Protein–RNA interactions for Protein: Q9BSH3

NICN1, Nicolin-1, humanhuman

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Length 213 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NICN1Q9BSH3 MFGE8-201ENST00000268150 1937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
NICN1Q9BSH3 PODNL1-202ENST00000339560 2165 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
NICN1Q9BSH3 CES3-203ENST00000543856 3178 ntTSL 2 BASIC14.99□□□□□ -0.01
NICN1Q9BSH3 SPAG9-205ENST00000505279 4659 ntTSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
NICN1Q9BSH3 ARHGEF25-208ENST00000616622 2103 ntTSL 2 BASIC14.99□□□□□ -0.01
NICN1Q9BSH3 KLF10-201ENST00000285407 3097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
NICN1Q9BSH3 RABGGTA-201ENST00000216840 2088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
NICN1Q9BSH3 KRT79-201ENST00000330553 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
NICN1Q9BSH3 PGRMC2-207ENST00000520121 3785 ntTSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
NICN1Q9BSH3 AP000347.2-202ENST00000421064 3041 ntTSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
NICN1Q9BSH3 CRTC3-201ENST00000268184 2537 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
NICN1Q9BSH3 PEX11G-201ENST00000221480 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
NICN1Q9BSH3 AZU1-201ENST00000233997 908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
NICN1Q9BSH3 MMP23A-201ENST00000234610 1017 ntBASIC14.99□□□□□ -0.01
NICN1Q9BSH3 ZNF584-202ENST00000322834 1042 ntTSL 2 BASIC14.99□□□□□ -0.01
NICN1Q9BSH3 RHOC-203ENST00000369632 1026 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.99□□□□□ -0.01
NICN1Q9BSH3 AL357874.1-201ENST00000428948 574 ntTSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
NICN1Q9BSH3 CR769775.1-204ENST00000439760 747 ntTSL 5 BASIC14.99□□□□□ -0.01
NICN1Q9BSH3 DCTN3-209ENST00000477738 713 ntTSL 3 BASIC14.99□□□□□ -0.01
NICN1Q9BSH3 AC112698.1-201ENST00000510299 916 ntBASIC14.99□□□□□ -0.01
NICN1Q9BSH3 CD81-212ENST00000526072 1172 ntTSL 5 BASIC14.99□□□□□ -0.01
NICN1Q9BSH3 CADM1-222ENST00000616271 1246 ntTSL 5 BASIC14.99□□□□□ -0.01
NICN1Q9BSH3 AC079602.3-201ENST00000623931 403 ntBASIC14.99□□□□□ -0.01
NICN1Q9BSH3 ATG4B-226ENST00000625810 370 ntTSL 4 BASIC14.99□□□□□ -0.01
NICN1Q9BSH3 TRPV4-205ENST00000537083 2436 ntTSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
NICN1Q9BSH3 TMEM127-202ENST00000432959 3099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
NICN1Q9BSH3 TBC1D10C-201ENST00000312390 1497 ntTSL 5 BASIC14.99□□□□□ -0.01
NICN1Q9BSH3 NDUFA10-214ENST00000620965 1489 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.99□□□□□ -0.01
NICN1Q9BSH3 XKR7-201ENST00000562532 7844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
NICN1Q9BSH3 GSS-201ENST00000216951 1922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
NICN1Q9BSH3 SLC18B1-201ENST00000275227 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
NICN1Q9BSH3 TRIM45-203ENST00000369464 3495 ntTSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
NICN1Q9BSH3 ACBD6-201ENST00000367595 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
NICN1Q9BSH3 AC116353.5-201ENST00000638148 1699 ntBASIC14.99□□□□□ -0.01
NICN1Q9BSH3 SLIT1-204ENST00000371070 4564 ntTSL 5 BASIC14.99□□□□□ -0.01
NICN1Q9BSH3 STK24-203ENST00000397517 4578 ntTSL 2 BASIC14.99□□□□□ -0.01
NICN1Q9BSH3 SLC19A2-202ENST00000367804 2976 ntTSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
NICN1Q9BSH3 LINC01311-201ENST00000565162 1445 ntBASIC14.99□□□□□ -0.01
NICN1Q9BSH3 NCAPH2-203ENST00000395701 2077 ntTSL 2 BASIC14.99□□□□□ -0.01
NICN1Q9BSH3 DTX3-204ENST00000548804 2067 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.99□□□□□ -0.01
NICN1Q9BSH3 CHRNE-201ENST00000293780 2455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
NICN1Q9BSH3 ARL13B-203ENST00000394222 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
NICN1Q9BSH3 ZNF385A-203ENST00000394313 2430 ntTSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
NICN1Q9BSH3 SLC52A1-202ENST00000424747 2412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
NICN1Q9BSH3 PICALM-219ENST00000532317 3474 ntTSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
NICN1Q9BSH3 THNSL2-203ENST00000377254 1560 ntTSL 2 BASIC14.98□□□□□ -0.01
NICN1Q9BSH3 CHEK2-202ENST00000348295 1771 ntTSL 5 BASIC14.98□□□□□ -0.01
NICN1Q9BSH3 LSP1-203ENST00000405957 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.98□□□□□ -0.01
NICN1Q9BSH3 LINC01148-201ENST00000557527 1763 ntTSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
NICN1Q9BSH3 FAM210B-201ENST00000371384 3046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
NICN1Q9BSH3 SLC30A4-201ENST00000261867 7157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
NICN1Q9BSH3 ITGB1BP1-204ENST00000360635 4859 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.98□□□□□ -0.01
NICN1Q9BSH3 FN1-208ENST00000426059 2388 ntTSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
NICN1Q9BSH3 KCNQ2-202ENST00000344462 2750 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
NICN1Q9BSH3 KCNQ2-236ENST00000637193 2983 ntTSL 5 BASIC14.98□□□□□ -0.01
NICN1Q9BSH3 RPAIN-203ENST00000381209 1535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
NICN1Q9BSH3 AC009041.2-206ENST00000563863 1728 ntTSL 2 BASIC14.98□□□□□ -0.01
NICN1Q9BSH3 HYAL3-201ENST00000336307 1942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
NICN1Q9BSH3 SLC25A45-208ENST00000527174 2138 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.98□□□□□ -0.01
NICN1Q9BSH3 NTRK1-202ENST00000368196 2701 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
NICN1Q9BSH3 HMGXB3-202ENST00000503427 5275 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.98□□□□□ -0.01
NICN1Q9BSH3 ITGA3-202ENST00000320031 4888 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
NICN1Q9BSH3 PTK7-202ENST00000230419 4272 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
NICN1Q9BSH3 HEYL-201ENST00000372852 3661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
NICN1Q9BSH3 LRRN4-201ENST00000378858 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
NICN1Q9BSH3 KRT86-201ENST00000293525 2091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
NICN1Q9BSH3 KRT28-201ENST00000306658 1685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
NICN1Q9BSH3 FITM1-201ENST00000267426 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
NICN1Q9BSH3 NDUFA1-201ENST00000371437 766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
NICN1Q9BSH3 DHRS4L2-202ENST00000397071 1117 ntTSL 2 BASIC14.98□□□□□ -0.01
NICN1Q9BSH3 DMKN-208ENST00000424570 1293 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
NICN1Q9BSH3 AC005104.2-201ENST00000427818 678 ntBASIC14.98□□□□□ -0.01
NICN1Q9BSH3 PTX4-202ENST00000440447 1117 ntTSL 5 BASIC14.98□□□□□ -0.01
NICN1Q9BSH3 AP003396.1-201ENST00000501918 507 ntTSL 5 BASIC14.98□□□□□ -0.01
NICN1Q9BSH3 AC136628.4-201ENST00000520758 535 ntTSL 2 BASIC14.98□□□□□ -0.01
NICN1Q9BSH3 AC009154.2-201ENST00000621177 724 ntBASIC14.98□□□□□ -0.01
NICN1Q9BSH3 PITPNC1-203ENST00000580974 6182 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
NICN1Q9BSH3 TUBB2B-201ENST00000259818 2020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
NICN1Q9BSH3 GPAT2-201ENST00000359548 2761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
NICN1Q9BSH3 PHGDH-223ENST00000641597 2585 ntAPPRIS P1 BASIC14.98□□□□□ -0.01
NICN1Q9BSH3 PCDH10-201ENST00000264360 8489 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
NICN1Q9BSH3 N4BP1-201ENST00000262384 7106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
NICN1Q9BSH3 AL391807.1-203ENST00000604392 2365 ntBASIC14.98□□□□□ -0.01
NICN1Q9BSH3 LYRM9-203ENST00000460380 2196 ntTSL 2 BASIC14.98□□□□□ -0.01
NICN1Q9BSH3 GJB3-201ENST00000373362 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
NICN1Q9BSH3 UBE3D-203ENST00000369747 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
NICN1Q9BSH3 FAM50A-202ENST00000393600 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
NICN1Q9BSH3 CLIP4-201ENST00000320081 4293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
NICN1Q9BSH3 ISYNA1-202ENST00000457269 1703 ntTSL 2 BASIC14.97□□□□□ -0.01
NICN1Q9BSH3 ETV4-211ENST00000591713 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
NICN1Q9BSH3 PHGDH-208ENST00000641023 2096 ntAPPRIS P1 BASIC14.97□□□□□ -0.01
NICN1Q9BSH3 TBC1D2-205ENST00000465784 3349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
NICN1Q9BSH3 ADCYAP1R1-203ENST00000409363 1889 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
NICN1Q9BSH3 HAGHL-203ENST00000389703 1347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
NICN1Q9BSH3 ARHGAP39-202ENST00000377307 4673 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.97□□□□□ -0.01
NICN1Q9BSH3 CCDC127-201ENST00000296824 9342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
NICN1Q9BSH3 AC046185.3-201ENST00000623228 1824 ntBASIC14.97□□□□□ -0.01
NICN1Q9BSH3 UBR3-201ENST00000272793 8005 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.97□□□□□ -0.01
NICN1Q9BSH3 MFSD11-202ENST00000355954 2832 ntTSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
NICN1Q9BSH3 RIMS1-210ENST00000491071 5047 ntTSL 5 BASIC14.97□□□□□ -0.01
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