Protein–RNA interactions for Protein: Q96EB6

SIRT1, NAD-dependent protein deacetylase sirtuin-1, humanhuman

Predictions only

Length 747 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SIRT1Q96EB6 LIN54-209ENST00000510557 2257 ntTSL 2 BASIC23.85■■□□□ 1.41
SIRT1Q96EB6 ST8SIA2-201ENST00000268164 5708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
SIRT1Q96EB6 PPP2R2C-209ENST00000515571 1832 ntTSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
SIRT1Q96EB6 MRGPRF-202ENST00000320913 705 ntTSL 2 BASIC23.85■■□□□ 1.41
SIRT1Q96EB6 KRT18P32-201ENST00000424695 1287 ntBASIC23.85■■□□□ 1.41
SIRT1Q96EB6 AL732437.1-201ENST00000442008 595 ntTSL 4 BASIC23.85■■□□□ 1.41
SIRT1Q96EB6 FAM13C-204ENST00000468840 2110 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.85■■□□□ 1.41
SIRT1Q96EB6 LINC02055-207ENST00000524346 706 ntTSL 3 BASIC23.85■■□□□ 1.41
SIRT1Q96EB6 COX5A-203ENST00000564811 568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
SIRT1Q96EB6 HCFC1R1-203ENST00000572355 610 ntTSL 3 BASIC23.85■■□□□ 1.41
SIRT1Q96EB6 METTL23-202ENST00000586200 465 ntTSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
SIRT1Q96EB6 METTL23-212ENST00000590964 1006 ntTSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
SIRT1Q96EB6 GMFG-207ENST00000598034 1028 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
SIRT1Q96EB6 RAB34-224ENST00000636513 888 ntTSL 5 BASIC23.85■■□□□ 1.41
SIRT1Q96EB6 WDR74-206ENST00000529106 1366 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.85■■□□□ 1.41
SIRT1Q96EB6 TCTN1-225ENST00000551590 2309 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
SIRT1Q96EB6 UNC5C-202ENST00000504962 1789 ntTSL 2 BASIC23.85■■□□□ 1.41
SIRT1Q96EB6 NOX4-201ENST00000263317 2388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
SIRT1Q96EB6 BRMS1L-201ENST00000216807 2657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
SIRT1Q96EB6 SMAD7-201ENST00000262158 3087 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
SIRT1Q96EB6 LRRC1-202ENST00000370888 3180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
SIRT1Q96EB6 SARDH-202ENST00000371867 1326 ntTSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
SIRT1Q96EB6 TUBB3P1-201ENST00000405796 1332 ntBASIC23.84■■□□□ 1.41
SIRT1Q96EB6 PML-221ENST00000569965 2148 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
SIRT1Q96EB6 TCP11-228ENST00000611141 2130 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
SIRT1Q96EB6 REPS2-202ENST00000357277 7953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
SIRT1Q96EB6 SLC27A1-204ENST00000598424 2681 ntTSL 2 BASIC23.84■■□□□ 1.41
SIRT1Q96EB6 ORC5-201ENST00000297431 1958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
SIRT1Q96EB6 TMEM143-202ENST00000377431 1960 ntTSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
SIRT1Q96EB6 MBD4-202ENST00000393278 1684 ntTSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
SIRT1Q96EB6 SOCS2-AS1-202ENST00000500986 1655 ntTSL 2 BASIC23.84■■□□□ 1.41
SIRT1Q96EB6 BORCS8-203ENST00000477565 1489 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
SIRT1Q96EB6 TCEAL3-203ENST00000372628 1221 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.84■■□□□ 1.41
SIRT1Q96EB6 CAPG-205ENST00000409921 1195 ntTSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
SIRT1Q96EB6 PAEP-208ENST00000479141 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
SIRT1Q96EB6 GABARAP-205ENST00000573928 476 ntTSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
SIRT1Q96EB6 RNF165-205ENST00000588679 2904 ntBASIC23.84■■□□□ 1.41
SIRT1Q96EB6 AP003774.1-201ENST00000316124 2340 ntTSL 2 BASIC23.84■■□□□ 1.41
SIRT1Q96EB6 CLK1-205ENST00000434813 2026 ntTSL 2 BASIC23.84■■□□□ 1.41
SIRT1Q96EB6 KCNMA1-209ENST00000372443 5059 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.84■■□□□ 1.41
SIRT1Q96EB6 LAMP1-201ENST00000332556 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
SIRT1Q96EB6 SDK1-201ENST00000389531 7606 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.84■■□□□ 1.41
SIRT1Q96EB6 PARD3-210ENST00000374794 5669 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
SIRT1Q96EB6 INAVA-202ENST00000413687 2197 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.84■■□□□ 1.41
SIRT1Q96EB6 KCNH2-202ENST00000330883 3267 ntTSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
SIRT1Q96EB6 WDR53-201ENST00000332629 1679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
SIRT1Q96EB6 LINC00315-201ENST00000441947 2323 ntTSL 5 BASIC23.83■■□□□ 1.41
SIRT1Q96EB6 WIPF1-206ENST00000409891 2568 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
SIRT1Q96EB6 FBXO4-206ENST00000509134 1284 ntTSL 5 BASIC23.83■■□□□ 1.41
SIRT1Q96EB6 SMCO4-204ENST00000527149 472 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.83■■□□□ 1.41
SIRT1Q96EB6 NRK-203ENST00000536164 908 ntTSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
SIRT1Q96EB6 AC009053.3-201ENST00000567148 574 ntTSL 4 BASIC23.83■■□□□ 1.41
SIRT1Q96EB6 TMEM88-202ENST00000574668 510 ntTSL 2 BASIC23.83■■□□□ 1.41
SIRT1Q96EB6 MIR3909-201ENST00000579518 119 ntBASIC23.83■■□□□ 1.41
SIRT1Q96EB6 IL11-202ENST00000585513 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
SIRT1Q96EB6 SNHG8-201ENST00000602414 672 ntTSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
SIRT1Q96EB6 SNHG8-205ENST00000602819 470 ntTSL 2 BASIC23.83■■□□□ 1.41
SIRT1Q96EB6 IRF1-211ENST00000613424 821 ntTSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
SIRT1Q96EB6 LINC00466-208ENST00000635218 1217 ntTSL 5 BASIC23.83■■□□□ 1.41
SIRT1Q96EB6 LMNA-202ENST00000361308 1713 ntTSL 5 BASIC23.83■■□□□ 1.41
SIRT1Q96EB6 HDAC10-202ENST00000349505 1950 ntTSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
SIRT1Q96EB6 MFSD2B-202ENST00000406420 1528 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.83■■□□□ 1.41
SIRT1Q96EB6 AC012569.1-201ENST00000591191 1524 ntBASIC23.83■■□□□ 1.41
SIRT1Q96EB6 CAPN5-205ENST00000529629 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.4
SIRT1Q96EB6 CTTN-203ENST00000376561 2247 ntTSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.4
SIRT1Q96EB6 NEIL2-203ENST00000436750 2226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.4
SIRT1Q96EB6 BACE2-202ENST00000330333 2993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
SIRT1Q96EB6 UBE3D-203ENST00000369747 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
SIRT1Q96EB6 POLR1D-220ENST00000637071 1943 ntTSL 5 BASIC23.82■■□□□ 1.4
SIRT1Q96EB6 REPS1-203ENST00000409812 2511 ntTSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
SIRT1Q96EB6 NKD2-202ENST00000296849 2155 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
SIRT1Q96EB6 GPS1-201ENST00000306823 1842 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
SIRT1Q96EB6 AL353732.1-201ENST00000569618 1459 ntBASIC23.82■■□□□ 1.4
SIRT1Q96EB6 ARHGAP11A-208ENST00000567348 2422 ntTSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
SIRT1Q96EB6 MADCAM1-204ENST00000587541 1723 ntTSL 2 BASIC23.82■■□□□ 1.4
SIRT1Q96EB6 IFT20-202ENST00000357896 974 ntTSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
SIRT1Q96EB6 OSTC-201ENST00000361564 1077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
SIRT1Q96EB6 VMA21-202ENST00000370361 693 ntTSL 5 BASIC23.82■■□□□ 1.4
SIRT1Q96EB6 LRRC37A5P-201ENST00000374304 1103 ntTSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
SIRT1Q96EB6 NDUFAF3-203ENST00000395458 808 ntTSL 2 BASIC23.82■■□□□ 1.4
SIRT1Q96EB6 PLAC9P1-202ENST00000433290 400 ntTSL 2 BASIC23.82■■□□□ 1.4
SIRT1Q96EB6 C5orf66-202ENST00000507641 547 ntTSL 3 BASIC23.82■■□□□ 1.4
SIRT1Q96EB6 AC055854.1-201ENST00000523627 570 ntTSL 4 BASIC23.82■■□□□ 1.4
SIRT1Q96EB6 KRT9-201ENST00000246662 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
SIRT1Q96EB6 ANKS3-202ENST00000446014 2265 ntTSL 5 BASIC23.82■■□□□ 1.4
SIRT1Q96EB6 NGFR-202ENST00000504201 1840 ntTSL 2 BASIC23.82■■□□□ 1.4
SIRT1Q96EB6 STPG3-AS1-201ENST00000612170 1701 ntTSL 2 BASIC23.81■■□□□ 1.4
SIRT1Q96EB6 NCKAP1-201ENST00000360982 4989 ntTSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
SIRT1Q96EB6 NRXN1-220ENST00000611589 1857 ntTSL 5 BASIC23.81■■□□□ 1.4
SIRT1Q96EB6 C5orf47-201ENST00000340147 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
SIRT1Q96EB6 CALM3-201ENST00000291295 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
SIRT1Q96EB6 GLT1D1-204ENST00000442111 2995 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.81■■□□□ 1.4
SIRT1Q96EB6 UMOD-205ENST00000570689 2315 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.81■■□□□ 1.4
SIRT1Q96EB6 NUDT4P1-201ENST00000322209 1206 ntAPPRIS P1 BASIC23.81■■□□□ 1.4
SIRT1Q96EB6 MIR346-201ENST00000362234 95 ntBASIC23.81■■□□□ 1.4
SIRT1Q96EB6 TNNC2-202ENST00000372557 780 ntTSL 3 BASIC23.81■■□□□ 1.4
SIRT1Q96EB6 PMS2P4-201ENST00000412466 1052 ntBASIC23.81■■□□□ 1.4
SIRT1Q96EB6 KLF2P3-201ENST00000451977 1087 ntBASIC23.81■■□□□ 1.4
SIRT1Q96EB6 LINC01812-201ENST00000457448 725 ntTSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
SIRT1Q96EB6 TAF8-206ENST00000472818 719 ntTSL 2 BASIC23.81■■□□□ 1.4
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 34.3 ms