Protein–RNA interactions for Protein: Q9BYD9

ACTRT3, Actin-related protein T3, humanhuman

Predictions only

Length 372 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ACTRT3Q9BYD9 EPB41L5-203ENST00000443124 2872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
ACTRT3Q9BYD9 PTGER3-202ENST00000351052 1404 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.19
ACTRT3Q9BYD9 CFC1B-203ENST00000620207 1444 ntTSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.19
ACTRT3Q9BYD9 CFC1-203ENST00000621673 1444 ntTSL 2 BASIC16.27■□□□□ 0.19
ACTRT3Q9BYD9 PARVG-205ENST00000422871 3462 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.19
ACTRT3Q9BYD9 SNAPC3-202ENST00000380821 5680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
ACTRT3Q9BYD9 GSKIP-207ENST00000556095 3834 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.26■□□□□ 0.19
ACTRT3Q9BYD9 ICAM3-205ENST00000589261 2024 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
ACTRT3Q9BYD9 COL27A1-201ENST00000356083 7790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
ACTRT3Q9BYD9 EMILIN3-201ENST00000332312 3796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
ACTRT3Q9BYD9 MBOAT1-201ENST00000324607 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
ACTRT3Q9BYD9 AC126755.2-202ENST00000427999 1547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
ACTRT3Q9BYD9 ZFP91-201ENST00000316059 5220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
ACTRT3Q9BYD9 PRPF19-201ENST00000227524 2157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
ACTRT3Q9BYD9 FBXO7-201ENST00000266087 2195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
ACTRT3Q9BYD9 TSPAN7-202ENST00000378482 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
ACTRT3Q9BYD9 BOLA2B-201ENST00000305321 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
ACTRT3Q9BYD9 ARMC10P1-201ENST00000313754 855 ntBASIC16.26■□□□□ 0.19
ACTRT3Q9BYD9 TYMSOS-201ENST00000323813 844 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
ACTRT3Q9BYD9 BOLA2-201ENST00000330978 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
ACTRT3Q9BYD9 NT5E-202ENST00000369646 974 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
ACTRT3Q9BYD9 HYI-201ENST00000372425 1265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
ACTRT3Q9BYD9 ARMC12-202ENST00000373866 1254 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.26■□□□□ 0.19
ACTRT3Q9BYD9 MRPL23-201ENST00000381514 919 ntTSL 3 BASIC16.26■□□□□ 0.19
ACTRT3Q9BYD9 SPEG-204ENST00000396689 1274 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
ACTRT3Q9BYD9 IGHV3-47-201ENST00000425060 335 ntBASIC16.26■□□□□ 0.19
ACTRT3Q9BYD9 C16orf91-201ENST00000442039 978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
ACTRT3Q9BYD9 RPP14-206ENST00000466547 805 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.26■□□□□ 0.19
ACTRT3Q9BYD9 AC015712.1-203ENST00000559331 593 ntTSL 3 BASIC16.26■□□□□ 0.19
ACTRT3Q9BYD9 HOXB8-203ENST00000576562 743 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.26■□□□□ 0.19
ACTRT3Q9BYD9 AC003688.1-201ENST00000577138 489 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.26■□□□□ 0.19
ACTRT3Q9BYD9 ANKRD29-202ENST00000585908 846 ntTSL 2 BASIC16.26■□□□□ 0.19
ACTRT3Q9BYD9 AC010632.1-201ENST00000590376 572 ntTSL 4 BASIC16.26■□□□□ 0.19
ACTRT3Q9BYD9 ZNF575-205ENST00000601282 1086 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.26■□□□□ 0.19
ACTRT3Q9BYD9 AC005906.2-206ENST00000638180 1029 ntTSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
ACTRT3Q9BYD9 KIF16B-201ENST00000354981 5261 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
ACTRT3Q9BYD9 CPZ-203ENST00000382480 2538 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
ACTRT3Q9BYD9 TAPBP-238ENST00000475304 1686 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
ACTRT3Q9BYD9 GNA13-201ENST00000439174 4922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
ACTRT3Q9BYD9 ATP6V0E2-202ENST00000425642 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
ACTRT3Q9BYD9 RDH12-201ENST00000267502 1833 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
ACTRT3Q9BYD9 DAGLB-202ENST00000425398 2044 ntTSL 2 BASIC16.26■□□□□ 0.19
ACTRT3Q9BYD9 SMOX-205ENST00000379460 2230 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.26■□□□□ 0.19
ACTRT3Q9BYD9 MAPK11-201ENST00000330651 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
ACTRT3Q9BYD9 MCF2L-203ENST00000375604 6445 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.26■□□□□ 0.19
ACTRT3Q9BYD9 TRAPPC11-201ENST00000334690 4552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
ACTRT3Q9BYD9 MOB3A-201ENST00000357066 3391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
ACTRT3Q9BYD9 SQSTM1-202ENST00000389805 2986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
ACTRT3Q9BYD9 PLEKHG6-203ENST00000396988 2963 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.26■□□□□ 0.19
ACTRT3Q9BYD9 ESYT2-206ENST00000613624 2766 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.26■□□□□ 0.19
ACTRT3Q9BYD9 SEPHS1-202ENST00000378614 2387 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
ACTRT3Q9BYD9 LRP4-201ENST00000378623 8076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
ACTRT3Q9BYD9 BCS1L-202ENST00000392109 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
ACTRT3Q9BYD9 BCS1L-204ENST00000392111 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
ACTRT3Q9BYD9 RMND5B-201ENST00000313386 1929 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
ACTRT3Q9BYD9 GPAT3-202ENST00000395226 2631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
ACTRT3Q9BYD9 TRAPPC2L-201ENST00000301021 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
ACTRT3Q9BYD9 OSBPL1A-204ENST00000399443 3317 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
ACTRT3Q9BYD9 APOA4-201ENST00000357780 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
ACTRT3Q9BYD9 DDHD1-201ENST00000323669 5503 ntTSL 2 BASIC16.25■□□□□ 0.19
ACTRT3Q9BYD9 DNM1-216ENST00000634267 2909 ntTSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
ACTRT3Q9BYD9 PBXIP1-201ENST00000368460 1175 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.25■□□□□ 0.19
ACTRT3Q9BYD9 GGT1-207ENST00000404532 853 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
ACTRT3Q9BYD9 MOGAT1-201ENST00000446656 1048 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
ACTRT3Q9BYD9 AC096582.2-201ENST00000510860 516 ntBASIC16.25■□□□□ 0.19
ACTRT3Q9BYD9 BARHL1-202ENST00000542090 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
ACTRT3Q9BYD9 AC074051.2-201ENST00000565115 352 ntBASIC16.25■□□□□ 0.19
ACTRT3Q9BYD9 MIR3180-1-201ENST00000580374 94 ntBASIC16.25■□□□□ 0.19
ACTRT3Q9BYD9 MIR3180-3-201ENST00000584616 94 ntBASIC16.25■□□□□ 0.19
ACTRT3Q9BYD9 BNIP3P18-201ENST00000593976 575 ntBASIC16.25■□□□□ 0.19
ACTRT3Q9BYD9 ZNF549-203ENST00000594943 556 ntTSL 4 BASIC16.25■□□□□ 0.19
ACTRT3Q9BYD9 AL445228.2-201ENST00000605589 952 ntBASIC16.25■□□□□ 0.19
ACTRT3Q9BYD9 NPAP1P7-201ENST00000613027 823 ntBASIC16.25■□□□□ 0.19
ACTRT3Q9BYD9 BEAN1-211ENST00000622872 1171 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
ACTRT3Q9BYD9 AXIN1-201ENST00000262320 3643 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
ACTRT3Q9BYD9 WDFY4-202ENST00000360890 2193 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
ACTRT3Q9BYD9 CLDN11-201ENST00000064724 2169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
ACTRT3Q9BYD9 AMIGO2-202ENST00000429635 3058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
ACTRT3Q9BYD9 CDH24-201ENST00000267383 2873 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
ACTRT3Q9BYD9 SCARF1-205ENST00000571272 2871 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
ACTRT3Q9BYD9 SMN1-204ENST00000506163 1445 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
ACTRT3Q9BYD9 KMT5B-205ENST00000402789 1599 ntTSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
ACTRT3Q9BYD9 GOLGA7-202ENST00000405786 1903 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
ACTRT3Q9BYD9 SLC12A9-202ENST00000415287 1912 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
ACTRT3Q9BYD9 DPF2-205ENST00000528416 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
ACTRT3Q9BYD9 ETNK2-202ENST00000367201 2431 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.25■□□□□ 0.19
ACTRT3Q9BYD9 RGS14-201ENST00000408923 2415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
ACTRT3Q9BYD9 AMMECR1-201ENST00000262844 5504 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
ACTRT3Q9BYD9 ANGPTL4-202ENST00000393962 1705 ntTSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
ACTRT3Q9BYD9 KLHL33-201ENST00000344581 1863 ntTSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
ACTRT3Q9BYD9 TACC1-202ENST00000317827 7802 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
ACTRT3Q9BYD9 PODXL-201ENST00000322985 2011 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
ACTRT3Q9BYD9 N4BP2L1-210ENST00000613078 2032 ntTSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
ACTRT3Q9BYD9 QSOX1-201ENST00000367600 2519 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
ACTRT3Q9BYD9 IGSF8-201ENST00000314485 2343 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
ACTRT3Q9BYD9 AL355315.1-201ENST00000370649 1848 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
ACTRT3Q9BYD9 PRKRA-203ENST00000432031 1344 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
ACTRT3Q9BYD9 ALKBH5-203ENST00000541285 1605 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
ACTRT3Q9BYD9 NSUN5P2-201ENST00000388955 1789 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
ACTRT3Q9BYD9 ST8SIA4-202ENST00000451528 1794 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23.3 ms