Protein–RNA interactions for Protein: Q9BVL2

NUP58, Nucleoporin p58/p45, humanhuman

Predictions only

Length 599 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NUP58Q9BVL2 PSMD12-202ENST00000357146 2437 ntTSL 2 BASIC19.06■□□□□ 0.64
NUP58Q9BVL2 AMT-250ENST00000637682 1823 ntTSL 5 BASIC19.06■□□□□ 0.64
NUP58Q9BVL2 LRRC56-201ENST00000270115 2769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
NUP58Q9BVL2 PTPN18-201ENST00000175756 3669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
NUP58Q9BVL2 SELENBP1-201ENST00000368868 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
NUP58Q9BVL2 SLC29A1-208ENST00000393844 2326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
NUP58Q9BVL2 SUZ12-204ENST00000580398 3977 ntTSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
NUP58Q9BVL2 EMD-202ENST00000369842 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
NUP58Q9BVL2 IDS-202ENST00000370441 1399 ntTSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
NUP58Q9BVL2 B4GALT4-216ENST00000483209 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
NUP58Q9BVL2 FLYWCH1-203ENST00000416288 4963 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
NUP58Q9BVL2 EML2-203ENST00000536630 2791 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.05■□□□□ 0.64
NUP58Q9BVL2 AATK-201ENST00000326724 5257 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.05■□□□□ 0.64
NUP58Q9BVL2 OS9-205ENST00000413095 1660 ntTSL 2 BASIC19.05■□□□□ 0.64
NUP58Q9BVL2 HCRTR1-203ENST00000403528 2003 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.05■□□□□ 0.64
NUP58Q9BVL2 AKIRIN1-202ENST00000432648 2741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
NUP58Q9BVL2 UCKL1-202ENST00000358711 1845 ntTSL 2 BASIC19.05■□□□□ 0.64
NUP58Q9BVL2 SUSD4-208ENST00000494793 1833 ntTSL 5 BASIC19.05■□□□□ 0.64
NUP58Q9BVL2 SERPINA4-202ENST00000555095 1987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
NUP58Q9BVL2 TBL2-201ENST00000305632 3161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
NUP58Q9BVL2 OR6D1P-203ENST00000641209 4860 ntBASIC19.05■□□□□ 0.64
NUP58Q9BVL2 TMEM190-201ENST00000291934 593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
NUP58Q9BVL2 GOSR2-202ENST00000393456 788 ntTSL 3 BASIC19.05■□□□□ 0.64
NUP58Q9BVL2 AGGF1P2-201ENST00000426656 2106 ntBASIC19.05■□□□□ 0.64
NUP58Q9BVL2 MAGI2-AS3-208ENST00000446159 670 ntTSL 3 BASIC19.05■□□□□ 0.64
NUP58Q9BVL2 IMMP2L-207ENST00000452895 833 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.05■□□□□ 0.64
NUP58Q9BVL2 AC127526.4-201ENST00000527970 983 ntTSL 3 BASIC19.05■□□□□ 0.64
NUP58Q9BVL2 GRP-204ENST00000529320 824 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
NUP58Q9BVL2 ADA-207ENST00000537820 1128 ntTSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
NUP58Q9BVL2 TK1-204ENST00000590430 683 ntTSL 3 BASIC19.05■□□□□ 0.64
NUP58Q9BVL2 ZNF524-203ENST00000591046 1260 ntAPPRIS P1 BASIC19.05■□□□□ 0.64
NUP58Q9BVL2 RNF7-201ENST00000273480 2763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
NUP58Q9BVL2 PTPA-203ENST00000348141 2737 ntTSL 5 BASIC19.05■□□□□ 0.64
NUP58Q9BVL2 PTPA-207ENST00000393370 2737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
NUP58Q9BVL2 MIB2-232ENST00000520777 3321 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
NUP58Q9BVL2 LYRM9-203ENST00000460380 2196 ntTSL 2 BASIC19.05■□□□□ 0.64
NUP58Q9BVL2 AL445238.1-203ENST00000606050 1525 ntTSL 2 BASIC19.05■□□□□ 0.64
NUP58Q9BVL2 CSF1-204ENST00000369802 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
NUP58Q9BVL2 THAP8-201ENST00000292894 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
NUP58Q9BVL2 ITGB7-202ENST00000422257 2791 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.04■□□□□ 0.64
NUP58Q9BVL2 ADGRB2-212ENST00000527361 4919 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
NUP58Q9BVL2 AC005332.1-201ENST00000577698 1310 ntBASIC19.04■□□□□ 0.64
NUP58Q9BVL2 ASXL1-212ENST00000620121 5374 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.04■□□□□ 0.64
NUP58Q9BVL2 EXD3-201ENST00000340951 2872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
NUP58Q9BVL2 MALT1-202ENST00000348428 9368 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
NUP58Q9BVL2 MFGE8-201ENST00000268150 1937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
NUP58Q9BVL2 TBXAS1-206ENST00000425687 2080 ntTSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
NUP58Q9BVL2 MED30-201ENST00000297347 985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
NUP58Q9BVL2 SSSCA1-201ENST00000309328 698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
NUP58Q9BVL2 ZNF454-201ENST00000320129 2332 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.04■□□□□ 0.64
NUP58Q9BVL2 PJA1-201ENST00000361478 2755 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
NUP58Q9BVL2 MYCLP1-201ENST00000372451 1075 ntBASIC19.04■□□□□ 0.64
NUP58Q9BVL2 DPP9-AS1-201ENST00000381796 3071 ntTSL 2 BASIC19.04■□□□□ 0.64
NUP58Q9BVL2 ELP5-204ENST00000396628 1423 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
NUP58Q9BVL2 SMYD3-204ENST00000403792 1209 ntTSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
NUP58Q9BVL2 VGLL4-210ENST00000426568 1428 ntTSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
NUP58Q9BVL2 TNFSF13-208ENST00000483039 959 ntTSL 2 BASIC19.04■□□□□ 0.64
NUP58Q9BVL2 SPEG-225ENST00000617028 815 ntTSL 5 BASIC19.04■□□□□ 0.64
NUP58Q9BVL2 AC116407.4-201ENST00000623319 1061 ntBASIC19.04■□□□□ 0.64
NUP58Q9BVL2 RUNX1-203ENST00000358356 2720 ntTSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
NUP58Q9BVL2 KLC2-203ENST00000394066 2591 ntTSL 2 BASIC19.04■□□□□ 0.64
NUP58Q9BVL2 SLC22A11-203ENST00000377585 2124 ntTSL 2 BASIC19.04■□□□□ 0.64
NUP58Q9BVL2 HCN1-201ENST00000303230 9885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
NUP58Q9BVL2 RDH12-201ENST00000267502 1833 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.04■□□□□ 0.64
NUP58Q9BVL2 SRSF1-201ENST00000258962 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
NUP58Q9BVL2 CDK2AP2-201ENST00000301488 1378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
NUP58Q9BVL2 KCNK7-204ENST00000394217 1372 ntTSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
NUP58Q9BVL2 KCNH1-214ENST00000640566 1365 ntTSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
NUP58Q9BVL2 PYCR3-201ENST00000220966 2678 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
NUP58Q9BVL2 CRTC3-201ENST00000268184 2537 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
NUP58Q9BVL2 C9orf62-201ENST00000623103 1924 ntTSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
NUP58Q9BVL2 LINC01148-201ENST00000557527 1763 ntTSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
NUP58Q9BVL2 KLHL24-201ENST00000242810 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
NUP58Q9BVL2 ATAD3A-207ENST00000536055 2332 ntTSL 2 BASIC19.03■□□□□ 0.64
NUP58Q9BVL2 RAPGEFL1-212ENST00000620260 3855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
NUP58Q9BVL2 PEX16-201ENST00000241041 1479 ntTSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
NUP58Q9BVL2 LRRC29-201ENST00000393992 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
NUP58Q9BVL2 DNAJA3-202ENST00000355296 2591 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
NUP58Q9BVL2 LYPLAL1-202ENST00000366928 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
NUP58Q9BVL2 HECTD2-204ENST00000446394 4939 ntTSL 2 BASIC19.03■□□□□ 0.64
NUP58Q9BVL2 AD000671.3-202ENST00000591091 1712 ntTSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
NUP58Q9BVL2 YARS2-201ENST00000324868 2122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
NUP58Q9BVL2 YIPF2-204ENST00000586748 1550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
NUP58Q9BVL2 UNKL-202ENST00000301712 1431 ntTSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
NUP58Q9BVL2 TMEM106C-203ENST00000449758 1414 ntTSL 2 BASIC19.03■□□□□ 0.64
NUP58Q9BVL2 GRB7-201ENST00000309156 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
NUP58Q9BVL2 AP1S2-201ENST00000329235 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
NUP58Q9BVL2 TMEM171-201ENST00000287773 1247 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.03■□□□□ 0.64
NUP58Q9BVL2 AANAT-202ENST00000392492 1005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
NUP58Q9BVL2 CBR1-203ENST00000439427 1024 ntTSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
NUP58Q9BVL2 AC112907.2-201ENST00000448639 330 ntBASIC19.03■□□□□ 0.64
NUP58Q9BVL2 AC092597.1-201ENST00000487352 616 ntBASIC19.03■□□□□ 0.64
NUP58Q9BVL2 AC004080.2-201ENST00000523331 556 ntTSL 4 BASIC19.03■□□□□ 0.64
NUP58Q9BVL2 AL136038.3-201ENST00000561909 1096 ntBASIC19.03■□□□□ 0.64
NUP58Q9BVL2 LTBR-207ENST00000539925 1665 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.03■□□□□ 0.64
NUP58Q9BVL2 MOCS1-206ENST00000425303 1920 ntTSL 2 BASIC19.03■□□□□ 0.64
NUP58Q9BVL2 SLC41A3-203ENST00000360370 2169 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
NUP58Q9BVL2 AL731569.1-201ENST00000428940 3058 ntTSL 2 BASIC19.03■□□□□ 0.64
NUP58Q9BVL2 AC125494.1-203ENST00000396799 1622 ntTSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
NUP58Q9BVL2 ATP6V0E2-202ENST00000425642 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 34.3 ms