQ76 KRT8P26-201ENST00000534154 1276 ntBASIC15.88■□□□□ 0.13
MEPEQ9NQ76 C17orf49-208ENST00000552402 760 ntTSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
MEPEQ9NQ76 AC109462.3-201ENST00000573934 613 ntBASIC15.88■□□□□ 0.13
MEPEQ9NQ76 AC004771.4-201ENST00000576752 474 ntTSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
MEPEQ9NQ76 AC010522.1-205ENST00000598031 606 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 30.7 ms