Protein–RNA interactions for Protein: Q9BUZ4

TRAF4, TNF receptor-associated factor 4, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 470 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRAF4Q9BUZ4 SLC29A1-206ENST00000371755 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
TRAF4Q9BUZ4 INO80E-207ENST00000563197 2103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
TRAF4Q9BUZ4 PDE1B-201ENST00000243052 3444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
TRAF4Q9BUZ4 FXYD6-204ENST00000526014 2171 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
TRAF4Q9BUZ4 SYVN1-201ENST00000294256 3048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
TRAF4Q9BUZ4 C5orf30-201ENST00000319933 3049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
TRAF4Q9BUZ4 POM121C-208ENST00000615331 5835 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
TRAF4Q9BUZ4 AL353692.3-201ENST00000407031 1396 ntBASIC15.64■□□□□ 0.09
TRAF4Q9BUZ4 ARHGEF25-208ENST00000616622 2103 ntTSL 2 BASIC15.64■□□□□ 0.09
TRAF4Q9BUZ4 CAPRIN1-207ENST00000529307 2266 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.64■□□□□ 0.09
TRAF4Q9BUZ4 GBA2-203ENST00000378103 3611 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
TRAF4Q9BUZ4 SNED1-204ENST00000401884 4538 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
TRAF4Q9BUZ4 PTPRU-202ENST00000373779 5579 ntTSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
TRAF4Q9BUZ4 CKLF-202ENST00000345436 571 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
TRAF4Q9BUZ4 ROMO1-204ENST00000374078 498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
TRAF4Q9BUZ4 DFNA5-203ENST00000409970 2005 ntTSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
TRAF4Q9BUZ4 C20orf166-AS1-201ENST00000412495 2302 ntTSL 2 BASIC15.64■□□□□ 0.09
TRAF4Q9BUZ4 NAT6-202ENST00000417393 1163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
TRAF4Q9BUZ4 EMBP1-201ENST00000458200 901 ntBASIC15.64■□□□□ 0.09
TRAF4Q9BUZ4 RN7SL606P-201ENST00000472779 293 ntBASIC15.64■□□□□ 0.09
TRAF4Q9BUZ4 LINC00167-201ENST00000530583 1419 ntBASIC15.64■□□□□ 0.09
TRAF4Q9BUZ4 EFCAB11-211ENST00000556609 568 ntTSL 3 BASIC15.64■□□□□ 0.09
TRAF4Q9BUZ4 ZNF688-207ENST00000567855 540 ntTSL 2 BASIC15.64■□□□□ 0.09
TRAF4Q9BUZ4 AL449423.1-201ENST00000578935 435 ntTSL 3 BASIC15.64■□□□□ 0.09
TRAF4Q9BUZ4 AC104971.2-201ENST00000588144 1209 ntTSL 2 BASIC15.64■□□□□ 0.09
TRAF4Q9BUZ4 AC011511.2-201ENST00000592893 918 ntTSL 3 BASIC15.64■□□□□ 0.09
TRAF4Q9BUZ4 SPINK2-205ENST00000616980 677 ntTSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
TRAF4Q9BUZ4 HNF1A-216ENST00000617366 2473 ntTSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
TRAF4Q9BUZ4 ERO1A-201ENST00000395686 5285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
TRAF4Q9BUZ4 C11orf24-201ENST00000304271 2063 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
TRAF4Q9BUZ4 RRBP1-208ENST00000470422 2070 ntTSL 2 BASIC15.64■□□□□ 0.09
TRAF4Q9BUZ4 MRPL4-203ENST00000393733 1620 ntTSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
TRAF4Q9BUZ4 ASL-205ENST00000395332 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
TRAF4Q9BUZ4 MRGPRF-AS1-201ENST00000538407 1490 ntTSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
TRAF4Q9BUZ4 IL4I1-204ENST00000595948 2407 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
TRAF4Q9BUZ4 CCDC8-201ENST00000307522 3213 ntAPPRIS P1 BASIC15.64■□□□□ 0.09
TRAF4Q9BUZ4 GABRB1-201ENST00000295454 2143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
TRAF4Q9BUZ4 CDK8-201ENST00000381527 3055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
TRAF4Q9BUZ4 FAM174B-201ENST00000327355 2792 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
TRAF4Q9BUZ4 RTN3-205ENST00000356000 2645 ntTSL 2 BASIC15.64■□□□□ 0.09
TRAF4Q9BUZ4 ZBTB22-207ENST00000418724 2645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
TRAF4Q9BUZ4 TYMS-203ENST00000323274 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
TRAF4Q9BUZ4 CENPN-202ENST00000305850 2481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
TRAF4Q9BUZ4 SURF4-208ENST00000613129 3148 ntTSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
TRAF4Q9BUZ4 AL163051.1-201ENST00000569214 1512 ntBASIC15.63■□□□□ 0.09
TRAF4Q9BUZ4 CADPS2-202ENST00000334010 6045 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
TRAF4Q9BUZ4 ABHD14B-204ENST00000461108 1397 ntTSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
TRAF4Q9BUZ4 PCBP4-202ENST00000355852 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
TRAF4Q9BUZ4 SLC27A2-201ENST00000267842 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
TRAF4Q9BUZ4 FARSA-202ENST00000423140 1720 ntTSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
TRAF4Q9BUZ4 TMCO1-207ENST00000580248 1735 ntTSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
TRAF4Q9BUZ4 FRMD6-AS1-201ENST00000617151 2229 ntBASIC15.63■□□□□ 0.09
TRAF4Q9BUZ4 VAC14-201ENST00000261776 3099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
TRAF4Q9BUZ4 LINC00535-201ENST00000501400 1914 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
TRAF4Q9BUZ4 SHOX-204ENST00000554971 1902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
TRAF4Q9BUZ4 IRF3-202ENST00000377135 1442 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
TRAF4Q9BUZ4 KRT8P10-201ENST00000450021 1447 ntBASIC15.63■□□□□ 0.09
TRAF4Q9BUZ4 C6orf15-201ENST00000259870 1140 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
TRAF4Q9BUZ4 UXT-201ENST00000333119 574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
TRAF4Q9BUZ4 MRPS15-201ENST00000373116 1006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
TRAF4Q9BUZ4 PAX3-208ENST00000409828 1254 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
TRAF4Q9BUZ4 AL591212.1-201ENST00000433646 615 ntTSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
TRAF4Q9BUZ4 AC092159.3-201ENST00000439196 571 ntTSL 4 BASIC15.63■□□□□ 0.09
TRAF4Q9BUZ4 VENTXP7-201ENST00000475503 772 ntBASIC15.63■□□□□ 0.09
TRAF4Q9BUZ4 ARSK-202ENST00000504763 1088 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
TRAF4Q9BUZ4 FGD4-212ENST00000534526 2977 ntTSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
TRAF4Q9BUZ4 AC092338.2-202ENST00000567158 611 ntTSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
TRAF4Q9BUZ4 C19orf25-204ENST00000586564 1265 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.63■□□□□ 0.09
TRAF4Q9BUZ4 ABHD17A-204ENST00000590661 1079 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
TRAF4Q9BUZ4 AC138894.3-201ENST00000603787 634 ntBASIC15.63■□□□□ 0.09
TRAF4Q9BUZ4 CEACAM3-208ENST00000630848 1110 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
TRAF4Q9BUZ4 LSM12-204ENST00000591247 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
TRAF4Q9BUZ4 AP5S1-201ENST00000246041 1960 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC15.63■□□□□ 0.09
TRAF4Q9BUZ4 ZNF256-202ENST00000598928 1958 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
TRAF4Q9BUZ4 NRXN2-202ENST00000301894 3535 ntTSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
TRAF4Q9BUZ4 BTG3-201ENST00000339775 1485 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
TRAF4Q9BUZ4 AC008393.1-201ENST00000499601 1454 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
TRAF4Q9BUZ4 BEST2-202ENST00000549706 2183 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
TRAF4Q9BUZ4 BDP1-202ENST00000380675 2861 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
TRAF4Q9BUZ4 AKT1-214ENST00000555528 3066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
TRAF4Q9BUZ4 SLC2A14-214ENST00000542505 1650 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
TRAF4Q9BUZ4 TRPC1-201ENST00000273482 4324 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
TRAF4Q9BUZ4 SMIM24-201ENST00000215531 1329 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
TRAF4Q9BUZ4 C1QTNF1-202ENST00000339142 3100 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
TRAF4Q9BUZ4 FICD-204ENST00000552695 3347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
TRAF4Q9BUZ4 REEP4-201ENST00000306306 1710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
TRAF4Q9BUZ4 MAGEA6-201ENST00000329342 1740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
TRAF4Q9BUZ4 MAGEA3-201ENST00000370278 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
TRAF4Q9BUZ4 SYT17-207ENST00000568115 1721 ntTSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
TRAF4Q9BUZ4 SORCS3-202ENST00000369701 5757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
TRAF4Q9BUZ4 LINC00554-201ENST00000564841 3011 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
TRAF4Q9BUZ4 RREB1-203ENST00000379933 5826 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
TRAF4Q9BUZ4 TPST2-201ENST00000338754 5697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
TRAF4Q9BUZ4 SLC2A6-202ENST00000371899 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
TRAF4Q9BUZ4 CORO6-212ENST00000584969 1416 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
TRAF4Q9BUZ4 ELN-221ENST00000445912 2583 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
TRAF4Q9BUZ4 MGAT1-201ENST00000307826 2761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
TRAF4Q9BUZ4 CHST11-201ENST00000303694 5709 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
TRAF4Q9BUZ4 SUPT20H-203ENST00000360252 2843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
TRAF4Q9BUZ4 RTN1-201ENST00000267484 3435 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 53.9 ms