Protein–RNA interactions for Protein: Q96BQ1

FAM3D, Protein FAM3D, humanhuman

Predictions only

Length 224 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FAM3DQ96BQ1 SEMA4B-202ENST00000411539 3807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
FAM3DQ96BQ1 FAHD2CP-202ENST00000443258 893 ntTSL 3 BASIC15.08■□□□□ 0
FAM3DQ96BQ1 IKBKB-210ENST00000518983 447 ntTSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
FAM3DQ96BQ1 CDC42EP2-202ENST00000533419 1279 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.08■□□□□ 0
FAM3DQ96BQ1 GSTZ1-218ENST00000557053 580 ntTSL 3 BASIC15.08■□□□□ 0
FAM3DQ96BQ1 AL929554.1-201ENST00000568665 460 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.08■□□□□ 0
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FAM3DQ96BQ1 AC011498.3-201ENST00000590159 569 ntTSL 4 BASIC15.08■□□□□ 0
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FAM3DQ96BQ1 MME-217ENST00000616757 1315 ntTSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
FAM3DQ96BQ1 POLR3E-202ENST00000359210 2469 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
FAM3DQ96BQ1 AFTPH-202ENST00000238856 4040 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
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FAM3DQ96BQ1 ZNF773-201ENST00000282292 2206 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
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FAM3DQ96BQ1 CCK-201ENST00000334681 830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
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FAM3DQ96BQ1 U73166.1-201ENST00000439898 2625 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
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FAM3DQ96BQ1 ZSCAN25-201ENST00000262941 1652 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
FAM3DQ96BQ1 PIGQ-201ENST00000026218 2846 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
FAM3DQ96BQ1 GRK6-202ENST00000355958 1789 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
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